• 제목/요약/키워드: bio assay

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Label-free and sensitive detection of purine catabolites in complex solutions by surface-enhanced raman spectroscopy

  • Davaa-Ochir, Batmend;Ansah, Iris Baffour;Park, Sung Gyu;Kim, Dong-Ho
    • 한국표면공학회지
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    • 제55권6호
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    • pp.342-352
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    • 2022
  • Purine catabolite screening enables reliable diagnosis of certain diseases. In this regard, the development of a facile detection strategy with high sensitivity and selectivity is demanded for point-of-care applications. In this work, the simultaneous detection of uric acid (UA), xanthine (XA), and hypoxanthine (HX) was carried out as model purine catabolites by surface-enhanced Raman Spectroscopy (SERS). The detection assay was conducted by employing high-aspect ratio Au nanopillar substrates coupled with in-situ Au electrodeposition on the substrates. The additional modification of the Au nanopillar substrates via electrodeposition was found to be an effective method to encapsulate molecules in solution into nanogaps of growing Au films that increase metal-molecule contact and improve substrate's sensitivity and selectivity. In complex solutions, the approach facilitated ternary identification of UA, XA, and HX down to concentration limits of 4.33 𝜇M, 0.71 𝜇M, and 0.22 𝜇M, respectively, which are comparable to their existing levels in normal human physiology. These results demonstrate that the proposed platform is reliable for practical point-of-care analysis of biofluids where solution matrix effects greatly reduce selectivity and sensitivity for rapid on-site disease diagnosis.

왕겨초액의 대량생산과 항노화 및 미백 효과 (Mass Production of Chaff-vinegar and Its Effect of Anti-Aging and Whitening)

  • 황재규;윤종국;김숙경;이상한;한길환
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제40권3호
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    • pp.208-214
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    • 2012
  • 본 연구는 왕겨를 이용한 항산화, 항노화에 효과적인 초액을 대량생산하여 기능성을 검증하고 왕겨초액 내의 기능성물질을 분석하여 사업화의 가능성을 타진하고자 하였다. 정제된 왕겨초액을 분획하여 기능성이 확인된 부분을 HPLC 기기를 이용하여 확인한 결과 caffeic acid 외에 7종의 polyphenol 유래물질에서 기능성을 확인하였다. 기능성 화장품소재 시험으로는 세포 생존율 측정(MTT assay), 주름개선 (collagenase inhibition assay, elastase inhibition assay), 미백(tyrosinase inhibition assay), 항산화 시험(DPPH free radical scavenging assay, SOD-like activity, xanthine oxidase inhibition assay)이 실시하였다. 피부주름형성은 콜라겐의 합성과 분해가 중요한 원인으로 작용한다고 알려져 있지만, 최근 많은 연구에서 엘라스틴의 재형성과 분해 또한 주름형성 기전에서 중요한 작용을 하는 것으로 보고되고 있다. 왕겨초액은 $100{\mu}L/mL$의 농도에서 collagenase 저해효과가 100%, elastase 저해효과가 55% 이상으로 주름개선 효과가 우수하였다. 왕겨초액은 $100{\mu}L/mL$의 농도에서 tyrosine에 대한 tyrosinase 저해효과가 80% 이상으로 미백효과가 우수하게 나타났다. DPPH radical 소거율, xanthine oxidase 저해와 SOD-like 활성을 이용하여 항산화 효과를 측정하였다. 왕겨초액 $100{\mu}L/mL$의 농도에서 DPPH radical 소거율이 80%, xanthine oxidase 저해효과가 80%, 그리고 SOD-like 활성이 100%를 나타내었다. 따라서 본 연구를 통하여 정제 왕겨초액을 이용한 산업화를 위한 가능성을 타진하여 효과가 좋음을 확인할 수 있었다. 이와 같은 결과로 왕겨초액을 이용한 기능성 화장품의 소재로 뿐만 아니라, 식품 및 의약외품의 품목허가를 통하여 고부가가치의 상품화소재로의 가능성이 있다고 사료됩니다.

Bacterial ${\beta}$-Lactamase Fragment Complementation Strategy Can Be Used as a Method for Identifying Interacting Protein Pairs

  • Park, Jong-Hwa;Back, Jung-Ho;Hahm, Soo-Hyun;Shim, Hye-Young;Park, Min-Ju;Ko, Sung-Il;Han, Ye-Sun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권10호
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    • pp.1607-1615
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    • 2007
  • We investigated the applicability of the TEM-l ${\beta}$-lactamase fragment complementation (BFC) system to develop a strategy for the screening of protein-protein interactions in bacteria. A BFC system containing a human Fas-associated death domain (hFADD) and human Fas death domain (hFasDD) was generated. The hFADD-hFasDD interaction was verified by cell survivability in ampicillin-containing medium and the colorimetric change of nitrocefin. It was also confirmed by His pull-down assay using cell lysates obtained in selection steps. A coiled-coil helix coiled-coil domain-containing protein 5 (CHCH5) was identified as an interacting protein of human uracil DNA glycosylase (hUNG) from the bacterial BFC cDNA library strategy. The interaction between hUNG and CHCH5 was further confirmed with immunoprecipitation using a mammalian expression system. CHCH5 enhanced the DNA glycosylase activity of hUNG to remove uracil from DNA duplexes containing a U/G mismatch pair. These results suggest that the bacterial BFC cDNA library strategy can be effectively used to identify interacting protein pairs.

Biapigenin, Candidate of an Agonist of Human Peroxisome Proliferator-Activated Receptor γ with Anticancer Activity

  • Kim, Jin-Kyoung;Shin, So-Young;Lee, Jee-Young;Lee, So-Jung;Lee, Eun-Jung;Jin, Qinglong;Lee, June-Young;Woo, Eun-Rhan;Lee, Dong-Gun;Yoon, Do-Young;Kim, Yang-Mee
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제32권8호
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    • pp.2717-2721
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    • 2011
  • Peroxisome proliferator-activated receptors (PPARs) are a subfamily of nuclear receptors (NRs). Human peroxisome proliferator-activated receptor gamma (hPPAR${\gamma}$) has been implicated in the pathology of numerous diseases, including obesity, diabetes, and cancer. ELISA-based hPPAR${\gamma}$ activation assay showed that biapigenin increased the binding between hPPAR${\gamma}$ and steroid receptor coactivator-1 (SRC-1) by approximately 3-fold. In order to confirm that biapigenin binds to hPPAR${\gamma}$, fluorescence quenching experiment was performed. The results showed that biapigenin has higher binding affinity to hPPAR${\gamma}$ at nanomolar concentrations compared to indomethacin. Biapigenin showed anticancer activity against HeLa cells. Biapigenin was noncytotoxic against HaCa T cell. All these data implied that biapigenin may be a potent agonist of hPPAR${\gamma}$ with anticancer activity. We will further investigate its anticancer effects against human cervical cancer.

서울시내 주거지역 미세먼지의 유전독성 영향 (Genotoxic Effect of Air-borne Particulate Matter in Residential Area of Seoul City)

  • 오승민;성혜경;김은실;김종극;유병택;정규혁
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • 제20권4호통권51호
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    • pp.365-374
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    • 2005
  • Ambient air particulate matters are classified into two distinct modes in sire distribution, namely the coarse and fine particles. Correlation between high particulate concentration and adverse effect on human populations has long been recognized. However, the toxicology of these adverse efforts has not been clarified. We investigated the genotoxic effect of PM 2.5 collected from urban area in Seoul by comet assay (A549 cells), CBMN assay (CHO-K1 cells) and EROD-microbioassay (H4IIE cells). Results from in vitro micronucleus assay and comet assay showed that PM 2.5 samples collected from traffic area, residential area and indoor air induced chromosomal damage and DNA breakage in a non-cytotoxic dose. The complex mixture effect of these PM 2.5 extracts was quantified by EROD-microbioassay in terms of its bio-TEQ (biologiral -TCDD equivalent concentration) which was 70.87$\pm$28.07, 93.55$\pm$21.80 and 14.31 $\pm$ 1.10 ng/g-PM 2.5 in traffic area, residental area and indoor air samples, respectively. Conclusively, we suggested that PM 2.5 collected from traffic area and residential area contains CYPIA inducer and genotoxic materials.

천마추출물의 항산화 및 항암 활성 (Anti-oxidant and Anti-tumor Activities of Crude Extracts by Gastrodia elata Blume)

  • 허진철;박자영;안상미;이진만;윤치영;신흥묵;권택규;이상한
    • 한국식품저장유통학회지
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    • 제13권1호
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    • pp.83-87
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    • 2006
  • 한의학에서 천마는 여러 치료의 목적으로 사용이 되는 한약재이다. 본 연구는 천마의 항산화활성과 항암 효과를 검증하기 위하여 실시하였다. 천마와 이를 이용한 식음료를 이용하여 항산화활성과 암세포를 이용한 세포의 운동성을 측정하였다. 항산화활성의 경우 DPPH, FRAP, Hydroxyl radical assay를 실시하였으며, 항암효과를 확인하기 위하여 wound / invasion assay를 실시하였다. 실험 결과 천마의 항산화 활성은 매우 뛰어난 것으로 나타났으며, 특히 DPPH / FRAP 실험에서 높은 활성을 보여주었다. 항암효과로 세포의 운동성을 확인한 결과 천마와 제품군 모두에서 세포의 운동성을 억제하는 효과가 매우 높은 것으로 나타났다. 천마는 항산화 효과와 함께 암세포의 운동성을 억제하는 항암효과를 가지는 것으로 나타났다.

BioFire® Meningitis/Encephalitis Panel의 진단적 유용성 평가: 90일 미만 발열영아에서의 예비 연구 (Diagnostic Evaluation of the BioFire® Meningitis/Encephalitis Panel: A Pilot Study Including Febrile Infants Younger than 90 Days)

  • 김경민;박지영;박경운;손영주;최윤영;한미선;최은화
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제28권2호
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    • pp.92-100
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    • 2021
  • 목적: 중추신경계 감염의 적절한 치료를 위해서 신속한 원인 병원체의 확인이 중요하다. 본 연구는 열이 있는 영아의 뇌척수액 검체에서 원인 병원체 검출을 위한 BioFire® Meningitis/Encephalitis (ME) panel 검사 방법의 진단적 가치를 평가하고자 수행되었다. 방법: 2016년 1월부터 2019년 7월까지 발열을 주소로 서울대학교 어린이병원에 내원한 90일 미만의 영아로부터 채취한 뇌척수액으로 기존검사(세균 배양, Xpert® enterovirus assay, herpes simplex virus-1 and -2 중합효소 연쇄반응 검사)를 시행한 후 -70℃ 초저온 냉동고에 보관된 검체를 대상으로 BioFire® ME panel 검사를 시행하였다. 결과: 총 72개 검체(원인 병원체가 검출된 24개와 검출되지 않은 48개)가 포함되었다. BioFire® ME panel 검사 결과, 기존검사로 원인 병원체가 검출되지 않은 48개의 검체 중 41개(85.4%)는 음성이었고 원인 병원체가 검출된 24개 검체 중 22개(91.7%)가 동일한 결과(enterovirus 19개, Streptococcus agalactiae 2개, Streptococcus pneumoniae 1개)를 보여 전체 일치율은 87.5% (63/72)였다. 병원체가 기존검사에서 검출되지 않았으나 BioFire® ME panel에서 검출된 7개의 검체 중 6개에서 human parechovirus (HPeV)가 검출되었다. 결론: 열이 있는 90일 미만 영아에서 BioFire® ME panel 검사법은 원인 병원체가 밝혀진 기존검사 결과와는 비교적 높은 일치도를 보이며, HPeV를 추가적으로 진단할 수 있었다. 향후, 소아청소년 진료 영역에서 BioFire® ME panel 검사법을 적용할 근거를 마련하기 위한 임상적 유용성과 비용 효과에 대한 연구가 필요하다.

BIO-RAD 정도관리 물질을 이용한 방사면역측정법의 Acceptable Range 설정에 대한 제언 (Radioimmunoassay Using Quality Control Materials BIO-RAD of the Suggestions for Setting Acceptable Range)

  • 박희원;김태훈;노경운;김현주
    • 핵의학기술
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    • 제16권1호
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    • pp.108-114
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    • 2012
  • 면역측정법을 이용하는 검사실에서 가장 많이 사용하고 있는 상업용 제3자 정도관리물질이 BIO-RAD사에서 제공하는 물질이다. 현재 BIO-RAD 정도관리 물질에 포함된 Reference Sheet에는 비방사면역측정을 이용한 검사방법과 검사장비별로 각 측정물질의 Acceptable Range가 기재되어 있다. 그러나 방사면역측정법을 이용하여 검사하는 측정kit나 기기에 대해서는 실무에 적용할 만한 Acceptable Range에 대한 언급이 다소 부족한 것이 현실이다. 방사면역측정검사에 대한 Acceptable Range를 설정하여 검사결과의 객관성을 높이고 누적된 데이터를 제조사에 권고하여 발행되는 Reference Sheet에 기재하고자 한다. 본원에서는 2009년부터 부분적으로 BIO-RAD 정도관리 물질을 사용하여 2011년에는 일부 특정 항목을 제외한 대부분의 검사종목에 BIO-RAD 제 3자 정도관리물질을 사용하고 있다. 따라서 측정된 내부정도관리 데이터를 BIO-RAD사의 Unity Real Time program (version 1.0.9.27)을 이용하여 Acceptable Range를 설정하였다. BIO-RAD 정도관리 물질을 사용하는 약 50가지 검사종목의 20개 Point Data의 평균값, 표준편차, 변이계수를 구하여 측정kit별 Acceptable Range를 산출하였으며, 자동화 면역 측정기기인 Roche Elecsys/ E170/ cobas e Systems의 측정값과 비교하였다. 현재 시행하고 있는 외부정도관리 프로그램과 같이 BIO-RAD 정도관리 물질을 공통으로 사용하는 병원과 peer group을 설정하여 측정 kit별, 기기별 Acceptable Range를 제조사에 권고하여 Reference Sheet에 방사면역검사실에 적합한 Acceptable Range를 기재하여 검사결과의 객관성을 높이고 국내외적으로 방사면역측정법에 대한 인지도를 높이고자 한다.

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Nuclear Anomalies, Chromosomal Aberrations and Proliferation Rates in Cultured Lymphocytes of Head and Neck Cancer Patients

  • George, Alex;Dey, Rupraj;Bhuria, Vikas;Banerjee, Shouvik;Ethirajan, Sivakumar;Siluvaimuthu, Ashok;Saraswathy, Radha
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제15권3호
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    • pp.1119-1123
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    • 2014
  • Head and neck cancers (HNC) are extremely complex disease types and it is likely that chromosomal instability is involved in the genetic mechanisms of its genesis. However, there is little information regarding the background levels of chromosome instability in these patients. In this pilot study, we examined spontaneous chromosome instability in short-term lymphocyte cultures (72 hours) from 72 study subjects - 36 newly diagnosed HNC squamous cell carcinoma patients and 36 healthy ethnic controls. We estimated chromosome instability (CIN) using chromosomal aberration (CA) analysis and nuclear level anomalies using the Cytokinesis Block Micronucleus Cytome Assay (CBMN Cyt Assay). The proliferation rates in cultures of peripheral blood lymphocytes (PBL) were assessed by calculating the Cytokinesis Block Proliferation Index (CBPI). Our results showed a significantly higher mean level of spontaneous chromosome type aberrations (CSAs), chromatid type aberration (CTAs) dicentric chromosomes (DIC) and chromosome aneuploidy (CANE UP) in patients (CSAs, $0.0294{\pm}0.0038$; CTAs, $0.0925{\pm}0.0060$; DICs, $0.0213{\pm}0.0003$; and CANE UPs, $0.0308{\pm}0.0035$) compared to controls (CSAs, $0.0005{\pm}0.0003$; CTAs, $0.0058{\pm}0.0015$; DICs, $0.0005{\pm}0.0003$; and CANEUPs, $0.0052{\pm}0.0013$) where p<0.001l. Similarly, spontaneous nuclear anomalies showed significantly higher mean level of micronuclei (MNi), nucleoplasmic bridges (NPBs) and nuclear buds (NBUDs) among cases (MNi, $0.01867{\pm}0.00108$; NPBs, $0.0156{\pm}0.00234$; NBUDs, $0.00658{\pm}0.00068$) compared with controls (MNi, $0.00027{\pm}0.00009$; NPBs, $0.00002{\pm}0.00002$; NBUDs, $0.00011{\pm}0.00007$).The evaluation of CBPI supported genomic instability in the peripheral blood lymphocytes showing a significantly lower proliferation rate in HNC patients ($1.525{\pm}0.005552$) compared to healthy subjects ($1.686{\pm}0.009520$) (p<0.0001). In conclusion, our preliminary results showed that visible spontaneous genomic instability and low rate proliferation in the cultured peripheral lymphocytes of solid tumors could be biomarkers to predict malignancy in early stages.

통초.희렴 추출물의 항산화.항비만 활성 및 혼합물의 항비만 시너지 효과 (Anti-Oxidative and Anti-Obesity Activities of Tetrapanax papyriferus and Siegesbeckia pubescens Extracts and their Synergistic Anti-Obesity Effects)

  • 박정애;진경숙;이지영;권현주;김병우
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제41권3호
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    • pp.341-349
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    • 2013
  • 본 연구에서는 통초(Tetrapanax papyriferus)와 희렴(Siegesbeckia pubescens)의 항산화 및 항비만 활성을 DPPH radical 소거능과 세포실험계를 이용하여 분석하였다. 통초와 희렴의 DPPH radical 소거능의 50% 저해능($IC_{50}$)은 각각 65.23과 47.79 ${\mu}g/ml$로 나타났다. 또한 두 시료 모두 농도 의존적으로 lipase 효소 활성을 유의적으로 억제시켰으며, 3T3-L1 preadipocyte를 이용하여 지방세포 분화 및 지방생성에 미치는 영향을 분석한 결과 통초와 희렴 모두 지방 세포 분화, 지방 축적, TG 함량 등을 독성 없이 농도의존적으로 억제함을 보였다. 이러한 통초와 희렴의 지방세포분화억제능은 핵심 작용 인자인 $C/EBP{\alpha}$, $C/EBP{\beta}$, 그리고 $PPAR{\gamma}$의 유전자 및 단백질 발현조절에서 기인함을 확인하였다. 또한 통초와 희렴 간의 항비만 시너지 효과를 분석한 결과 각 시료의 단독 처리시보다 병용 처리시 더 높은 지방세포분화억제능을 보여 두 시료간에 시너지 효과를 보유함을 확인하였다. 이러한 결과는 통초 및 희렴의 항비만 활성 및 그 작용 기전을 밝힌 것이며 추후 계속적인 연구를 통해 활성 물질의 규명이 필요할 것으로 판단된다.