Lamsal, Kabir;Kim, Sang Woo;Kim, Yun Seok;Lee, Youn Su
Mycobiology
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v.40
no.4
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pp.244-251
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2012
In vitro and greenhouse screening of seven rhizobacterial isolates, AB05, AB10, AB11, AB12, AB14, AB15 and AB17, was conducted to investigate the plant growth promoting activities and inhibition against anthracnose caused by Colletotrichum acutatum in pepper. According to identification based on 16S rDNA sequencing, the majority of the isolates are members of Bacillus and a single isolate belongs to the genus Paenibacillus. All seven bacterial isolates were capable of inhibiting C. acutatum to various degrees. The results primarily showed that antibiotic substances produced by the selected bacteria were effective and resulted in strong antifungal activity against the fungi. However, isolate AB15 was the most effective bacterial strain, with the potential to suppress more than 50% mycelial growth of C. acutatum in vitro. Moreover, antibiotics from Paenibacillus polymyxa (AB15) and volatile compounds from Bacillus subtilis (AB14) exerted efficient antagonistic activity against the pathogens in a dual culture assay. In vivo suppression activity of selected bacteria was also analyzed in a greenhouse with the reference to their prominent in vitro antagonism efficacy. Induced systemic resistance in pepper against C. acutatum was also observed under greenhouse conditions. Where, isolate AB15 was found to be the most effective bacterial strain at suppressing pepper anthracnose under greenhouse conditions. Moreover, four isolates, AB10, AB12, AB15, and AB17, were identified as the most effective growth promoting bacteria under greenhouse conditions, with AB17 inducing the greatest enhancement of pepper growth.
This experiment was conducted to clarify the plant growth promoting effect of compost supplemented with cultured solution of photosynthetic bacteria(Rhodopseudomonas capsulatus) before sowing on the early growth of plug seedling of tomato and to evaluate the optimum concentration of bacterialization. Bacterializing concentrations(v/w) to the compost were 2%, 3.3%, 10%, 20% and 50%, respectively. Plant growth in terms of plant height, stem diameter, leaf area, total fresh and dry weight were promoted by the bacterialization of photosynthetic bacteria. Especially, in the plots supplemented with 10 to 20% the early growth was promoted markedly over 2 times. Compositions of photosynthetic bacteria consisted of crude protein 60.7%, soluble carbohydrates 20.1%, crude fat 7.6%, crude fiber 3.2% and crude ash 4.8, respectively.
BACKGROUND: Rhizosphere bacteria may improve plant growth and productivity both by supply nutrients and hormonal stimulation. Although many experiments have shown improvements in plant growth with inoculation of bacterial cultures to the rhizosphere, the main obstacle in the applications of plant growth promoting rhizobacteria in a large scale is the inconsistency of the results. We tested the growth promoting effects of Azospirillum and Methylobacterium strains on red pepper plant. METHODS AND RESULTS: Red pepper seedlings were grown for 25 days in a growth media inoculated with A. brasilense CW903 or M. oryzae CBMB20. The seedlings were transplanted and grown for 45 days in pots with soil in a greenhouse, at half the recommended level of fertilizer. Bacterial culture, $4.0{\times}10^9$ for A. brasilense CW903 and $5.8{\times}10^8$ CFU for M. oryzae CBMB20, was applied in root zone soil periodically every 10 days during the experiment. Inoculation of M. oryzae CBMB20 significantly increased the red pepper plant growth in terms of leaf number, height and mass of shoot, or root mass compared to uninoculated control plants. Although beneficial effects of A. brasilense on plant growth of many crops were observed, the growthpromoting effect of A. brasilense CW903 on red pepper plant was not found in this study. CONCLUSION(s): The factors responsible for the irregularities in plant growth promoting of rhizobacteria are difficult to elucidate. Extensive inoculation experiments in the greenhouse and in the field should enable us to define the factors critical to obtain successful application of plant growth promoting rhizobacteria.
Plant growth promoting traits like production of indoleacetic acid (IAA), ammonia, hydrogen cyanide (HCN), siderophore, and like the enzyme activities of catalase, ACC deaminase, cellulase, chitinase and protease were assayed in vitro for twenty one phosphorus solubilizing bacteria isolated from soil isolates. Except SPP-5 and SPP-15 strains, all the other isolated strains produced IAA in various amounts of 10 to $23{\mu}g\;ml^{-1}$. All strains showed positive response for ammonia production and ACC deaminase activity implying that they are capable of growing in a N-free basal medium. Catalase activity was found to be superior in SPP-2, SPP-7, SPP-12 and SPP-17 compared to the other strains tested. HCN production was detected by 15 strains and among them SPP-9, SPP-15, SAph-11, and SAph-24 were found to be strong HCN producers. Except the isolates SPP-10, SPP-12, SPP-13 and SPP-14, all the other isolates produced more than 80% siderophore units. None of the strains showed cellulose and chitinase activity. SAph-8, SAPh-11, SAPh-24 and SPP-15 strains showed 35.84, 50.33, 56.64 and 34.78 U/ml protease activities, respectively. SPP-1, SPP-2, SPP-3, SPP-11, SPP-17, SPP-18, SAph-11 and SAph-24 strains showed positive response for all the tested plant growth promotion traits except cell wall degrading enzyme activities. According to the results, all the tested phosphorus solubilizing isolates could exhibit more than three or four plant growth promoting traits, which may promote plant growth directly or indirectly or synergistically. Therefore, these phosphorus solubilizing strains could be employed as bio-inoculants for agriculture soils.
Purple nonsulfur bacteria were isolated from river sediments and their growth promoting capabilities on tomato were examined. Isolated strains KL9 and BL6 were identified as Rhodopseudomonas spp. by 16S rDNA sequence analysis. Rhodopseudomonas strain KL9 maximally produced 5.56 mM/min/mg protein and $67.2\;{\mu}M/min/mg$ protein of indole-3-acetic acid (IAA) and 5-aminolevulinic acid (ALA), respectively, which may be one of the mechanisms of plant growth enhancement. The germination percentage of tomato seed, total length, and dry mass of germinated tomato seedling increased by 30.2%, 71.1%, and 270.8%, respectively, compared with those of the uninoculated control 7 days after inoculation of strain KL9. The lengths of the root and shoot of germinated seedling treated with 3 mM tryptophan, a precursor of IAA, increased by 104.4% and 156.5%, respectively, 7 days after inoculation of strain KL9. Rhodopseudomonas KL9 increased 123.5% and 54% of the root and shoot lengths of germinated seedling, respectively, treated with 15 mM glycine and succinate, precursors of ALA. This plant growth promoting capability of purple nonsulfur bacteria may be a candidate for a biofertilizer in agriculture.
Lee Su-Jin;Lee Sang-Eun;Seul Keyung-Jo;Park Seung-Hwan;Ghim Sa-Youl
Microbiology and Biotechnology Letters
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v.34
no.1
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pp.78-82
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2006
Since there could be more and rather various diazotrophs in rhizosphere of wild crops than those in rhizosphere of cultivars, some wild gramineous crops grown in Korea were collected for isolating nitrogen-fixing bacteria. Six diazotrophs were purified from their roots using nitrogen-free media. The isolated bacteria were partially identified as 4 genera by 16S rDNA sequence analysis: Stenotrophomonas sp., Bosea sp., Klebsiella sp., and Azorhizobium sp. By PCR amplification and sequence analysis, DNA fragments extracted from all isolates turned out to have an individual nifH homologous gene. Five isolates (KNUC163, KNUC165, KNUC169, KNUC170, and KNUC171) showed auxin activity and four isolates (KNUC163, KNUC166, KNUC170, and KNUC171) produced siderophores. Especially,3 strains of S. maltophilia showed both auxin and siderophore activities. In conclusion, the isolated nitrogen-fixing bacteria might have capabilities for plant growth promotion.
Endophytic bacterial communities of tidal flat plants antagonistic to oomycete plant pathogens were studied by the isolation of 256 root colonizing endophytic bacteria from surface-disinfected root tissues of six plants ($Rosa$$rugosa$, $Suaeda$$maritima$, $Vitex$$rotundifolia$, $Carex$$scabrifolia$, $Glehnia$$littoralis$ and $Elymus$$mollis$) growing in a tidal flat area of Namhae Island, Korea. To understand the antagonistic potential, an $in$$vitro$ antagonistic assay was performed to characterize and identify strains that were antagonistic to the oomycete plant pathogens $Phytophthora$$capsici$ and $Pythium$$ultimum$ from the total population. Nine percent of the total number of isolated bacteria exhibited in vitro inhibitory activity against target plant pathogenic oomycetes. Taxonomic and phylogenetic placement of the antagonistic bacteria was investigated by analysis of the 16S rRNA gene sequences. The sequence analysis classified the antagonistic strains into four major classes of the domain bacteria ($Firmicutes$, ${\alpha}-Proteobacteria$, ${\gamma}-Proteobacteria$ and $Actinomycetes$) and 10 different genera. Further production of secondary metabolites, hydrolytic enzymes and plant growth promoting traits were determined for the putative new species of antagonistic endophytic bacteria. These new strains could not be identified as known species of ${\alpha}-Proteobacteria$, and so may represent novel bacterial taxa. The unexpected high antagonistic bacterial diversity associated with the tidal flat plants may be indicative of their importance in tidal flat plants as a promising source of novel antimicrobial compounds and biocontrol agents.
In this study, samples were collected from the leaves and stems of healthy wild Pistachio trees (Pistacia atlantica L.) from various locations of Baneh and Marivan regions, Iran. In total, 61 endophytic bacteria were isolated and grouped according to phenotypic properties. Ten selected isolates from each group were further identified by partial sequencing of the 16S rRNA gene. Based on the results, isolates were identified as bacteria belonging to Pseudomonas, Stenotrophomonas, Bacillus, Pantoea and Serratia genus. The ability of these isolates was evaluated to phytohormone production such as auxin and gibberellin, siderophore production, phosphate solubilization, atmospheric nitrogen fixation, protease and hydrogen cyanide production. All strains were able to produce the plant growth hormone auxin and gibberellin in different amounts. The majority of strains were able to solubilize phosphate. The results of atmospheric nitrogen fixation ability, protease and siderophore production were varied among strains. Only Ba66 could produce a low amount of hydrogen cyanide. The results of biocontrol assay showed that Pb78 and Sp15 strains had the highest and lowest inhibition effects on bacterial plant pathogens, Pseudomonas syringae pv. syringae Pss20 and Pseudomonas tolaasii Pt18 under in vitro condition. Pb3, Pb24 and Pb71 strains significantly promote root formation on carrot slices. To our knowledge this is the first report of the isolation of endophytic bacterial strains belonging to Pantoea, Bacillus, Pseudomonas, Serratia and Stenotrophomonas genus from wild pistachio trees with plant growth promoting potential and biocontrol activity.
Park, Se Won;Yang, Hee-Jong;Seo, Ji Won;Kim, Jinwon;Jeong, Su-ji;Ha, Gwangsu;Ryu, Myeong Seon;Yang, Hee Gun;Jeong, Do-Youn;Lee, Hyang Burm
The Korean Journal of Mycology
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v.49
no.4
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pp.441-454
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2021
Fungal diseases including anthracnose, stem rot, blight, wilting, and root rot of crops are caused by phytopathogens such as Colletotrichum species, Sclerotinia sclerotiorum, Phytophthora species, and Fusarium oxysporum and F. solani which threaten the production of chili pepper. In this study, to identify biological control agents (BCAs) of phytopathogenic fungi, potentially useful Bacillus species were isolated from the field soils. We screened out five Bacillus strains with antagonistic capacity that are efficiently inhibiting the growth of phytopathogenic fungi. Bacillus species were characterized by the production of extracellular enzymes, siderophores, and indole-3-acetic acid (IAA). Furthermore, the influence of bacterial strains on the plant growth promoting activity and seedling vigor index were assessed using Brassica juncea as a model plant. Inoculation with Bacillus subtilis SRCM 121379 significantly increased the length of B. juncea shoots and roots by 45.6% and 52.0%, respectively. Among the bacterial isolates, Bacillus subtilis SRCM 121379 showed the superior enzyme activities, antagonistic capacity and plant growth promoting effects. Based on the experimental results, Bacillus subtilis SRCM 121379 (GenBank accession no. NR027552) was finally selected as a BCA candidate.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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