Zhu, Fang-Lai;Ling, An-Sheng;Wei, Qi;Ma, Jie;Lu, Gang
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제16권2호
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pp.719-722
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2015
Objective: To evaluate the values of 4 tumor markers in serum and ascites and their ascites/serum ratios in the identification and diagnosis of benign and malignant ascites. Materials and Methods: A total of 76 patients were selected as subjects and divided into malignant ascites group (45 cases) and benign ascites group (31 cases). Samples of ascites and serum of all hospitalized patients were collected before treatment. The levels of carcinoembryonic antigen (CEA), alpha fetoprotein (AFP), cancer antigen 125 (CA125) and carbohydrate antigen 19-9 (CA19-9) were detected by chemiluminescence (CLIA). Results: CEA, AFP and CA19-9 in both serum and ascites as well as CA125 in ascites were evidently higher in the malignant ascites group than in the benign ascites group (P<0.01). Malignant ascites was associated with elevated ascites/serum ratios for AFP and CA125 (P<0.01). The areas under receiver operating characteristic (AUROCs) of CEA and CA125 in ascites and the ratios of ascites/serum of AFP, CEA, CA125 and CA19-9 were all >0.7, suggesting certain values, while those of ascites CA19-9 and serum CEA were 0.697 and 0.629 respectively, indicating low accuracy in the identification and diagnosis of benign and malignant ascites. However, the AUROCs of the remaining indexes were <0.5, with no value for identification and diagnosis. Compared with single index, the sensitivity of combined detection increased significantly (P<0.05), in which the combined detection of CEA, CA19-9 and CA125 in ascites as well as the ratio of ascites/serum of CEA, CA19-9, CA125 and AFP had the highest sensitivity (98.4%) but with relevantly low specificity. Both sensitivity and specificity of combined detection should be comprehensively considered so as to choose the most appropriate index. Conclusions: Compared with single index, combined detection of tumor markers in serum and ascites can significantly improve the diagnostic sensitivity and specificity.
A calcium-dependent sialic acid-binding lectin has been isolated by thyroglobulin-affinity chromatography from the coastal crab Macrophthalmus Japonicus. This lectin, Macrophthalmus Japonicus lectin (MJL), was eluted with 50mM Tris-HCl, 0.3 M NaCl, 10 mM EDTA, and the recovery yield from the crude protein extract was about 5.6%. The molecular weight of MJL was estimated as 65 kDa in SDS-PAGE both under reducing and non-reducing conditions. MJL induced an agglutination reaction in rabbit, rat, and mouse erythrocytes, but not in human ABO types. This activity was effectively inhibited by sialoglycoproteins such as fetuin, bovine submaxillary mucin, and thyroglobulin.
Carboxypeptidase Z(CPZ) cDNA of Absidia zychae was experssed in Saccharomyces cerevisiae. The expressed CPZ(YCPZ) was secreted about 30 mg/l into the medium and has a little higher molecular weight than the wild type CPZ in SDS-PAGE. By the result of N-terminal amino acid sequencing, YCPZ has additional 15 amino acids residues in N-terminus of CPZ. But YCPZ shows no difference with CPZ in enzyme activity and substrate specificity. For the identification of processing mechanism of YCPZ, 36-Arg was changed to 36-Thr by site specific mutagenesis. Mutant YCPZ does not processed at 36-Thr. It was, therefore, concluded that the YCPZ was processed by KEX2. According to endo F treatment, high amount of carbohydrate was N-glycosylated in YCPZ.
Chitin deacetylase(CDA; EC 3.5.1.41)는 키틴의 N-acetamide bonds를 가수분해하여 이를 키토산으로 전환시키는 효소다. 한편, 키토산은 의약, 화장품, 식품, 농업 등의 분야에서 다양하게 응용되는 고분자 다당류이다. 본 논문에서는 미생물 유래 CDA의 분포, 분석법, 효소적 특성, 기질 특이성, 작용기작, 유전자의 구조, 생물학적 역할, 응용 등의 최신 지견을 기술하고자 하였다. 미생물 CDA가 세포벽 형성과 식물-미생물 상호작용에 관여한다는 연구결과들을 제시하였으며, CDA의 유전자 구조를 다양한 acetylated poly/oligo-saccharides를 탈아세틸화하는 family 4 carbohydrate esterase의 유전자 구조와 비교하였다. 키틴의 탈아세틸화로 키토산을 제조하는 과정에 CDA의 활용 가능성과, CDA를 포함한 고활성의 키틴 대사효소들을 분비하는 곤충 병원균의 활용 가능성도 살펴보았다.
Lee, Jae Pil;Shin, Eun-Sun;Cho, Min Yeol;Lee, Kyung-Dong;Kim, Hoon
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제28권12호
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pp.2036-2045
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2018
An endo-${\beta}$-1,4-glucanase gene, cel5L, was cloned using the shot-gun method from Bacillus sp.. The gene, which contained a predicted signal peptide, encoded a protein of 496 amino acid residues, and the molecular mass of the mature Cel5L was estimated to be 51.8 kDa. Cel5L contained a catalytic domain of glycoside hydrolase (GH) family 5 and a carbohydrate-binding module family 3 (CBM_3). Chromatography using HiTrap Q and CHT-II resulted in the isolation of two truncated forms corresponding to 50 (Cel5L-p50) and 35 kDa (Cel5L-p35, CBM_3-deleted form). Both enzymes were optimally active at pH 4.5 and $55^{\circ}C$, but had different half-lives of 4.0 and 22.8 min, respectively, at $70^{\circ}C$. The relative activities of Cel5L-p50 and Cel5L-p35 for barley ${\beta}$-glucan were 377.0 and 246.7%, respectively, compared to those for carboxymethyl-cellulose. The affinity and hydrolysis rate of pNPC by Cel5L-p35 were 1.7 and 3.3 times higher, respectively, than those by Cel5L-p50. Additions of each to a commercial enzyme set increased saccharification of pretreated rice straw powder by 17.5 and 21.0%, respectively. These results suggest CBM_3 is significantly contributing to thermostability, and to affinity and substrate specificity for small substrates, and that these two enzymes could be used as additives to enhance enzymatic saccharification.
Yildirim, Mustafa;Suren, Dinc;Yildiz, Mustafa;Alikanoglu, Arsenal Sezgin;Kaya, Vildan;Doluoglu, Suleyman Gunhan;Aydin, Ozgur;Yilmaz, Necat;Sezer, Cem;Karaca, Mehmet
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제14권2호
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pp.1027-1030
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2013
Background: Peritoneal washing cytology (PWC) that shows the microscopic intra-peritoneal spread of gynaecologic cancers is not used in staging but is known as prognostic factor and effective in planning the intensity of the therapy. False negative or false positive results clearly affect the ability to make the best decision for therapy. In this study we assessed levels of tumour markers, carcinoembryonic antigen (CEA), cancer antigen 125 (CA-125) and carbohydrate antigen (CA19-9), in peritoneal washing fluid to establish any possible contribution to the peritoneal washing cytology in patients operated for gynaecologic cancer. Materials and Methods: Preoperative tumour markers were studied in serum of blood samples obtained from the patients for preoperative evaluation of a gynaecologic operation. In the same group peritoneal tumour markers were studied in the washing fluid obtained for intraoperative cytological evaluation. Results: This study included a total of 94 patients, 62 with malignant and 32 with benign histopathology. The sensitivity of the cytological examination was found to be 21% with a specificity of 100%. When evaluated with CEA the sensitivity of the cytological examination has increased to 37%. Conclusions: In addition to examination of PWC, the level of CEA, a tumour marker, in peritoneal washing fluid can make a diagnostic contribution. Determining the level of CEA in peritoneal washing fluid will be useful in the management of gynaecologic cancers.
가지 열매로부터 neutral saline에 의한 추출, $(NH_4)_2SO_4$ 침전 및 Sephadex-G100을 이용한 affinity chromatography에 의해 분리한 lectin의 생화학적 특성을 연구하였다. Trypsin을 처리하지 않은 사람, 쥐와 토끼의 적혈구에서는 혈구 응집반응이 일어나지 않았으며, Trypsin을 처리한 사람, 쥐와 토끼의 적혈구 중에서는 쥐의 적혈구에서만 혈구 응집반응이 일어났다. SDS-PAGE에 의해 가지 lectin의 분자량을 확인한 결과, 19.3 kDa의 단일 band 임이 확인되었다. D-glucose를 포함하는 7개의 탄수화물은 100 mM 이하의 농도에서 lectin과 적혈구의 응집을 저해시키지 않았으므로, 탄수화물에 대한 특이성이 나타나지 않았다. 최적 반응온도 범위는 $10-20^{\circ}C$로서, $20-70^{\circ}C$에서 열에 대해 안정하였으며, 안정된 pH 범위는 pH 6.2-7.2로 확인되었다. $Ca^{2+},\;Co^{2+},\;Cu^{2+},\;Fe^{2+},\;Mg^{2+}$ 및 $Mn^{2+}$ 20 mM 이하의 농도에서는 lectin과 적혈구의 응집을 저해시키지 않았으므로, 금속이온에 대한 특이성이 나타나지 않았다
A new lectin was partially purified from starfish,Asterina pectinifera by means of physiological saline extraction, salt fractionation, ion exchange chromatography and hy droxyapatite chromatography, and it was named APL. The biochemical properties of the APL were characterized. In addition, its effects on lymphocyte mitogenicity and cancer cell agglutinability were tested. The APL agglutinated nonspecifically human erythrocytes and rabbit blood cells. Agglutinability was decreased to 30% of control activity below pH 5 and above pH 9 and was relatively unstable at increasing temperatures above 60$^{\circ}C$. The activity was reduced by addition of two kinds of metal ions, $Ba^{2+},\;Mn^{2+}$ and chelating agent, EDTA. APL was proved to be glycoproteins containing 9% sugars. For carbohydrate specificity, it was found that the activity of APL was inhibited by D(+)-glucosamine, D(+)-galactosamine, stachyose, N-acetyl-galactosamine and methyl-${\alpha}$-D-galactopyranoside among 35 sugars tested. In amino acid composition, the contents of acidic amino acids such as aspartic acid and glutamic acid were relatively high. This result suggest that the isoelectric point would be in a lower range. APL was found that it promotes the division of human lymphocytes. APL was proved to be a potent agglutinin for cancer cells such as HeLa, L929 and L1210 cells. Significant changes on the HeLa cell surfaces affected by APL were observed under the electron microscope.
목적: 대장암 재발의 조기진단은 생존율을 증가시키는 중요한 인자이다. 대장암의 재발이나 전이를 진단하는데 있어 혈청 CEA, CA 19-9 등의 종양표지 자와 CT 등의 가장 많이 이용되어 왔고 최근 새로운 진단기술로서 PET/CT의 이용이 증가되고 있다. 이 연구에서는 근치적 수술을 포함한 치료를 시행하고 재발이나 전이의 증거가 없었던 상태에서 추적관찰을 받았던 대장암 환자에서 FDG PET/CT의 정기 추적 검사로서의 진단 성능을 혈청 CEA, CA 19-9, CT와 비교하고자 시행하였다 대상 및 방법: 수술적 치료 후 추적관찰 중인 대장암 환자 189명을 대상으로 하였다. PET/CT상에서 관찰된 비정상적인 FDG 섭취 증가 병소는 생검이나 6개월 이상 방사선학적 검사의 추적관찰로서 전이여부 판단하였다. PET/CT시행시기에서 6주 이내에 모든 환자에서 혈청 CEA, 174명의 환자에서 CA 19-9를 측정하였다. 115명의 환자에서 PET/CT 시행 시기 2개월 이내에 CT를 시행하였다. PET/CT 상에서 관찰된 비정상적인 FDG 셥취 증가 병소는 생검이나 6개월 이내의 방사선학적 검사와 임상적 진단의 추적 관찰로 재발이나 전이 병소로 진단하였다. 결과: 국소적 재발 및 전이가 발견된 환자는 76명(40.2%)이었다. 재발 또는 전이 병소는 총 81개였고 간과 폐에서 29개와 16개로 가장 많이 나타났다. PET/CT의 민감도, 특이도, 양성예측도, 음성예측도는 94.7%, 91.1%, 87.8%, 96.2%이고 혈청 CEA 치수는 44.7%, 97.3%, 91.8%, 72.3%였다. 종양표지 자와 PET/CT와의 비교에서는 PET/CT가 종양표지 자보다 민감도(94.2%, 52.1%)와 특이도(90.4%, 88.5%)가 높았다. 종양표지자와 CT를 종합하여 PET/CT와 비교하였을 때 민감도는 92.9%로 동일하였지만 특이도는 PET/CT가 91.3%로 높았다. 결론: 이러한 결과로 보아 FDG PET/CT가 근치적 절제술 후 대장암의 정기적 추적 관찰에도 유용하게 이용될 수 있을 것이다.
한국산 흰구름버섯(Trametes hirsuta S1)로부터 배지 내로 분비된 laccase를 ultrafiltration과 anion exchange chromatography, adsorption chromatography를 이용하여 분리 정제하고 정제된 효소의 특성을 조사하였다. Laccase는 균주의 일차 대사 과정에서 주로 생산되는 세포의 페놀 산화효소였다. 흰구름버섯을 기본 배지에서 배양하였을 때 생장은 배양 6일까지 급속히 이루어졌고, laccase의 활성은 배양 5일에 최대활성을 나타냈으며 배양액에서 LiP와 VAO의 활성은 측정되지 않았다. Laccase의 생산에 미치는 유도원의 영향을 조사하기 위하여 배양 중인 흰구름버섯에 몇몇 유도원을 첨가한 결과, 2,5-xylidine은 대조구에 비하여 laccase의 생산을 약4배 증가 시켰다. 정제된 laccase는 SDS 젤 전기영동에서 대략 66 kDa의 분자량을 가지는 단일 폴리펩타이드(single polypeptide)였고, 탄수화물 함량은 12%였다. 정제된 laccase의 $K_m$과 $V_{max}$를 ABTS[2,2-azino-bis(3-ethylbenzthiazo line-6-sulfonic acid)]를 기질로 사용하여 조사한 결과 각각 $51.2\;{\mu}M$과 $56.8\;{\mu}mole{\cdot}min^1{\cdot}mg^{-1}$로 측정되었다. Laccase 활성의 최적 pH는 3.0이며, 이 효소는 $50^{\circ}C$ 미만에서 1시간 동안 처리하였을 때 안정적이었고 $70^{\circ}C$에서 20분간 처리하였을 때 효소의 활성이 반감되었다. Laccase의 분광학적 특성을 조사한 결과 구리를 포함하는 단백질로 나타났다. 일반적으로 알려진 laccase의 기질들에 대한 특이성을 조사한 결과, 5 mM ABTS에서 가장 높은 활성을 나타내었으며 tyrosine에서는 laccase의 활성이 나타나지 않았다. 저해제의 영향을 조사한 결과, 일반적으로 구리를 포함하는 단백질의 저해제인 $NaN_3$, TGA, DDC를 일정 농도로 처리한 실험구에서는 효소의 활성이 완전하게 억제되었으며, EDTA 처리구에서는 효소의 활성이 억제되지 않았다. 한국산 흰구름버섯 S1 균주로부터 생산되는 laccase의 N-말단의 아미노산의 서열은 Coriolus hirsutus의 laccase와 100%의 상동성을 나타냈고, T. versicolor의 laccase I과는 68%의 상동성을 나타냈다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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