• BMB Reports
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• 제54권5호
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• pp.278-283
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• 2021

Our understanding of the differential effects between specific omega-3 fatty acids is incomplete. Here, we aimed to evaluate the effects of docosahexaenoic acid (DHA) and eicosapentaenoic acid (EPA) on T-helper type 1 (Th1) cell responses and identify the pathways associated with these responses. Naïve CD4⁺ T cells were co-cultured with bone marrow-derived dendritic cells (DCs) in the presence or absence of palmitate (PA), DHA, or EPA. DHA or EPA treatment lowered the number of differentiated IFN-γ-positive cells and inhibited the secretion of IFN-γ, whereas only DHA increased IL-2 and reduced TNF-α secretion. There was reduced expression of MHC II on DCs after DHA or EPA treatment. In the DC-independent model, DHA and EPA reduced Th1 cell differentiation and lowered the cell number. DHA and EPA markedly inhibited IFN-γ secretion, while only EPA reduced TNF-α secretion. Microarray analysis identified pathways involved in inflammation, immunity, metabolism, and cell proliferation. Moreover, DHA and EPA inhibited Th1 cells through the regulation of diverse pathways and genes, including Igf1 and Cpt1a. Our results showed that DHA and EPA had largely comparable inhibitory effects on Th1 cell differentiation. However, each of the fatty acids also had distinct effects on specific cytokine secretion, particularly according to the presence of DCs.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제13권5호
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• pp.1901-1906
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• 2012

Background: The discovery that microRNA (miRNA) regulates metastasis provide a principal molecular basis for tumor heterogeneity. A characteristic of solid tumors is their heterogenous distribution of blood vessels, with significant hypoxia occurring in regions (centers of tumor) of low blood flow. It is necessary to discover the mechanism of breast cancer metastasis in relation to the fact that there is a differential distribution of crucial microRNA in tumors from centers to edges. Methods: Breast tissues from 48 patients (32 patients with breast cancer) were classified into the high invasive and metastatic group (HIMG), low invasive and metastatic group (LIMG), and normal group. Samples were collected from both the centers and edges of all tumors. The first six specimens were detected by microRNA array, and the second ten specimens were detected by real-time qRT-PCR and Western blot analyses. Correlation analysis was performed between the miRNAs and target proteins. Results: The relative content of miR-20a and miR-20b was lower in the center of the tumor than at the edge in the LIMG, lower at the edge of the tumor than in the center in the HIMG, and lower in breast cancer tissues than in normal tissues. VEGF-A and HIF-1alpha mRNA levels were higher in the HIMG than in the LIMG, and levels were higher in both groups than in the normal group; there was no difference in mRNA levels between the edge and center of the tumor. VEGF-A and HIF-1alpha protein levels were higher in the HIMG than in the LIMG, and protein levels in both groups were higher than in the normal group; there was a significant difference in protein expression between the edge and center of the tumor. Correlation analysis showed that the key miRNAs (miR-20a and miR-20b) negatively correlated with the target proteins (VEGF-A and HIF-1alpha). Conclusions: Our data suggest that miR-20a and miR-20b are differentially distributed in breast cancer, while VEGF-A and HIF-1alpha mRNA had coincident distributions, and VEGF-A and HIF-1alpha proteins had uneven and opposing distributions to the miRNAs. It appears that one of the most important facets underlying metastatic heterogeneity is the differential distribution of miR-20a and miR-20b and their regulation of target proteins.

• 대한화장품학회지
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• 제32권1호
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• pp.7-15
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• 2006

본 연구에서는 발아 검은 쌀로부터 분리한 올리고펩타이드($Oligosproutin^{(R)}$)의 피부 탄력 개선 효과에 대하여 연구하였다. 올리고펩타이드가 각질형성세포의 유전자 발현에 미치는 영향을 알아보고자 DNA microarray를 수행하였다. 각질형성세포에 올리고펩타이드를 처리하여 유전자의 발현이 2배 이상 증가하는 유전자는 745개이고, 2배 이상 감소하는 유전자는 1011개로 나타났다. 이 중 hyaluronan synthase 2 (HAS2)의 유전자 발현이 2배 이상 증가함을 확인하였다. 올리고펩타이드를 처리한 각질형성세포에서 세포활성 증가, HAS2 유전자 발현 증가, 세포내 항산화 효과를 확인하였다. 올리고펩타이드를 함유한 O/W 에멀젼을 이용한 임상실험에서 피부의 탄력 개선 효과를 확인하였다. 본 연구를 통하여 발아 검은 쌀로부터 분리한 올리고펩타이드는 피부 탄력 개선을 주는 항노화 화장품 개발에 응용될 수 있을 것이라 기대된다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제49권4호
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• pp.460-469
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• 2017

열충격 단백질(heat shock proteins, HSPs)은 다양한 종양에서 과발현 되고, 종양이 형성되는 과정이나 그 예후에 영향을 주며, 분자량에 따라 HSP27, HSP60, HSP90, HSP100 등으로 구분한다. Heat shock protein90은 세포 내 불안정한 단백질을 보호하는 역할을 통해 질병의 유지에 기여하는데, 정상 조직에 비해 종양 세포에서 높은 수준으로 발현된다고 보고되었다. 이에 본 연구에서는 우리나라 사망원인 1위인 폐암 중 비소세포 폐암에서 Heat shock protein90 family 발현과 비소세포 폐암환자의 임상적 특징과의 상관관계를 분석하여 종양의 생물학적 표지자로서의 가능성을 조사하였다. HSP90 family의 발현과 임상병리학적 특성 및 생존율과의 상관관계를 분석한 결과 $HSP90{\alpha}$는 림프혈관강 침윤이 되지 않은 환자에서 높은 발현을 보였고(p=0.014), $HSP90{\beta}$ 은 조직학적 형태에서 편평상피세포 암종에서 높은 발현을 보였으며(p=0.003), GRP94 은 분화도가 낮을수록 높은 발현을 나타내었다(p=0.048). 생존율은 $HSP90{\alpha}$, $HSP90{\beta}$, GRP94 모두 발현 차이에 대한 유의성이 없었다. 본 연구를 통해 miRNA-126, miRNA-155, miRNA-200c의 발현은 비소세포 폐암의 진단을 위한 생물학적 표지자 및 예후 인자로서 사용될 수 있을 것으로 사료된다. 그리고 비소세포 폐암의 치료용으로 HSP90 family가 고려되어야 할 것이며, GRP94가 종양의 예후예측을 위한 중요한 인자라 사료된다.

• Molecules and Cells
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• 제27권4호
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• pp.467-473
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• 2009

Our previous study suggested that OsBWMK1, a gene which encodes a member of the rice MAP kinase family, generates transcript variants which show distinct expression patterns in response to environmental stresses. The transcript variants are generated by alternative splicing and by use of alternative promoters. To test whether the two alternative promoters, pOsBWMK1L (promoter for the OsBWMK1L splice variant) and pOsBWMK1S (promoter for the OsBWMK1S splice variant), are biologically functional, we analyzed transgenic plants expressing GUS fusion constructs for each promoter. Both pOsBWMK1L and pOsBWMK1S are biologically active, although the activity of pOsBWMK1S is lower than that of pOsBWMK1L. Histochemical analysis revealed that pOsBWMK1L is constitutively active in most tissues at various developmental stages in rice and Arabidopsis, whereas pOsBWMK1S activity is spatially and temporally restricted. Furthermore, the expression of pOsBWMK1S::GUS was upregulated in response to hydrogen peroxide, a plant defense signaling molecule, in both plant species. These results suggest that the differential expression of OsBWMK1 splice variants is the result of alternative promoter usage and, moreover, that the mechanisms controlling OsBWMK1 gene expression are conserved in both monocot and dicot plants.

• 생명과학회지
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• 제24권5호
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• pp.567-572
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• 2014

초롱꽃과에 속하는 도라지는 항염증, 항산화, 항암작용뿐 아니라 간기능 강화에도 작용하여 한방에서 만성염증성 질환의 치료제로 널리 사용되고 있다. 이번 연구에서 마우스 대식세포주인 RAW 246.7 세포와 비장으로부터 분리한 T세포에서 도라지 추출액(CC), 도라지 추출물이 함유된 활맥단 추출액(HWAL, 도라지 82% 함유) 및 맥환추출액(MAEK, 도라지 7% 함유)을 처리하여 대식세포와 T세포의 활성과 관련 있는 유전자의 발현을 통해 면역증진 및 항염증 효과를 real-time RT-PCR 기법을 통해 확인해 보았다. 그 결과, 활성화된 T세포에서 많이 발현되는 c-fos (10배 이상), CD40L 유전자(6배 이상)의 경우, 맥환 추출액 처리군에서 가장 높은 발현이 유도되어 면역활성 효과가 높을 것으로 사료되었다. 도라지 추출액과 활맥단 추출액의 경우도 c-fos 유전자의 발현을 유의적으로 증가시켰지만 미약하였고, CD40L의 경우는 영향을 주지 않았다. 도라지 추출액을 처리한 군에서 면역활성을 유도하는 M1 대식세포에서 많이 발현되는 iNOS 유전자의 발현이 유의하게 증가되었다. 반면에 활맥단 추출액을 처리한 대식세포는 M2 표식인자인 Ym1, arginase1 (ARG1) 유전자의 발현이 유의적으로 상승하였다. 결론적으로 도라지가 다량 포함된 맥환 추출액은 면역활성을 유도하는데 탁월한 효과를 나타내며, 도라지 함유가 적게 포함된 활맥단 추출액은 항염증 작용에 탁월한 효과가 있을 것으로 사료된다.

• 생명과학회지
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• 제18권8호
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• pp.1090-1095
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• 2008

근내지방 축적이 왕성하게 진행되는 12개월 및 27개월령 사이에 유전자발현이 증가하는 inducible cAMP early repressor (ICER) 유전자의 클로닝 및 유전자발현 특성을 규명하기 위하여 한우조직별, 근육 내 조지방 함량에 따라 마블링 high- 및 low 한우 각 4두와 3두씩을 공시하였다. ddRT-PCR 분석을 통하여 증폭된 300 bp PCR 산물 및 EST 서열을 중심으로 1.5 kb 한우 ICER cDNA를 염기서열 분석하였으며, 조직별 유전자발현분석결과, 식이지방이 흡수되는 소장 조직에서 ICER 유전자의 발현량이 가장 높았다. 아울러, 같은 근육타입인 등심 및 우둔조직 사이에서 ICER 유전자발현은 등심조직에서 2.5배 많이 발현하였다. 한우 마블링 high, low 두 그룹 간 유전자발현 분석 결과, high 그룹에서 ICER 유전자발현이 4배 이상 증가하는 것으로 분석되었다. 따라서, ICER 유전자는 가축의 마블링과 밀접한 관련이 있는 유전자임이 사료된다.

• 한국수정란이식학회지
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• 제25권1호
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• pp.29-34
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• 2010

난포낭종은 소 번식 장애의 주요 원인 중의 하나이며, 다양한 유전자의 변화는 여러 세포와 조직 기능에 영향을 준다. 이러한 유전자 변화는 낭종성 난소에서도 나타날 수 있다. 이온 및 수송체와 관련된 유전자 변화가 한우의 난포낭종을 유발할 수 있을 것이라는 가설 하에 난포낭종성 난포에서 발현 변화를 보이는 유전자를 찾기 위하여 마이크로어레이 분석을 수행하였다. 마이크로어레이 분석 결과, 난포낭종성 난포에서 FGG와 LRP8이 증가하고, SLC44A4, SLC27A5, ANXA8 및 aquaporin 4는 감소하였다. 반정량적 역전사중합효소 연쇄 반응으로 마이크로어레이 분석 결과를 재확인하였다. 6개의 DEG 중 3개의 DEG(FGG, SLC44A4 및 aquaporin 4)는 마이크로어레이 분석 결과와 동일하게 증가와 감소를 보였다. 마이크로어레이와 역전사중합효소 반응에서 동일한 결과를 보이는 3개의 유전자 중 가장 크게 변화를 보인 섬유소원에 중점을 두고 연구를 수행하였다. 마이크로어레이와 역전사중합효소 연쇄 반응은 난포낭종성 난포에서 섬유소원 유전자 발현을 각각 8.4배와 1.7배 증가시켰다. 그러나 난포 및 과립층세포에서 섬유소원의 단백질 양은 웨스턴 블랏 분석으로 분석한 결과, 정상에 비하여 낭종에서 유의한 차이를 보이지 않았다. 본 연구에서 섬유소원은 유전자와 단백질 발현에 있어 상관관계는 보이지 않았지만 섬유소원 유전자는 정상 조직으로부터 난포낭종을 구별하는데 있어서 중요한 생물표지자가 될 수 있는 가능성을 제시한다.

• Biomolecules & Therapeutics
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• 제27권3호
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• pp.302-310
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• 2019

Melanoma cells have been shown to respond to BRAF inhibitors; however, intrinsic and acquired resistance limits their clinical application. In this study, we performed RNA-Seq analysis with BRAF inhibitor-sensitive (A375P) and -resistant (A375P/Mdr with acquired resistance and SK-MEL-2 with intrinsic resistance) melanoma cell lines, to reveal the genes and pathways potentially involved in intrinsic and acquired resistance to BRAF inhibitors. A total of 546 differentially expressed genes (DEGs), including 239 up-regulated and 307 down-regulated genes, were identified in both intrinsic and acquired resistant cells. Gene ontology (GO) analysis revealed that the top 10 biological processes associated with these genes included angiogenesis, immune response, cell adhesion, antigen processing and presentation, extracellular matrix organization, osteoblast differentiation, collagen catabolic process, viral entry into host cell, cell migration, and positive regulation of protein kinase B signaling. In addition, using the PAN-THER GO classification system, we showed that the highest enriched GOs targeted by the 546 DEGs were responses to cellular processes (ontology: biological process), binding (ontology: molecular function), and cell subcellular localization (ontology: cellular component). Ingenuity pathway analysis (IPA) network analysis showed a network that was common to two BRAF inhibitorresistant cells. Taken together, the present study may provide a useful platform to further reveal biological processes associated with BRAF inhibitor resistance, and present areas for therapeutic tool development to overcome BRAF inhibitor resistance.

• BMB Reports
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• 제33권5호
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• pp.396-401
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• 2000

A differential display method is used to identify novel genes whose expression is affected by treatment with ferric ammonium citrate (FAC) or desferrioxamine (DFO), an iron chelating agent in the human hepatoblastoma cell line (HepG2). These chemicals are known to deplete or increase the intracellular concentration of iron, respectively. Initially, we isolated seventeen genes whose expressions are down- or up regulated by the treatment of the chemicals, as well as their four differentially expressed genes that are designated as clone-1, -2, -3, and -4. These are further characterized by cDNA sequencing and Northern blot analysis. Through the cDNA sequencing, as well as comparing them to genes published using the NCBI BLAST program, we identified the sequence of the clone-1 that is up-regulated by the treatment of DFO. It is identical to the human insulin-like growth factor binding protein-1 (IGFBP-1). This suggests that the IGFBP-1 gene in the HepG2 cell is up-regulated by an iron depletion condition. Also, the expression of the clone-3 and -4 is up-regulated by FAC treatment and their eDNA sequences are identical to the human ferritin-fight chain and human NADH-dehydrogenase, respectively. However, the sequence of the clone-2 has no significant homology to any other known gene. Therefore, we suggest that changes of the cellular iron level in the HepG2 cell affects the transcription of cellular genes. This includes human IGFBP-1, ferritin-fight chain, and NADH-dehydrogenase. Regulation of these gene expressions may have an important role in cellular functions that are related to cellular iron metabolism.