• 제목/요약/키워드: $PI(4,5)P_2$

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콩 P34 단백질 결핍 유전자를 이용한 SSLP 마커 개발 (Development of SSLP Marker Targeted to P34 Null Gene in Soybean)

  • 양기웅;고종민;이영훈;전명기;정찬식;백인열;김현태;박금룡
    • 한국육종학회지
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    • 제42권5호
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    • pp.502-506
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    • 2010
  • 콩 알레르기에 민감한 사람들은 15가지가 넘는 콩 알레르기 단백질을 인지한다. 이러한 알레르기 단백질 때문에 콩의 광범위한 사용이 제한적이다. 시스테인 프로테아제에 속하는 P34 단백질은 콩의 주된 알러젠이다. 미국 국무부에서 16,226개의 유전자원에서 P34 단백질이 결핍된 PI567476 유전자원을 찾아냈다. P34 유전자 염기서열과 P34 유전자가 결실된 염기서열을 NCBI 데이터베이스에서 확인한 결과 P34 유전자가 결실된 염기서열에서 4 bp 가 삽입되었다는 것을 확인하였고, 그 부위에서 SSLP 마커를 개발하였다. 본 연구에서는 태광콩과 PI567476을 이용한 교배조합 $F_2$ 339개체를 개발한 분자표지마커로 확인하였다. 실험결과 태광콩 유형과 heterozygous 유형 및 PI567476 유형의 분리비는 85: 187: 67로 $X^2{_{0.05}}=5.99$, df=2에서 1:2:1의 분리비로 하나의 유전자가 관여한다는 것으로 나타났다. 앞으로 P34 단백질 관련 분자마커가 단백질 수준에서 정확히 일치하는지 확인 할 것이다.

Partial-isolation LDMOS의 항복전압과 온저항 분석 (Breakdown Voltage and On-resistance Analysis of Partial-isolation LDMOS)

  • 김신욱;이명진
    • 전기전자학회논문지
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    • 제27권4호
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    • pp.567-572
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    • 2023
  • 본 논문에서는 Partial isolation lateral double diffused metal oxide semiconductor(Pi-LDMOS)의 항복전압에 대해 시뮬레이션을 통해 분석하였다. 항복전압 변화는 Partial buried oxide(P-BOX)의 다양한 파라미터(길이, 두께, 위치)에 따라 조사되었고, 그 메커니즘에 대해 명기하였다. 또한 항복전압과 trade-off 관계에 있는 온저항의 변화를 P-BOX 파라미터 변화에 따라 분석하였고 Figure of merit(FOM)을 계산하여 비교하였다. 제안된 구조에서 Lbox=5㎛, tbox=2㎛, Lbc=2㎛일 경우 138V의 가장 높은 항복전압을 나타내었고, Lbox=5㎛, tbox=1.6㎛, Lbc=2㎛일 경우 가장 높은 FOM을 나타내었다. 이는 conventional LDMOS 대비 항복전압은 123%, FOM은 3.89배 향상된 수치이다. 따라서 Pi-LDMOS는 높은 항복전압과 FOM을 가져 Power IC의 안정적인 동작범위 향상에 기여할 수 있다.

Kiwifruit 과육에 존재하는 단백질분해효소의 특성과 열안정성 (Properties and Thermostability of Gelatin-degrading Proteinases in the Fruit of Actinidia chinensis (Kiwifruit))

  • 오순자;김성철;고석찬
    • 생명과학회지
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    • 제12권6호
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    • pp.752-758
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    • 2002
  • 본 연구에서는 단백질분해효소의 산업적 이용을 위하여 kiwifruit 과육 속에 들어 있는 gelatin분해활성을 조사하였다. Kiwifruit 과육에는 3개의 단백질분해효소의 활성 밴드(PI, PII, PIII)가 관찰되었다. 단백질분해효소 PI은 220 kD, PII는 51 kD, PIII는 26 kD에 해당하는 것으로 추정할 수 있었다. 이들 단백질분해효소 PI, PII, PIII는 모두 pH 2.0~5.0 범위에서 높은 활성을 보였으며 pH 4.0에서 가장 높게 나타났다. 이들 단백질분해효소 PI, PII, PIII는 모두 cysteine proteinase 저해제인 E-64와 iodoacetate에 의해서 저해되었으며, cysteine proteinase를 촉진하는 DTT, cysteine 및 $\beta$-mercaptoethanol에 의해서 활성이 증가하였다. 그 중 단백질분해효소 PIII는 분자량과 효소의 특성으로 보아 actinidin (EC 3.4.22.14)과 동일한 것으로 판단되었다. 단백질분해효소 PI, PII, PIII는 모두 $Ca^{2+}$, $Mg^{2+}$$Mn^{2+}$에 의해 촉진되었으며 $Zn^{2+}$$Hg^{2+}$에 의해 완전히 저해되는 것으로 나타났다. 하지만, $Co^{2+}$, $Cu^{2+}$, $Al^{3+}$, $Fe^{3+}$ 등 금속이온의 영향이 다소 다르게 나타났다. Kiwifruit 과육의 단백질분해효소 PI, PII, PIII 중에서 PI과 PII는 온도가 증가함에 따라 활성이 점차 낮아졌으나 PIII는 비교적 안정한 것으로 조사되었다. 특히, PIII는 $50^{\circ}C$ 이내의 범위에서 48시간 경과시에도 75% 이상의 활성을 보여 이 범위의 온도에서는 상당 시간 동안 안정한 것으로 나타났다.

Hesperetin Inhibits Vascular Formation by Suppressing of the PI3K/AKT, ERK, and p38 MAPK Signaling Pathways

  • Kim, Gi Dae
    • Preventive Nutrition and Food Science
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    • 제19권4호
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    • pp.299-306
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    • 2014
  • Hesperetin has been shown to possess a potential anti-angiogenic effect, including vascular formation by endothelial cells. However, the mechanisms underlying the potential anti-angiogenic activity of hesperetin are not fully understood. In the present study, we evaluated whether hesperetin has anti-angiogenic effects in human umbilical vascular endothelial cells (HUVECs). HUVECs were treated with 50 ng/mL vascular endothelial growth factor (VEGF) to induce proliferation as well as vascular formation, followed by treatment with several doses of hesperetin (25, 50, and $100{\mu}M$) for 24 h. Cell proliferation and vascular formation were analyzed using the 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide and tube formation assay, respectively. In addition, cell signaling related to cell proliferation and vascular formation was analyzed by western blot. Furthermore, a mouse aorta ring assay was performed to confirm the effect of hesperetin on vascular formation. Hesperetin treatment did not cause differences in HUVECs proliferation. However, hesperetin significantly inhibited VEGF-induced cell migration and tube formation of HUVECs (P<0.05). Moreover, hesperetin suppressed the expression of ERK, p38 MAPK, and PI3K/AKT in the VEGF-induced HUVECs. In an ex vivo model, hesperetin also suppressed microvessel sprouting of mouse aortic rings. Taken together, the findings suggest that hesperetin inhibited vascular formation by endothelial cells via the inhibition of the PI3K/AKT, ERK and p38 MAPK signaling.

Increased Activity of Large Conductance $Ca^{2+}-Activated$ $K^+$ Channels in Negatively-Charged Lipid Membranes

  • Park, Jin-Bong;Ryu, Pan-Dong
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제2권4호
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    • pp.529-539
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    • 1998
  • The effects of membrane surface charge originated from lipid head groups on ion channels were tested by analyzing the activity of single large conductance $Ca^{2+}-activated\;K^+$ (maxi K) channel from rat skeletal muscle. The conductances and open-state probability ($P_o$) of single maxi K channels were compared in three types of planar lipid bilayers formed from a neutral phosphatidylethanolamine (PE) or two negatively-charged phospholipids, phosphatidylserine (PS) and phosphatidylinositol (PI). Under symmetrical KCl concentrations $(3{\sim}1,000\;mM)$, single channel conductances of maxi K channels in charged membranes were $1.1{\sim}1.7$ times larger than those in PE membranes, and the differences were more pronounced at the lower ionic strength. The average slope conductances at 100 mM KCl were $251{\pm}9.9$, $360{\pm}8.7$ and $356{\pm}12.4$ $(mean{\pm}SEM)$ pS in PE, PS and PI membranes respectively. The potentials at which $P_o$ was 1/2, appeared to have shifted left by 40 mV along voltage axis in the membranes formed with PS or PI. Such shift was consistently seen at pCa 5, 4.5, 4 and 3.5. Estimation of the effect of surface charge from these data indicated that maxi K channels sensed the surface potentials at a distance of $8{\sim}9\;{\AA}$ from the membrane surface. In addition, similar insulation distance ($7{\sim}9\;{\AA}$) of channel mouth from the bilayer surface charge was predicted by a 3-barrier-2-site model of energy profile for the permeation of $K^+$ ions. In conclusion, despite the differences in structure and fluidity of phospholipids in bilayers, the activities of maxi K channels in two charged membranes composed of PS or PI were strikingly similar and larger than those in bilayers of PE. These results suggest that the enhancement of conductance and $P_o$ of maxi channels is mostly due to negative charges in the phospholipid head groups.

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원형질막 타기팅에 필요한 ApPDE4의 N-말단의 아미노산 서열 분석 및 발현에 의한 형태적 변화 (Identification of N-terminal amino acids of ApPDE4 involved in targeting to plasma membrane and cellular morphological change by expression of N-terminal peptide)

  • 김건형;전용우;이진아;장덕진
    • 분석과학
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    • 제26권1호
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    • pp.106-112
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    • 2013
  • Phosphodiesterase (PDE)는 세포내의 cAMP를 분해하는 효소로 세포의 신호 전달에 중요한 기능을 수행하는 것으로 알려져 왔다. 각각의 PDE들은 N-말단의 서열을 통해 세포 내 특정 부위로 이동되어 기능을 수행한다. 이전의 연구를 통해 바다달팽이인 군소에서 새롭게 클로닝된 ApPDE4 long-form이 원형질막과 시냅스전 뉴런의 말단에 발현됨을 확인하였다. 그러나, 현재까지 이러한 세포내 작용부위로의 이동, 즉 타겟팅(targeting)에 필요한 최소부위가 어디인지, 이러한 타겟팅이 세포에 미치는 영향은 무엇인지는 보고되지 않았다. 따라서, 본 연구에서는 이를 알아보기 위해 첫째, 원형질막으로 타겟팅에 필요한 최소부위를 알아 보고자 하였다. 이를 위해 다양한 결실돌연변이체를 제작하고, 이들의 이동과 분포를 확인한 결과, N-말단 13개의 아미노산만으로도 원형질막으로 타기팅에 충분하다는 것을 확인할 수 있었다. 또한, ApPDE4 N-말단의 20개 아미노산을 mRFP에 융합해서 만든 ApPDE4(N20)-mRFP를 HEK293T 세포에 과발현시킨 결과, 기포(bleb)가 생성되는 세포의 비정상적인 형태 변화가 관찰 되었다. 이러한 형태적 변화는 ApPDE4가 원형질막으로 타겟팅되는 것과 관련이 있었다. 대표적인 인지질의 하나인 PI4,$5P_2$에 선택적으로 결합함으로써 원형질막으로 타겟팅되는 단백질인 mRFP-$PLC{\delta}1$(PH)의 과발현도 ApPDE4(N20)-mRFP와 비슷한 세포의 형태적 변화가 유도됨을 확인할 수 있었다. ApPDE4의 N-말단은 PI4,$5P_2$와 같은 인지질과의 결합으로 원형질막으로 타겟팅될 수 있고, 형태적 변화를 유도하는 가능성을 제시한다.

양마의 제주지역 지역 적응성, 생산성 및 사료가치에 관한 연구 (Study on Adaptation, Dry Matter Yield and Nutrient Value of Kenaf(Hibiscus cannabinus L.) on Jeju Province)

  • 황경준;김문철;강시용;유장걸;송상택;박남건;김종하
    • 한국초지조사료학회지
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    • 제22권4호
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    • pp.287-296
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    • 2002
  • 본 시험은 제주지역에서 양마의 적응성과 생산량 및 사료가치를 구명하기 위해서 양마 Evergrlades 41, China Chong-pi 3 및 수수$\times$수단 교잡종 Pioneer 947를 이용하여 2000년 5월부터 11월까지 제주의 4개 지역( 제주시, 서귀포시, 성산 수산 및 한림 금악)에서 수행되었다. 건물수량은 수수$\times$수단 교잡종 (pioneer 947), 양마 (Everglades 41) 및 (China Chong-pi 3)을 비교시 각각 7,313, 4,653 및 5,238 kg/ha로서 Chong-pi 3이 가장 높은 수량을 보였고(P<0.05) 지역별(제주, 서귀, 성산 및 한림)로 각 각 5,040, 5,663, 7,283 및 4,950 kg/ha서 성산지역이 가장 높은 수량을 보였다(P<0.05). 양마 두 품종 모두에서 1회 수확이 2회 수확 보다 높은 건물수량을 보였다. NDF 및 ADF 함량은 두 양마 품종간 또는 수수X수단 교잡종과 양마간 뚜렷한 차이가 없었고 조단백질 함량은 수수$\times$수단 교잡종 Pioneer 947, 양마 Everglades 41 및 China Chong-pi 3에서 각각 12.60, 16.1 및 16.20%를 보여 수수$\times$수단 교잡종 보다 양마에서 높은 조단백질 함량을 보였으며(p<0.05) 지역 간에 차이가 분명치 않았다. 그러나 1회 예취(13.72%) 보다 2회 예취 시(17.75%) 양마의 조단백질 함량이 유의적으로 증가하였고(P<0.05) 한편 NDF(50.61, 42.57%)와 ADF(50.66, 41.61) 함량은 1회 보다 2회에서 유의적 감소를 보였다. (P<0.05). 수확이 끝난 후 수수$\times$수단 교잡종(Pioneer 947)과 양마 2 품종(Everglades 41, China-chong-pi 3)을 재배했던 4개 지역 토양에 대한 중금속 함량을 조사한 결과 처리간 뚜렷한 차이를 발견치 못했다. 결론적으로 양마는 수수$\times$수단 교잡종 보다 건물수량이 높지 못하였으나 조단백질 함량이 수수$\times$수단 교잡종 보다 높았고 그 중 1회 보다 2회 예취를 하므로 더 높은 조단백질 함량 을 보였다.

Kiwifruit 과육의 단백질분해효소의 생화학적 특성과 산업화 방안 검토

  • 오순자;고석찬
    • 한국자원식물학회:학술대회논문집
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    • 한국자원식물학회 2003년도 춘계 학술발표대회
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    • pp.142-142
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    • 2003
  • 본 연구에서는 kiwifruit 과육 속에 들어 있는 단백질분해효소의 gelatin분해활성을 조사하고 그 산업적 방안을 검토하였다. Kiwifruit 과육에서 3개의 단백질분해효소의 활성 밴드(PI, PII, PIII)가 관찰되었다. 단백질분해효소 PI은 220 kD, PII는 51 kD, PIII는 26 kD에 해당하는 것으로 추정할 수 있었다. 이들 단백질분해효소 PI, PII, PIII는 모두 pH 2.0~5.0 범위에서 높은 활성을 보였으며 pH 4.0에서 가장 높게 나타났다. 이들 단백질분해효소 PI, PII, PIII는 모두 cysteine proteinase 저해제인 E-64와 iodoacetate에 의해서 저해되었으며, cysteine proteinase를 촉진하는 DTT, cysteine 및 $\beta$-mercaptoethanol에 의해서 활성이 증가하였다. 그 중 단백질분해효소 PIII는 분자량과 효소의 특성으로 보아 actinidin (EC 3.4.22.14)과 동일한 것으로 판단되었다. 단백질분해효소 PI, PII, PIII는 모두 $Ca^{2+}$, $Mg^{2+}$$Mn^{2+}$에 의해 촉진되었으며, $Zn^{2+}$과 Hg$^{2+}$에 의해 완전히 저해되는 것으로 나타났다. 하지만, Co$^{2+}$, Cu$^{2+}$, $Al^{3+}$ , Fe$^{3+}$ 등 금속이온의 영향은 다소 다르게 나타났다. Kiwifruit 과육의 단백질분해효소 PI, PII, PIII 중에서 PI과 PII는 온도가 증가함에 따라 활성이 점차 낮아졌으나 PIII는 비교적 안정한 것으로 조사되었다. 특히, PIII는 5$0^{\circ}C$ 이내의 범위에서 48시간 경과시에도 75% 이상의 활성을 보여 이 범위의 온도에서는 상당 시간 동안 안정한 것으로 나타났다. 단백질분해효소의 산업적 가치를 고려해 볼 때 우선적으로 넓은 기질특이성과 열안정성이 높아야 한다. Kiwifruit에서 추출한 단백질분해효소는 4$0^{\circ}C$ 전후에서 최대의 활성을 보이고, 고온에서도 상당 시간 비교적 안정한 특성을 보여 식품제조, 식육연화 등 식품산업 분야에서의 활용가능성이 높을 것으로 보이며, 나아가 단백질이 갖는 식품학적 기능성을 높이는 데에도 사용할 수 있을 것으로 판단된다.

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인 축정능이 우수한 세균의 분리 및 동정 (Isolation and Identification of High Phosphate-accumulating Bacteria)

  • 신공식;고정연;최우영
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제27권4호
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    • pp.286-291
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    • 1999
  • By using autoradiography and phosphate medium, high phosphate accumulating bacteria were isolated from the soil of protected cultivation area and activated sludge. Selected strain, PO8, was gram-negative, rod/spherial(0.5~0.6$\times$1.0~1.2${\mu}{\textrm}{m}$ in size) and non-motile. PI4, another selected strain, was gram-negative, rod(0.4~0.5$\times$1.5~1.6${\mu}{\textrm}{m}$ in size) and motile. It also had flagella. According to their morphological, physiological and biochemical properties, the stains were identified as Acinetobacter lwoffi PO8 and Chromobacterium lividum PI4, respectively. A. lowoffi PO8 and C. lividum PI4 cultured in the P-1 medium containing 150ppm phosphate were able to uptake high phosphate up to 92% and 85%, respectively after 24 hours at 3$0^{\circ}C$ during liquid culture.

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Analysis of Cholangitis Rates with Extended Perioperative Antibiotics and Adjuvant Corticosteroids in Biliary Atresia

  • Goh, Lynette;Phua, Kong Boo;Low, Yee;Chiang, Li Wei;Yong, Chen;Chiou, Fang Kuan
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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    • 제24권4호
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    • pp.366-376
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    • 2021
  • Purpose: There is no consensus regarding adjuvant therapies following Kasai portoenterostomy (KP) for biliary atresia (BA). This study aimed to analyze the effect of extended perioperative intravenous antibiotics (PI-Abx) and adjuvant corticosteroid on cholangitis and jaundice clearance rates in the 3 years post-KP in children with BA. Methods: Data of patients who underwent KP between 1999-2018 at a single center were retrospectively analyzed. Group A (1999-2010) received PI-Abx for 5 days, Group B (2010-2012) received PI-Abx for 5 days plus low-dose prednisolone (2 mg/kg), and Group C (2012-2017) received PI-Abx for 14 days plus high-dose prednisolone (5 mg/kg). Results: Fifty-four patients were included with groups A, B, and C comprising 25, 9, and 20 patients, respectively. The number of episodes of cholangitis was 1.0, 1.6, and 1.3 per patient (p=NS) within the first year and 1.8, 2.3, and 1.7 (p=NS) over 3 years in Groups A, B, and C, respectively. The jaundice clearance rate at 6 months was 52%, 78%, and 50% (p=NS), and the 3-year native liver survival (NLS) rate was 76%, 100%, and 80% (p=NS) in Groups A, B, and C, respectively. A near-significant association was observed between the incidence of cholangitis within the first year and decompensated liver cirrhosis/death at 3 years post KP (p=0.09). Persistence of jaundice at 6 months was significantly associated with decompensated cirrhosis/death at 3 years (p<0.001). Conclusion: The extended duration of PI-Abx and adjuvant corticosteroids was not associated with improved rates of cholangitis, jaundice clearance, or NLS in patients with BA.