• 제목/요약/키워드: endophytic fungi

검색결과 179건 처리시간 0.033초

생강나무(Lindera obtusiloba)의 잎에서 분리한 내생균의 다양성 (Diversity of Foliar Endophytic Fungi Isolated from Lindera obtusiloba in Korea)

  • 김창균;어주경;엄안흠
    • 한국균학회지
    • /
    • 제40권3호
    • /
    • pp.136-140
    • /
    • 2012
  • 생강나무에 공생하는 내생균의 다양성을 확인하기 위하여, 강원도 4 개 지역에서 병증이 없는 생강나무 잎을 채집하여 내생균을 분리하였다. 분리된 내생균의 rDNA의 ITS지역을 분석한 결과, Alternaria alternata, Annulohypoxylon annulatum, Creosphaeria sassafras, Diaporthe eres, Discosia sp., Epicoccum nigrum, Glomerella acutata, Glomerella cingulata, Paraconiothyrium brasiliense, Pestalotiopsis neglecta, Phomopsis amygdali, Xylaria sp.의 총 7과 11속 12종이 확인되었으며 Phomopsis amygdali가 모든 연구 지역의 생강나무 잎에서 가장 높은 빈도로 분리되었으며 채집지에 따라 내생균의 종 다양성에 차이가 있음을 확인하였다.

새우난초와 은대난초 뿌리에서 분리한 내생균의 다양성 (Diversity of Endophytic Fungi Associated with Roots of Calanthe discolor and Cephalanthera longibracteata in Korea)

  • 이봉형;엄안흠
    • 한국균학회지
    • /
    • 제46권4호
    • /
    • pp.427-435
    • /
    • 2018
  • 본 연구에서는 충남, 제주, 경남, 충북 등에서 새우난초(Calanthe discolor)와 은대난초(Cephalanthera longibracteata)의 뿌리를 채취하여 표면살균한 후 내생균을 순수분리 하였다. 분리된 내생균의 형태학 특징을 관찰하고 internaltranscribed spacer (ITS) rDNA영역의 염기서열을 ITS1F와 ITS4프라이머를 이용하여 분석하였다. 서로 다른 지역에서 채집한 새우난초와 은대난초이지만, 공통적으로 Leptodontidium orchidcola가 높은 상대수도와 빈도를 나타냈으며, 내생균류의 군집차이를 분석할 결과, 지역적 차이보다는 숙주에 의한 차이가 더 큰 영향을 미치는 것으로 나타났다.

Endophytic fungi harbored in Panax notoginseng: diversity and potential as biological control agents against host plant pathogens of root-rot disease

  • Zheng, You-Kun;Miao, Cui-Ping;Chen, Hua-Hong;Huang, Fang-Fang;Xia, Yu-Mei;Chen, You-Wei;Zhao, Li-Xing
    • Journal of Ginseng Research
    • /
    • 제41권3호
    • /
    • pp.353-360
    • /
    • 2017
  • Background: Endophytic fungi play an important role in balancing the ecosystem and boosting host growth. In the present study, we investigated the endophytic fungal diversity of healthy Panax notoginseng and evaluated its potential antimicrobial activity against five major phytopathogens causing root-rot of P. notoginseng. Methods: A culture-dependent technique, combining morphological and molecular methods, was used to analyze endophytic fungal diversity. A double-layer agar technique was used to challenge the phytopathogens of P. notoginseng. Results: A total of 89 fungi were obtained from the roots, stems, leaves, and seeds of P. notoginseng, and 41 isolates representing different morphotypes were selected for taxonomic characterization. The fungal isolates belonged to Ascomycota (96.6%) and Zygomycota (3.4%). All isolates were classified to 23 genera and an unknown taxon belonging to Sordariomycetes. The number of isolates obtained from different tissues ranged from 12 to 42 for leaves and roots, respectively. The selected endophytic fungal isolates were challenged by the root-rot pathogens Alternaria panax, Fusarium oxysporum, Fusarium solani, Phoma herbarum, and Mycocentrospora acerina. Twenty-six of the 41 isolates (63.4%) exhibited activity against at least one of the pathogens tested. Conclusion: Our results suggested that P. notoginseng harbors diversified endophytic fungi that would provide a basis for the identification of new bioactive compounds, and for effective biocontrol of notoginseng root rot.

무안 염습지에 자생하는 염생식물(halophyte)의 뿌리로부터 분리된 내생진균(endophytic fungi)의 유전학적 다양성 (Genetic Diversity of Culturable Endophytic Fungi Isolated from Halophytes Naturally Growing in Muan Salt Marsh)

  • 유영현;윤혁준;서영교;김미애;강명석;김창무;하상철;조가연;김종국
    • 생명과학회지
    • /
    • 제22권7호
    • /
    • pp.970-980
    • /
    • 2012
  • 90종의 내생진균(endophytic fungi)은 염습지에 자생하고 있는 염생식물(halophyte)의 뿌리에서 분리하였다. 자생식물 샘플은 해홍나물, 갯질경, 칠면초, 갯잔디, 갈대가 염습지로부터 분리하였다. 그리고 분리된 내생진균들은 ITS1, 5.8S와 ITS2를 포함하는 ITS-rDNA 영역에 의해 분석하였다. 다양한 내생진균은 Capnodiales (4.44%), Cystofilobasidiales (1.11%), Dothideales (3.33%), Eurotiales (53.33%), Glomerellales (3.33%), Hypocreales (8.89%), Mucorales (1.11%), Pleosporales (15.56%), Sordariales (1.11%), Trichosphaeriales (1.11%), unidentified (6.67%) 등 10종류 목에 속하는 것이 확인되었다. 90종의 내생진균은 속(genus)단계에서 Acremonium 속, Alternaria 속, Aspergillus 속, Aureobasidium 속, Cephalosporium 속, Chaetomium 속, Cladosporium 속, Colletotrichum 속, Cryptococcus 속, Didymella 속, Dothideomycete 속, Emericellopsis 속, Epicoccum 속, Eupenicillium 속, Fusarium 속, Gibberella 속, Gongronella 속, Macrophoma 속, Microsphaeropsis 속, Nigrospora 속, Paecilomyce 속, Paraconiothyrium 속, Penicillium 속, Phaeomyces 속, Phoma 속, Pleosporales 속, Purpureocillium 속, 그리고 Talaromyces 속으로 모두 28속이 확인되었다. 그리고 동정된 모든 내생진균은 Eurotiales목의 Aspergillus속과 Penicillium속이 가장 많이 분포하고 있는 것이 확인되었다.

Antioxidant and Antifungal Activity of Endophytic Fungi Associated with Agarwood Trees

  • Hidayat, Asep;Turjaman, Maman;Faulina, Sarah Asih;Ridwan, Fadel;Aryanto, Aryanto;Najmulah, Najmulah;Irawadi, Tun Tedja;Iswanto, Apri Heri
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
    • /
    • 제47권4호
    • /
    • pp.459-471
    • /
    • 2019
  • Several species of Aquilaria and Gyrinops are native to Indonesia and well known as agarwood-producing trees with a high economic value. Their bioactive compounds have a wide spectrum of uses, such as in medicine and cosmetics. These genera have undergone extensive search for novel bioactive compounds. The purpose of this study was to isolate, identify, and characterize the endophytic fungi community associated with Aquilaria malaccensis, A. microcarpa, Gyrinops versteegii, and A. crassna trees and investigate their bioactive properties as antioxidant agents and antagonists. A total of 50 fungi were successfully isolated from different tissues of the four species of agarwood-producing trees. Two isolates exhibited strong antioxidant activity, namely, Apodus oryzae (R2MC3A, $IC_{50}$ 60.92 mg/mL) and Diaporthe sp. (P1DS1[C], $IC_{50}$ 76.65 mg/mL). Two isolates, Pestalotiopsis theae (P3BS3[B]) and Curvularia sp. (P2CD3A), showed >75% antifungal activity against pathogenic Fusarium solani. The results revealed that endophytic fungi associated with the studied agarwood-producing trees had potential antioxidant and antifungal activities for further applications in biotechnology.

구상나무와 주목의 침엽에서 분리된 국내 미기록 내생균 (New Records of Endophytic Fungi Isolated from Leaves of Abies koreana and Taxus cuspidata in Korea)

  • 박혁;김동여;김새롬;엄안흠
    • 한국균학회지
    • /
    • 제46권3호
    • /
    • pp.241-248
    • /
    • 2018
  • 제주도 한라산의 구상나무와 주목의 침엽에서 내생균을 분리하였다. 분리된 균주들은 형태적 특성 및 internal transcribed spacer 영역, large subunitrDNA 영역 및 translation elongation factor 영역 염기서열의 계통분석을 통해 종을 동정하였다. 그 결과 4종의 국내 미기록 내생균을 확인하였고, 확인된 종은 각각 Lachnellula hyalina, Ochrocladosporium elatum, Phacidium lacerum, Phyllosticta cussoniae이다. 확인된 4종의 미기록 내생균 균주의 형태적 특성 및 염기서열 계통분석의 결과에 대해 기술하였다.

Distribution and Antifungal Activity of Endophytic Fungi in Different Growth Stages of Chili Pepper (Capsicum annuum L.) in Korea

  • Paul, Narayan Chandra;Deng, Jian Xin;Sang, Hyun-Kyu;Choi, Young-Phil;Yu, Seung-Hun
    • The Plant Pathology Journal
    • /
    • 제28권1호
    • /
    • pp.10-19
    • /
    • 2012
  • This study investigated the distribution of endophytic fungi obtained from the surface sterilized tissues of leaves, stems and roots of chili pepper ($Capsicum$ $annuum$ L.) plants in seedling, flowering and fruiting stages in Korea and their antifungal activity. A total of 481 isolates were recovered and were identified using molecular techniques. Based on rDNA ITS gene sequence and phylogenetic analysis, 21 fungal genera were characterized, belonging to 16 Ascomycota and 5 Basidiomycota. $Penicillium$ in seedling stage, $Fusarium$ in flowering stage, $Colletotrichum$ followed by $Fusarium$, $Alternaria$ and $Xylaria$ in fruiting stage was predominant and $Alternaria$, $Cladosporium$ and $Fusarium$ were common in all growth stages. Among 481 endophytes 90 phenotypes were evaluated for the antimicrobial activity against three major pathogens ($Phytophthora$ $capsici$, $Colletotrichum$ $acutatum$ and $Fusarium$ $oxysporum$) of chili pepper. Among them 16 isolates inhibited the growth of at least one test microorganisms. Three strains showed a broad spectrum antifungal activity and displayed strong inhibition against chili pepper pathogenic fungi.

The Biosynthesis Pathway of Swainsonine, a New Anticancer Drug from Three Endophytic Fungi

  • Ren, Zhenhui;Song, Runjie;Wang, Shuai;Quan, Haiyun;Yang, Lin;Sun, Lu;Zhao, Baoyu;Lu, Hao
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제27권11호
    • /
    • pp.1897-1906
    • /
    • 2017
  • Swainsonine (SW) is the principal toxic ingredient of locoweed plants that causes locoism characterized by a disorder of the nervous system. It has also received widespread attention in the medical field for its beneficial anticancer and antitumor activities. Endophytic fungi, Alternaria sect. Undifilum oxytropis isolated from locoweeds, the plant pathogen Slafractonia leguminicola, and the insect pathogen Metarhizium anisopliae, produce swainsonine. Acquired SW by biofermentation has a certain foreground and research value. This paper mainly summarizes the local and foreign literature published thus far on the swainsonine biosynthesis pathway, and speculates on the possible regulatory enzymes involved in the synthesis pathway within these three fungi in order to provide a new reference for research on swainsonine biosynthesis by endophytic fungi.

목본식물 잎에서 분리된 Phyllosticta 속의 국내 미기록종 내생균 (Unrecorded Endophytic Fungi Belonging to Genus Phyllosticta Isolated from Leaves of Woody Plants)

  • 박혁;이종철;권주희;이향범;엄안흠
    • 한국균학회지
    • /
    • 제49권1호
    • /
    • pp.81-86
    • /
    • 2021
  • 전남 여수 금오산의 청미래덩굴 잎과 경남 통영 한산도의 삼나무 침엽을 표면살균하여 내생균을 분리하였다. 분리된 균주는 internal transcribed spacer (ITS), large subunit rDNA (LSU), translation elongation factor 1-α DNA (TEF)의 염기서열을 이용한 계통분석 및 형태적 특성을 이용하여 동정하였다. 본 연구에서 Phyllosticta 속에 속하는 두 종의 국내 미기록종 내생균이 확인되었으며, 확인된 종은 Phyllosticta ericaum과 Phyllosticta philoprina이다. 두 종의 내생균 균주에 대해 형태적 특성 및 계통분석의 결과를 보고하고자 한다.

부안갯벌 생태계 복원을 위한 칠면초와 해홍나물의 내생진균류에 대한 유전학적 다양성 분석 (Analysis of Genomic Diversity of Endophytic Fungal Strains Isolated from the Roots of Suaeda japonica and S. maritima for the Restoration of Ecosystems in Buan Salt Marsh)

  • 유영현;윤혁준;서영교;김미애;신재호;이인중;추연식;김종국
    • 한국미생물·생명공학회지
    • /
    • 제40권4호
    • /
    • pp.287-295
    • /
    • 2012
  • 부안갯벌에서 채집된 염생식물 칠면초와 해홍나물의 뿌리로부터 84종의 내생진균을 분리 및 동정하였다. 염생식물 샘플은 칠면초와 해홍나물이 부안갯벌로부터 분리되었다. 모든 내생진균류들은 ITS1, 5.8s와 ITS2를 포함하는 ITS영역의 서열에 의해 분석되었다. 내생진균류들은 Pleosporales (45%), Eurotiales (27%), Incertae sedis (11%), Dothideales (6%), Capnodiales (5%), Hypocreales (5%), 및 Agaricales (1%)에 해당하는 것을 확인하였다. 내생진균류는 자낭균문과 담자균문의 Alternaria속, Ascomycota속, Aspergillus속, Aureobasidium속, Cladosporium속, Eupenicillium속, Fusarium속, Gibberella속, Hocrea속, Lewia속, Macrophoma속, Penicillium속, Peyronellaea속, Phoma속, Pleospora속, Pleosporales속, Pseudeurotium속, Schizophyllum속, 그리고 Talaromyces속이 포함되는 것을 확인하였다. 그리고 alternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 우점종인 것을 확인하였다. 본 연구에서는 칠면초와 해홍나물로부터 내생진균을 분리한 결과 Pleosporales 목과 Eurotiales 목의 Alternaria (21%)와 Penicillium (13%)이 가장 많이 분포하는 것으로 나타났다.