• 제목/요약/키워드: D-Loop

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한우 산유량에 미치는 Mitochondrial DNA D-loop영역의 염기서열 변이효과 (Effect of Sequence Variation in Bovine Mitochondrial DNA D-Ioop Region on ~ilk Production for Hanwoo)

  • 공홍식;오재돈;임현진;이학교;전광주;윤두학;전기준;최재관;최연호;조병욱
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권5호
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    • pp.729-734
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    • 2004
  • 본 연구는 한우의 mtDNA D-loop 영역 염기 변이가 산유량에 미치는 효과를 검증하기 위하여 수행하였다. 젖소의 mtDNA D-loop 영역에서 단일염기의 치환이 20 개의 지역에서 확인되었다. 그중 8, 169, 16042, 16051, 16057, 16093, 16119, 16122, 16209, 16255, 16302 bp 지역에서 높은 빈도의 염기치환이 검출되었다. 16119bp 지역에서는 T가 C로 치환된 빈도가 0 .138로 검출되었으며, 이 위치에서의 염기치환에 의한 산유량 효과는 -1.61 (p<0.1)로 나타났다. 16185bp 지역에서의 염기치환에 의한 산유량 효과는 3.557(p<0.05)로 나타났으며 G가 A로 치환된 빈도는 0.063로 나타났다. 본 연구에서 검출한 한우 다유계통 집단의 mtDNA내 D- loop 영역의 염기서열 변이 빈도와 유량과의 연관성분석 결과 등은 한우 집단의 유전적 변이성 추정과 좀 더 다양한 경제형질과의 관련성 분석으로 다양한 유전적 지표인자 발굴에 도움 될 것이며 이를 통해 분자유전학적 기법을 이용한 한우의 육종 전략을 확립하논데 기초 자료가 되는 것은 물론 우려나라 고유 품종인 한우의 유전자원 보존과 분자육종학적인 연구에 기초 자료로서 유용하게 활용 할 수 있을 것으로 기대된다.

Complete mitochondrial genome sequence of Tosa-Jidori sheds light on the origin and evolution of Japanese native chickens

  • Osman, Sayed A.M.;Nishibori, Masahide;Yonezawa, Takahiro
    • Animal Bioscience
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    • 제34권6호
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    • pp.941-948
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    • 2021
  • Objective: In Japan, approximately 50 breeds of indigenous domestic chicken, called Japanese native chickens (JNCs), have been developed. JNCs gradually became established based on three major original groups, "Jidori", "Shoukoku", and "Shamo". Tosa-Jidori is a breed of Jidori, and archival records as well as its morphologically primitive characters suggest an ancient origin. Although Jidori is thought to have been introduced from East Asia, a previous study based on mitochondrial D-loop sequences demonstrated that Tosa-Jidori belongs to haplogroup D, which is abundant in Southeast Asia but rare in other regions, and a Southeast Asian origin for Tosa-Jidori was therefore suggested. The relatively small size of the D-loop region offers limited resolution in comparison with mitogenome phylogeny. This study was conducted to determine the phylogenetic position of the Tosa-Jidori breed based on complete mitochondrial D-loop and mitogenome sequences, and to clarify its evolutionary relationships, possible maternal origin and routes of introduction into Japan. Methods: Maximum likelihood and parsimony trees were based on 133 chickens and consisted of 86 mitogenome sequences as well as 47 D-loop sequences. Results: This is the first report of the complete mitogenome not only for the Tosa-Jidori breed, but also for a member of one of the three major original groups of JNCs. Our phylogenetic analysis based on D-loop and mitogenome sequences suggests that Tosa-Jidori individuals characterized in this study belong to the haplogroup D as well as the sub-haplogroup E1. Conclusion: The sub-haplogroup E1 is relatively common in East Asia, and so although the Southeast Asian origin hypothesis cannot be rejected, East Asia is another possible origin of Tosa-Jidori. This study highlights the complicated origin and breeding history of Tosa-Jidori and other JNC breeds.

한우 Mitochondrial DNA D-loop 영역의 염기서열 및 유전변이 (Sequence and Genetic Variation of Mitochondrial DNA D-loop Region in Korean Cattle)

  • 정의룡;김우태;김연수;이정구;한상기
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제44권2호
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    • pp.181-190
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    • 2002
  • 본 연구는 한우 mt DNA 염기서열 가운데 $tRNA^{Pro}$$tRNA^{Pre}$ 유전자 사이에 위치하고 있는 D-loop 영역의 염기서열을 결정하고 한우의 염기변이 다형성을 분석하기 위하여 mt DNA의 D-loop 영역내 404번부터 15061까지 1142bp 크기의 염기서열 부위를 특이적인 primer를 이용하여 PCR로 증폭하였다. 한우의 mt DNA내 D-loop 영역에서 단일염기의 치환 및 삽입에 의해 총 24개의 polymorphic site가 확인되었다. 한우 mt DNA D-loop 영역 가운데 16042~16122번째에 위치하고 있는 영역의 염기치환율이 다른 염기서열 영역에 비하여 약 50%를 점유하고 있었으며 이들 polymorphic site에서 16055, 16230 및 16260 번의 염기치환은 한우에서만 검출된 새로운 염기변이로 확인되었다. 따라서, 한우 D-loop 영역내 특이적인 염기변이는 모계 및 세포질 DNA marker로서 한우품종을 특정하는데 활용할 수 있는 가능성을 시사하였다. Polymorphic site의 출현빈도는 169번째 염기가 81.3%로 가장 출현율이 높았고 다음으로 16302번과 16093번째는 56.3% 그리고 16042번와 16119번째 염기가 각각 50.0%와 43.8%의 치환율을 보였으며 나머지 14개 염기는 6.3%에서 25.0% 수준의 출현율을 나타냈다. 한우와 타 품종간의 유전적 근연관계를 추정한 결과 Bos taurus 계통의 유럽종과 유전적 유사도가 높은 것으로 추정되었고, Africa와 India의 Bos indicus 계통의 품종과는 상대적으로 근연관계가 먼 것으로 나타났다. 본 연구에서 검출한 mt DNA내 D-loop 영역의 염기서열 다형성은 한우집단의 유전적 변이성 추정과 모계유전 분석 및 나아가 경제적으로 중요한 형질들과의 연관성 분석에 유용하게 활용할 수 있을 것으로 기대된다.

Locking 상태 표시기를 이용한 저잡음 고속 위상고정 루프 (A Fast Lock and Low Jitter Phase Locked Loop with Locking Status Indicator)

  • 최영식;한대현
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제9권3호
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    • pp.582-586
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    • 2005
  • 본 논문은 locking 상태에 따라서 루프대역폭이 변화하는 Phase Locked Loop (PLL)의 구조를 제안하였다. 제안한 PLL은 기본적인 PLL 블록과 NOR Gate, Inverter, Capacitor, 그리고 Schmitt trigger로 이루어진 Locking Status Indicator(LSI) 블록으로 구성되었다. LSI는 Loop Fille.(LF)에 공급되는 전류와 저항 값을 locking 상태에 따라 변화시켜서 unlock이 되면 넓은 루프대역폭 가지는 PLL로, lock이 되면 좁은 루프대역폭을 가지는 PLL로 동작하도록 한다. 이러한 구조의 PLL은 짧은 locking 시간과 저 잡음의 특성을 동시에 만족시킬 수 있다. 제안된 PLL은 Hynix CMOS $0.35{\mu}m$ 공정으로 Hspice 시뮬레이션 하였으며 40us의 짧은 locking 시간과 -76.1dBc 크기의 spur를 가진다.

mtDNA D-loop 변이로 확인된 한국재래닭의 다양한 모계기원 (Multiple Maternal Origins of Korean Native Chicken Based on the mtDNA D-loop Variation)

  • 조창연;이풍연;고응규;김학규;박미나;연성흠
    • 한국가금학회지
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    • 제38권1호
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    • pp.5-12
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    • 2011
  • 우리나라 재래닭의 기원을 구명하기 위해서 mtDNA D-loop 영역을 분석한 결과, 1,231~1,232개의 염기구성되어 있으며, 35개소에서 변이가 관찰되었다. 변이 부위를 이용하여 Haplotype을 분류한 결과, 21종으로 분류되었으며 이중 9개인 GenBank에 미등록된 것으로 밝혀졌다. Hplotype 다양성으로 추정한 한국 재래닭의 유전적 변이성은 중국의 재래닭과 유사한 것으로 추정되었다. Haplotype에 대한 Network 분석 결과, 재래닭은 5개의 Clade로 분류되었다. 이들 Clade에 대한 각 집단의 분포 현황으로 한국 재래닭은 운남성 및 중국 재래닭이 보인 결과와 유사하나, 일본의 재래닭과는 약간 상이한 것으로 밝혀졌다. 이상의 결과로 우리나라 재래닭은 공통선조가 다른 5개 이상의 모계가 중국을 통하여 유래되었으며, 일본에도 전파된 것이 확인되었다. 한편, 일본은 한반도를 유래하지 않은 닭의 유입이 있었던 것으로 추정된다.

추가적인 부궤환 루프를 가지는 연속 미세 조절 위상 고정루프 (A Continuous Fine-Tuning Phase Locked Loop with Additional Negative Feedback Loop)

  • 최영식
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제20권4호
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    • pp.811-818
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    • 2016
  • 추가적인 부궤환 루프를 가지는 연속 미세 조절 위상 고정루프를 소개하였다. 위상고정루프가 위상이 고정되지 않았을 때 위상고정루프는 연속적인 밴드 선택 루프를 통하여 빠르게 위상을 고정시키는 특성을 가지고 있다. 위상고정루프가 고정 상태에 다다랐을 때 밴드 폭은 미세한 루프를 통해서 좁아진다. 추가적인 부궤환 루프는 안정성과 위상여유 성능을 향상시킨다. 0.18um CMOS 공정으로 제작한 위상고정루프의 결과 측정은 위상 잡음이 742.8MHz 캐리어 주파수로부터 2MHz 오프셋 주파수에서 -109.6dBc/Hz을 보여준다.

Determination of Phylogenetic Relationships of Turkish Native Cattle Breeds with Other Cattle Breeds Using Mitochondrial DNA D-loop Sequence Polymorphism

  • Ozdemir, Memis;Dogru, Unsal
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제22권7호
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    • pp.955-961
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    • 2009
  • The aim of this study was to determine the specific polymorphic sites in cattle breeds and inter- and interbreed genetic variation among breeds and to develop a databank of Turkish native cattle mtDNA using sequence analysis. The entire D-loop region was analyzed based on DNA sequences in Turkish Grey, East Anatolian Red, South Anatolian Red, and Anatolian Black native breeds. In total, 68 nucleotide differences were observed at 26 different sites. The variable positions consisted of 22 transitions, two transversions, and two insertions, but no deletions. Haplotype number, haplotype diversity, nucleotide diversity, and mean number of pairwise difference values were found to be 17, 0.993, 0.00478, and 4.275, respectively. In addition, a phylogeny was developed by comparison among cattle populations for which the entire D-loop sequence was available. A high level of genetic variation was observed within and among the native cattle breeds.

FDM 3D 프린팅의 경로생성을 위한 옵?루프의 꼬임제거 알고리즘 (An Algorithm for the Removing of Offset Loop Twists during the Tool Path Generation of FDM 3D Printer)

  • 올리올 이슬람;김호찬
    • 한국기계가공학회지
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    • 제16권3호
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    • pp.1-8
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    • 2017
  • Tool path generation is a part of process planning in 3D printing. This is done before actual printing by a computer rather than an AM machine. The mesh geometry of the 3D model is sliced layer-by-layer along the Z-axis and tool paths are generated from the sliced layers. Each 2-dimensional layer can have two types of printing paths: (i) shell and (ii) infill. Shell paths are made of offset loops. During shell generation, twists can be produced in offset loops which will cause twisted tool paths. As a twisted tool path cannot be printed, it is necessary to remove these twists during process planning. In this research, An algorithm is presented to remove twists from the offset loops. To do so the path segments are traversed to identify twisted points. Outer offset loops are represented in the counter-clockwise segment order and clockwise rotation for the inner offset loop to decide which twisted loop should be removed. After testing practical 3D models, the proposed algorithm is verified to use in tool path generation for 3D printing.

Transonic buffet alleviation on 3D wings: wind tunnel tests and closed-loop control investigations

  • Lepage, Arnaud;Dandois, Julien;Geeraert, Arnaud;Molton, Pascal;Ternoy, Frederic;Dor, Jean Bernard;Coustols, Eric
    • Advances in aircraft and spacecraft science
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    • 제4권2호
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    • pp.145-167
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    • 2017
  • The presented paper gives an overview of several projects addressing the experimental characterization and control of the buffet phenomenon on 3D turbulent wings in transonic flow conditions. This aerodynamic instability induces strong wall pressure fluctuations and therefore limits flight domain. Consequently, to enlarge the latter but also to provide more flexibility during the design phase, it is interesting to try to delay the buffet onset. This paper summarizes the main investigations leading to the achievement of open and closed-loop buffet control and its experimental demonstration. Several wind tunnel tests campaigns, performed on a 3D half wing/fuselage body, enabled to characterize the buffet aerodynamic instability and to study the efficiency of innovative fluidic control devices designed and manufactured by ONERA. The analysis of the open-loop databases demonstrated the effects on the usual buffet characteristics, especially on the shock location and the separation areas on the wing suction side. Using these results, a closed-loop control methodology based on a quasi-steady approach was defined and several architectures were tested for various parameters such as the input signal, the objective function, the tuning of the feedback gain. All closed-loop methods were implemented on a dSPACE device able to estimate in real time the fluidic actuators command calculated mainly from the unsteady pressure sensors data. The efficiency of delaying the buffet onset or limiting its effects was demonstrated using the quasi-steady closed-loop approach and tested in both research and industrial wind tunnel environments.

휴대형 무선 단말을 위한 FERRITE-CORE LOOP ATENNA의 설계 제작 (Design & Fabrication of Ferrite-core Loop Antenna for Portable Radio Receiver)

  • 권원현;천경준;허선종;박한규
    • 한국통신학회논문지
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    • 제17권9호
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    • pp.918-926
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    • 1992
  • 본 논문에서는 이동 통신용 소형 무선기기에 사용가능한 소형 Ferrite-core Loop 안테나를 설계 제작하고 그 특성을 고찰하였다. 안테나는 $10{\times}6{\times}15mm^3$의 크기를 갖는 loop 안테나 내부에 Ferrite core를 삽입하여 제작하였고 제작된 안테나는 $50\Omega$ 정합시 대역폭 (SWR 1.5이하)은 0.55 MHz, Q값은 280으로 동일 크기를 갖는 Loop 안테나 (BW=1.9 MHz, Q=81.4)에 비해 주파수 선택 특성이 우수하였다. 8 방향 방사특성시험 및 TEM Cell을 이용한 수신특성시험에서도 기존의 loop안테나에 비해 11dB이상 이득이 증가됨을 알 수 있었다.

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