In order to trace the survival route of weedy rice in Korean farmer's field, occurrence rate and position of weedy rice, number of weedy rice plants per $m^2$, in transplanted and direct seeded field were investigated. The highest occurrence rate of weedy rice in transplanted field was 5.5%. Number of weedy rice plants in direct seeded field was higher than that in transplanted field. In transplanted field, most of the weedy rice were grown within hills of cultivated rice and only a few was grown between hills of the cultivated rice, however in direct seeded field the number of weedy rice occurred between hills or rows of cultivated rice was higher than that occurred within hills or rows. Weedy rice occurrence rate in the field of .non-recommended rice variety was higher than that in the field of recommended variety. The main survival route of weedy rice in transplanted field was supposed to be mixture of weedy rice seeds with cultivated rice, and that in direct seeded field to be natural survival.
Nuclear DNA was isolated from the sperm cells representing genetic characteristics and genomic polymorphisms of rainbow trout by polymerase chain reaction(PCR) amplification of DNA using arbitrary primers. Genomic DNA fingerprints were generated from rainbow trout sperm DNA by polymerase chain reaction amplification using 20 arbitrary decamers as primers. Out of these primers, 4 generated 17 highly reproducible RAPD markers, producing almost six polymorphic bands per primers. Four of 6 primers tested generated amplified fragments which were polymorphic between different individuals. Polymorphic DNA fragments were reproducibly amplified from independent DNA preparations made from individuals. Rainbow trout was distinctly observed 3 specific DNA markers (2. 3, 2.0 and 1.3kb) in bandsharing. Individual fragments generated using the same arbitrary primer, demonstrated that a single primer detected at least three independent genomic polymorphisms in rainbow trout sperm DNA. The RAPD polymorphism generated by this primer may be used as a genetic marker for individual identification The RAPD-PCR technique has been shown to reveal informative polymorphism in many species of fish. The present results demonstrate that RAPD markers are abundant, reproducible and provide a basis for future gene mapping and MAS in these important aquaculture species using RAPD polymorphic markers. It is concluded that RAPD polymorphisms are useful as genetic markers for fish breed differentiation.
Kim, Sangil;Oh, Yoon Sik;Won, Nam-Il;Park, Sang Rul
Korean Journal of Environmental Biology
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v.32
no.4
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pp.353-362
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2014
In this study, we investigated the effect of geographical variations on Sargassum thunbergii morphology to make a taxonomic reconsideration about infraspecific taxa in this species. In order to examine the morphological characteristics of S. thunbergii, total 27 matured and morphologically intact thalli were collected from the east, west and south coast in spring 2011. Interestingly, it was observed that the species populations on the west coast were characterized by short, thin and coarse thallus, and soft texture. However, the populations on the east coast showed thicker thallus, larger leaf and vesicle, and tougher texture. Thallus height of S. thunbergii was found to be similar at both east and west coast. Further, the height of the thallus and lateral branch of the species populations residing south coast were highest whereas the size of leaf and vesicle are shortest, in comparison with east and west coast species. Although morphological characteristics of the north east coast populations corresponded to the original description of S. thunbergii f. latifolium, we could not find exact morphological features and diagnostic characters to distinguish form in S. thunbergii. These results indicated that it is not the optimal characteristics to identify infraspecific form in this species. In contrast, morphological variations may signify the adaptation of this species to local environmental factors. Thus, we recommend that intraspecific morphological variation of S. thunbergii should be carefully used to identify infraspecific taxa.
The composition of four rice protein groups is greatly affected by the extraction conditions. The extraction amounts of albumins and glubulines primarily depended on the temperature rather than the method of extraction. The total amount of glutelins, the major components of rice storage proteins, could be extracted by a successive extraction processes, extraction with 0.5% SDS-0.1M borate buffer(pH 8.3) followed by extraction with 0.5% SDS-0.6% ${\beta}-mercaptoethanol-0.1M$ borate buffer(pH 8.3). The extracted amounts of glutelin with these solvents were 54.1 and 45% respectively. The further purification of SDS soluble glutelins was achieved by Sephadex G-150 gel column chromatography. The molecular weight of the components in four protein groups has been estimated by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis with or without ${\beta}-mercaptoethanol.$ The comparison of albumins and globulins by starch gel electrophoresis at pH 3.1 permitted us to identify seven rice varieties. However, at pH 8.95, the specific bands for Japonica type rice varieties were observed.
This thesis is the study of the rainfall probability depth in the major areas of Korea, such as Seoul, Pusan and Taegu. The purpose of the paper is to analyze the rainfall in connection with the safe planning of the hydraulic structures and with the project life. The methodology used in this paper is the statistical treatment of the rainfall data in the above three areas. The scheme of the paper is the following. 1. The complementation of the rainfall data We tried to select the maximm values among the values gained by the three methods: Fourier Series Method, Trend Diagram Method and Mean Value Method. By the selection of the maximum values we tried to complement the rainfall data lacking in order to prevent calamities. 2. The statistical treatment of the data The data are ordered by the small numbers, transformed into log, $\sqrt{}, \sqrt[3]{}, \sqrt[4], and$\sqrt[5], and calculated their statistical values through the electronic computer. 3. The examination of the distribution types and the determination of the optimum distibution types By the $x^2-Test$ the distribution types of rainfall data are examined, and rejected some part of the data in order to seek the normal rainfall distribution types. In this way, the optimum distribution types are determined. 4. The computation of rainfall probability depth in the safety project life We tried to study the interrelation between the return period and the safety project life, and to present the rainfall probability depth of the safety project life. In conclusion we set up the optimum distribution types of the rainfall depths, formulated the optimum distributions, and presented the chart of the rainfall probability depth about the factor of safety and the project life.ct life.
Park, Suhyoung;Choi, Su Ryun;Lee, Jung-Soo;Nguyen, Van Dan;Kim, Sunggil;Lim, Yong Pyo
Horticultural Science & Technology
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v.31
no.4
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pp.457-466
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2013
Since the early 1980s, the National Institute of Horticultural & Herbal Sciences has been breeding and collecting diverse radish breeds to select those samples with better horticultural characteristics, to ultimately expand and develop as good radish produce. Genetic diversity is a crucial factor in crop improvement and therefore it is very important to obtain various variations through sample collection. The collected samples were compared with one another in order to assess the level of diversity among the collections, and this procedure allowed for increased application of the gathered resources and aided in determining the direction to secure further samples. Towards this end, this experiment was conducted in order to examine whether the SSR markers derived from Chinese cabbage samples could be transferred to the radish samples. Among the radish breeding lines and introduced resources, 44 lines were used as materials to analyze the genotype using 22 SSR markers selected. As a result, the analysis showed that among all the selected markers, 'cnu_m139' and 'cnu_m289' were the most useful markers for diversity evaluation. The genetic relationship of the radish genetic resources showed that the geographic origins affected the diversity. Furthermore, the different types of radish groups were also determined by the year they were bred. This result demonstrated that there are differences between the older radish breeds and the more recently developed radish breeds. Even though a relatively small number of markers were used in the analysis, it was possible to distinguish whether the radish was bred 30 years ago or in the 2000s, and that the similar physical shapes comprised a particular group, showed that the SSR markers can indeed be successfully applied to to study the diversity within radish breeding lines. Through the results of this study, it can be concluded that the SSR marker developed for the Chinese cabbage can be applied to examine the genetic diversity and analyze the relationship (genetic resource determination) of radish.
Korean Journal of Agricultural and Forest Meteorology
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v.5
no.3
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pp.185-190
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2003
This study was conducted to examine rice growth duration by analyzing agricultural climatic conditions at different latitudes in unified Korea. The climatic conditions of nine sites from Wunggi (latitude 42N) to Jeju (latitude 31N) were examined in this study. The rice growth duration of various cropping patterns was determined by analyzing consecutive days when effective daily mean air temperature was suitable for rice growth from the first seeding date to the last maturing date. The rice growth duration in Wunggi located in North Korea was available 138 days for machine transplanting, 115 days for direct seeding on dry paddy cultivation, and 97 days for direct seeding on a flooded surface with cultivation after seeding. On the other hand, the rice growth duration in Kwangju (latitude 35N) located in South Korea was 195 days for machine transplanting, 180 days for direct seeding on dry paddy cultivation, and 170 days for direct seeding on a flooded surface cultivation after seeding.
Identification of animals has been made with an ear tag with dummy code, and blood typing has been used for paternity and individual identification in live animals. As various genetic markers are for different cattle breeds vary, the discrete genetic markers are necessary to identify Hanwoo. A total of 740 progeny testing Hanwoo were used to identify Hanwoo specific markers. To examine traceability of individuals by using breed specific genetic codes, four animal were randomly sampled, and traced from live animals to post-slaughter processing stages. The candidate genetic makers used in the study were 16 DNA microsatellites which were identified in romosomes 1 and 14. The number of alleles of those DNA microsatellites ranged from a minimum of 3 to maximum of 12. The heterozygote frequency ranged from 0.022 to 0.824. Effective number of alleles for each DNA microsatellites were 3 to 6. Six selected candidate genetic markers were able ti trace individual cattle with an 100% confidence level.
To determine whether FT-IR spectral analysis based on multivariate analysis could be used to discriminate Chinese cabbage breeding line at metabolic level, whole cell extracts of nine different breeding lines (three paternal, three maternal and three $F_1$ lines) were subjected to Fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR). FT-IR spectral data of Chinese cabbage plants were analyzed by principal component analysis (PCA), partial least square discriminant analysis (PLS-DA), and hierarchical clustering analysis (HCA). The hierarchical dendrograms based on PLS-DA from two of three cross combinations showed that paternal, maternal, and their progeny $F_1$ lines samples were perfectly separated into three branches in breeding line dependent manner. However, a cross combination failed to fully discriminate them into three branches. Thus, hierarchical dendrograms based on PLS-DA of FT-IR spectral data of Chinese cabbage breeding lines could be used to represent the most probable chemotaxonomical relationship among maternal, paternal, and $F_1$ plants. Furthermore, these metabolic discrimination systems could be applied for rapid selection and classification of useful Chinese cabbage cultivars.
The seeds of Coix lachryma-jobi Linne var. mayuen Stapf. are used as dietary food for obesity and diabetes under the names of Yulmu in Korea and Yiyiren(薏苡仁) in China. It is one of the drugs promoting diuresis to eliminate the wetness-evil from the lower warmer in the traditional Korean medicine. According to ancient textbook of the traditional Korean medicine, it should be applied to patients with phlegm and heat, etc. The establishment of the method for the discrimination of Coisis Semen is very important for the quality control of drugs. Random amplified polymorphic DNA(RAPD) analysis and anatomical characteristics were used for the discrimination of Coix lachryma-jobi $Linn\acute{e}$ var. mayuen $S_{TAPF}$. and C. lachryma-jobi $Linn\acute{e}$. In the RAPD analysis with 20 primers, 8 primers gave informative and reproducible bands with the genomic DNA. From the cluster analysis, the genus Coix were divided into two groups at similarity coefficient of 0.863.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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