축엽세균병으로 알려진 피해뽕나무에서 진균인 Fusarium spp. 균이 분리되어 이를 구명하고 그 피해정도를 조사한 결과 1. 신소썩음증상은 세로로 긴 갈색의 병무늬가 시간이 경과할 수록 암갈색으로 변하고 흰곰팡이가 생기며, 축엽세균병증상은 잎이 말리고 신소에 수침상의 병반과 bacterial ooze가 보인다. 그러나 시간이 경과하면 구분이 어렵다. 2. 신소썩음증상의 피해율은 7.5%, 축엽세균병의 피해율은 4.4%였다. 3. Fusarium spp. 균의 분리는 신소썩음증상에서 높았고, Pseudomonas균의 분리는 축엽세균병 증상에서 많았다. 또한 병원성도 같은 경향을 보였다. 4. 수원 등 3지역 모두에서 부위별 병원성 Fusarium spp. 균의 분리율은 병반에서 30cm 부위에서 보다 병진전부위에서 더 높았다. 5. 수원 등 3지역 모두에서 개량뽕의 신소썩음증상 피해가 가장 많았다. 그러나 청올뽕의 신소썩음증상 피해는 조사 품종중에 가장 적었다.
Bacterial blight occurred on the flowers, leaves, twigs and branches of apple trees (Malus domestica Borkh) in Chunchon, Kangwon-Do. Infected flowers and leaves turned brownish black, and they were fallen down or remained hanging in the trees. Under humid conditions during postblossom period, the casual bacterium spreaded along twigs and killed them. However, killing of branches was very rare. The symptoms on apple trees were very similar to symptoms of fire blight. But the causal organism isolated from the lesions was identified as Pseudomonas syringae based on physiological and chemical characteristics. This is the first described bacterium that causes apple shoot blight in Korea.
본 연구에서는 경상북도 북부지역의 주요 사과 산지를 대상으로 재배 중에 발생하는 병해의 발병상황을 조사하고 병원균을 조사하였다. 경북 북부지역의 주요 사과 재배지에서 발병하는 주요 병은 탄저병, 겹무늬썩음병, 점무늬낙엽병, 갈색무늬병, 가지마름병이었다. 특히 2013년에 비해 2014년에는 갈색무늬병이 증가하였으며, 이는 10월의 강수량과 정의 상관관계가 인정된다. 점무늬낙엽병과 탄저병, 겹무늬썩음병도 모든 포장에서 발병되었다. 또한 P. syringae pv. syringae에 의한 가지마름병의 발병이 지역에 따라 10-20% 정도 발병하였다. 이러한 결과는 사과 재배에 있어 주요병해에 대한 중점 방제 대상 병해를 선정하여 관리하여야 하며, 또한 근래 문제되지 않았던 P. syringae pv. syringae에 의한 가지마름병에 대한 생태학적 연구 및 방제 연구가 수행하여야 할 것으로 판단된다.
Erwinia amylovora and Erwinia pyrifoliae cause fire blight and black-shoot blight, respectively, in apples and pears. E. pyrifoliae is less pathogenic and has a narrower host range than that of E. amylovora. Fire blight and black-shoot blight exhibit similar symptoms, making it difficult to distinguish one bacterial disease from the other. Molecular tools that differentiate fire blight from black-shoot blight could guide in the implementation of appropriate management strategies to control both diseases. In this study, a primer set was developed to detect and distinguish E. amylovora from E. pyrifoliae by conventional polymerase chain reaction (PCR). The primers produced amplicons of different sizes that were specific to each bacterial species. PCR products from E. amylovora and E. pyrifoliae cells at concentrations of 104 cfu/ml and 107 cfu/ml, respectively, were amplified, which demonstrated sufficient primer detection sensitivity. This primer set provides a simple molecular tool to distinguish between two types of bacterial diseases with similar symptoms.
Bacterial strains were isolated from diseased samples of shoot blight collected from different pear growing orchards of Chuncheon, Korea from 1995 to 1998. Forty-nine strains showed their pathogenicity on immature fruit and shoot of pear. Microbiological, physiological, and biochemical tests were performed on these pathogenic strains. One strain, designated as WT3 in this study, was selected as a representative strain as it was collected from the first outbreak area in Jichonri, Chuncheon in 1995. Further detailed characterization of the strain WT3 was done by PCR amplification using specific primers described previously for distinguishing Erwinia pyrifoliae from its close pathogen Erwinia amylovora. Based on phenotypical, biochemical, and molecular analyses, strain WT3 was identified as a shoot blight pathogen which was the same as E. pyrifoliae Ep16 previously described by a German group in 1999.
Pseudomonas syringae pv. syringae WSPS007 균주는 대한민국 경상북도 영주시 사과 과원에서 나타난 가지마름병 병징으로부터 2013년 분리되었다. 본 논문에서는 6,238,498 bp(59.04% G+C 함량)인 WSPS007 균주의 전체 염기서열을 보고한다. 전체 지놈은 5,379개의 코딩서열, 65개의 tRNA, 16개의 rRNA 유전자를 가지고 있다. 특히 WSPS007 균주의 전체 염기서열 분석은 냉해와 관련된 빙핵 활성 유전자 클러스터를 중심으로 분석을 수행하였으며, P. syringae pv. syringae 국외 대표 균주인 PssB728a와 유사한 빙핵활성 유전자 구성을 가지고 있는 것으로 나타났다. 따라서 본 논문에서의 염기서열 분석 결과를 바탕으로 경상북도 일원 사과 과원에서 동해로 추정되는 병원균의 원인을 규명하기 위한 기본 자료를 제공하는데 있어서 의의가 있다고 사료된다.
E. pyrifoliae에 의한 과수 가지검은마름병은 국내에서 1995년 최초 발생이래 2016년까지 꾸준히 발생하여 과수농가에 피해를 주고 있는 세균병해이다. 가지검은마름병 발생 농가의 폐원조치 및 공적방제로 인한 경제적 피해 감소를 위하여, 병징이 관찰되는 이병조직 및 건전조직 내의 병원 세균을 검출하여 효율적 관리방안을 마련하고자 본 연구를 수행하였다. 가지검은마름병원세균의 검출은 genomic DNA 추출과정을 생략한 순수 균총만을 이용하는 colony-PCR을 이용하였으며, 이를 위해 ERIC 지역에서 제작된 가지검은마름병원세균 특이 프라이머 EpSPF/EpSPR 프라이머쌍을 선발하였다. 특이 프라이머를 활용한 colony-PCR 방법으로 2014-2015년 4-10월까지 사과나무 생육기간 동안 가지검은마름병 발생상황을 모니터링한 결과, $25^{\circ}C$ 일 평균 온도 기간인 5월 중순부터 7월 초순까지 발병이 가장 빈번하였다. 발병가지 내 병원세균의 존재유무 검정 결과 병징 부위와 이로부터 20 cm 내 건전조직에서만 병원세균이 지속적으로 검출되었다. 따라서 이미 발생한 가지검은마름병을 효율적으로 관리하기 위해 이병조직과 건전조직 경계 부위로부터 20 cm 이상에서 가지치기를 하는 것이 매우 적절할 것으로 판단된다.
Park, Jungkum;Lee, Gyu Min;Kim, Donghyuk;Park, Duck Hwan;Oh, Chang-Sik
The Plant Pathology Journal
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제34권5호
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pp.445-450
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2018
Bacteriophages, bacteria-infecting viruses, have been recently reconsidered as a biological control tool for preventing bacterial pathogens. Erwinia amylovora and E. pyrifoliae cause fire blight and black shoot blight disease in apple and pear, respectively. In this study, the bacteriophage phiEaP-8 was isolated from apple orchard soil and could efficiently and specifically kill both E. amylovora and E. pyrifoliae. This bacteriophage belongs to the Podoviridae family. Whole genome analysis revealed that phiEaP-8 carries a 75,929 bp genomic DNA with 78 coding sequences and 5 tRNA genes. Genome comparison showed that phiEaP-8 has only 85% identity to known bacteriophages at the DNA level. PhiEaP-8 retained lytic activity up to $50^{\circ}C$, within a pH range from 5 to 10, and under 365 nm UV light. Based on these characteristics, the bacteriophage phiEaP-8 is novel and carries potential to control both E. amylovora and E. pyrifoliae in apple and pear.
Erwinia pyrifoliae is a Gram-negative bacterial plant pathogen that causes black shoot blight in apple and pear. Although earlier studies reported the genome comparison of Erwinia species, E. pyrifoliae strains for such analysis were isolated in 1996. In 2014, the strain E. pyrifoliae EpK1/15 was newly isolated in the apple tree showing black shoot blight in South Korea. This study aimed to better understand the similarities and differences caused by natural variations at the genomic level between newly isolated E. pyrifoliae EpK1/15 and the strain Ep1/96, which were isolated almost 20 years apart. Several comparative genomic analyses were conducted, and Clusters of Orthologous Groups of proteins (COG) database was used to classify functional annotation for each strain. E. pyrifoliae EpK1/15 had similarities with the Ep1/96 strain in stress-related genes, Tn3 transposase of insertion sequences, type III secretion systems, and small RNAs. The most remarkable difference to emerge from this comparison was that although the draft genome of E. pyrifoliae EpK1/15 was almost conserved, Epk1/15 strain had at least three sorts of structural variations in functional annotation according to COG database; chromosome inversion, translocation, and duplication. These results indicate that E. pyrifoliae species has gone natural variations within almost 20 years at the genomic level, and we can trace their similarities and differences with comparative genomic analysis.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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