• 제목/요약/키워드: gene knock

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Carbamoyl Phosphate Synthetase I이 요소회로 유전자를 발현하는 CHO 세포 주의 세포 성장과 재조합 Erythropoietin의 생산에 미치는 영향 (Effects of Carbamoyl Phosphate Synthetase I against Cell Growth and Production of Recombinant Erythropoietin in Urea Cycle Enzyme Expressing CHO Cell Line)

  • 조수미;김나영;김형진;김홍진
    • 약학회지
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    • 제51권3호
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    • pp.214-218
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    • 2007
  • In the previous reports, we developed the CO5 by introducing genes for the first and second urea cycle enzymes, carbamoyl phosphate synthetase I (CPS I) and ornithine transcarbamoylase (OTC) into the IBE cell lines producing erythropoietin (EPO). The CO5 have been found out to have 15-20% higher cell growth rate and produce 2-times more EPO than the parental cell line, IBE. To investigate the role of CPS I in CO5 cell line for the cell growth and amount of EPO, we knock-downed CPS I gene expression via siRNA treatment. Expression level of EPO in cell lysate of CO5 was 3-5 fold higher than that of IBE. After siRNA treatment, the cell growth of CO5 was decreased 8-21% and the EPO productivity in the cell Iysate was significantly decreased. However, these changes of the cell growth and EPO productivity were not observed in IBE. These results indicate that CPS I gene expression is important for the increased cell growth and EPO productivity of CO5 cell line.

Structure and Expression of OsUBP6, an Ubiquitin-Specific Protease 6 Homolog in Rice (Oryza sativa L.)

  • Moon, Yea Kyung;Hong, Jong-Pil;Cho, Young-Chan;Yang, Sae-Jun;An, Gynheung;Kim, Woo Taek
    • Molecules and Cells
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    • 제28권5호
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    • pp.463-472
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    • 2009
  • Although the possible cellular roles of several ubiquitin-specific proteases (UBPs) were identified in Arabidopsis, almost nothing is known about UBP homologs in rice, a monocot model plant. In this report, we searched the rice genome database (http://signal.salk.edu/cgi-bin/RiceGE) and identified 21 putative UBP family members (OsUBPs) in the rice genome. These OsUBP genes each contain a ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (UCH) domain with highly conserved Cys and His boxes and were subdivided into 9 groups based on their sequence identities and domain structures. RT-PCR analysis indicated that rice OsUBP genes are expressed at varying degrees in different rice tissues. We isolated a full-length cDNA clone for OsUBP6, which possesses not only a UCH domain, but also an N-terminal ubiquitin motif. Bacterially expressed OsUBP6 was capable of dismantling K48-linked tetra-ubiquitin chains in vitro. Quantitative real-time RT-PCR indicated that OsUBP6 is constitutively expressed in different tissues of rice plants. An in vivo targeting experiment showed that OsUBP6 is predominantly localized to the nucleus in onion epidermal cells. We also examined how knock-out of OsUBP6 affects developmental growth of rice plants. Although homozygous T3 osubp6 T-DNA insertion mutant seedlings displayed slower growth relative to wild type seedlings, mature mutant plants appeared to be normal. These results raise the possibility that loss of OsUBP6 is functionally compensated for by an as-yet unknown OsUBP homolog during later stages of development in rice plants.

Platelet-derived Growth Factor Signaling and Human Cancer

  • Yu, Jiu-Hong;Ustach, Carolyn;ChoiKim, Hyeong-Reh
    • BMB Reports
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    • 제36권1호
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    • pp.49-59
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    • 2003
  • Platelet-derived growth factor (PDGF) is a critical regulator of mesenchymal cell migration and proliferation. The vital functions of PDGFs for angiogenesis, as well as development of kidney, brain, cardiovascular system and pulmonary alveoli during embryogenesis, have been well demonstrated by gene knock-out approaches. Clinical studies reveal that aberrant expression of PDGF and its receptor is often associated with a variety of disorders including atherosclerosis, fibroproliferative diseases of lungs, kidneys and joints, and neoplasia. PDGF contributes to cancer development and progression by both autocrine and paracrine signaling mechanisms. In this review article, important features of the PDGF isoforms and their cell surface receptor subunits are discussed, with regards to signal transduction, PDGF-isoform specific cellular response, and involvement in angiogenesis, and tumorstromal interactions.

Development of Two-Component Nanorod Complex for Dual-Fluorescence Imaging and siRNA Delivery

  • Choi, Jin-Ha;Oh, Byung-Keun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제24권9호
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    • pp.1291-1299
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    • 2014
  • Recently, multifunctional nanomaterials have been developed as nanotherapeutic agents for cellular imaging and targeted cancer treatment because of their ease of synthesis and low cytotoxicity. In this study, we developed a multifunctional, two-component nanorod consisting of gold (Au) and nickel (Ni) blocks that enables dual-fluorescence imaging and the targeted delivery of small interfering RNA (siRNA) to improve cancer treatment. Fluorescein isothiocyanate-labeled luteinizing hormone-releasing hormone (LHRH) peptides were attached to the surface of a Ni block via a histidine-tagged LHRH interaction to specifically bind to a breast cancer cell line, MCF-7. The Au block was modified with TAMRA-labeled thiolated siRNA in order to knock down the vascular endothelial growth factor protein to inhibit cancer growth. These two-component nanorods actively targeted and internalized into MCF-7 cells to induce apoptosis through RNA interference. This study demonstrates the feasibility of using two-component nanorods as a potential theranostic in breast cancer treatment, with capabilities in dual imaging and targeted gene delivery.

공여세포 처리 조건이 형질전환 복제돼지 생산에 미치는 영향 (Effects of Donor Cell Treatments on the Production of Transgenic Cloned Piglets)

  • 권대진;곽태욱;오건봉;김동훈;양병철;임기순;김진회;박진기;황성수
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제35권3호
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    • pp.197-201
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    • 2011
  • This study was conducted to investigate the effects of donor cell treatments on the production of transgenic cloned piglets. Ear fibroblast cell obtained from NIH MHC Inbred minipig was used as control. The GalT knock-out/CD45 knock-in (GalT/CD46) transgenic cell lines were established and used as donor cells. The reconstructed GalT/CD46 embryos were surgically transferred into oviduct of naturally cycling surrogate sows (Landrace ${\times}$ Yorkshire) on the second day of standing estrus. Unlike control (1.2 kV/cm, 75.4%), the fusion rate of the GalT/CDl6 donor cells was significantly higher in 1.5 kV/cm, (84.5%) than that of 1.25 kV/cm, (20.2%) (p<0.01). When the number of the transferred embryos were more than 129, the pregnancy and delivery rates were increased to 13/20 (65%) and 5/20 (25%) compared to less then 100 group [1/6 (16.7%) and 0/6 (0%)], respectively. To analyze the effect of donor cell culture condition on pregnancy and delivery rates, the GalT/CD46 donor cells were cultured with DMEM or serum reduced medium. In serum reduced medium group, the pregnancy and delivery rates were improved to 8/12 (66.7%) and 5/12 (41.7%) compared to DMEM group [3/7 (42.9%) and 0/7 (0%)], respectively. In conclusion, it can be postulated that an appropriate fusion condition and culture system is essential factors to increase the efficiency of the production of transgenic cloned piglets.

소포체 스트레스에 대한 Protein Disulfide Isomerase의 세포보호효과 (Bombyx mori Protein Disulfide Isomerase (bPDI) Protects Sf9 Cells from Endoplasmic Reticulum (ER) Stress)

  • 구태원;윤은영;김성완;최광호;강석우;권기상;권오유
    • 생명과학회지
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    • 제17권8호통권88호
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    • pp.1129-1134
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    • 2007
  • bPDI가 ER내 misfolding 단백질의 생성을 제한함으로써 곤충변역과 관계하는지를 해석하기 위하여 bPDI가 과발현(overexpression)되는 곤충세포주와 이와 반대로 bPDI가 억제발현(knock-down)되는 곤충세포주를 제작하여 bPDI가 곤충면역에 관련하는지를 해석하였다. bPDI가 과발현되는 세포주 (Sf9-bPDI)는 정상세포주(Sf9)나 pIZT/V5-His 벡터만 도입된 세포주(Sf9-pIZT)에 비하여 생존율이 30% 이상 높았지만, bPDI의 전사체 발현이 억제된 세포주(Sf9-bPDI-dsRNA)는 오히려 정상세포주나 pIZT/V5-His 벡터만 도입된 세포주에 비하여 생존율이 약 15%낮았다. 이와 같은 결과로써, bPDI는 ER내 misfolding 단백질의 생성을 제한함으로써 곤충의 ERSE과 밀접하게 관련할 것이라 추정할 수 있었다.

Regulator of calcineurin 1-4과 파골세포 분화의 관련성 (Relationship between the Regulator of Calcineurin 1-4 Isoform and In Vitro Osteoclast Differentiation)

  • 박경록
    • 생명과학회지
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    • 제25권2호
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    • pp.223-230
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    • 2015
  • RCAN1은 calcineurin을 억제하는 내인성 단백질로 calcineurin-NFATc1 신호전달 경로와 관련된 질환의 병인에 중요한 역할을 담당한다. 특히 RCAN1-4 아형 유전자의 경우 NFATc1 전사인자에 의해 조절된다. RANKL 자극은 calcineurin-NFATc1 경로로 파골세포 분화를 유도하는데, RCAN1과 파골세포의 분화에 관련된 연구는 보고 된 바 없다. 따라서 본 연구는 RANKL 처리에 의해 파골세포 분화가 유도될 때 RCAN1이 calcineurin-NFATc1 경로에 미치는 영향을 in vitro에서 조사했다. 마우스로부터 분리한 골수단핵세포에 RANKL을 처리하여 파골세포 분화를 유도했다. RANKL 처리 후 조사 대상 유전자의 mRNA 발현과 단백질 발현을 각각 RT-PCR과 Western blot로써 측정했다. 마우스 RCAN1-4 vector를 파골전구세포인 RAW 264.7 단핵세포주와 골수단핵세포에 형질도입(transfection)시켜 RCAN1-4 유전자의 과발현을 유도했다. 형질도입 후 파골세포 분화의 형태적 변화는 TRAP 염색을 통해 관찰했다. RANKL 처리 후 NFATc1, calcineurin, RCAN1-4 mRNA 발현은 크게 증가했다. 단백질 발현의 경우 NFATc1과 RCAN1은 증가했으나 calcineurin은 대조군과 차이가 없었다. RCAN1-4 유전자의 과발현 유도 시 RCAN1-4 mRNA는 크게 증가되었으나 RCAN1 단백질 발현은 증가되지 않았다. 특히 RANKL 존재 시 RCAN1 유전자를 knock-down시켜도 RCAN1 발현은 정상적으로 유지되었다. 한편, NFATc1 발현은 과발현 유도시 감소했고 knock-down 유도 시 증가하는 경향을 보였다. RCAN1-4 유전자 과발현을 유도한 골수단핵세포에서 배양 5일 후 파골세포 분화는 대조군과 차이가 없었다. 이러한 결과는 RANKL에 의한 파골세포 분화 시 RCAN1이 calcineurin-NFATc1 경로를 통해 파골세포 분화에 미치는 영향은 제한적일 것으로 사료된다.

β-catenin 유전자의 3T3-L1 지방세포 및 인체에서의 지방축적 연관성 연구 (Association of β-Catenin with Fat Accumulation in 3T3-L1 Adipocytes and Human Population)

  • 배성민;이해용;채수안;오동진;박석원;윤유식
    • 생명과학회지
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    • 제21권9호
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    • pp.1301-1309
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    • 2011
  • 비만은 중성지방이 체내에 과잉으로 축적되어 지방 본래의 에너지 저장과 대사조절의 기능을 정상적으로 하지 못하는 상태를 말한다. 본 연구진은 siRNA 방법을 이용하여 Wingless-type MMTV integration site (WNT)/${\beta}$-catenin pathway에 의한 지방축적 조절에서 중요한 역할을 하는 유전자를 확인하고자 하였다. WNT/${\beta}$-catenin pathway에 속한 유전자 중 ${\beta}$-catenin을 siRNA기법을 통하여 knock down 한 후 adipogenesis의 핵심 조절자인 peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR)${\gamma}$, CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP)${\alpha}$의 mRNA와 단백질 발현 변화를 확인해 보았다. 그 결과 ${\beta}$-catenin유전자의 knock down에 의하여 PPAR${\gamma}$, CEBP${\alpha}$의 유전자 및 단백질 발현이 유의하게 증가함을 확인하였다. WNT/${\beta}$-catenin pathway에서 ${\beta}$-catenin의 상위 조절자인 LRP6와 DVL2의 knock down에 의한 adipogenesis 조절 유무를 분석하였으나 유의적인 영향을 미치지 못하는 것으로 발견되었다. 이는 ${\beta}$-catenin이 상위 조절자들의 영향을 받기 보다는 독립적인 기작으로 PPAR${\gamma}$, CEBP${\alpha}$의 mRNA, 단백질 발현의 조절함으로써 adipogenesis의 negative regulator의 기능을 하는 것으로 판단된다. 또한 290명의 한국인을 대상으로 비만의 대표적인 표지인자인 혈중 중성지방 농도와 혈중 콜레스테롤 농도에 대한 ${\beta}$-catenin 유전자의 단일염기다형성(SNP)과의 연관성을 통계 분석해보았다. 그 결과 프로모터 부분에 위치한 4종류의 SNP 중에서 transcription개시 지점으로부터 -10,288위치에 존재하는 C>T polymorphism인 rs7630377이 유의하게 혈중 중성지방 농도와 연관성이 있음을 확인할 수 있었다. 본 연구의 결과는 ${\beta}$-catenin이 세포 수준에서 뿐 아니라 인체에서도 지방축적에 유의적인 영향을 미치고 있음을 제시하고 있다.

환경위해성 평가를 고려한 GM작물의 개발 전략 (I) (Strategies for the development of GM crops in accordance with the environmental risk assessment (I))

  • 이신우
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제38권2호
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    • pp.125-129
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    • 2011
  • GM작물의 상용화를 위하여서는 반드시 환경위해성평가를 거쳐야 한다. 불행하게도 초기 event가 개발되고 기본적인 검토가 완료된 GM작물에 대하여 환경위해성평가를 수행하기 위하여서는 약 7백만에서 1,500만불의 경비가 소요되며 기간 또한 수년이 필요하다. 따라서 저자는 사용화를 위한 GM작물의 개발을 위한 프로젝트에 관여하는 개발자는 실험실 또는 온실단계의 아주 초기단계에서부터 환경위해성평가기준을 충분히 숙지하여야 한다고 제안한다. 기존의 많은 리뷰논몬에서 이미 지적된 것 과 같이 GM작물의 상용화과제에서 가장 큰 걸림돌(죽음의 계곡)은 초기 사상 (event)의 선발과정이며, 대부분이 이 단계에서 충분한 자료를 제시할 수 없어서 포기한다는 사실을 간과하여서는 안 될 것이다. 특히 지극히 기본적인 분자생물학 특성에 관한 자료들로서 예를 들어 도입유전자의 copy 수, 숙주의 게놈내 도입위치, 도입유전자의 주변 염기서열, 유전자 재배열과 도입유전자로 인한 숙주 내 기존유전자의 knock out 현상의 여부 등에 관한 충분한 자료를 제시하지 못하는 경우가 많으며 이는 GM 작물의 개발 초기단계에서부터 철저하게 검증이 이루어져야 하는 항목들이다. 국내의 경우, 농촌진흥청은 2011년부터 2020년까지 10년간 "차세대바이오그린 21 사업"을 발족하여 추진 중에 있으며 특히 국내용뿐만 아니라 중국의 사막화 지역 등 불량환경에 재배가 가능한 GM작물 등 해외로 수출을 위한 global GM작물의 개발을 위한 전략을 수립하여 추진 중에 있다. 따라서 저자는 환경위해성평가기준에 부합되는 초기 event의 선발 과정에 역점을 두어 사전에 분자생물학적 특성에 관한 RA기준을 고려하여 자체평가시스템을 도입하도록 제안 한다.

DNA Damage-inducible Phosphorylation of p53 at Ser20 is Required for p53 Stabilization

  • Yang, Dong-Hwa;Rhee, Byung-Kirl;Yim, Tae-Hee;Lee, Hye-Jin;Kim, Jungho
    • Animal cells and systems
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    • 제6권3호
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    • pp.263-269
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    • 2002
  • The p53 tumor suppressor gene is among the most frequently mutated and studied genes in human cancer, but the mechanisms by which it sur presses tumor formation remain unclear. DNA damage regulates both the protein levels of p53 and its affinity for specific DNA sequences. Stabilization of p53 in response to DNA damage is caused by its dissociation from Mdm2, a downstream target gene of p53 and a protein that targets p53 for degradation in the proteosome. Recent studies have suggested that phosphorylation of human p53 at Ser20 is important for stabilizing p53 in response to DNA damage through disruption of the interaction between Mdm2 and p53. We generated mice with an allele encoding changes at Ser20, known to be essential for p53 accumulation following DNA damage, to enable analyses of p53 stabilization in vivo. Our data showed that the mutant p53 was clearly defective for full stabilization of p53 in response to DNA damage. We concluded that Ser20 phosphorylation is critical for modulating the negative regulation of p53 by Mdm2, probably through phosphorylation-dependent inhibition of p53-Mdm2 interaction in the physiological context.