• Title/Summary/Keyword: principal component regression

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Attenuated total reflection Fourier transform infrared as a primary screening method for cancer in canine serum

  • Macotpet, Arayaporn;Pattarapanwichien, Ekkachai;Chio-Srichan, Sirinart;Daduang, Jureerut;Boonsiri, Patcharee
    • Journal of Veterinary Science
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    • 제21권1호
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    • pp.16.1-16.10
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    • 2020
  • Cancer is a major cause of death in dogs worldwide, and the incidence of cancer in dogs is increasing. The attenuated total reflection Fourier transform infrared spectroscopic (ATR-FTIR) technique is a powerful tool for the diagnosis of several diseases. This method enables samples to be examined directly without pre-preparation. In this study, we evaluated the diagnostic value of ATR-FTIR for the detection of cancer in dogs. Cancer-bearing dogs (n = 30) diagnosed by pathologists and clinically healthy dogs (n = 40) were enrolled in this study. Peripheral blood was collected for clinicopathological diagnosis. ATR-FTIR spectra were acquired, and principal component analysis was performed on the full wave number spectra (4,000-650 cm-1). The leave-one-out cross validation technique and partial least squares regression analysis were used to predict normal and cancer spectra. Red blood cell counts, hemoglobin levels and white blood cell counts were significantly lower in cancer-bearing dogs than in clinically healthy dogs (p < 0.01, p < 0.01 and p = 0.03, respectively). ATR-FTIR spectra showed significant differences between the clinically healthy and cancer-bearing groups. This finding demonstrates that ATR-FTIR can be applied as a screening technique to distinguish between cancer-bearing dogs and healthy dogs.

Other faunas, coral rubbles, and soft coral covers are important predictors of coral reef fish diversity, abundance, and biomass

  • Imam Bachtiar;Tri Aryono Hadi;Karnan Karnan;Naila Taslimah Bachtiar
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제26권4호
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    • pp.268-281
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    • 2023
  • Coral reef fisheries are prominent for the archipelagic countries' food sufficiency and security. Studies showed that fish abundance and biomass are affected by biophysical variables. The present study determines which biophysical variables are important predictors of fish diversity, abundance, and biomass. The study used available monitoring data from the Indonesian Research Center for Oceanography, the National Board for Research and Innovation. Data were collected from 245 transects in 19 locations distributed across the Indonesian Archipelago, including the eastern Indian Ocean, Sunda Shelf (Karimata Sea), Wallacea (Flores and Banda Seas), and the western Pacific Ocean. Principal component analysis and multiple regression model were administered to 13 biophysical metrics against 11 variables of coral reef fishes, i.e., diversity, abundance, and biomass of coral reef fishes at three trophic levels. The results showed for the first time that the covers of other fauna, coral rubbles, and soft corals were the three most important predictor variables for nearly all coral reef fish variables. Other fauna cover was the important predictor for all 11 coral reef fish variables. Coral rubble cover was the predictor for ten variables, but carnivore fish abundance. Soft coral cover was a good predictor for corallivore, carnivore, and targeted fishes. Despite important predictors for corallivore and carnivore fish variables, hard coral cover was not the critical predictor for herbivore fish variables. The other important predictor variables with a consistent pattern were dead coral covered with algae and rocks. Dead coral covered with algae was an important predictor for herbivore fishes, while the rock was good for only carnivore fishes.

Gender differences in the association between food costs and obesity in Korean adults: an analysis of a population-based cohort

  • Soim Park;Jihye Kim
    • Nutrition Research and Practice
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    • 제17권5호
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    • pp.984-996
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    • 2023
  • BACKGROUND/OBJECTIVES: Prior studies, mostly conducted in Western countries, have suggested that the low cost of energy-dense foods is associated with an increased risk of obesity. This study aimed to investigate the association between food costs and obesity risk among Koreans who may have different food cost and dietary patterns than those of Western populations. SUBJECTS/METHODS: We used baseline data from a cohort of 45,193 men and 83,172 women aged 40-79 years (in 2006-2013). Dietary intake information was collected using a validated food frequency questionnaire. Prudent and Western dietary patterns extracted via principal component analysis. Food cost was calculated based on Korean government data and market prices. Logistic regression analyses were performed to investigate the association of daily total, prudent, and Western food cost per calorie with obesity. RESULTS: Men in the highest total food cost quintile had 15% higher odds of obesity, after adjusting for demographic characteristics and lifestyle factors (adjusted odds ratio, 1.15; 95% confidence interval, 1.08-1.22; P-trend < 0.001); however, this association was not clear in women (P-trend = 0.765). While both men and women showed positive associations between prudent food cost and obesity (P-trends < 0.001), the association between Western food cost and obesity was only significant in men (P-trend < 0.001). CONCLUSIONS: In countries in which consumption of Western foods is associated with higher food costs, higher food costs are associated with an increased risk of obesity; however, this association differs between men and women.

중환자실 섬망 환자와 비섬망 환자 구분에 기여하는 임상 지표에 관한 연구 (A Study on Clinical Variables Contributing to Differentiation of Delirium and Non-Delirium Patients in the ICU)

  • 고찬영;김재진;조동래;오주영;박진영
    • 정신신체의학
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    • 제27권2호
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    • pp.101-110
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    • 2019
  • 연구목적 중환자실 환자들의 섬망 발생 유무와 관련이 되어 있는 것으로 알려진 많은 임상 지표들이 있지만, 이 중 실제 섬망군과 비섬망군을 분류하는 데 있어서 어떠한 지표가 보다 중요한 역할을 하는지에 대한 연구는 충분히 이루어지지 않았다. 본 연구는 중환자실 내에서 섬망이 발생한 군과 발생하지 않은 군 사이의 재실 기간 내 특징을 비교하고, 두 군을 효과적으로 구분할 수 있는 임상 지표들을 확인하고자 하였다. 방 법 2013년 3월 1일부터 2017년 5월 31일까지 강남세브란스병원 중환자실에 있던 6386명의 환자들 중, 섬망과 연관성을 보일 것으로 예상되는 40개의 임상 지표에 대한 데이터가 재실 기간 중 적어도 한 번 이상 측정되거나, 확인이 가능한 환자 1559명을 대상으로 하였다. 무작위 부분집합 특징 선택 방법 및 주성분분석을 사용하여 섬망과 비섬망을 구분하는 데에 기여도가 높은 특징들의 순위를 구하고, 몇 개의 상위 지표가 동시에 사용되었을 때에 섬망과 비섬망을 가장 효율적으로 판별할 수 있는지를 확인하였다. 확인된 상위 지표만을 이용한 것과 전체 임상 지표를 모두 사용하였을 때의 섬망과 비섬망을 구분할 수 있는 정확도에 대해서 비교 분석하였다. 결 과 총 40개 변수 중 32개의 변수에서 섬망과 비섬망군 간 유의미한 차이를 보였다. 주성분 분석(Principal Component Analysis, PCA)상, 상위 6개 변수인 리치몬드 흥분 진정 척도(Richmond Agitation Sedation Scale, RASS), 도뇨관 사용 유무, 혈관 카테터 사용 유무, 해밀턴 불안 척도(Hamilton Anxiety Rating Scale, HAM-A), 혈액 요소 질소(Blood Urea Nitrogen, BUN), 급성 생리학 및 만성 건강 평가-II (Acute Physiology and Chronic Health Examination II, APACHE II)를 사용했을 때에 섬망과 비섬망군이 가장 잘 구분되었다. 이들 상위 6개 변수에 대해 단일 변수 로지스틱 회귀분석 시행 시 모두 섬망 여부 결정에 대한 유의성을 보였다. 다중 변수 회귀분석 시행 시, 혈관 카테터 사용 유무 를 제외하고 나머지 5개 변수에서 모두 섬망 여부 결정에 대한 유의성을 보였다. 수신자판단특성곡선 분석 결과 신뢰구간 95%에서 곡선하면적 0.818로 높은 판별력을 보였다. 전체 임상 변수를 모두 사용한 수신자판단특성곡선 분석 결과에서는 곡선하면적 0.881로 매우 높은 판별력을 보였다. 결 론 본 연구 결과, 리치몬드 흥분 진정 척도, 도뇨관 사용 유무, 혈관 카테터 사용 유무, 해밀턴 불안 척도, 혈액 요소 질소, 급성 생리학 및 만성 건강 평가-II가 섬망이 발생한 군과 섬망이 발생하지 않은 군을 구분하는데 가장 유용하였다. 중환자실 환자 중 리치몬드 흥분 진정 척도 및 해밀턴 불안 척도 점수가 과도하게 낮거나, 도뇨관 및 혈관 카테터 등의 침습적인 시술을 사용하였을 경우 좀 더 집중적인 모니터링을 통해 섬망의 가능성을 살펴보아야 할 것이다.

아파트 주민의 건강상태에 거주 환경이 미치는 영향 (Effect of Residential Environment on the Health Status in Apartment Inhabitants)

  • 강기원;김화준;권근용;정민수
    • 농촌의학ㆍ지역보건
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    • 제34권3호
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    • pp.279-290
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    • 2009
  • 이 연구는 우리나라 대표적 주거형태인 아파트 입주민들을 대상으로 입주자들의 주거환경 만족도와 관련이 높은 건강상태 변수가 무엇인지 밝히고 어떠한 주거환경이 건강상태에 영향을 주는지 평가하고자 하였다. 주거환경에 대한 설문조사는 사회자본에 대한 국제적인 조사도구인 SC-IQ를 바탕으로 하되 Chun[2]의 아파트 주거환경 조사척도를 첨가하였다. 설문조사는 2007년 12월부터 2008년 1월까지 7주간 이루어졌으며, 조사방법은 사전조사 차원을 통해 반응도 및 수거율 등을 고려하여 2회에 걸쳐 수행되었다. 수집된 설문지는 총 276부로서 수거율은 28%였으며 이 중 6부는 변수의 결측값이 많아 제거하여 총 270부의 설문지를 대상으로 분석을 시행하였다. 주성분 분석을 통해 기존에 알려진 주거환경과 관련된 건강관련 변수들 중에 1년 전 대비 주관적 건강상태 변수가 가장 관련도가 높음을 파악했고, 요인 회전 및 요인 추출을 통해 27가지 주거환경 만족도에 대한 문항을 5가지 요인들로 구분할 수 있었다. 여기서 요인 1은 아파트 관리와 관련된 요인으로 요인 2는 아파트 개별 가구 환경과 관련된 요인으로 요인 3은 아파트 단지 환경(근린)과 관련된 요인으로 요인 4는 이웃관계와 관련된 요인으로 요인 5는 아파트 단지 시설환경과 관련된 요인이었다. 로지스틱 회귀분석의 결과를 보면, 주거환경 요인 중 이웃관계 관련 요인 및 아파트단지 시설환경 요인의 경우 만족도가 높을수록 1년 대비 주관적 건강상태가 양호 하지만, 아파트단지 환경(근린) 관련 요인은 만족도가 낮은 경우가 1년 전 대비 주관적 건강상태에 안 좋은 영향을 주는 것으로 나타났다. 이것은 근린공간 및 이와 결합되어 있는 사회적 지지 변수가 건강이 악화되는 것을 방지한다는 '완충효과' 이론을 입증하는 결과이다. 결국 이 연구는 주거환경이 건강의 악화방지에 영향을 주는 요인일 수 있음을 밝히고 기존에는 고려되지 못한 물리적이고 정서적인 주거환경과 건강과의 관련성을 제시했다는 데에 그 의의가 있다.

전라북도 김치관련 제조업체의 상대적 효율성 및 통계적 분석 (Relative Efficiency and Statistical Analysis of Kimchi-related Manufacturers in Jeollabuk-do)

  • 최경호;정은영;곽희종
    • 디지털융복합연구
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    • 제12권8호
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    • pp.139-146
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    • 2014
  • 본 연구에서는 전라북도에 소재하는 김치관련 제조업체들을 대상으로 상대적인 효율성과 통계적인 분석을 통해 경영 효율성과 개선방안을 탐색적으로 조사해 보고자 하였다. 이를 위해 상대적 효율성을 자료포락분석(data enveloped analysis: DEA)을 이용하였으며 통계적 분석방법에는 t-검정, 주성분분석 등으로 실시하였다. 본 연구의 대상 업체는 전라북도의 67개 김치관련 제조업체 중 34개였다. 분석결과 전체 DMU에 대한 기술 효율성 평균은 0.653으로, 순수 기술적 효율성은 0.761 그리고 규모 효율성은 0.863으로 나타났다. 다음 CCR 모형에 의한 분석에서는 8개의 시 지역 DMU가 그리고 군 지역에서는 5개의 DMU가 효율성이 1인 업체로, 각각 61.5%와 23.8%를 나타냈다. 그러나 CCR모형, BCC모형 그리고 규모효율성에 따른 측정값을 시 지역과 군 지역으로 나누어 통계적으로 유의한 차이가 있는지를 검정한 결과, 시 지역과 군 지역은 통계적으로 유의한 차이가 없는 것으로 나타났다. 이러한 본 연구는 김치 관련 제조업체의 분석 정보를 제공하며 특히 지역사회의 산업에 대한 구체적 자료 분석을 통해 지역사회의 산업 활성을 위한 기초 자료로 활용될 수 있을 것으로 사료된다.

고속도로의 주행속도예측 및 주행환경만족도 모형 개발에 관한 연구 (Development of Predicting Models of the Operating Speed and Operating environment Satisfaction Model in Expressways)

  • 김장욱;장일준;김정현;이수범
    • 대한교통학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.117-131
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    • 2009
  • 고속도로이용자가 주행할 때 도로기하구조를 정확하게 파악하지 못하면, 도로이용자는 자신의 감각과 인식에 의존해 판단을 내리게 되기 때문에 고속도로의 주행성을 평가할 때 설계자와는 다른 판단을 내리게 될 수도 있다. 따라서 도로이용자의 기대심리를 만족시키면서 안전성, 쾌적성 등을 확보하기 위해서는 정확한 주행속도를 예측할 필요가 있다. 또한, 고속도로의 기하구조적인 주행성뿐만 아니라 도로이용자가 이러한 구성요소의 조화에 의해 느끼는 감성적 측면에서의 주행환경만족도에 대한 인식의 변화를 파악할 필요가 있다. 이에 본 연구에서는 주행속도 예측모형 구축하기 위해 6개 고속도로(경부, 서해안, 영동, 남해, 중앙, 호남)를 대상으로 주행속도에 영향을 미치는 요인을 크게 선형요소, 교통운영특성 요소로 분류하였다. 주행속도에 영향을 미치는 요인을 대상으로 다중회귀를 이용한 주행속도예측모형 구축 및 검증 결과, 통계적으로 모두 적합한 것으로 나타났다. 또한, 본 연구에서는 고속도로 이용자를 대상으로 개별면접 설문조사를 통해 수집된 주행환경만족도 이미지 데이터를 바탕으로 수량화 제II류 및 주성분분석을 실시하여 고속도로 주행환경만족도에 대한 영향 요인을 규명하였다. 또한 수량화 제I류 및 구조방정식을 이용하여 사회인식 및 고속도로 이용자의 실제인식의 변화가 고려된 고속도로의 주행환경만족도 모형을 구축하였다. 본 연구에서 구축된 모형을 통해 주행속도와 같은 정량적인 요인뿐만 아니라 도로이용자가 느끼는 고속도로의 주행환경만족도와 같은 정성적인 요인에 대한 결과도 제시할 수 있어서 도로이용자가 느끼는 변화된 교통 환경과 인식여부가 반영된 고속도로의 주행성을 평가할 수 있다는 데에 그 의의가 있다.

NEAR-INFRARED STUDIES ON STRUCTURE-PROPERTIES RELATIONSHIP IN HIGH DENSITY AND LOW DENSITY POLYETHYLENE

  • Sato, Harumi;Simoyama, Masahiko;Kamiya, Taeko;Amari, Trou;Sasic, Slobodan;Ninomiya, Toshio;Siesler, Heinz-W.;Ozaki, Yukihiro
    • 한국근적외분광분석학회:학술대회논문집
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    • 한국근적외분광분석학회 2001년도 NIR-2001
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    • pp.1281-1281
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    • 2001
  • Near-infrared (NIR) spectra have bean measured for high-density (HDPE), linear low-density (LLDPE), and low-density (LDPE) polyethylene in pellet or thin films. The obtained spectra have been analyzed by conventional spectroscopic analysis methods and chemometrics. By using the second derivative, principal component analysis (PCA), and two-dimensional (2D) correlation analysis, we could separate many overlapped bands in the NIR. It was found that the intensities of some bands are sensitive to density and crystallinity of PE. This may be the first time that such bands in the NIR region have ever been discussed. Correlations of such marker bands among the NIR spectra have also been investigated. This sort of investigation is very important not only for further understanding of vibration spectra of various of PE but also for quality control of PE by vibrational spectroscopy. Figure 1 (a) and (b) shows a NIR reflectance spectrum of one of the LLDPE samples and that of PE, respectively. Figure 2 shows a PC weight loadings plot of factor 1 for a score plot of PCA for the 16 kinds of LLDPE and PE based upon their 51 NIR spectra in the 1100-1900 nm region. The PC loadings plot separates the bands due to the $CH_3$ groups and those arising form the $CH_2$ groups, allowing one to make band assignments. The 2D correlation analysis is also powerful in band enhancement, and the band assignments based upon PCA are in good agreement with those by the 2D correlation analysis.(Figure omitted). We have made a calibration model, which predicts the density of LLDPE by use of partial least square (PLS) regression. From the loadings plot of regression coefficients for the model , we suggest that the band at 1542, 1728, and 1764 nm very sensitive to the changes in density and crystalinity.

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한국프로야구에서 타자력 지수 제안 (Alternative hitting ability index for KBO)

  • 홍종선;김재영;신동식
    • Journal of the Korean Data and Information Science Society
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    • 제27권3호
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    • pp.677-687
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    • 2016
  • 야구 타자의 능력을 측정하는 많은 세이버메트릭스 통계량들 중에서 WAR은 미국프로야구에서 가장 많이 사용하는 통계량이다. 그러나 한국프로야구 자료에는 수비에 관련된 변수에 포함된 야구장 요인, 포지션조정 그리고 리그 조정 통계량들이 존재하지 않으므로 WAR을 한국프로야구에 적용하는 데에는 문제가 있다. 본 연구에서는 타자의 능력을 측정하는 대안적인 세이버메트릭스 통계량을 제안하여 미국프로야구 뿐만 아니라 한국프로야구에서도 동시에 사용할 수 있도록 한다. 본 연구에서 제안한 타자력 지수 모형은 한국프로야구와 미국프로야구 타자들에 대한 다섯 종류의 통계량을 사용하여 개발한다. 우선 2015년도 최소 규정 타석을 만족한 미국프로야구 타자들의 자료를 바탕으로 타자력 지수 모형을 개발한다. 미국프로야구 타자들의 WAR과 비교하면서 본 연구에서 제안한 타자력 지수의 능력의 타당성을 검토한다. 다음으로 이 모형을 2015년도 한국프로야구 자료에 적용하여 한국형 타자력 지수를 제안한다. 한국프로야구 타자력 지수를 서로 다른 팀별, 나이별, 포지션별로 통계적으로 분석하고, 타자력 지수와 그들의 연봉과의 선형관계성을 토론한다. 연봉에 관한 회귀모형의 신뢰영역을 바탕으로 연봉책정의 적절함에 따라 46명의 타자를 세 그룹으로 할당하고, 세 그룹에 속한 연봉을 다양한 인자에 대하여 통계적으로 탐색한다.

근적외 분석법을 응용한 사과의 생잎과 건조잎의 질소분석 (Determination of Nitrogen in Fresh and Dry Leaf of Apple by Near Infrared Technology)

  • 장광재;서상현;강연복;한효일;박우철
    • 한국토양비료학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.259-265
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    • 2004
  • 사과의 영양진단에서 사과잎 분석을 신속히 하기 위한 방법을 모색하기 위해 생잎과 건조잎을 이용해 근적의 스펙트럼을 측정하고 이를 질소 함량과의 최적의 상관관계를 도출하기 위해 부분소자승(PLS)과 주성분회귀(PCR)과 같은 다변량 분석법을 이용하여 비파괴 검량식을 작성하였다. 또한 검량식 작성에서 비파괴 측정 정확도를 향상시키기 위하여 smoothing, mean normalization, multiplicative scatter correction (MSC). derivative 등의 다양한 데이터 전처리 조작을 수행하여 정확도 향상 가능성을 조사하였다. 사과 건조잎의 비파괴 측정 가능성을 조사한 결과 PLS-1 모델에서 Norris first derivate하였을 태 RMSEP가 $0.6999g\;kg^{-1}$ 로 가장 좋았으며, 생잎은 Savitzky-Golay first derivate하였을 때에 RMSEP 가 $1.202g\;kg^{-1}$으로 가장 좋았다. 건조잎의 PCR 모델은 mean normalization 처리 후 Savitzky-Golay first derivative하였을 때가 RMSEP 가 $0.553g\;kg^{-1}$, 이었으며 생잎에서도 RMSEP는 $1.047g\;kg^{-1}$로 나타났다. 이와 같은 견과로서 사과의 생잎과 건조잎의 분석이 근적외분석기술에 의해 가능할 것으로 판단된다.