• 제목/요약/키워드: Solanum

검색결과 548건 처리시간 0.03초

Genome-wide analysis of Solanum lycopersicum L. cyclophilins

  • Khatun, Khadiza;Robin, Arif Hasan Khan;Islam, Md. Rafiqul;Jyoti, Subroto Das;Lee, Do-Jin;Kim, Chang Kil;Chung, Mi-Young
    • Journal of Plant Biotechnology
    • /
    • 제49권1호
    • /
    • pp.15-29
    • /
    • 2022
  • Cyclophilins (CYPs) are highly conserved ubiquitous proteins belong to the peptidyl prolyl cis/trans isomerase (PPIase) superfamily. These proteins are present in a wide range of organisms; they contain a highly conserved peptidyl-prolyl cis/trans isomerase domain. A comprehensive database survey identified a total of 35 genes localized in all cellular compartments of Solanum lycopersicum L., but largely in the cytosol. Sequence alignment and conserved motif analyses of the SlCYP proteins revealed a highly conserved CLD motif. Evolutionary analysis predicted the clustering of a large number of gene pairs with high sequence similarity. Expression analysis using the RNA-Seq data showed that the majority of the SlCYP genes were highly expressed in mature leaves and blooming flowers, compared with their expression in other organs. This study provides a basis for the functional characterization of individual CYP genes in the future to elucidate their role(s) in protein refolding and long-distance signaling in tomatoes and in plant biology, in general.

페피노의 삽목번식과 착과증진 (Cutting Propagation and Fruit Setting Enhancement of Pepino(Solanum muricatum AIT))

  • 주문갑;김봉구;조재연
    • 한국작물학회지
    • /
    • 제32권1호
    • /
    • pp.34-39
    • /
    • 1987
  • 페피노(Solanum muricatum AIT)의 증식을 위한 삽목방법과 착과진행을 위한 지베레린(GA$_3$)의 처리시기를 구명하기 위하며 시험한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 삽목용 상토로는 피트모스(50%)+질석(50%)의 혼합상토가 모래나 일반상토보다 발근수와 발근장이 모두 좋았다. 2. 발근을 위한 생장조절제로는 NAA 1,000ppm 침지처리가 삽목 15 일 후에 발근수와 발근장이 많아 타처리보다도 효과가 컸다. 3. 착과증진을 위한 GA$_3$(50ppm )의 처리시기는 개화기가 좋았고 처리부위는 화기가 좋았다. 4. 지베레린의 처리는 착과효과 이외에도 단위결과를 유도할 수 있었다.

  • PDF

The pattern of coding sequences in the chloroplast genome of Atropa belladonna and a comparative analysis with other related genomes in the nightshade family

  • Satyabrata Sahoo;Ria Rakshit
    • Genomics & Informatics
    • /
    • 제20권4호
    • /
    • pp.43.1-43.18
    • /
    • 2022
  • Atropa belladonna is a valuable medicinal plant and a commercial source of tropane alkaloids, which are frequently utilized in therapeutic practice. In this study, bioinformatic methodologies were used to examine the pattern of coding sequences and the factors that might influence codon usage bias in the chloroplast genome of Atropa belladonna and other nightshade genomes. The chloroplast engineering being a promising field in modern biotechnology, the characterization of chloroplast genome is very important. The results revealed that the chloroplast genomes of Nicotiana tabacum, Solanum lycopersicum, Capsicum frutescens, Datura stramonium, Lyciumbarbarum, Solanum melongena, and Solanum tuberosum exhibited comparable codon usage patterns. In these chloroplast genomes, we observed a weak codon usage bias. According to the correspondence analysis, the genesis of the codon use bias in these chloroplast genes might be explained by natural selection, directed mutational pressure, and other factors. GC12 and GC3S were shown to have no meaningful relationship. Further research revealed that natural selection primarily shaped the codon usage in A. belladonna and other nightshade genomes for translational efficiency. The sequencing properties of these chloroplast genomes were also investigated by investing the occurrences of palindromes and inverted repeats, which would be useful for future research on medicinal plants.

Lipopolysaccharide로 유발된 간독성에 대한 까마중의 효과 (The Effects of Solanum nigum Linne extract on the Hepatotoxicity of Rats Induced by Lipopolysaccharide)

  • 허예영;권륜희;하미숙;하배진
    • 한국식품위생안전성학회지
    • /
    • 제24권3호
    • /
    • pp.285-290
    • /
    • 2009
  • 본 연구에서는 LPS를 투여시켜 간손상을 유발한 흰쥐의 간에서 까마중 추출물의 간손상 보호효과를 알고자 하기 위한 것이며, 이 물질을 천연 한방차로 개발하기 위한 기초자료를 얻고자 하였다. 본 실험에서는 생후 7주 암컷 흰쥐 총 35마리를 7마리씩 나누어 NOR, CON, SNT, SNL, SNR 5군으로 분리하여 실험하였다. 정상군은 20일 동안 1.5ml/kg of 0.9% saline을 투여하고 대조군은 20일 동안 1.5ml/kg of 0.9% saline을 매일 투여한 후 21일째 되는 날 LPS를 5 mg/kg의 농도로 만들어 1.5 ml/kg의 용량으로 복강 내로 투여하였다. 시료군(SNT, SNL, SNR)에는 100 mg/kg 농도의 각각의 분획을 1.5ml/kg씩 복강 내에 20일간 매일 투여하고 21일째 되는 날에 LPS를 1.5 ml/kg의 용량을 복강 내로 투여하여 희생시켰다. GOT, GPT는 혈청을 사용하여 측정하였고, SOD, catalase, GPx는 간 조직을 사용하여 실험하였다. SNT, SNL, SNR group들은 LPS로 유도된 쥐의 혈청에서 GOT와 GPT활성을 억제하였고, 반면에 SOD, catalse, GPx의 활성은 LPS로 유도된 쥐의 간 조직에서 정상의 수치로 높아졌다. 이것은 SNT, SNL, SNR들이 기능성 음료로서의 가능성이 보여진다.

Suppressive Effect of Solanum Iyratum Aqueous Extract Via Down-regulation of $TNF-{\alpha}$ and $IFN-{\gamma}$ Production on Collagen-induced Arthritis in Mice

  • Kim, Seung-Hyung;Seo, Chang-Woo;Kim, Chang-Min;Kim, Yang-Jin;Lee, Boo-Kyun;Choi, Yong-Sun;Oh, Hwang;Yoon, Ho-Sok;Lee, Seon-Goo;Lee, Jang-Cheon;Lee, Young-Cheal
    • 동의생리병리학회지
    • /
    • 제21권5호
    • /
    • pp.1278-1284
    • /
    • 2007
  • Solanum Iyratum Thunb (Solanaceae) has multiple applications in korean traditional medicine because of its cytotoxic, immunological and anti-inflammatory activities. However, no study on the anti-arthritic activity of Solanum Iyratum Thunb has been reported in vivo. Rheumatoid arthritis (RA) is a systemic autoimmune disease with chronic inflammation characterized by hyperplasia of synovial cells in affected joints, which ultimately leads to the destruction of cartilage and bone. Cytokine production were assessed during CIA(collagen-induced arthritis) model mice in lymph node (LN), in knee joint and spleen, using ELISA. DBA/1j mice were immunized with bovine type II collagen. After a second collagen immunization, mice were treated with Solanum Iyratum Thunb (SLT) orally at 400, 200 mg/kg once a day for 4 weeks. The severity of arthritis within the knee joints was evaluated by histological assessment of cartilage destruction and pannus formation. SLT significantly suppressed the progression of CIA and inhibited the production of TNF-alpha and IFN-gamma in serum and spleen cell culture supernatant. The erosion of cartilage was dramatically reduced in mouse knees after treatment with SLT. In conclusion, our results demonstrates that SLT significantly suppressed the progression of CIA. This action was characterized by suppression of arthritis index, cartilage erosion and synovial cell infiltration and the decreased production of $TNF-{\alpha}$, $IFN-{\gamma}$, CD4+, CD19+, CD3+/CD69+ cells (in lymph node), CD11b+/Gr-1 + (in knee joint).

까마중(Solanum nigrum L.) 전초 추출물의 항산화 활성 (Antioxidative Activities of Whole Plant Extracts of Solanum nigrum L.)

  • 성준섭;김경미;서지영;하지훈;박수남
    • 한국응용과학기술학회지
    • /
    • 제32권4호
    • /
    • pp.781-788
    • /
    • 2015
  • 본 연구에서는 건조된 까마중(Solanum nigrum L.) 전초의 50% 에탄올 추출물, 에틸아세테이트 분획, 아글리콘 분획을 이용하여 항산화 실험을 진행하였다. 1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl(DPPH)을 이용한 자유라디칼 소거 활성($FSC_{50}$)은 50% 에탄올 추출물, 에틸아세테이트 분획, 아글리콘 분획에서 각각 $215.46{\mu}g/mL$, $42.43{\mu}g/mL$, $52.28{\mu}g/mL$이였다. Luminol-의존성 화학발광법을 이용한 $Fe^{3+}-EDTA/H_2O_2$ 계에서의 총항산화능($OSC_{50}$) 평가에서, 까마중 50% 에탄올 추출물은 $25.25{\mu}g/mL$, 에틸아세테이트 분획은 $7.05{\mu}g/mL$, 아글리콘 분획은 $6.25{\mu}g/mL$를 나타냈다. $^1O_2$로 유도된 적혈구 세포손상에 대한 보호효과 측정에서는 까마중 50% 에탄올 추출물 및 아글리콘 분획은 $5{\sim}25{\mu}g/mL$ 농도에서는 세포보호효과를 나타냈으나 높은 농도에서는 세포보호 활성을 나타내지 않았다. 이러한 결과를 통해 까마중 추출물 및 분획물들은 항산화 활성을 가지고 있지만, 세포 수준에서는 비교적 높은 농도에서 활성산소로 유도된 세포 손상을 촉진할 수도 있음을 시사한다. 따라서 화장품 등에 까마중 추출물을 응용할 때는 사용상 주의가 필요한 것으로 판단된다.

용규(Solanum nigrum)에서 HT29 세포에 대한 신규 항암 활성 단일 물질 분리 (Isolation and Identification of a Novel Anticancer Compound from Solanum nigrum)

  • 윤희정;정종헌;현숙경;김병우;권현주
    • 생명과학회지
    • /
    • 제24권3호
    • /
    • pp.234-241
    • /
    • 2014
  • 용규(Solanum nigrum)에 함유된 여러 성분 중 항암 활성이 있는 물질을 분리 및 규명하고자 용규를 MeOH로 추출하고 이 추출물을 $CH_2Cl_2$, EtOAc, n-BuOH, $H_2O$로 유기용매 계통분획 하였다. 이 분획물 중 $H_2O$ 획분이 가장 뛰어난 세포 독성 효과를 보였으며 이를 다시 용매별($H_2O$, 40% MeOH, 60% MeOH, MeOH)로 Diaion HP-20 column chromatography하여 4개의 fraction으로 나누었다. 이 fraction 중 $H_2O$ fraction에서 가장 뛰어난 세포 독성효과를 보였으며 몇 차례의 column chromatography를 행하여 얻어진 활성 획분을 GC-MS 및 FAB-MS 분석하였다. 분자량이 416이었으며 GC-Mass를 통하여 library search를 행한 결과 분자식 $C_{28}H_{48}O_2$인 Des-N-26-methylenedihydrotomatidine으로 확인되었다. Des-N-26-methylene-dihydrotomatidine과 비슷한 구조를 가지고 있는 tomatine과 tomatidine의 HT29 세포에 대한 세포독성효과를 확인한 결과, tomatine보다는 활성이 낮았으나 tomatidine 보다는 40 ${\mu}g/ml$ 이상의 농도에서 높은 세포독성 효과를 나타내었다. Des-N-26-methylene-dihydrotomatidine은 지금까지 학계에 보고되어 있지 않은 물질로, 본 연구에서 최초로 용규에서 Des-N-26-methylene-dihydrotomatidine을 분리하였고, 암세포에 대한 세포 독성 효과를 보고하였다. Des-N-26-methylene-dihydrotomatidine의 정상세포에서의 세포 독성 및 작용 기전 등의 추가 연구를 통해 천연 생리 활성 물질 소재로 활용 가능할 것으로 사료된다.

Allelochemicals 함유 식물의 항균 효과 (Antimicrobial Activity of Some Plants Containing Allelochemicals)

  • 이호준;김용옥
    • The Korean Journal of Ecology
    • /
    • 제22권1호
    • /
    • pp.51-58
    • /
    • 1999
  • 자생식물과 귀화식물을 대상으로 allelochemicals를 분석하고 그 항균효과를 조사하였다. 자생식물과 귀화식물 추출액 간의 가용성 고형물 함량에는 차이를 보이지 않았고 자생식물인 까마중의 가용성 고형물 함량이 90 mg/ml로 가장 높게 나타났다. 자생식물의 에탄을 추출액에 의한 Aspergillus phoenicis KCTC 1228의 항균력은 까마중에서만 나타났으며 clear zone이 18 mm였고 포자형성은 억제되었다. 귀화식물 중 돼지풀과 망초에서 포자형성이 억제되면서 clear zone이 24 mm와 22 mm로 형성되었고 미국자리공과 원추천인국은 포자가 형성되면서 clear zone이 22 mm와 19 mm로 나타났다. 자생식물인 까마중과 귀화식물인 미국자리공과 돼지풀에서 토양미생물인 Bacillus sphiaericus 2362와 Bacillus sphiaericus 2291, Bacillus thuringiensis var. subtilis와 Bacillus thuringiensis var. cereus에서 항균력이 나타났는데 돼지풀이 각 균주에서 항균활성이 가장 크게 나타났다. 특히 Bacillus thuringiensis var. subtilis에서 clear zone이 32 mm로 활성이 강하게 조사되었다. 일반적으로 추출액내의 가용성 고형물 함량이 높을수록 항균 활성이 크게 나타남을 알 수 있다. 자생식물인 까마중과 귀화식물인 미국자리공과 돼지풀의 추출액을 HPLC로 성분분석한 결과 까마중은 hydroquinone외 3종이, 미국자리공은 cinnamic acid외 5종이, 돼지풀은 benzoic acid외 7종이 분석되었다. Phenolic compound 각각에 대한 Aspergillus phoenicis KCTC 1228에 대한 항균력은 coumaric acid와 benzoic acid에서 조사되었다.

  • PDF