• 제목/요약/키워드: Biological information

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A Review on Venom Enzymes Neutralizing Ability of Secondary Metabolites from Medicinal Plants

  • Singh, Pushpendra;Yasir, Mohammad;Hazarika, Risha;Sugunan, Sunisha;Shrivastava, Rahul
    • 대한약침학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.173-178
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    • 2017
  • Objectives: Medicinal plants are vital sources of bioactive compounds that are useful for the treatment of patients with snake bites or are indirectly applicable for boosting the effects of conventional serum therapy. These plants are being used traditionally by local healers and tribes for the treatment of patients with snake bites and therefore can be used as an alternative against snake envenomation. Scientifically, using the secondary metabolites of plants to neutralize venom enzymes has an extra benefit of being based on traditional knowledge; also, the use of such metabolites for the treatment of patients with snake bites is cheaper and the treatment can be started sooner. Methods: All the available information on various secondary metabolites exhibiting venom neutralizing ability were collected via electronic search (using Google books, Pubmed, SciFinder, Scirus, Google Scholar, and Web of Science) and articles of peer-reviewed journals. Results:Recent interest in different plant has focused on isolating and identifying of different phytoconstituents that exhibit Phospholipase A2 activity and other venom enzyme neutralizing ability. In this support convincing evidence in experimental animal models are available. Conclusion: Secondary metabolites are naturally present, have no side effect, are stable for a long time, can be easily stored, and can neutralize a wide range of snake enzymes, such as phospholipase A2, hyaluronidase, protease, L-amino acid oxidase, 5'nucleotidase, etc. The current review presents a compilation of important plant secondary metabolites that are effective against snake venom due to enzyme neutralization.

LNG 터미널 유량 보정 방법 개발 (Development of LNG Terminal Flow Rate Data Reconciliation Method)

  • 이상호;이철진;임영섭;박찬샘;한종훈
    • 한국가스학회지
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    • 제14권6호
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    • pp.21-26
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    • 2010
  • 국내의 LNG 터미널은 일반적으로 대형화 되어있다. 그런데 이런 대형화된 터미널의 안전한 관리를 위해서는 전 시설에 대한 온도 관측이 필요하며 따라서 터미널 내 모든 시설에는 온도센서가 다수 존재한다. 하지만 터미널의 운영, 관리 및 안전사고 예방을 위해서 또 파악해야 하는 정보 중 하나가 유량인데 보통 부족한 경우가 많다. 그런데 배관의 온도 정보는 유량과 밀접한 관련을 맺고 있고 이를 통해 유량은 몇 가지 가정을 통해서 쉽게 추산할 수 있다. 이렇게 발생된 유량 데이터는 오차를 갖고 있을 수 있기 때문에 이를 정상상태 데이터 보정(steady state data reconciliation)을 활용하면 보다 신뢰성 있는 데이터를 얻을 수 있다. 본 논문에서는 이러한 LNG 터미널 데이터 보정 방법에 대해 설명하고 사례연구를 통해 얼마나 신뢰성 있는 데이터를 제공하는지에 대해서 기술하고자 한다.

Analysis of the Oxidative Stress-Related Transcriptome from Capsicum annuum L.

  • Lee, Hyoung-Seok;Lee, Sang-Ho;Kim, Ho-Bang;Lee, Nam-Houn;An, Chung-Sun
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제37권4호
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    • pp.472-482
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    • 2010
  • For the massive screening of the genes related to oxidative stress, a cDNA library was constructed from hot pepper (Capsicum annuum L. cv. Nockkwang) leaves treated with methyl viologen. From this library, 1,589 cDNA clones were sequenced from their 5' ends. The sequences were clustered into 1,252 unigenes comprised of 152 contigs and 1,100 singletons. Similarity search against NCBI protein database identified 1,005 ESTs (80.3%) as Known, 197 ESTs (15.7%) as Unknown, and 50 ESTs (3.99%) as No hit. In the ESTs, oxidative stress-related genes such as ascorbate peroxidase, catalase, and osmotin precursor were highly expressed. The cDNA microarray containing 1,252 unigenes was constructed and used to analyze their expression upon methyl viologen treatment. Analyses of the hybridization revealed that various stress-related genes such as peroxidase, tyrosine aminotransferase, and omega-6 fatty acid desaturase, were induced and some metabolism related genes such as aldolase and ketol-acid reductoisomerase, were repressed by methyl viologen treatment, respectively. The information from this study will be used for further study on the functional roles of oxidative stress-related genes and signaling network of oxidative stress in hot pepper.

해양관련 생물다양성협약 의제 소개 (The Present of Convention on Biological Diversity Maritime Agenda)

  • 백진욱;이강현
    • 환경생물
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    • 제32권4호
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    • pp.397-402
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    • 2014
  • 1992년 6월 브라질 리우데자네이루에서 생물다양성협약(Convention on Biological Diversity, CBD)에 158개국이 서명한 이후, 현재 194개국 당사국들은 자국의 이익을 위해 다양한 형태로 논의에 참여하고 있다. 그리고 생물다양성협약 유전자원에 대한 접근 및 이익 공유(Access to genetic resources and Benefit-Sharing, ABS)를 다룬 나고야의정서가 채택되어 2014년 10월 12일에 발효 되었다. 이러한 상황에서 생물다양성협약 및 나고야의정서 발효가 해양생물다양성을 연구하는 연구자들에게 어떠한 영향을 미칠 것인가는 상당히 중요한 문제이다. 그러나 지난 생물다양성총회에서 해양 및 해양생물자원에 대한 관심은 비교적 적었으며, 이에 따라, 이와 관련된 논의도 늦어졌다. 하지만 이번 제12차 평창 생물다양성총회에서 생물학적 또는 생태학적 중요해역 (Ecologi-cally or Biologically Significant marine Areas, 이하 EBSA) 및 기타 해양관련 문제를 논의하였다. 우리나라는 나고야 의정서에 아직 정식으로 가입하지 않았지만 유전자원 이용 시 사전통보승인(Prior and Informed consent, PIC) 및 상호합의조건 (Mutually Agreed Terms, MAT) 그리고 다자간 이익공유체계 (Global Multilateral Benefit-Sharing Mechanism, GMBSM)를 중심으로 다양한 논의가 이루어졌다. 우리나라는 생물자원 보유국으로서 정부는 국내 생물자원의 관리체계 및 법률을 빠르게 정비하여야 한다. 또한 이용국으로서 학계 및 산업계가 국외의 생물자원을 보다 쉽고 효율적으로 이용하도록 정보체계를 구축할 필요가 있다고 판단된다.

다양한 ECM 조건하에서의 세포막 미세영역 부위 국소접착인산화효소 활성의 단일세포 이미징 기반 분석 (Single-Cell-Imaging-Based Analysis of Focal Adhesion Kinase Activity in Plasma Membrane Microdomains Under a Diverse Composition of Extracellular Matrix Proteins)

  • 최규호;장윤관;서정수;김헌수;안상현;한기석;김은혜;김태진
    • 생명과학회지
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    • 제32권2호
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    • pp.148-154
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    • 2022
  • 국소접착인산화효소(FAK)는 국소접착부에서 세포부착, 세포이동, 세포역학적 신호전달 등에 관여한다고 알려져 있다. 그러나 세포 외 기질(ECM)과 상호작용하는 인테그린 막단백질과 함께 위치하는 세포막 미세영역(membrane microdomain)의 종류와 ECM 구성에 따른 FAK 활성은 여전히 불분명하다. 형광 공명 에너지 전달(FRET)을 기반으로 유전적으로 인코딩 된 바이오센서는 세포 내 FAK 신호를 높은 시공간 해상도로 제공할 수 있다. 본 연구에서는 유리, 제1형 콜라겐, 피브로넥틴, 라미닌의 ECM 조건에서 FRET 기반 막 표적 FAK 바이오센서를 사용하여 지질유동섬(Lipid raft) 및 비-지질유동섬(non-Lipid raft)에서 FAK의 활성을 분석하고 시각화 하였다. 흥미롭게도, 지질유동섬에서 라미닌 조건 하의 FAK 활성은 다른 ECM 조건보다 낮았고, 비-지질유동섬에서 FAK 활성은 다른 ECM 조건보다 낮았다. 동일한 ECM 조건 상의 비교에서는 피브로넥틴 조건일 때 지질유동섬에서 비-지질유동섬 보다 높은 FAK 활성이 관측되었다. 따라서 이번 연구는 FAK 활성도가 ECM 유형 및 세포막 미세영역에 따라 특이적으로 조절되는 것을 시각적, 정량적으로 보여준다.

생체 기반 시각정보처리 동작인식 모델링 (A Bio-Inspired Modeling of Visual Information Processing for Action Recognition)

  • 김진옥
    • 정보처리학회논문지:소프트웨어 및 데이터공학
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    • 제3권8호
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    • pp.299-308
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    • 2014
  • 신체 동작, 얼굴 표정과 같이 아주 복잡한 생체 패턴을 인식하고 분류하는 인간의 능력을 모방한 정보처리 컴퓨팅 관련 연구가 최근 다수 등장하고 있다. 특히 컴퓨터비전 분야에서는 인간의 뛰어난 인지 능력 중 상황정보 없이 시각시퀀스에서 동작을 분류하는 기능을 통해 시공간적 패턴 코딩과 빠른 인식 방법을 이해하고자 한다. 본 연구는 비디오 시퀀스상의 동작인식에 생물학적 시각인지과정의 영향을 받은 생체 기반 컴퓨터비전 모델을 제시하였다. 제안 모델은 이미지 시퀀스에서 동작을 검출하고 시각 패턴을 판별하는 데 생체 시각처리과정의 신경망 구조 단계를 반영하였다. 실험을 통해 생체 기반 동작인식 모델이 인간 시각인지 처리의 여러 가지 속성을 고려했을 뿐 아니라 기존 동작인식시스템에 비해 시간 정합성이 뛰어나며 시간 변화에 강건한 분류 능력을 보임을 알 수 있다. 제안 모델은 지능형 로봇 에이전트와 같은 생체 기반 시각정보처리 시스템 구축에 기여할 수 있다.

한반도 자생생물 조사·발굴 연구사업 고찰(2006~2020) (Review of the Korean Indigenous Species Investigation Project (2006-2020) by the National Institute of Biological Resources under the Ministry of Environment, Republic of Korea)

  • 배연재;조기종;민기식;김병직;현진오;이진환;이향범;윤정훈;황정미;염진화
    • 환경생물
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    • 제39권1호
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    • pp.119-135
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    • 2021
  • 생물다양성협약(1992년)과 나고야의정서(2010년)의 체결 이후 우리나라는 한반도의 생물다양성 보전과 생물자원 확보를 위한 자생생물의 조사·발굴 연구에 박차를 가하였다. 이러한 계기로 2007년에 설립된 환경부 소속 국립생물자원관의 주도로 "한반도 자생생물 조사·발굴 연구사업"이 진행되었다. 본 사업은 2006년 이후 현재까지 15년 동안 5단계(1단계 2006~2008년, 2단계 2009~2011년, 3단계 2012~2014년, 4단계 2015~2017년, 5단계 2018~2020년)로 나누어 진행되었다. 연구의 결과, 본 사업의 이전에 29,916종(2006년)이던 한반도 자생생물이 본 사업의 각 단계가 마무리되는 시점에서 누계로 집계하여 볼 때, 1단계 33,253종(2008년), 2단계 38,011종(2011년), 3단계 42,756종(2014년), 4단계 49,027종(2017년), 그리고 5단계 54,428종(2020년)으로 급속히 증가하여 본 사업 기간 동안 한반도 자생생물 기록종이 약 1.8배 증가하였다. 이 통계자료는 이 기간 동안 연평균 2,320종의 한반도 미기록종이 새로이 기록된 것을 보여준다. 또한 전체 발굴종 중에서 총 5,242종의 신종을 기록하는 학술적 큰 성과를 거두었다. 분류군 별로는 총 연구 기간 동안 곤충 4,440종(신종 988종 포함), 무척추동물(곤충 제외) 4,333종(신종 1,492종 포함), 척추동물(어류) 98종(신종 9종 포함), 식물(관속식물과 선태식물) 309종(관속식물 176종, 선태식물 133종, 신종 39종 포함), 조류(algae) 1,916종(신종 178종 포함), 균류와 지의류 1,716종(신종 309종 포함), 그리고 원핵생물 4,812종(신종 2,226종 포함)이 한반도에서 새로이 기록되었다. 생물표본은 각 단계별로 집계하여 볼 때 1단계 247,226점(2008년), 2단계 207,827점(2011년), 3단계 287,133점(2014년), 4단계 244,920점(2017년), 그리고 5단계 144,333점(2020년)이 수집되어 연평균 75,429점, 총 1,131,439점의 생물표본이 채집되었다. 그중에서 곤충 281,054점, 곤충 이외의 무척추동물 194,667점, 척추동물(어류) 40,100점, 식물 378,251점, 조류(algae) 140,490점, 균류 61,695점, 그리고 원핵생물 35,182점이 채집되었다. 본 사업에 참여한 각 단계별 연구원/보조연구원(주로 대학원생)의 수는 1단계 597/268명, 2단계 522/191명, 3단계 939/292명, 4단계 575/852명, 그리고 5단계 601/1,097명으로 전체년도의 참여연구자는 연평균 395명, 총 연인원 약 5,000명이 참여하여 전국의 거의 모든 분류학자와 분류학 전공의 대학원생이 참여하였다. 본 사업 기간 동안 전문학술지 논문 3,488편(국내학술지 논문 2,320편, SCI급 국제학술지 논문 1,168편 포함)이 출판되었다. 본 사업 기간 중 자생생물 조사·발굴 사업 및 생물표본 확보 사업에 투입된 예산은 총 833억원(연평균 55억원)이다. 본 사업은 국가 주도의 대형 연구 프로젝트로서 전국의 거의 모든 분류학자가 참여하고 대규모 예산이 투입되어 단기간에 이루어 낸 한국식 압축성장의 한 성공 사례로 볼 수 있다. 본 사업의 종발굴 성과는 최근의 생물분류 체계로 분류되어 국가생물종목록으로 만들어졌으며, 전문가와 학생 및 일반 시민에게 제공되고 있다(https://species.nibr.go.kr/index.do). 본 사업에서 파생된 기재문, DNA 염기 서열, 서식처, 분포, 생태, 이미지, 멀티미디어 등 각 종의 정보는 디지털화되어 생물의 계통, 진화 연구 등 학문적 발전에 기여하였고, 기후변화에 따른 지표종의 변화 같은 생물분포 모니터링 사업과 바이오산업의 생물소재를 탐색하는 기반이 되었다. 본 사업을 통하여 젊은 분류인력(주로 대학원생)의 양성을 지원할 수 있었던 것은 본 사업이 가져온 가장 의미 있는 성과라고 할 수 있다. 과거 15년간 숨 가쁘게 달려온 본 사업은 아직 진행 중이다. 그동안 발굴된 종들에 대한 이명(synonym)과 오동정 등을 바로잡아 학문적인 완성도를 높이고, 한반도에 존재하리라 예상되는 약 10만 종의 자생생물 중에서 남겨진 5만 종에 대한 조사·발굴 연구가 지속되어야 한다.

생체정보를 이용한 지능형 감성 추천시스템에 관한 연구 (A Study on Intelligent Emotional Recommendation System Using Biological Information)

  • 김태연
    • 한국정보전자통신기술학회논문지
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    • 제14권3호
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    • pp.215-222
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    • 2021
  • 인간과 컴퓨터의 상호 작용 (Human Computer Interface) 기술의 중요성이 더욱 커지고 있으며 HCI에 대한 연구가 진행됨에 따라 사용자의 직접적인 입력에 의한 컴퓨터 반응이 아닌 감정 추론 혹은 사용자 의도에 따른 컴퓨터 반응에 대한 연구가 증가되고 있다. 스트레스는 현대 인간 문명사회에서의 피할 수 없는 결과이며 복잡한 현상을 나타내며 통제 유무에 따라 인간의 활동능력은 심각한 변화를 받을 수 있다. 본 논문에서는 인간과 컴퓨터의 상호 작용의 일환으로 스트레스를 통해 증가된 심박변이도 (HRV)와 가속도 맥파(APG)를 측정한 후 스트레스를 완화시키기 위한 방안으로 음악을 이용한 지능형 감성 추천시스템을 제안하고자 한다. 사용자의 생체정보 즉, 스트레스 지수를 획득 및 인식하여 신뢰성 있는 데이터를 추출하고자 차분진화 알고리즘을 사용하였으며 이렇게 획득된 스트레스 지수를 단계별에 따라 시멘틱 웹 (Semantic Web)을 통해 감성추론을 하였다. 또한 스트레스 지수와 감성의 변화에 매칭 되는 음악 리스트를 검색 및 추천함으로써 사용자의 생체정보에 맞는 감성 추천시스템을 애플리케이션으로 구현하였다.

생물학적 정보를 활용한 병원에서 존재하는 공기중 부유 세균에 대한 이산화염소의 유용성 (Usefulness of Chlorine Dioxide to Airborne Bacteria at a Hospital Using Biological Information)

  • 정석률
    • 사물인터넷융복합논문지
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    • 제6권2호
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    • pp.19-24
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    • 2020
  • 본 연구에서, 세균의 생물학적 정보와 이산화염소 가스의 생화학적 정보들을 활용하여, 그람 양성 세균인 Alloiococcus otitis, Erysipelothrix rhusiopathiae, Staphylococcus caprae, Staphylococcus lentus 및 그람 음성 세균인 Acinetobacter baumannii complex, Aeromonas salmonicida, Brucella melitensis, Oligella ureolytica에 대한 이산화염소가스의 성장 억제 효과를 분석하였다. 전체적으로, 이산화염소 가스는 10 CFU 미만으로 세균의 성장을 약 99 % 억제하였다. 하지만, 그람 양성인 Alloiococcus otitis 및 그람 음성인 Aeromonas salmonicida는 약 50 CFU 이상인 것으로 밝혀졌다. 여러 세균과의 실험 결과를 비교할 때, 이산화염소 가스의 농도는 세균 억제에 대해 10 ppm 내지 400 ppm 일 것이라고 제안한다. 이 연구의 결과는 이산화염소 가스의 임상적 유용성을 평가하기 위한 기본 데이터로 사용될 수 있을 것이다. 이 연구가 임상에 있는 근무자가 병원에서 감염을 일으키는 미생물의 존재를 인식하고 예방하는 사전 지식에 도움이 되는 경우, 융합분야 중, 임상에서처럼 환자 치료와 같은 활동에 도움이 될 것이다. 향후에, 이산화염소 가스에 대해 억제되는 미생물들의 정보의 데이터를 활용하여, 환자에게 감염된 미생물들을 신속히 억제하는데 기초가되는 연구결과가 될 것으로 사료된다.

유전자 재조합 인간의 G-CSF의 생리활성과 EGFP-hG-CSF유전자가 도입된 체세포의 분리 (Biological Activity of Recombinant Human Granulocyte Colony-Stimulating Factor and Isolation of the Somatic Cell Transfected EGFP-hG-CSF Gene)

  • 박종주;민관식
    • 생명과학회지
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    • 제18권7호
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    • pp.912-917
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    • 2008
  • 유전자재조합 hG-CSF의 생리활성을 분석하기 위하여 편상의 암세포로부터 분리되어진 cDNA를 이용하여 hG-CSF 유전자를 분리하여 동물세포(CHO cell lines)를 이용하여 재조합 단백질을 생산하였다. 재조합 단백질의 체내 생리활성을 분석하기 위하여0일과 2일에 피하주사 후 5일에 혈액을 채취하여 백혈구 수를 분석하였다. 투여 전과 비교하여 5일째에 백혈구 수는 현저하게 증가하였다. 또한, pEGFP-mUII-hG-CSF벡터를 소 태아로부터 분리되어진 체세포에 형질전환을 시켜서, EGFP signal을 나타내는 세포를 confocal를 이용하여 분리하여 수립하였다. 따라서, 이러한 결과는 유전자재조합 hG-CSF는 체내에서 강력한 생리활성을 나타내며, 또한 당쇄가 첨가되어지고 이중으로 연결되어진 새로운 돌연변이체를 포함하여 고 활성 재조합체의 생산이 가능할 것으로 보이며, pEGFP-mUII-hG-CSF벡터는 복제 형질전환 가축 생산을 위하여 유용하게 사용되어질 것으로 사료된다.