• 제목/요약/키워드: Sequence variation

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객체의 모양 변화를 이용한 동작 표현 및 검색 방법 (A Method of Describing and Retrieving Movement of an Object by Using the Shape Variation of an Object)

  • 최민석
    • 융합정보논문지
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    • 제12권1호
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    • pp.15-21
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    • 2022
  • 동영상의 내용 기반 검색에 있어 객체의 움직임에 대한 정보는 내용의 분류와 구분에 있어 중요하게 이용될 수 있다. 특히 사람의 동작을 분석하고 구분하는 것은 검색뿐 아니라 다양한 분야에 활용할 수 있다. 본 논문에서는 객체의 움직임에 따라 변화하는 모양 정보를 이용하여 동작을 표현하고 구분하기 위해 제안된 모양 변화 기술자와 모양 시퀀스의 성능을 높이는 방법을 제안한다. 변화하는 객체의 모양 정보를 더 효율적으로 표현하기 위한 모양 기술자의 선택과 유사도 측정을 위해 사용되는 거리함수의 비교를 통하여 동작 정보의 표현 및 검색 효율을 높일 수 있도록 하였다. 실험을 통하여 제안된 방법이 기존의 방법에 비해 더 효율적으로 동작 정보를 표현하여 검색의 성능을 높일 수 있음을 보였다.

주파수 변동시 불평형 전압에 강인한 DSC-PLL 설계 연구 (The Design of Robust DSC-PLL under Distorted Grid Voltage Contained Unbalance on Frequency Variation)

  • 이재도;차한주
    • 전기학회논문지
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    • 제67권11호
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    • pp.1447-1454
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    • 2018
  • In this paper, the design of robust DSC-PLL(Delayed Signal Cancellation Phase Locked Loop) is proposed for coping with frequency variation. This method shows significant performance for detection of fundamental positive sequence component voltage when the grid voltage is polluted by grid unbalance and frequency variation. The feedback frequency estimation of DSC-PLL is tracking the drift in the phase by unbalance and frequency variation. The robust DSC PLL is to present the analysis on method and performance under frequency variations. These compensation algorithms can correct for discrepancies of changing the frequency within maximum 193[ms] and improve traditional DSC-PLL. Linear interpolation method is adopted to reduce the discretized errors in the digital implementation of the PLL. For verification of robust characteristic, PLL methods are implemented on FPGA with a discrete fixed point based. The proposed method is validated by both Matlab/Simulink and experimental results based on FPGA(XC7Z030).

Intraspecific genetic variation in Corynandra chelidonii (Angiosperms: Cleomaceae) as revealed by SCoT, ISSR and RAPD analyses

  • Sirangi, Subash;Jogam, Phanikanth;Nemali, Gandhi;Ajmeera, Ragan;Abbagani, Sadanandam;Raju, Vatsavaya S.
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제47권4호
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    • pp.289-297
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    • 2020
  • The genetic diversity of two subpopulations of Corynandra chelidonii, one of terrestrial and the other of aquatic environments, was measured with molecular markers, such as start codon targeted (SCoT), inter simple sequence repeats (ISSR), and random amplification of polymorphic DNA (RAPD). The traditional morphological traits such as habitat, habit, leaf morphology, the colour of the sepals and petals, number of stamens, and seed morphology formed the base for their realization as two varieties, C. chelidonii var. pallae and C. chelidonii var. chelidonii. The polymorphism between the two variants was 100% with the primers SCoT-2 and OPA-1 and 4, while maximum polymorphism was detected with ISSR-2, SCoT-3, and OPA-3. The study used, for the first time, more than one molecular marker to assess the genetic variation underscoring the morphological variation in Corynandra chelidonii (L.f.) Cochrane & Iltis. The study justifies the recognition of the two subpopulations of Corynandra chelidonii from aquatic and terrestrial environments as two distinct varieties, C. chelidonii var. pallae (Reddy & Raju) V.S.Raju and C. chelidonii var. chelidonii, respectively, based on the traditional taxonomic evidence.

Simple Sequence Repeat (SSR) and GC Distribution in the Arabidopsis thaliana Genome

  • Mortimer Jennifer C;Batley Jacqueline;Love Christopher G;Logan Erica;Edwards David
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제7권1호
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    • pp.17-25
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    • 2005
  • We have mined each of the five A. thaliana chromosomes for the presence of simple sequence repeats (SSRs) and developed custom perl scripts to examine their distribution and abundance in relation to genomic position, local G/C content and location within and around transcribed sequences. The distribution of repeats and G/C content with respect to genomic regions (exons, UTRs, introns, intergenic regions and proximity to expressed genes) are shown. SSRs show a non-random distribution across the genome and a strong association within and around transcribed sequences, while G/C density is associated specifically with the coding portions of transcribed sequences. SSR motif repeat number shows a high degree of variation for each SSR type and a high degree of motif sequence bias reflecting local genome sequence composition. PCR primers suitable for the amplification of identified SSRs have been designed where possible, and are available for further studies.

Mitochondrial Cytochrome b gene의 분석에 의한 한국산 미꾸리과 어류(Cobitidae)의 계통 (Molecular Phylogeny of Korean Loaches Inferred from Mitochondrial DNA Cytochrome b Sequences)

  • 김소영;김익수;장광엽;장미희
    • 한국어류학회지
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    • 제12권4호
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    • pp.223-229
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    • 2000
  • 한국산 미꾸리과 어류의 계통유전학적 관계를 고찰하고자 8종의 mitochondrial cytochrome b의 유전자 서열을 비교한 결과 대부분 이전의 형태학적 연구의 결과와 일치하였다. 그러나 종개속 Orthrias과 쌀미꾸리속 Lefua의 분류학적 위치는 미꾸리과 Cobitidae와 paraphyletic group으로 나타났으며 이 두 속의 sequence divergence는 0.184~0.272으로 나타나 미꾸리과와 잉어과 사이의 divergence와 유사하였다. 한편 참종개속 Iksookimia 2종과 북방종개 Cobitis melanoleuca는 각각 다르게 분화한 결과를 보여 주었으며 또한 중국산 미꾸리와 한국산 영덕 미꾸리의 sequence divergence는 0.099로 종간의 divergence를 보여주어 주목되었다. 미꾸리과 어류 가운데 참종개속의 일부 어류는 분류학적 위치로 보아 이들의 기원이 미꾸리과의 속간 잡종기원으로 생각된다.

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스마트 홈에서 마이닝을 이용한 행동 순차 패턴 발견 (Discovery of Behavior Sequence Pattern using Mining in Smart Home)

  • 정경용;김종훈;강운구;임기욱;이정현
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제8권9호
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    • pp.19-26
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    • 2008
  • 유비쿼터스 컴퓨팅의 발전에 따라 일대일 개인화 서비스를 위한 인프라스트럭처가 구축되면서, 사용자의 상황과 환경, 즉 상황인식 기반 서비스의 중요성이 부각되고 있다. 스마트 홈은 현실공간과 가상공간을 연결하여 가상공간에서 현실의 상황을 정보화하고 이를 활용하여 사용자 중심의 지능화된 서비스를 제공하는 기술이다. 본 논문에서는 스마트 홈에서 마이닝을 이용한 행동 순차 패턴 발견을 제안하였다. 마이닝을 이용하여 위치 트랜잭션에서 발생하는 위치간의 연관 규칙에 시간의 변이를 추가하여 행동 순차 패턴을 발견하였다. 인식된 시간 순서에 따라 사용자가 이동한 경로의 파악 및 행동 방향을 예측하고 그에 따른 서비스가 가능하다. 마이닝을 이용한 행동 순차 패턴의 성능 평가를 하기 위해 대응표본 t검정을 실시하여 유용성을 검증하였다. 평가 결과, 서비스에 대한 만족도의 차이가 통계적으로 의미가 있음을 증명하였고 높은 만족도를 보임을 확인하였다. 따라서 본 연구 결과를 활용하면 시장성 증대와 고부가 가치를 창출할 수 있을 것으로 기대하며 다양한 응용 분야에 활용이 가능하다.

쥐노래미 (Hexagrammos otakii) 성장호르몬 cDNA유전자의 염기서열 변이 및 발현 특성 (Molecular Cloning and Alternative Splicing of Growth Hormone Transcripts in Greenling, Hexagrammos otakii)

  • 남윤권;김동수
    • 한국수산과학회지
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    • 제35권6호
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    • pp.676-681
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    • 2002
  • 우리나라 주요 해산 어종인 쥐노래미 (Hexagrammos otakii)로부터 성장호르몬 유전자 CDNA를 클로닝하고 이의 염기서열과 발현 특성을 분석하였다. 뇌하수체 조직으로부터 CDNA library를 제작하였으며 membrane filter hybridization 및 expressed sequence tag기술을 이용하여 성장호르몬 CDNA transcript들을 대량 발굴하였다. 총 확보된 full-length clone 39개중 31개가 동일한 형태로 나타났으나 나머지 클론들에서는 5'쪽의 염기서열 변이, ORF내의 염기서열 삽입, 3'쪽의 여기서열의 변이 등이 검출되었다. RT-PCR과 RNA dot blot 분석을 수행한 결과 본 연구에서 얻어진 쥐노래미 성장호르몬 transcript들은 뇌하수체 특이적인 전형적인 어류 성장호르몬 발현 특성을 나타내었다.

동영상에서 모양 시퀀스를 이용한 동작 검색 방법 (Movement Search in Video Stream Using Shape Sequence)

  • 최민석
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제12권4호
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    • pp.492-501
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    • 2009
  • 동영상에서 객체의 동작 정보는 장면의 내용을 분류하고 구분하는 중요한 정보로 이용될 수 있다. 본 논문에서는 동영상에서 객체의 동작을 효과적으로 찾기 위한 모양기반 동작 검색 방법을 제안한다. 객체의 동작 정보는 동영상 프레임에서 객체 영역을 추출하여 연속된 2차원 모양 정보로 표현되고, 각각의 2차원 모양 정보는 모양 기술자를 이용하여 1차원 모양 특정값으로 변환된다. 순서에 따라 나열된 모양 기술자 시퀀스를 이용하여 개별 동작의 분할 과정 없이 문서에서 단어를 검색하듯이 동영상에서 객체의 동작을 검색할 수 있다. MPEG-7 모양 변화 기술자와의 성능 비교 실험을 통하여 제안된 방법이 객체의 동작 정보를 보다 효과적으로 표현할 수 있으며, 동작 검색 및 분석 응용에 적용할 수 있음을 보였다.

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Genetic Diversity of Ascaris in China Assessed Using Simple Sequence Repeat Markers

  • Zhou, Chunhua;Jian, Shaoqing;Peng, Weidong;Li, Min
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제56권2호
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    • pp.175-181
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    • 2018
  • The giant roundworm Ascaris infects pigs and people worldwide and causes serious diseases. The taxonomic relationship between Ascaris suum and Ascaris lumbricoides is still unclear. The purpose of the present study was to investigate the genetic diversity and population genetic structure of 258 Ascaris specimens from humans and pigs from 6 sympatric regions in Ascaris-endemic regions of China using existing simple sequence repeat data. The microsatellite markers showed a high level of allelic richness and genetic diversity in the samples. Each of the populations demonstrated excess homozygosity (Ho0). According to a genetic differentiation index (Fst=0.0593), there was a high-level of gene flow in the Ascaris populations. A hierarchical analysis on molecular variance revealed remarkably high levels of variation within the populations. Moreover, a population structure analysis indicated that Ascaris populations fell into 3 main genetic clusters, interpreted as A. suum, A. lumbricoides, and a hybrid of the species. We speculated that humans can be infected with A. lumbricoides, A. suum, and the hybrid, but pigs were mainly infected with A. suum. This study provided new information on the genetic diversity and population structure of Ascaris from human and pigs in China, which can be used for designing Ascaris control strategies. It can also be beneficial to understand the introgression of host affiliation.

C/D, P 및 Z단계 표백시 Xylanase처리에 의한 펄프성질의 변화 (Variation of Oak Kraft Pulp Properties by Xylanase Treatment in C/D, P and Z Stage)

  • 김동호;백기현
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제25권2호
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    • pp.100-109
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    • 1997
  • The objectives of this study was to decrease pollutions of bleaching effluent and was to enhanced brightness of non-chlorine bleached pulps by xylanase treatments. Xylanase cloned Esherichacoli(E. coli) capable of each of endo, exo-xylanase and acetyl-esterase were obtained from Bacillus stearothermophillus. These xylanase was maintained high activity in alkali and high temperature. Especially endo-xylanase would be more active in $60^{\circ}C$ and pH 11. Xylanase pretreatment(X) of unbleached pulp increased brightness, and decreased the degree of delignification. The degree of increase in brightness of pulp due to xylanase pretreatment was similar to non-enzyme treated pulp, regardless of the amount of enzyme added. Therefore, the addition of xylanase of 2 unit was recommended when considering costs of enzyme. The pulp bleached XO sequence had higher brightness and lower Kappa no, than O bleached pulp, while pulp bleached XP sequence had similar brightness and Kappa no. with P bleached pulp. In XOC/D, XOZ and XOP bleaching sequences, brightness and degree of delignification were improved. The C/D and Z stage bleached pulp was good effect on rate of raise in brightness and Kappa no., but P stage bleached pulp had similar level in non-enzyme treated bleaching sequence.

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