Halenia coreana is an endangered, endemic species that is distributed in only a few locations in Korea, such as Mts. Hwaaksan and Daeamsan. It has been recently segregated from H. corniculata, broadly distributed in cold temperate regions that include northern Japan, the Russian Far East, northeastern China, Mongolia, and eastern Europe, where population sizes are usually large. To examine the genetic diversity of H. coreana and evaluate the level of genetic differentiation of the species compared with that of H. corniculata, we surveyed 183 candidate simple sequence repeats (SSR) motif markers for H. coreana and H. corniculata from sequence data of amplified fragments of a specific length in the genome. A total of 17 genomic-SSR markers were selected to examine the levels of genetic diversity and differentiation using 17 samples of H. coreana and 60 samples of three populations of H. corniculata. The results here suggest that the genetic diversity of H. coreana is very low with a high frequency of inbreeding within its population. We found that H. coreana is genetically differentiated from H. corniculata, supporting the recognition of the geographically isolated H. coreana as a distinct species.
Charcoal rot disease, caused by the fungus Macrophomina phaseolina, is one of the most important diseases of Sesame (Sesamum indicum) all over the world. However, the population biology of M. phaseolina is poorly understood. In this study, M. phaseolina isolates from five different regions of Iran (Khuzestan, Fars, Bushehr, Hormozgan, and Kohgiluyeh & Boyer-Ahmad provinces) (n=200) were analyzed for genetic variation using inter simple sequence repeats marker. In total, 152 unique haplotypes were identified among the 200 M. phaseolina isolates, and gene diversity (H=0.46-0.84) and genotypic diversity were high in each of the regions. The structure analysis clustered five Iranian populations into two distinct groups, the individuals from group 1 were assigned to the Bushehr population and the individuals from Khuzestan, Fars, Hormozgan and Kohgiluyeh & Boyer-Ahmad were aggregated and formed group 2. The results matched with genetic differentiation and gene flow among regions. Analyses of the distribution of gene diversity within and among five Iranian populations were 61% and 39%, respectively. Our results showed that infected seeds are thought to be the dominant mechanism responsible for the spreading of the pathogen in southern parts of Iran. In summary, it is essential to have local quarantine and prevent seed exchanges between geographical populations to restrict the dispersal of pathogen over long distances and provide certified seeds in Iran.
Genetic heterogeneity of the tropical abalone, Haliotis asinina was examined using randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) and microsatellite analyses. One hundred and thirteen polymorphic RAPD fragments were generated. The percentage of polymorphic bands of H. asinina across overall primers was 85.20%. The average genetic distance of natural samples within the Gulf of Thailand (HACAME and HASAME) was 0.0219. Larger distance was observed when those samples were compare with HATRAW from the Andaman Sea (0.2309 and 0.2314). Geographic heterogeneity and $F_{ST}$ analyses revealed population differentiation between H. asinina from the Gulf of Thailand and the Andaman Sea (p < 0.0001). Three microsatellite loci (CUHas1, CUHas4 and CUHas5) indicated relatively high genetic diversity in H. asinina (total number of alleles = 26, 5, 23 and observed heterozygosity = 0.84, 0.42 and 0.33, respectively). Significant population differentiation was also found between samples from different coastal regions (p < 0.0001). Therefore, the gene pool of natural H. asinina in coastal Thai waters can be genetically divided to 2 different populations; the Gulf of Thailand (A) and the Andaman Sea (B).
It has been reported that bone marrow (BM)-side population (SP) cells, with hematopoietic stem cell activity, can transdifferentiate into cardiomyocytes and contribute to myocardial repair. However, this has been questioned by recent studies showing that hematopoietic stem cells (HSCs) adopt a hematopoietic cell lineage in the ischemic myocardium. The present study was designed to investigate whether BM-SP cells can in fact transdifferentiate into functional cardiomyocytes. Phenotypically, BM-SP cells were $19.59%{\pm}9.00\;CD14^+$, $8.22%{\pm}2.72\;CD34^+$, $92.93%{\pm}2.68\;CD44^+$, $91.86%{\pm}4.07\;CD45^+$, $28.48%{\pm}2.24\;c-kit^+$, $71.09%{\pm}3.67\;Sca-1^+$. Expression of endothelial cell markers (CD31, Flk-1, Tie-2 and VEGF-A) was higher in BM-SP cells than whole BM cells. After five days of co-culture with neonatal cardiomyocytes, $7.2%{\pm}1.2$ of the BM-SP cells expressed sarcomeric ${\alpha}$-actinin as measured by flow cytometry. Moreover, BM-SP cells co-cultured on neonatal cardiomyocytes fixed to inhibit cell fusion also expressed sarcomeric ${\alpha}$-actinin. The co-cultured BM-SP cells showed neonatal cardiomyocyte-like action potentials of relatively long duration and shallow resting membrane potential. They also generated calcium transients with amplitude and duration similar to those of neonatal cardiomyocytes. These results show that BM-SP cells are capable of functional cardiomyogenic differentiation when co-cultured with neonatal cardiomyocytes.
Human pluripotent stem cells (hPSCs) include human embryonic stem cells (hESCs) derived from blastocysts and human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) generated from somatic cell reprogramming. Due to their self-renewal ability and pluripotent differentiation potential, hPSCs serve as an excellent experimental platform for human development, disease modeling, drug screening, and cell therapy. Traditionally, hPSCs were considered to form a homogenous population. However, recent advances in single cell technologies revealed a high degree of variability between individual cells within a hPSC population. Different types of heterogeneity can arise by genetic and epigenetic abnormalities associated with long-term in vitro culture and somatic cell reprogramming. These variations initially appear in a rare population of cells. However, some cancer-related variations can confer growth advantages to the affected cells and alter cellular phenotypes, which raises significant concerns in hPSC applications. In contrast, other types of heterogeneity are related to intrinsic features of hPSCs such as asynchronous cell cycle and spatial asymmetry in cell adhesion. A growing body of evidence suggests that hPSCs exploit the intrinsic heterogeneity to produce multiple lineages during differentiation. This idea offers a new concept of pluripotency with single cell heterogeneity as an integral element. Collectively, single cell heterogeneity is Janus-faced in hPSC function and application. Harmful heterogeneity has to be minimized by improving culture conditions and screening methods. However, other heterogeneity that is integral for pluripotency can be utilized to control hPSC proliferation and differentiation.
북방종개(Iksookimia pacifica)의 유전적 다양성과 구조적 특징을 밝히기 위해 동해 독립하천들에 서식하는 10개의 집단들을 대상으로 핵유전자와 미토콘드리아 유전자에 기반한 집단유전학적 분석을 실시하였다. 일부 예외적인 경우를 제외하고, 미토콘드리아와 핵유전자 모두 통계적으로 유의미한 집단 간 유전적 분화가 관찰되었다. 핵유전자들의 DNA 서열자료에서 추출한 유전자형 자료를 Bayesian 방법으로 분석한 결과 북방종개는 천진천과 양양남대천을 기준으로 북쪽과 남쪽의 두 개의 그룹으로 나뉘는 구조를 보였다. 현재 동해 하천들이 지리적으로 단절되어 온 독립 수계라는 것을 감안했을 때, 남북으로 구별되는 집단유전적 구조는 북방종개가 한반도에 정착했던 초기 조상 집단이 남북으로 갈라지는 지리적인 분리 사건과 관련되었을 것으로 해석되며, 이러한 초기 조상집단의 지리적 분리 이후, 두 조상그룹들은 남북의 지리적인 범위 내에서 하천 별 고립에 따른 추가적인 분화 과정을 거쳤을 것으로 추정된다. 주목할 점으론, 자산천 집단의 많은 개체들이 지리적 거리가 먼 양양남대천 및 강릉남대천 집단과 하나의 유전적 cluster를 형성하고 있는 것이다. 이와 함께 미토콘드리아 유전자의 경우 몇몇 이웃하는 집단들 사이에 현저히 낮은 유전적 분화도 그리고 일부 집단들에서 매우 낮은 유전적 다양성이 관찰되었다. 본 집단유전학적 결과는 향후 북방종개의 보존 및 관리를 위한 기초자료로 제시될 것이다.
Kim, Eun-Hye;Shin, Jae-Kwon;Jeong, Keum-Seon;Lee, Chang-Seok;Chung, Jae-Min
Journal of Ecology and Environment
/
제42권3호
/
pp.111-119
/
2018
Background: Juniperus chinensis L. populations are distributed locally on several areas including coastal cliffs which are difficult to access in the central eastern Korea. Wild populations inhabit relatively barren environments such as rocky areas and cliffs, which are very sensitive to even minor environmental disturbances including artificial interventions and natural disturbances, and thus demonstrate great fluctuations in the population size and density. This study aims to analyze the genetic diversity, differentiation, and genetic structure of each population in order to provide useful data required to establish a substantial conservation strategy of J. chinensis. Results: The genetic diversity of J. chinensis at the population level (P = 78.7%, h = 0.282, S.I. = 0.420) was somewhat higher compared with those measured in the same genus, Juniperus. The genetic differentiation degree among nine populations established naturally in central eastern Korea was 11.50% and that among sub-populations within the same area was 5.52%. On the other hand, genetic variation of individuals within the populations was 82.93%. But frequency of the main allele was different among loci. In particular, fixation of allele frequency and occurrence of rare allele in the highly isolated population suggest a likelihood that genetic drift would occur in populations of this plant. As the result of analysis on the genetic structure of nine populations, nearby populations and isolated populations tended to form separate clusters from each other as the hypothetical number of clusters (K) increase. Conclusions: This result implies that if the population size of J. chinensis is reduced due to environmental change and artificial and/or natural disturbances in the future, it could affect negatively on the genetic diversity of the plant species. In order to maintain and conserve genetic diversity of J. chinensis, ecological network, which can help genetic exchange among the local populations, should be prepared, and conservation strategies in situ as well as ex situ are also required with continuous monitoring.
Morphological and ecological comparions are made between specimens of Cobitis koreensis KIM and the geographically restricted population of the Cobitid fish which is found along the Begchon stream, Puangun, Cholla-bugdo province over a 12-month period of 1982 and 1983. The Begchon population is tentatively identified as Cobitis koreensis, but the color patterns and two morphometric proportions differ widely fromthose reported previously for this species. In addition to these character, it is easily distinguished from C. koreensis by the smaller body size, by having the larger egg size and the less egg number in female during the breeding season. As the differentiation of this population is primarily due to geographically isolation, it is supposed that Begchon cobitid population may be an undescribed distinct subspecies of K. koreensis or above the conventional subspecies level.
Stem cells have self-renewal capacity, long-term viability, and multiline age potential. Adult bone marrow contains mesenchymal stem cells. Bone marrow-derived mesenchymal stem cells (BMSCs) are progenitors of skeletal tissue components and can differentiate into adipocytes, chondrocytes, osteoblasts, and myoblasts in vitro and undergo differentiation in vivo. However, the clinical use of BMSCs has presented problems, including pain, morbidity, and low cell number upon harvest. Recent studies have identified a putative stem cell population within the adipose tissue. Human adipose tissue contains pluripotent stem cells simillar to bone marrow-derived stem cells that can differentiate toward the osteogenic, adipogenic, myogenic, and chondrogenic lineages. Human adipose tissue-derived stem cells (ATSCs) could be proposed as an alternative source of adult bone marrow stem cells, and could be obtained in large quantities, under local anesthesia, with minimal discomfort. Human adipose tissue obtained by liposuction was processed to obtain ATSCs. In this study, we compared the osteogenic differentiation of ATSCs in a specific osteogenic induction medium with that in a non-osteogenic medium. ATSCs were incubated in an osteogenic medium for 28 days to induce osteogenesis respectively. Osteogenic differentiation was assessed by von Kossa and alkaline phosphatase staining. Expression of osteocyte specific bone sialoprotein, osteocalcin, collagen type I and alkaline phosphatase, bone morphogenic protein 2, bone morphogenic protein 6 was confirmed by RT-PCR. ATSCs incubated in the osteogenic medium were stained positively for von Kossa and alkaline phosphatase staining. Expression of osteocyte specific genes was also detected. Since this cell population can be easily identified through fluorescence microscopy, it may be an ideal source of ATSCs for further experiments on stem cell biology and tissue engineering. The present results show that ADSCs have an ability to differentiate into osteoblasts. In the present study, we extend this approach to characterize adipose tissue-derived stem cells.
Hong, Kyung Nak;Kim, Young Mi;Park, Yu Jin;Lee, Jei Wan
한국자원식물학회지
/
제27권6호
/
pp.660-670
/
2014
The Korean plum yew (Cephalotaxus koreana Nakai) is a shade-tolerant, coniferous shrub. The seeds have been used as a folk medicine in Korea, and an alkaloid extract (HTT) is known to have anticancer properties. We estimated the genetic diversity of 429 trees in 16 populations in South Korea using 194 polymorphic amplicons from seven combinations of AFLP primer-restriction enzymes. The average number of effective alleles and the percentage of polymorphic loci were 1.37 and 79.4%, respectively. Shannon's diversity index and the expected heterozygosity were 0.344 and 0.244, respectively. We divided 16 populations into four groups on the UPGMA dendrogram and the PCA biplot. The first two principal components explained 84% of the total genetic variation. Genetic differentiation between populations explained 14% of total genetic variation, and the remaining 86% came from difference between individuals within populations, as determined by an analysis of molecular variance (AMOVA). However, the genetic differentiation did not correlate with the geographic distance between populations from the Mantel test. The Bayesian statistics, which are comparable to Wright's $F_{ST}$ and Nei's $G_{ST}$, were ${\theta}^I=0.406$ and ${\theta}^{II}=0.172$, respectively. The population genetic diversity was slightly lower, and the strength of genetic differentiation was much weaker, than the average of those plants having similar life histories, as assessed using arbitrary marker systems. We discuss strategies for the genetic conservation of the plum yew in Korea.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.