• 제목/요약/키워드: Southern blot hybridization

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BcHSP17.6 cDNA의 도입에 의한 형질전환된 식물의 내열성 획득 (Acquisition of Thermotolerance in the Transgenic Plants with BcHSP17.6 cDNA)

  • Ki Yong Kim;Min Sup Chung;Jin Ki Jo
    • 한국초지조사료학회지
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    • 제17권4호
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    • pp.379-386
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    • 1997
  • 대만산 배추 (Brassica campestris M.)로부터 분리한 BcHSPI7.6 cDNA(내열성 유전자)를 pBKSl-l vector에 subcloning하므로서, NPTII 유전자와 P35S-HSPI7.6 cDNA를 가지는 pBKH4 재조합 플라스미드를 제작하였다. 이들 플라스미드를 갖는 A. tumefaciens LBA4404로서 담배잎 단편을 24시간 동안 공배양하므로서 감염시켰으며, 이들 유전자로 형질전환된 shoot는 $100\;{\mu\textrm{g}}/ml$의 가나마이신을 첨가한 MS-n/B 배지에서 선발하였다. 담배((Nicotiana. tabacum)의 열에 대한 치사온도는 $50^{\circ}$에서 15분 이상이었으며, BcHSPI7.6 cDNA를 갖는 형질전환된 식물체는 이 온도에서 내열성을 나타내었다. 식울체의 형질전환 여부는 ${\alpha}^{_32}P$로 표지한 BcHSPI7.6 cDNA 단편을 probe로 이용해서 Southern blot hybridization을 실시하므로서 확인하였다. BcHSPI7.6 cDNA의 발현정도는 Northern blot 분석과 이중면역확산 방법으로 확인하였다. 본 연구에서, 담배에 도입한 BcHSPI7.6 cDNA는 내열성과 관련이 있는 유전자로서, HSPI7.6 단백질은 식물체를 열에 의한 손상으로부터 방지해 주는 protector 역할을 하는 것 으로 사료된다.

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균류 Coprinus cinereus에서 DNA 회복에 관여하는 RAD4 유사유전자의 분리와 특성 (Characterization of RAD4 Homologous Gene from Coprinus cinereus)

  • Choi, In-Soon
    • 생명과학회지
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    • 제13권4호
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    • pp.522-528
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    • 2003
  • 본 연구는 출아형 효모 Saccharomyces cerevisiae에서 자외선의 상해 시 이를 정상으로 회복시키는 절제회복 (excision repair) 유전자로 알려진 RADA4의 특성 규명을 위하여 균류 Coprinus cinereus에서 이와 유사한 유전자를 분리하였다. RAD4 유사 유전자를 분리하기 위하여 균류 C. cinereus의 염색체 DNA를 전기영동하여 분리한 다음 효모 RAD4 DNA를 probe로하여 이와 hybridization하였다. 이 결과 RAD4 유사 유전자는 3.2 kb의 insert DNA를 갖고 있었다. 또한 Southern hybridization으로 이 유사 유전자는 fungus C. cinereus의 염색체에 존재함을 확인하였다. 분리한 RAD4 유사 유전자의 전사체 크기는 2.5 kb 였으며, 자외선의 상해 시 전혀 'inducibility가 없음을 Northern hybridization으로 확인하였다. 또한 유사유전자 부분을 삭제하였을 때 이 부분이 없는 세포는 전혀 생존을 못하였다. 이 결과 분리한 RAD4 유사유전자는 세포의 생존에 관여함을 알 수 있었다.

Molecular and Cytogenetic Analysis of Transgenic Plants of Rice(Oryza sativa L.) Produced by Agrobacterium-mediated Transformation

  • Cho, Joon-Hyeong;Kim, Yong-Wook
    • Plant Resources
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    • 제7권1호
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    • pp.39-46
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    • 2004
  • To demonstrate the importance of transformation efficiency in independent event, molecular and cytogenetic analysis were conducted with genomic DNA and chromosome of transgenic plants produced by Agrobacterium tumefeciens LBA4404 (pSBM-PPGN: gusA and bar). Selection ratios of putative transgenic calli were similar in independent experiments, however, transformation efficiencies were critically influenced by the type of regeneration media. MSRK5SS-Pr regeneration mediun, which contains 5 mgL$^{-1}$ kinetin, 2% (w/v) sucrose in combination with 3% (w/v) sorbitol, and 500 mgL$^{-1}$ proline, was efficient to produce transgenic plant of rice from putative transgenic callus in the presence of L-phosphinotricin (PPT). With MSRK5SS-Pr medium, transformation efficincies of Nagdongbyeo were significantly enhanced from 3.7% to 6.3% in independent callus lines arid from 7.3% to 19.7% in plants produced, respectively. Stable integration and expression of bar gene were confirmed by basta herbicide assay, PCR amplification and Southern blotting of bar gene, and fluorescence in situ hybridization (FISH) analysis using pSBM-PPGN as a probe. In Southern blot analysis, diverse band patterns were observed in total 44 transgenic plants regenerated from 20 independent PPT resistant calli showing from one to five copies of T-DNA segments, however, the transformants obtained from one callus line showed the same copy numbers with the same fractionized band patterns.

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세포병리학적 기초에 의한 암진단의 발전: 진단방법과 보조기법 (Recent Advances in Cancer Diagnosis: On an Overview of Diagnostic Cytopathologic Modalities and Ancillary Techniques)

  • 김기태;함의근
    • 대한세포병리학회지
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    • 제7권1호
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    • pp.1-11
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    • 1996
  • 19세기말과 20세기초에 각각 비르효와 파파니콜로에 의해 명료하게 된 세포 병리학과 탈락세포학의 개념에서 오늘날의 암진단의 일차적인 방법이 발전해 왔다. 파파니콜로의 탈락세포학의 개념에서 1960년대 초반에 세침흡인 세포검사가 개발되었다. 이 세침흡인 세포검사는 주된 진단방법이 되어져, 절개생검을 감소하게 하고 의료비용의 효과적인 이용에 공헌하였다. 1980년대에는 면역생화학적 기술들이 암 진단에 보충역활을 하게 되었다. 단 클론 항체를 이용하는 면역과산화효소법이 먼저 암의 본성을 밝히는 보조적인 방법으로 쓰여졌다. 특정 단클론 항체들이 이용가능하게 되어 세포산물이나 표면 표지자들을 인지하는 것을 훨씬 용이하게 하였다. 예를 들면 중간세사에 대한 항체들이 분화가 나쁜 종양의 조직기원을 결정하는데 가치가 있는 것이 증명되었다. 종양표지자들은 종양존재의 생화학적 표시자로 이용될 수도 있는데 이러한 종양표지자들은 혈장이나 다른 체액들에서 검출할 수 있다. 이 종양표지자들을 농출한 것을 진단적 검사에 이용하여 이미 진단된 암의 임상 경과를 추적하고 암 발생의 위험이 있는 집단에서 특정 종양을 발견해 내기 위한 선별검사로써 이용할 수 있다. 유세포 검사는 백혈병이나 림프종 세포들의 면역표현형을 알아내고, 종양세포들의 DNA함유량을 알아내며, 세포증식율을 알아내는 등의 몇가지의 세포의 특성을 분류해내는데 유용한 도구이다. 분자생물학적 방법들은, 암 환자를 진료하는데 있어 진단, 예후평가 및 치료 등의 분야에서 일보 전진하게 하였다. 핵산교잡법이 Southern blots, Nothern blot, Dot blot 및 in situ hybridization으로 이용된다. 분자생물학 및 그 기술이 암종 생물학을 이해하고 유전자 조작을 기초로한 치료법을 계획하는데 밝은 새로운 지평선을 열어줄 수 있을 것이다.

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한국 분리주 감자 잎말림 바이러스 (PLRV) 외피 단백질 유전자의 클로닝 및 감자 내 도입 (Cloning of Coat Protein Gene from Korean Isolate Potato Leafroll Virus (PLRV) and Introduction into Potato (Solanum tuberosum))

  • 서효원;이정윤;박영은;조지홍;함영일;조현묵
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제32권4호
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    • pp.243-250
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    • 2005
  • 한국 분리주 감자잎말림바이러스 (PLRV)로부터 627bp 크기의 외피단백질 유전자의 ORF (AF296280)를 분리하여 장려품종 감자인 '수미'를 형질전환 하였다. 17계통의 형질전환체를 선발하여 온실과 포장에서 5세대를 증식하면서 PLRV에 대한 저항성이 큰 5계통을 선발 하였다. 도입된 유전자들의 유전적인 안정성을 확인하기위해 PCR, Southern, 그리고 northern blot 분석을 수행하였다. 또한 클론으로 증식된 형질전환 감자들의 특성과 저항성도 검정하였다. 형질전환된 감자들에서 PLRV의 외피단백질 유전자는 안전적으로 발현되며 저항성을 유지하였으며, 유사도가 비교적 낮은 감자 바이러스 Y (PVY)에는 저항성을 나타내지 않았다. 따라서 이러한 저항성은 도입된 유전자와 유사성도가 높은 바이러스에 저항성을 나타내는 homology dependent gene silencing으로 판단되었다. 유망계통 형질전환 감자 계통들의 포장평가를 통해 PLRV에 대한 저항성을 제외한 주요한 농업적 특성과 식물학적 특성은 형질전환 되지 않은 감자와 큰 차이를 보이지 않았다.

측방유동방식 신속 DNA 교잡 분석법의 개발 (Development of a Method for Rapid Analysis of DNA Hybridization)

  • 정동석;최의열
    • 미생물학회지
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    • 제39권2호
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    • pp.114-117
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    • 2003
  • 유전자의 기능을 분석하는 과정에서 특정한 염기 서열의 존재여부를 확인하는 분석법은 필수적이다. 현재 사용되고 있는 Southern및 Northern blotting방법은 시간이 오래 걸리며, 온도 등과 같은 외부 조건을 엄격하게 조절하여야 한다. 본 연구에서는 측방유동방식을 이용한 크로마토그라피법을 응용하여 새로운 간편용 DNA분석법을 개발하였다. 이 측방유동형 DNA 분석 스트립은 시료가 적용되는 샘플패드, 이동하여 분리되고 교잡반응이 일어나는 전개용 막, 그리고 시료가 계속하여 이동하기 위한 흡수패드로 구성되어 있다. 모델 시스템으로 HIV와 HCV에 대한 포획 및 표적 DNA를 합성하고 스트립을 제조하였다. 시료를 샘플패드에 적하한 후 교잡반응체의 생성여부와 상대적인 양은 GSI형광 스캐너로 분석하였다. 교잡반응이 매우 빠르게 진행되고 세척과정이 없음에도 불구하고 비특이적인 교차 반응이 거의 관찰되지 않았다. 기존의 DNA 교잡방법과 비교하여 볼 때 이 새로운 방법으로 DNA/DNA 교잡 실험을 보다 더 쉽고, 간편하고, 그리고 빠르게 할 수가 있을 것으로 예상된다.

Acquisition of Thermotolerance in Transgenic Orchardgrass Plants with DgHSP17.2 Gene

  • Kim, Ki-Yong;Jang, Yo-Soon;Cha, Joon-Yung;Son, Daeyoung;Choi, Gi Jun;Seo, Sung;Lee, Sang Jin
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제21권5호
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    • pp.657-662
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    • 2008
  • To develop transgenic orchardgrass (Dactylis glomerata L.) resistant to high temperature, the recombinant DgHSP17.2 gene was introduced into orchardgrass plants using the Agrobacterium-mediated transformation method and expressed constitutively under the control of the CaMV 35S promoter. The results of genomic DNA PCR and Southern analysis showed a DNA band and hybridization signal on agarose gel and X-ray film in transgenic orchardgrass plants harboring the recombinant DgHSP17.2 gene, but a DNA band and hybridization signal were not observed in the wild type and empty vector control plants. The same result was also obtained in RT-PCR and Southern blot analysis, and these transgenic orchardgrass plants did not show any morphological aberration both in the culture bottle and soil mixture. When leaf discs cut from transgenic orchardgrass plants with recombinant DgHsp17.2 gene were exposed to lethal temperature (heat treatment at $60^{\circ}C$ for 50 min), 60-80% of the leaf discs showed only damage symptoms, but non-transgenic leaf discs showed a lethal condition. These results indicate that the DgHsp17.2 gene may act as a protector from heat stress in plants.

Application of Chromosome Manipulation, DOP-PCR and AFLP Methods to Isolate Sex-Specific DNAs from Rumex acetosa L.

  • Jin, Dong-Chung;Kim, Joong-Soon;Park, ji-Young;Bong, Jae-Wook;Hur, Yoon-Kang
    • Journal of Photoscience
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    • 제12권2호
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    • pp.75-82
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    • 2005
  • Rumex acetosa L. is a dioecious flowering plant with well developed sex chromosome system: 2n = 12 + XX in the female plants and 2n = 12 + XY1Y2 in the male plants. To isolate sex-linked DNA, we carried out chromosome micromanipulation, followed by DOP-PCR, AFLP of the PCR products, reverse Southern hybridization and sequence analysis. From 500 AFLP specific clones, 13 X-chromosome and 5 Y-chromosome specific clones were obtained. Except one clone RADAX-239 ($\underline{R}umex\;\underline{a}-\underline{D}OP-PCR-\underline{A}FLP-\underline{Y}-chromosome\;specific$), all clones appear to be R. acetosa plant-specific sequences and non-coding sequences. Southern blot analysis using these clones could not discriminate genomic DNAs either from male or female plants. Results of this study imply that both autosome-origin and degeneration of sex chromosomes are prevalent in plant systems.

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Coprinus congregatus에서 선형으로 전환한 plasmid DNA를 사용하여 phosphinothricin 저항성에 대한 형질전환 (Transformation of Coprinus congregatus with a Linearized Plasmid Vector to Phosphinothricin Resistance)

  • 임영은;김순자;최형태
    • 미생물학회지
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    • 제33권4호
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    • pp.274-276
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    • 1997
  • Coprinus congregatus에서 laccase를 과량생성하는 변이주를 대상으로 phosphinothricin 저항성을 선택표지로 사용하여 형질전환을 수행하였다. 항생물질에 대한 저항성을 부여하는 plasmid DNA(pBARGEM 7-1)를 제한효소로 가수분해하여 원형질체에 형질전환을 수행한 결과 plasmid DNA $1{\mu}g$ 당 약 500여개의 형질전환체를 얻었다. 도입된 plasmid는 형질전환체의 chromosomal DNA에 삽입되어 있음을 Southern blot으로 확인하였다.

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Lactococcus lactis subsp. lactis ATCC 7962의 nisin 저항성 유전자를 포함하는 plasmid pCS100의 특성규명 (Characteristics of the Plasmid pCS100 Containing Nisin Resistant Gene from Lactococcus lactis subsp. lactis ATCC7962.)

  • 송종효;이형주;김정환;정대균
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제26권6호
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    • pp.562-565
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    • 1998
  • Nisin-producing and nisin resistant L. lactis subsp. lactis ATCC7962 harbored six plasmids. To find a plasmid containing a nisin resistant gene, these plasmids were transformed into L lactis LM0230 of plasmid-free and nisin sensitive strain. After screening on nisin selection media containing nisin (150 $\mu\textrm{g}$/$m\ell$), several nisin resistant transformants were obtained and the level of nisin resistance was very similar to that of wild type L lactis subsp. lactis ATCC7962. A 26.5 kb plasmid, named as pCS100, which confers resistance to nisin, was identified in transformants. The pCS100 was digested with EcoRI and Southern blot hybridization was done with nisI probe to localize the nisin resistant gene. A 4 kb EcoRI fragment showed a strong positive signal, and it was cloned into pBluescript for the potential selection marker.

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