최근 다중 응용 프로그램이 적재된 스마트카드는 여러 가지 장점들로 인해서 많은 관심을 끌고 있다. 일반 사용자들은 지갑에 가지고 다니는 다양한 기능을 가지고 있는 카드의 수를 줄이기를 원하고 있으며 카드 발행자는 카드의 발행 이 후 새로운 응용 프로그램을 추가하거나 기존의 응용 프로그램을 업그레이드시키기 위해서, 개발자들은 개발 기간 단축 가능성 등의 요구로 인해 다중 응용 프로그램을 지원하는 스마트카드의 사용이 활성화되고 있는 추세에 있다. 또한, 다중응용프로그램 스마트카드 서비스는 사업 파트너 상호간의 비즈니스 상승효과 측면에서 볼 때도 아주 많은 장점을 가지고 있는 실정이다. 최근에는 자바카드, MULTOS 와 같은 다중응용프로그램 스마트카드를 지원하기 위한 운영체제가 제안되었다. 본 논문에서는 스마트카드의 산업계 표준으로 자리잡아 가고 있는 자바카드를 중심으로 다중응용프로그램 스마트카드의 작동 원리를 연구하고 이와 관련된 여러 가지 보안 측면에서의 문제점을 파악한 뒤 키 관리 기법, 응용프로그램 다운로드 방안, 보안 해결 기법 등을 제안한다.