무지개송어와 산천어에 있어서 백점충의 자연 감염 및 수온별, 어종 유래별 인위 감염에 의한 폐사율을 비교하였다. 백점병은 수온이 낮은 시기에는 산천어가 무지개송어에 비해 잘 감염되었으나, 수온이 높은 시기에는 두 어종간의 차이가 없었다. 백점충의 밀도가 높았던 5월을 제외하고는 양어지의 사육수, 찌꺼기에서 백점충이 검출이 되지 않았다. 수온 10℃에서는 무지개송어에 비해 산천어가 백점충에 대한 감수성이 높았으나, 수온 17${^{\circ}C}$에 서는 폐사에 있어 별 차이가 없었다. 이상의 결과로 무지개송어보다 산천어가 저수온에서 백점충에 대한 감수성이 높음을 알 수 있었다.

2007년 3월부터 2008년 2월까지 약 12개월에 걸쳐서 우리나라 동, 서, 남해 연안 지역에서 총 11목 44종 989마리 자연산 해산어류를 대상으로 아니사키스형 유충의 기생상황을 조사하였다. 유충의 감염률은 44종 중 28종에서, 전체 989마리 중 377마리에서 검출되어 평균 38%의 감염률을 보였다. 적출된 유충의 대부분은 형태학적 조사 및 유전학적 조사를 통하여 A. simplex type I 유충으로 동정하였다. 일반적으로 가을 겨울철보다 봄 여름철에 감염률이 높았으며, 같은 어종이라도 크기가 큰 개체에서 감염률이 높게 나타났다. 병리조직학적 검사를 통하여 유충의 기생 부위는 어종에 따라서 다르나 대체로 배설강 주변부를 비롯하여 장간막, 간, 복강지방 등 이였으며, 한두 마리씩 산재해 있는 것과 여러 마리가 함께 모여 있는 것, 피낭에 뭉쳐 있는 것 등 다양하게 나타났다.

경북 울진 지역에서 채집된 양식 강도다리와 충남 태안 및 부산 지역 넙치 시료로부터 분리한 MABV에 대한 유전자 비교를 위해 VP2-NSPhylogenetic VP3 region (432 bp)을 phylogenetic 분석에 이용했다. Sequence 확인 결과 MABV (08-KU)는 일본 방어에서 최초 분리 보고된 YTAV와 98%의 nucleotide 유사성이 나타났으며, 이전 보고된 다 른 여러 strain들과는 76%이상 유사한 것으로 확인되었다. 그리고 MABV (06-KP)와 MABV (08-KC)도 YTAV와 97-98%의 높은 sequence 유사성을 보였다. 또한 다양한 MABV strain들과의 비교를 위해 충남태안 및 부산지역 넙치 시료에서 분리한 MABV (08-KC)와 MABV (06-KP)에 대한 phylogenetic 분석도 실시하였다. 그 결과 분석에 사용된 MABV (08-KU0, MABV (06-KP), MABV (08-KC)는 모두 일본 방어에서 분리된 MABV Y6와 동일한 genogroup VII에 포함 되었다.

The genomic and subgenomic RNAs of fish nodavirus encode the four proteins, protein A, capsid protein, non-structural protein B1 and B2. In this study, we describe the immune response of olive flounder Paralichthys olivaceus immunized with live fish nodavirus or recombinant capsid protein, non-structural protein B1 and B2 expressed in E. coli. Nodavirus-infected flounder produced antibodies to capsid protein, B1 and B2 and nodavirus-neutralizing activities were detected in the serum of the nodavirus-infected flounder. The flounder were immunized against the three recombinant proteins of fish nodavirus and the sera from these immunized fishes were assayed for nodavirus-specific antibody by ELISA and a neutralization test. In the immunized flounder, all three recombinant proteins induced the production of similar levels of antibody, but only the antibody to capsid protein significantly neutralized nodavirus. These results indicate that all three nodaviral proteins are immunogenic in flounder, but only the capsid protein can induce neutralizing antibody against nodavirus.

The causative agent for the tunic softness syndrome of the cultured ascidian Halocynthia roretzi from Jan 1999 to Feb 2009 was identified using virus isolation and polymerase chain reaction (PCR). The pathogenicity of the isolated virus MABV UR-1 strain was determined by experimental infection trials. The cytopathic effects was observed in CHSE-214 cell line at a level 5.1% (4/78) in normal ascidian and 1.8% in abnormal ascidian showing tunic softness syndrome signs. MABV gene was detected in 16.8% (18/107) of normal and 13.1% (5/38) of abnormal organisms by PCR. The ratio of MABV isolation and gene detection was similar level in normal and soft tunic diseased ascidian. Based on the VP2/NS junction region sequences, eight strains of virus isolated from ascidian, were included in the same genogroup with MABV which is originally isolated in wide ranges of marine fish and shellfish species. The UR-1 strain caused 60% mortality (36.5% mortality in control group) by immersion infection and 37% mortality (same mortality in control group) in injection infection indicating no significant differences in infected and control groups. These results suggest that ascidian can act as reservoir of the MABV, and this virus is not directly related with the ascidian mortality.

배양 온도, 배양 배지 중의 pH, NaCl 농도, iron 농도와 같은 배양 조건이 P. damselae의 미생물학적 성상 및 병원성에 미치는 영향을 조사하였다. P. damselae는 배양 온도 15-30${^{\circ}C}$에서 배지의 pH 5-9, NaCl 농도 0-6%와 $FeCl_{3}$ 첨가시 성장이 촉진되었지만, iron-chelator 첨가 시성장이 억제되었다. Iron-limited 조건에서 배양시 ECPs protein 농도, phospholipase, 용혈능, siderophore 및 cytotoxicity 활성 이 높게 나타났고, 넙치 혈청의 살균작용 대한 생존율도 증가 되었으나, iron-added 조건에서는 감소되어, 배양 조건 중 iron 농도에 영향을 가장 많이 받는 것으로 나타났다. 따라서, 본 연구에서 적용한 iron-limited 조건은 철농도가 낮은 숙주 내와 유사한 환경이므로 iron-limited에서 P. damselae 배양 시 나타나는 병원성의 증가는 어체에 감염시 나타나는 병원성 발현 기전과 유사할 것으로 사료된다.

병든 넙치에서 분리한 Streptococcus parauberis (FP2284)를 스트레스 조건을 달리하여 넙치, Paralichthys olivaceus에 인위감염한 후 조직 내 생균수 변화 및 병리조직학적 변화를 분석하였다. 인위감염 실험은 건강한 넙치 (평균 어체 중 40.4 g)에 $2{\times}10^{8}$ CFU/fish 농도로 복강주사하고 스트레스를 주지 않거나 하루 2번, 2분간 Netting 스트레스를 처리하였다. 스트레스를 주지 않은 그룹과 Netting 스트레스를 준 그룹의 누적 폐사율은 각각 70% 및 95%로 나타났다. 인위감염 시킨 넙치에서는 체색흑화와 심장의 염증이 주요 임상소견으로 나타났으며, 심장에서는 주로 심외막염, 심근염 및 심근의 섬유화가 관찰되었다. 인위감염 후 심장 조직의 세균수 변화를 측정한 결과, 주사 후 3주째까지 심장 1 g당 $10^{4}$ CFU의 세균수가 유지되는 것으로 나타났다. 스트레스 조건하에서 심장에서의 병리조직학적 변화가 더 심한 것으로 나타났으며, 심장 조직내 세균의 점차적인 감소가 지연되는 것으로 나타났다.

우리나라에서 Streptococcus parauberis는 넙치, Paralichthys olivaceus와 강도다리, Platichthys stellatus의 병원체로 보고되는 사례가 증가하고 있다. 본 연구에서는 S. parauberis에 의한 연쇄 구균병의 수온에 대한 영향 (14${^{\circ}C}$ 및 21${^{\circ}C}$)과 넙치에 대한 병원성을 확인하고자 하였다. S. parauberis 생균을 넙치에 $2.0{\times}10^{7}$ cfu/fish의 농도로 복강주사하고 21일간 폐사를 조사하였다. 또한, H&E 염색과 in situ hybridization 방법을 이용하여 감염 정도, 조직 변화 및 세균의 분포를 포함하는 조직병리학적 연구를 수행하였다. 21일간 넙치의 폐사를 관찰한 결과, 14${^{\circ}C}$와 21${^{\circ}C}$에서의 누적폐사율이 각각 16.7%와 50%로 나타났다. 대부분의 경우 S. parauberis에 감염된 넙치는 체색흑화, 무기력, 복수에 의한 가벼운 복부팽만, 비장 종대, 간 충혈 및 각 내부 장기의 퇴색이 관찰되었다. 심장에서는 한계가 명료한 유백색의 결절과 심낭에 불투명한 염증성 삼출물이 차 있었다. 특히, 폐사가 나타나기 시작한 후 모든 실험어에서 심외막염과 심근염이 관찰 되었다. S. parauberis 인위 감염 시, 균의 검출여부나 조직 내에서의 세균 분포 양상을 관찰하기 위하여 수행한 in situ hybridization의 결과, 실험에 사용한 장기들 중 간장, 비장, 신장 및 위에서는 약한 양성 반응을 나타내었으나 심장의 심근에서 가장 강한 양성 반응을 관찰할 수 있었다. 이러한 결과는 S. parauberis가 심근에 심각한 영향을 미쳐서 호흡곤란과 혈액순환에 영향을 미치는 것으로 판단되므로 S. parauberis에 의한 심외막염과 심근염은 넙치의 폐사와 직접적인 관련이 있는 것으로 사료된다.

본 연구는 에드워드 내성 정도를 기준으로 선발된 넙치 친어를 이용하여 $4{\times}4$ 펙토리얼 교배를 통해 얻어진 16가계 넙치의 에드워드 인위 감염 결과를 이용하여 교배 그룹, 교배 암컷, 교배 수컷의 효과를 분석하였다. 내성 친어간의 교배에 의해 생산된 교배구(RR)의 내성 지수, 생존율, 생존 일수는 각각 17.98, 13.77%, 18.36일로 나타났으나, 민감 친어간의 교배에 의해 생산된 교배구(SS)는 각각 12.46, 2.71%, 12.40일로 나타났다. 이상의 결과에서, 에드워드 질병내성 형질에 대한 가계간, 개체간 내성 정도의차이가 존재하는 것을 확인하였고, 인위 감염 결과를 이용하여 질병 저항성에 대한 선발이 가능할 것으로 판단된다.

2008년 7월부터 12월까지 양식장 2개소에서 사육중인 넙치를 대상으로 상업용 배합사료 (extruded pellet, EP) 및 습사료 (raw fish moist pellet, MP)를 급이하고, 시험 사료별로 병원체 검출률과 혈액학적 성상의 차이를 조사하였다. 그 결과, EP 사료를 먹인 시험구 (EP 그룹)가 MP 사료를 먹인 시험구 (MP 그룹)에 비해 혈청 GOT, GPT 및 glucose 성분이 높게 나타났다. 시험기간 동안의 평균 생존율과 병원체 검출률에서는 뚜렷한 차이가 없는 것으로 나타났으나, 계절적으로 수온이 높은 7월부터 10월까지 EP 그룹에 비해 MP 그룹에서 병원체 검출률이 높게 나타났다. EP 그룹에서는 Dactylogyrus sp., E. tarda 및 red seabream iridovirus (RSIV)가 주로 검출되었으며, MP 그룹에서는 Trichodina sp., Streptococcus spp. 및 viral nervous necrosis virus (VNNV)가 우점적으로 검출되었다.

본 연구는 저염분에 의한 둥근전복, Haliotis discus discus의 생리학적 변화를 조사하기 위하여 실시하였다. 생리학적 변화를 조사하기 위하여 생존율, 혈림프수, 항산화효소, Respiratory burst, Phenoloxidase, Lysozyme의 활성 및 HSP 70 mRNA 발현을 측정하였다. 둥근전복은 우선, 급격한 염분 스트레스에 따른 둥근전복의 생존율에서는 25, 30 psu 실험구에서만 48 h 째에 폐사된 개체가 발견되었다. 혈림프 수의 변화는 실험구 대부분이 시간의 경과에 따라 점차 감소하는 경향을 나타내었으나, 3 h째 30 psu에서 급격한 증가가 나타난 후 다른 실험구간의 수치와 유사한 수치로 회복되는 경향을 나타내었다. 항산화 효소인 Superoxide Dismutase (SOD)와 Catalase (CAT) 효소는 25 및 30 psu에서 높은 수치를 나타내어 저염분으로의 변화가 둥근전복의 SOD 및 CAT의 증가를 유발시키는 것으로 나타났다. 한편, Respiratory burst 활성은 실험 기간 동안 큰 변화를 나타내지 않았다. 그러나 면역활성을 나타내는 Phenoloxidase은 염분 감소 의존적으로 감소하는 경향을 나타내어, 면역력의 저하를 유발하는 것으로 나타났다. Lysozyme의 활성에 있어서도 Phenoloxidase 활성의 변화와 같은 저염분 정도에 의존하는 경향은 나타내지 않았으나, 25 psu 48 h째에 급격한 저하를 나타내었다. 저염분의 스트레스를 가하여 나타난 HSP 70 mRNA의 염색성은 가장 낮은 염분농도인 25 psu에서는 지속적으로 관찰되었으나, 33 psu에서는 염색성이 낮게 나타났다. HSP 70 mRNA에 대한 $\beta$-actin mRNA의 발현량은 33 psu에서는 실험기간 중 거의 일정하여 스트레스를 받지 않은 것으로 나타났으며, 25 psu에서는 시간의 경과에 따라 증가하다가 다시 감소하여 회복되는 결과를 나타내었다 이상의 결과로, 저염분 현상은 둥근전복에 있어서 주로 Phenoloxidase 및 Lysozyme의 면역계 활성을 낮추는 작용을 통하여 생존에 악영향을 미칠 가능성이 있는 것으로 추정된다. 또한 저염분에 의해 발생되는 항산화효소는 스트레스의 지표로 써 활용할 수 있을 것으로 여겨진다.

Haemocyte characterization in the surf clam, Mectra veneriformis was carried out based on morphological, cytochemical, and phagocytic characteristics. The haemocytes were classified into two cell types, granulocytes and agranulocytes on the basis of presence of cytoplasmic granules. Granulocytes were then classified again into 2 types, large eosinophilic granulocytes and small eosinophilic granulocytes after staining with May-Grünwald Giemsa. In electron microscopy, both types of granulocytes contained electron-dense and electron-lucent cytoplasmic granules. Agranulocytes (hyalinocytes) were also divided into two cell types, large agranulocytes and small agranulocytes based on their sizes. Both cell types did not have granules in cytoplasm. Granulocyte and agranulocyte were negative for the enzyme activities of alkaline phosphatase, peroxidase, and $\beta$-glucuronidase but positive for phenoloxidase and acid phosphatase activities. Both types of haemocytes have phagocytic activity, with the exception of small agranulocyte, and granulocytes seemed more active in this respect than agranulocytes. This present study is the first study to characterize haemocytes of M. veneriformis.

This study has shown the screening of anti-bacterial activity of three Indian medicinal plant choloroform : methanol (50:50) solvent leaf extracts (i.e. Azadirachta indica, Ocimum sanctum, and Curcuma longa) with different concentrations (10, 5, 2.5, 1.25, 0.625, 0.312, and 0.156 mg/ml) under in vitro conditions against fish pathogenic bacteria, Aeromonas hydrophila, Streptococcus iniae, Vibrio harveyi, V. anguillarum, and Edwardsiella tarda isolated from olive flounder farms, Jeju Island, South Korea. The anti-microbial activity of the A. indica and O. sanctum extracts yielded the zones of growth inhibition (ZI) was 3 and 1mm against A. hydrophila at concentration of 0.156 mg/ml when compared to that of tetracycline standard (3 mm). At highest concentration (10 mg/ml) of A. indica, O. sanctum, and C. longa, high inhibition was 9, 7, and 6 mm when compared to that of tetracycline (11 mm) against A. hydrophila. The minimum inhibitory concentration (MIC) of A. indica, O. sanctum, and C. longa at 0.156 mg/ml that yield 9, 10, and 13 CFU/ml for A. hydrophila, 16, 22, and 25 CFU/ml for S. iniae and 18, 22, and 23 CFU/ml for E. tarda compared to the tetracycline. At highest concentration (10 mg/ml) of the three extracts was better inhibiting the growth of A. hydrophila, S. iniae and E. tarda. A. indica, O. sanctum, and C. longa were determined to the potential antioxidant activityon the basis of their scavenging activity of the stable 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) free radical. A. indica extract was 0.625 mg/ml which indicated that the strong anti-oxidant activity. However, O. sanctum and C. longa extracts showed weak anti-oxidant activity at this concentration. Hence, in vitro assay among the pathogens, A. hydropila is better inhibitory activity of the extracts. It is evident that the Indian medicinal plants extracts were subjected to its effectiveness against A. hydrophila, S. iniae, and E.tarda at low concentrations. The obtained results in the present study suggested that the Indian plant extracts is a prevention tools for Korean olive flounder aquaculture pathogens and its need further advance investigation.

본 연구는 넙치, Paralichthys olivaceus에서 Edwardsiella tarda와 Streptococcus iniae에 대한 혼합백신의 효능과 안전성에 대해 조사하고자 하였다. 혼합백신을 주사한 넙치에서 2, 4, 6, 8주 째에 채혈하여 E. tarda와 S. iniae에 대한 항체가 를 microtitre 법으로 조사하였다. 백신 주사 후 3주째에 E. tarda와 S. iniae를 각각 인위감염 시켰을 때 백신구에서 81.0-92.8%의 높은 상대생존율을 보여 혼합백신에 의한 항병력의 증가가 확인되었다. 백신 주사 후 초기에 백신구가 대조구에 비해 체중 증가가 느렸으나 사육기간이 길어지면서 회복되어 대조구와 백신구 체중의 차이를 보이지 않았다. 이 결과는 백신 주사가 넙치의 성장에 영향을 주지 않고 에드와드병과 연쇄구균증을 예방할 수 있음을 보여준다.

본 연구에서는 능성어를 대상으로 항체 검출 ELISA법을 적용하기 위한 기초 연구로서 능성어 혈청의 보존 조건에 따른 IgM의 안정성을 검토하였으며, 또한 항체 검출 ELISA법을 통해 능성어의 특이 항체반응을 조사하였다. 항 BSA 능성어 혈청을 사용하여 보존 온도 (-80, -20 및 4${^{\circ}C}$) 및 기간 (1, 34, 61 및 119일)에 따른 ELISA값을 비교한 결과, 모든 시료에 서 뚜렷한 O.D.값의 차이는 확인되지 않았다. -80${^{\circ}C}$ 및 -20${^{\circ}C}$에 보존된 혈청을 사용하여 해동 횟수 (1, 5, 10회)에 따른 ELISA O.D.값을 비교한 결과, 해동을 반복한 혈청 및 미동결 혈청의 O.D.값은 뚜렷한 차이를 보이지 않았다. 이상의 결과로 능성어 혈청은 -80, -20 및 4${^{\circ}C}$에서 119일간 보존하거나 10회 반복 해동하여도 능성어 IgM의 안정함이 확인되었다. 사육수온에 따른 능성어의 특이적 항체 반응을 조사한 결과, 20${^{\circ}C}$에서 사육중인 능성어에서 는 BSA 면역 후 14일째부터 BSA에 대한 특이 항체가 확인되었고, 21일-28일에 가장 높은 항체가를 나타냈으며 그 후 항체가는 서서히 떨어졌으나 면역 70일째에도 BSA에 대한 특이 항체는 관찰되었다. 반면 25${^{\circ}C}$에서 사육중인 능성어에서는 7일째부터 항체가가 확인되었고, 14일-21일 가장 높은 항체가를 나타냈으며 그 후 항체가는 서서히 떨어져 면역 70일째에는 0.4-1.6의 O.D. 값이 관찰되었다. 이상의 결과로 능성어의 특이 항체 반응은 20${^{\circ}C}$보다 25${^{\circ}C}$에서 항체 형성이 빠르고 항체가도 높게 나타나는 것이 확인되었으며, 또한 20${^{\circ}C}$와 25${^{\circ}C}$에서 사육중인 능성어에서 특이 항체반응은 약 2달간 지속됨이 확인되었다.

Natural-killer-cell-enhancing factor (NKEF) belongs to the newly defined peroxiredoxin (Prx) family. It was originally isolated from human erythroid cells. The black rockfish NKEF cDNA was identified through the expressed sequence tag (EST) analysis of PBLs libraries. The full-length NKEF cDNA was 1433 bp long and contained an open reading frame (ORF) of 594 bp that encoded 198 amino-acid residues. The 5' UTR had a length of 39 bp, and the 3’UTR 800 bp. The deduced amino-acid sequence of the black rockfish had a density 93.4, 92.9, 87.8, 85.8, 84.8, 83.8, 80.3, 79.7, 77.2, and 75.2% that of the pufferfish, olive flounder, channel catfish, zebrafish, chicken, common carp, Myotis lucifugus, cattle, human PrxI, rat PrxI, human NKEF-A, and Xenopus tropicalis, respectively. The NKEF gene was expressed in all the tissues of the black rockfish. The RT-PCR indicated that the NKEF transcripts were predominantly in the spleen and gill, less dominantly in the PBLs, head kidney, trunk kidney, and liver, and least in the intestine and muscles. This is the first report on the existence of the NKEF-A gene in black rockfish.

We constructed a rock bream Oplegnathus fasciatus leukocyte cDNA library and a total of 795 expressed sequence tag (EST) clones were generated. Gene annotation procedures and homology searches of the sequenced ESTs were locally done by BLASTX for amino acid similarity comparisons. Of the 795 EST clones, 491 different ESTs showed significant homology to previously described genes while 304 ESTs were unidentified, hypothetical, or unnamed proteins. Encoding 121 different sequences were identified as putative bio-defense genes or genes associated with immune response.

오매 추출물 첨가 사료의 투여가 양식 뱀장어의 비특이적 면역 반응에 미치는 효과를 조사하였다. 그 결과, 뱀장어의 혈청 내 lysozyme의 활성을 증가시키는 것으로 나타났고, 점액 내 lysozyme 및 혈청의 살균능에 있어서는 차이를 나타내지 않았다. 혈청 내 lysozyme의 활성은 추출물 첨가 사료 투여 후 2주째에 증가하기 시작하여 5주째에 가장 높은 것으로 나타났다. 어류 병원성 세균인 Edwardsiella tarda와 Aeromonas hydrophila 균에 대한 저항성 실험에 서 오매 추출물 첨가 사료을 투여한 실험구가 대조구에 비해 세균에 대한 저항성이 높게 나타났다. 또한 오매 추출물 첨가 사료를 투여한 실험구에서 대조구에 비해 성장이 좋게 나타났다.

목적 유전자를 숙주 세포의 게놈에 삽입하거나 발현하는데 있어서, retrovirus 매개의 유전자 전달 시스템을 사용하게 되면, 복잡하고 힘든 절차를 거치게 된다. 본 연구에서는 목적 유전자의 BF-2 세포 게놈 내 삽입을 하기 위해, UV로 불활화한 어류 레트로바이러스인 SnRV를 사용한 간단한 방법에 대해 조사하였다. 우선, BF-2 세포를 사용한 transfection을 위해 Lipofectamine 2000과 Transome을 사용하여 최적 조건을 결정하였다. 0.5 $\mu\ell$ Lipofectamine 2000을 사용한 경우 0.5, 1 그리고 2 $\mu{g}$ DNA 사용에 대해 33.8, 40.6 그리고 40.2%의 transfection 효율을 보인 동시에 최소 80 % 이상의 높은 세포 생존율을 나타낸 반면, Transome을 사용한 transfection 효율은 모두 5% 이하였다. UV 처리 시간에 있어서는 5분간의 UV 처리로 SnRV의 감염성이 불활성화되는 것을 확인하였다. 다음으로 GFP 유전자의 양측에 SnRV에서 유래된 LTR 서열을 접하고 있는 cassette를 구축한 뒤 BF-2 세포에 transfection 하고, cassette 유전자의 삽입과 발현을 위해 UV로 불활화한 SnRV를 처리하였다. 그 결과 UV로 불활화한 SnRV를 1회 처리 또는 SnRV 무처리 BF-2 세포에서는 형광이 관찰되지 않았던 반면, 3회와 5회 처리한 BF-2 세포에서 형광발현이 확인되었다. 이러한 결과로, GFP 유전자가 불활화한 SnRV를 이용하여 BF-2 세포 게놈에 삽입되는 것을 확인하였다.

Analysis of expressed sequence tags (ESTs) is an efficient approach for gene discovery, expression profiling, and development of resources useful for functional genomics studies. As part of studies on the immune system of olive flounder, a total of 251 EST sequences from gill cDNA library were generated to identify and characterize important genes in the immune machanisms of olive flounder. Of the 251 clones, 126 clones (50.2%) were identified as orthologues of known genes from olive flounder and other organisms. Among the 126 EST clones, 16 clones (12.7%) were representing 9 unique genes identified as homologous to the previously reported olive flounder ESTs, 100 clones (79.4%) representing 103unique genes were identified as orthologs of known genes from other organisms. We also identified several kinds of immune associated proteins, indicating EST as a powerful method for identifying immune related genes of fish as well as identifying novel genes. Further studies using cDNA microarrays are needed to identify the differentially expressed transcripts after disease infection.

Genetic identification of 17 fish-derived Aeromonas strains was attempted using 5 housekeeping genes. 16S rRNA, gyrB, rpoD, dnaJ and recA genes from the 17 strains were amplified, and total of 85 amplicons were sequenced. DNA sequences of the strains and type strains of the 17 Aeromonas homology groups were used for genetic identification and phylogenetic analyses. None of the strains was identified as a single species using the 16S rRNA gene, showing the same identities (average = 99.7%) with several Aeromonas species. According to gyrB, rpoD, dnaJ, and recA, 9 strains and RFAS-1 used in this study were identified as A. hydrophila and A. salmonicida, respectively. However, the other strains were closely related to 2 or more Aeromonas species (i.e., A. salmonicida, A. veronii, A. jandaei, A. media and A. troda) depending on the genetic marker used. In this study, gyrB, rpoD, dnaJ and recA gene sequences proved to be advantageous over 16S rRNA for the identification of field Aeromonas isolates obtained from fish. However, there are discrepancies between analyses of different phylogenetic markers, indicating there are still difficulties in genetic identification of the genus Aeromonas using the housekeeping genes used in this study. Advantages and disadvantages of each housekeeping gene should be taken into account when the gene is used for identification of Aeromonas species.

2008년 5월 제주지역 하천에 소하하는 은어 중 일부개체가 주둥이 부식 또는 체표궤양증상을 보이면서 폐사하였다. 어류 질병원인균 중 부식증 및 체표궤양과 연관성이 높은 Flavobac-terium 속 세균의 분리를 위해 Shu-Shott medium 및 R2A medium에 주둥이 부식 및 체표궤양 부위를 도말하여 배양 하였고, Flavobacterium 속 세균의 전형적인 집락인 pale yellow colony를 분리하였다. 16S rDNA 염기서열 분석결과 Flavobacterium succinicans DSM 4002(Accession NO. AM230492)와 98.27%의 상동성을 보여 F. succinicans JMFL55로 동정하였다.