• 제목/요약/키워드: Integrated STEM

검색결과 116건 처리시간 0.03초

Visual Cell : 바이오세포 이미지 빅데이터를 위한 이미지 분석 및 시각적 검색 시스템 (Visual Cell : Image Analysis and Visual Retrieval System for Biology Cell Image Bigdata)

  • 박범준;조선화;이수안;신지운;유혁상;김진호
    • 한국빅데이터학회지
    • /
    • 제4권1호
    • /
    • pp.53-61
    • /
    • 2019
  • 주변 세포의 구조적, 생화학적 지지체를 제공하는 세포 외 기질은 세포의 분열과 분화 등을 좌우하는 세포생리 조절인자이다. 바이오 분야에서는 3차원 조직공학 지지체인 스캐폴드를 제작하고, 제작한 스캐폴드에 줄기세포를 배양해 동물에 이식해 조직 재생력을 평가한다. 이는 조직 내 콜라겐과 같은 구성성분에 좌우된다. 따라서 조직 내 구성성분의 포함율 및 분포를 파악하는 것이 매우 중요한데, 이에 관한 데이터를 염색된 조직 이미지의 색상을 분석함으로써 얻어낸다. 이때 이미지 수집부터 분석까지의 과정이 적지 않은 비용이 소모되고 있고, 수집되고 분석된 데이터를 연구 기관마다 상이한 포맷으로 관리하고 있다. 따라서 데이터 통합관리 및 분석결과 검색 등이 이루어지지 않고 있다. 본 논문에서는 관련 빅데이터를 통합적으로 관리할 수 있는 데이터베이스를 구축하고, 이 연구 분야에서 중요한 분석 척도인 색상을 기준으로 검색할 수 있는 바이오 이미지 통합 관리 및 검색 시스템을 제안한다.

  • PDF

제어 기능을 갖는 디지털 컨버전스 장비를 위한 SNMP 확장에 관한 연구 (An Extended SNMP Scheme for a Digital Convergence Device with Control Functions)

  • 허길;김은회;최재영
    • 정보처리학회논문지A
    • /
    • 제16A권5호
    • /
    • pp.369-380
    • /
    • 2009
  • SNMP는 네트워크 장비들을 관리하기 위한 표준 프로토콜로서, 확장성, 정보관리, 인증, 암호화, 접근 제어 등과 같은 우수한 장비 관리기능을 제공한다. 그러나 상황적응형 서비스를 제공하기 위한 제어 기능을 갖는 디지털 컨버전스 장비들을 통합 관리하기에는 제어기능이 취약하며, SNMP 통신 메시지의 길이에 제약이 있다는 단점이 있다. 이러한 문제점을 해결하기 위하여, 본 논문에서는 제어기능을 가진 디지털 컨버전스 장비들을 통합 관리하기 위한 확장된 SNMP를 제안한다. 확장된 SNMP는 다양한 디지털 컨버전스 장비들을 효과적으로 제어하기 위해 SNMP 엔진에 DDS (Device Driver Subsy stem)를 추가하고 CADM (Control Agent Driver Model)을 정의하여 그 구조를 개선하였다. 따라서 설정과 제어 구분의 모호성을 해결하였고, 추상화된 인터페이스를 지원함으로써 SNMP 어플리케이션이 장비를 쉽게 제어할 수 있도록 하였다. 또한 SNMP 통신 메시지 길이의 제약을 받지 않는 세 개의 SNMP 명령어를 추가함으로써 용량이 큰 고수준의 데이터도 전송이 가능하도록 하였다.

High Levels of Hyaluronic Acid Synthase-2 Mediate NRF2-Driven Chemoresistance in Breast Cancer Cells

  • Choi, Bo-Hyun;Ryoo, Ingeun;Sim, Kyeong Hwa;Ahn, Hyeon-jin;Lee, Youn Ju;Kwak, Mi-Kyoung
    • Biomolecules & Therapeutics
    • /
    • 제30권4호
    • /
    • pp.368-379
    • /
    • 2022
  • Hyaluronic acid (HA), a ligand of CD44, accumulates in some types of tumors and is responsible for tumor progression. The nuclear factor erythroid 2-like 2 (NRF2) regulates cytoprotective genes and drug transporters, which promotes therapy resistance in tumors. Previously, we showed that high levels of CD44 are associated with NRF2 activation in cancer stem like-cells. Herein, we demonstrate that HA production was increased in doxorubicin-resistant breast cancer MCF7 cells (MCF7-DR) via the upregulation of HA synthase-2 (HAS2). HA incubation increased NRF2, aldo-keto reductase 1C1 (AKR1C1), and multidrug resistance gene 1 (MDR1) levels. Silencing of HAS2 or CD44 suppressed NRF2 signaling in MCF7-DR, which was accompanied by increased doxorubicin sensitivity. The treatment with a HAS2 inhibitor, 4-methylumbelliferone (4-MU), decreased NRF2, AKR1C1, and MDR1 levels in MCF7-DR. Subsequently, 4-MU treatment inhibited sphere formation and doxorubicin resistance in MCF7-DR. The Cancer Genome Atlas (TCGA) data analysis across 32 types of tumors indicates the amplification of HAS2 gene is a common genetic alteration and is negatively correlated with the overall survival rate. In addition, high HAS2 mRNA levels are associated with increased NRF2 signaling and poor clinical outcome in breast cancer patients. Collectively, these indicate that HAS2 elevation contributes to chemoresistance and sphere formation capacity of drug-resistant MCF7 cells by activating CD44/NRF2 signaling, suggesting a potential benefit of HAS2 inhibition.

Evaluation of Durum Wheat Genotypes for Resistance against Root Rot Disease Caused by Moroccan Fusarium culmorum Isolates

  • Bouarda, Jamila;Bassi, Filippo M.;Wallwork, Hugh;Benchacho, Mohammed;Labhilili, Mustapha;Maafa, Ilyass;El Aissami, Aicha;Bentata, Fatiha
    • The Plant Pathology Journal
    • /
    • 제38권1호
    • /
    • pp.1-11
    • /
    • 2022
  • Fusarium culmorum is one of the most important causal agents of root rot of wheat. In this study, 10 F. culmorum isolates were collected from farms located in five agro-ecological regions of Morocco. These were used to challenge 20 durum wheat genotypes via artificial inoculation of plant roots under controlled conditions. The isolate virulence was determined by three traits (roots browning index, stem browning index, and severity of root rot). An alpha-lattice design with three replicates was used, and the resulting ANOVA revealed a significant (P < 0.01) effect of isolate (I), genotype (G), and G × I interaction. A total of four response types were observed (R, MR, MS, and S) revealing that different genes in both the pathogen and the host were activated in 53% of interactions. Most genotypes were susceptible to eight or more isolates, while the Moroccan cultivar Marouan was reported resistant to three isolates and moderately resistant to three others. Similarly, the Australian breeding line SSD1479-117 was reported resistant to two isolates and moderately resistant to four others. The ICARDA elites Icaverve, Berghisyr, Berghisyr2, Amina, and Icaverve2 were identified as moderately resistant. Principal component analysis based on the genotypes responses defined two major clusters and two sub-clusters for the 10 F. culmorum isolates. Isolate Fc9 collected in Khemis Zemamra was the most virulent while isolate Fc3 collected in Haj-Kaddour was the least virulent. This work provides initial results for the discovery of differential reactions between the durum lines and isolates and the identification of novel sources of resistance.

Atomic Resolution Scanning Transmission Electron Microscopy of Two-Dimensional Layered Transition Metal Dichalcogenides

  • Lu, Ning;Wang, Jinguo;Oviedo, uan Pablo;Lian, Guoda;Kim, Moon Jea
    • Applied Microscopy
    • /
    • 제45권4호
    • /
    • pp.225-229
    • /
    • 2015
  • Transition metal dichalcogenides (TMDs) are a class of two-dimensional (2D) materials that have attracted growing interest because of their promising applications. The properties of TMDs strongly depend on the crystalline structure and the number and stacking sequence of layers in their crystals and thin films. Though electrical, mechanical, and magnetic studies of 2D materials are being conducted, there is an evident lack of direct atom-by-atom visualization, limiting insight on these highly exciting material systems. Herein, we present our recent studies on the characterization of 2D layered materials by means of aberration corrected scanning transmission electron microscopy (STEM), in particular via high angle annular dark field (HAADF) imaging. We have identified the atomic arrangements and defects in 2H stacked TMDs, 1T stacked TMDs, distorted 1T stacked TMDs, and vertically integrated heterojunctions of 2D TMDs crystals.

Development and Characterization of a New Cell Line from Olive Flounder Paralichthys olivaceus

  • Kim, Ju-Won;Oh, Bang Geun;Kim, Julan;Kim, Dong-Gyun;Nam, Bo-Hye;Kim, Young-Ok;Park, Jung Youn;Cheong, JaeHun;Kong, Hee Jeong
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
    • /
    • 제22권3호
    • /
    • pp.225-234
    • /
    • 2018
  • A new embryonic cell line (OFEC-17FEN) derived from olive flounder Paralichthys olivaceus was developed. OFEC-17FEN cells were subcultured for <30 passages over ~200 days. OFEC-17FEN cells had a doubling time of 114.34 h and modal diploid chromosome number was 48. The pluripotency genes POU5f1 and NANOG were expressed in OFEC-17FEN cells. However, the lack of several pluripotency-related genes expression indicates that OFEC-17FEN cells are not stem cells. OFEC-17FEN cells transfected with plasmid pEGFP-c1 exhibited a strong green fluorescent signal at 48 h after transfection. Accordingly, OFEC-17FEN cells may be useful for both basic research and biotechnological application.

10 Gb/s XFP Transceiver용 Transmitter Optical Sub-assembly(TOSA)의 RF 설계/제작 및 주파수 특성 해석 (Design, Fabrication and Frequency Analysis of Transmitter Optical Sub-assembly for a 10 Gb/s XFP Transceiver)

  • 김동철;심종인;박문규;어영선
    • 한국광학회지
    • /
    • 제15권4호
    • /
    • pp.349-354
    • /
    • 2004
  • XFP(10 Gb/s Small Form Factor Pluggable) 트랜시버 모듈에 사용되는 광송신 서브어셈블리(TOSA: Transmitter Optical Sub-assembly)를 열적, 전기적 측면에서 설계, 제작 및 평가하였다. 저가격이며 소형인 TOSA를 제작하기 위해서 바이어스 티 및 정합저항등을 AlN서브마운트 위에 집적하였다. 10 Gb/s의 초고속 전기 신호의 입력을 위해 CPW형 마이크로파 전송로를 스템 구조체내에 도입하였다. 소자의 전기적 특성 분석을 위해 서브마운트내에 실장되는 각종 전기광학 부품들과 스템 구조체들을 고속회로 모델링 하였다. 제작한 TOSA의 특성평가를 통해, 85$^{\circ}C$에서 11 GHz 이상의 -3 dB 대역폭을 얻을 수 있었다.

그룹웨어의 현황 분석 Ⅰ (Groupware Current Status Analysis Ⅰ)

  • 김선욱;김봉진
    • 산업공학
    • /
    • 제10권3호
    • /
    • pp.75-93
    • /
    • 1997
  • Unlike individual applications, it is extremely hard to obtain user requirements for group systems, since there exists very complicated dynamics in group. This may result in spreading a great amount of products with a broad range of contents. Thus, this study presents a comparative analysis of groupware products. As a result, these products have been categorized into three areas which include cooperation/document management systems, collaborative writing systems, and decision-making/meeting systems. While the systems reviewed here focus on the cooperation/document management systems, the other two areas will be dealt in details in part Ⅱ. The first area ends up with two large categories such as proprietary groupware products and intranet groupware products. However, it has been observed that there is a natural convergence between these two categories. Consequently, the comparative analysis has been performed in terms of functions provided on the two categories and a combined category. Each group of the functions has been divided into three parts which consist of basic functions, quasi-basic functions, and others. Such a decision has been made based on the frequency rate of the functions provided in the products. With a more strict rule, the basic functions comprise electronic mail, sanction, bulletin board, document management, scheduling, security, Web browser, and Internet connectivity. This study also provides a framework for integrated functional model of groupware systems. The basic functions are merged into the model. However, the model is so flexible that it can partially include the quasi-functions in addition to the basic functions. In the future, it is expected that a large number of products will stem from the modification of the functional model.

  • PDF

토마토 암면재배에서 정전용량 측정장치를 기반으로 한 급액방법 구명 (Determination of Proper Irrigation Scheduling for Automated Irrigation System based on Substrate Capacitance Measurement Device in Tomato Rockwool Hydroponics)

  • 한동섭;백정현;박주성;신원교;조일환;최은영
    • 생물환경조절학회지
    • /
    • 제28권4호
    • /
    • pp.366-375
    • /
    • 2019
  • 본 실험은 토마토(Solanum lycopersicum L. 'Hoyong' 'Super Doterang') 암면재배에서 배지 전체의 정전용량을 측정할 수 있는 장치(Substrate capacitance measurement device, SCMD)를 기반으로 한 적정 급액 방법을 구명하기 위하여 누적일사량 제어구(Integrated solar radiation automated irrigation, ISR)와 물관수액흐름 제어구(sap flow automated irrigation, SF)를 대조구로 비교하면서 봄부터 여름철과 겨울철에 재배를 실시하였다. SCMD 제어구는 급액 개시 후 배지 한 개당 설정된 배액 목표량이 처음 발생하는 시점까지 10분간격으로 급액하였고 첫 배액이 배출되면 그 때의 배지의 정전용량(Capacitance)을 100%로 간주하고 그 기준치의 급액제어점(Capacitance threshold, CT)에 도달하면 급액 되었고 그 뒤 목표 배액량이 발생하면 급액이 멈추는 방식으로 제어되었다. 봄부터 여름재배에서 실험 처리를 위해 SCMD제어구의 일회 급액량 (Irrigation volume per event)을 50, 75, 또는 100mL로 설정하였고 겨울철 재배에서는 CT가 0.65, 0.75, 또는 0.90가 되면 급액 되도록 설정하였다. 봄부터 여름철 재배에서 일회 급액량을 50, 75, 100mL로 설정하였을 때 급액 횟수는 각각 39, 29, 19회였고 배액율은 각각 3.04, 9.25, 20.18%였다. 겨울철 재배에서 CT를 0.65, 0.75, 0.90로 설정하였을 때 급액횟수는 각각 5.67, 6.50, 14.67회였고 배액율은 9.91, 10.78, 35.3%였다. 봄부터 여름철 재배에서 일회 급액량 처리에 따른 물관수액흐름속도(SF) 변화는 1회 급액량과 배액량을 각각 50과 75mL로 제한한 경우 100mL로 제한한 경우와 비교하여SF 신호가 외부 광량 신호 (SI) 보다 늦어지는 경향(time lag)을 보였고 겨울철 재배에서 CT를 0.65로 설정한 경우는 물관수액흐름 속도나 함수율이 매우 낮아졌고 CT를 0.90로 설정한 경우는 함수율과 물관수액흐름 속도는 매우 높았으나 많은 배액이 배출되었다. 따라서 토마토 봄부터 여름철 재배에서 SCMD를 활용하여 CT를 0.9로, 배지 한 개당 배액 목표량을 100mL로 설정하였을 때 일회 급액량은 75~100mL 범위가 적합하고 겨울철 재배에서는 1회 급액량을 75mL로, 배액 목표량을 70mL로 설정하였을 때 CT는 0.75이상 0.9이하 범위가 적합할 것으로 판단되었다. 앞으로 정전용량 값과 배지 용적수분함량의 관계성을 구명하고 보정계수를 구하는 연구가 필요할 것으로 판단된다.

신개간경사지(新開墾傾斜地) 토양개량(土壤改良)과 작물생육(作物生育)에 관(關)한 연구(硏究) III. 토양개량(土壤改良)이 토양화학성(土壤化學性)과 청예용(靑刈用) 옥수수 생육(生育)에 미치는 영향(影響) (The Soil Improvement and Plant Growth on the Newly-Reclaimed Sloped Land III. Effects of Soil Improvement on the Soil Chemical Properties and Silage Corn Growth)

  • 허봉구;김무성;한기학;강우성
    • 한국토양비료학회지
    • /
    • 제22권3호
    • /
    • pp.197-204
    • /
    • 1989
  • 지력(地力)이 낮은 신개간경사지(新開墾傾斜地) 토양(土壤)을 개량(改良)하기 위(爲)하여 대조구(對照區), 퇴비구(堆肥區), 심경구(深耕區), 석회구(石灰區), 인산구(燐酸區) 및 종합개량구(綜合改良區) 등(等)의 6개(個) 처리구(處理區)를 경사(傾斜) 20%인 송정(松汀)에 설치(設置)하고 1985년(年)부터 3년간(年間) 청예용(靑刈用) 옥수수를 재배(栽培)했을때 토양개량(土壤改良) 요인별(要因別) 처리(處理)가 토양(土壤)의 화학성(化學性) 및 옥수수 생육(生育)과 청예수량(靑刈收量)에 미치는 영향(影響)을 구명(究明)하기 위(爲)하여 실시(實施)한 시험(試驗)의 결과(結果)는 다음과 같다. 1. 토양(土壤)의 pH는 표토(表土)에서 대조구(對照區)와 인산구(燐酸區)를 제외(除外)하고는 5.0이상(以上)이었고 심토(心土)에서는 석회구(石灰區)와 종합개량구(綜合改良區)만이 5.0이상(以上)이었다. 유기물(有機物) 함량(含量)은 표토(表土)에서 대조구(對照區)와 심경구외(深耕區外)에는 2.0% 이상(以上)이었고 심토(心土)에서는 대조구(對照區)와 종합개량구(綜合改良區)가 낮았으며 양(陽)이온 치환용량(置換容量)은 대조구(對照區) 외(外)에는 표토(表土) 7.4~7.8 me/100g, 심토(心土) 7.0~7.7 me/100g 범위(範圍)에 있었다. 2. 근권토양(根圈土壤)의 미생물상중(微生物相中) 세균밀도(細菌密度)는 종합개량구(綜合改良區)에서 가장 높았고 출사기(出絲期)보다는 수확기(收穫期)때가 높았으며 전(全) 처리간(處理間)의 평균(平均)은 세균(細菌)이 $61.3{\times}10^5/g$이고 균류(菌類)와 방선균(放線菌)은 비슷하였고 B/F 비(比)는 28.5, B/A 비(比)는 2.9이었다. 3. 토양(土壤) 층위별(層位別) 뿌리 분포(分布)는 심경(深耕)을 한 심경구(深耕區)와 종합개량구(綜合改良區)에서 뿌리량이 가장 많았고 10cm 이하(以下)에서의 뿌리량도 많았다. 4. 무기성분중(無機成分中) 총질소(總窒素) 함량(含量)은 종합개량구(綜合改良區)에서 가장 높았고 인산함량(燐酸含量)은 엽(葉)에서는 퇴비구(堆肥區)와 종합개량구(綜合改良區)가 높고 간(稈)과 종실(種實)은 비슷하였다. 가리함량(加里含量)은 식물체(植物體) 전체(全體)가 종합개량구(綜合改良區)가 가장 높았다. 옥수수 건물중(乾物重)은 총질소(總窒素) 함량(含量)에서 상관계수(相關係數)가 가장 높았으며 인산(燐酸), 칼슘, 마그네슘과도 유의성(有意性)이 있었으나 가리(加里)와는 유의성(有意性)이 없었다.

  • PDF