• 제목/요약/키워드: 박상동

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새로운 생체적합성 폴리펩티드공중합체의 합성과 혈액적합성에 관한 연구 : 측쇄에 에틸렌글리콜을 함유하는 폴리펩티드 공중합체의 혈액적합성 (Synthesis and Blood Compatibility of New Biocompatible Copolypeptides : Blood Compatibility of Copolypeptide Having Ethylene Glycol Oligomers Substituted in the Side Chain)

  • 강인규;박상동;조종수;성용길
    • 대한화학회지
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    • 제36권6호
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    • pp.947-954
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    • 1992
  • Poly (γ-benzyl L-glutamate) (PBLG)와 말단에 아미노기를 갖는 Polyethylene glycol (PEG)의 치환반응을 행하여 PEG-grafted PBLG (PEG-g-PBLG)를 합성하였다. 또한 PEG-g-PBLG 필름표면에 ethanolamine(EA)을 치환반응하여 표면에 히드록시그룹을 갖는 PEG-g-PBLG-EA 필름을 얻었다. 폴리펩티드중합체와 혈액성분과의 상호작용에 관한 실험결과, PEG-g-PBLG 상에서의 혈소판의 점착율 및 형태변화는 PEG-g-PBLG-EA보다 적게 나타났고, PEG-g-PBLG상에서의 혈장 단백질의 응고시간은 PEG-g-PBLG-EA 또는 PBLG의 응고시간보다 길게 나타났다. 이들 결과는 혈액응고시간 및 혈액응고량을 조사한 실험결과와 일치하였다. 따라서 폴리펩티드상의 히드록시그룹은 혈액성분과의 상호작용을 강하게 하여 혈액적합성이 저하하는 반면, PEG-g-PBLG는 비교적 좋은 혈액적합성을 나타냄을 알 수 있었다.

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국화흰녹병균 Puccinia horiana 유전체 분석과 약물 표적으로서의 sterol 14-demethylase (Genome Sequence Analysis of Chrysanthemum White Rust pathogen Puccinia horiana and Sterol 14-demethylase as Drug Target)

  • 김정구;박상근;박하승;권수진;김승환;이동준;손성한;이병무;배신철;안일평;김창훈;백정훈
    • 농약과학회지
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    • 제17권4호
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    • pp.468-472
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    • 2013
  • 국화는 한국을 비롯한 여러나라에서 중요한 화훼작물이며 국화흰녹병은 절대기생성 진균인 Puccinia horiana에 의하여 유발되는 병으로 국화에 가장 심한 피해를 초래하는 병해 중의 하나이다. 이 병의 방제는 주로 약제 방제에 의존하고 있는데 국내에서는 26개 농약품목이 등록되어 있으며 그 중 10개 품목의 주성분은 트리아졸계 화합물이다. 트리아졸 화합물에 대한 약물표적의 유전자 존재를 확인하고 그 정보를 얻기 위하여 국화흰녹병균 유전체 염기서열 분석의 중간결과로서 병원균의 세포막 구성의 중요성분인 에르고스테롤 생합성에 관여하며 트리아졸계 화합물의 표적이 되는 sterol 14-demethylase 유전자의 염기서열을 확인하고 그 아미노산 서열과 삼차구조를 예측하였다. 이 단백질은 Puccinia속내에서는 84% 이상의 상동성을 보였으나 다른 속에서는 68% 이하의 상동성을 보였다.

단백질분해효소를 생산하는 Pseudoxanthomonas sp. WD12와 WD32의 분리 (Isolation of Pseudoxanthomonas sp. W12 and WD32 Producing Extracellular Protease)

  • 조운동;이제관;임채성;박아름;오용식;노동현
    • 미생물학회지
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    • 제46권1호
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    • pp.63-67
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    • 2010
  • 생리 및 상업적 응용분야에서 중요한 위치를 차지하는 단백질 분해효소는 펩타이드 결합의 가수분해를 촉매한다. 단백질 분해효소를 생산하는 신규 균주를 분리하기 위하여 부패한 나무로부터 균을 분리하여 1% skim milk가 포함된 LB 배지에서 투명환의 생성 능력이 높은 두 균주 WD12와 WD32를 선발하였다. 선발균주의 동정을 위하여 16S rRNA gene의 염기서열을 결정한 후 GenBank 상에 등록된 서열들과 상동성을 조사한 결과, WD12는 Pseudoxanthomonas mexicana와 97.8%, WD32는 99.8%의 상동성을 보여주었다. 계통적 유연관계를 조사한 결과 이들 균들은 P. mexicana와 P. japonensis와 cluster를 형성하였다. WD12와 WD32는 그람 음성 간균으로 catalase와 oxidase 활성을 보였다. WD12의 경우 P. mexicanna와 달리 malate를 동화할 수 있었으며, D-mannose를 동화할 수 없었다. 두 균주의 최적 단백질 분해효소를 생산하는 온도는 $35-37^{\circ}C$로 나타났으며, 최대활성은 WD12가 656 unit/ml, WD32가 267 unit/ml을 나타내었다.

국내 브루그만시아에서 분리한 Brugmansia mosaic virus의 특성 (Characterization of Brugmansia mosaic virus Isolated from Brugmansia spp. in Korea)

  • 박충열;김봉섭;남문;이민아;백다솜;배양수;박은혜;김정선;최종윤;임승모;문제선;이수헌
    • 식물병연구
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    • 제20권4호
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    • pp.307-313
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    • 2014
  • 2013년 5월, 경기도 수원시에서 모자이크와 기형의 병징을 보이는 천사의 나팔꽃 잎을 채집하였다. 채집한 시료는 전자현미경을 이용하여 검경한 결과 720-800 nm 길이의 사상형 입자가 관찰되었다. 전자현미경 검경 결과에 근거하여 기보고된 3종의 바이러스(Brugmansia mosaic virus, Colombian datura virus, Brugmansia suaveolens mottle virus)에 대하여 RT-PCR을 수행하였으며, BruMV에 양성반응을 보였다. 기계적 접종을 이용하여 BruMV의 병원성과 기주범위를 결정하였다. 가지과(담배, 토마토, 가지)와 비름과(땅꽈리)에서 전형적인 바이러스 병징이 나타났다. BruMV의 외피단백질을 결정하기 위하여 특이적 프라이머를 설계하였고, PCR, 클로닝, 시퀀싱을 수행하였다. 계통수 분석 결과, BruMV-SW는 BruMV SK와 가장 유사한 것으로 나타났다. 외피단백질을 이용한 뉴클레오타이드 상동성 비교에서는 BruMV 분리주와 92%와 99%의 상동성을 보였다.

양파 노균병균 Peronospora destructor의 분자계통학적 유연관계 분석과 PCR 검출기술 개발 (Phylogenetic Analysis of Downy Mildew Caused by Peronospora destructor and a Method of Detection by PCR)

  • 백창기;황선경;박미정;권영석;정희영;박종한
    • 한국균학회지
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    • 제45권4호
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    • pp.386-393
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    • 2017
  • 우리나라 양파 재배지의 주요 곰팡이병인 양파 노균병의 원인균 Peronospora destructor를 채집하여, internal transcribed spacer (ITS) 영역을 포함한 4개 유전자의 염기서열을 분석하여 상동성 비교와 분자계통학적 유연관계를 분석하였다. 그 결과, 경남 창녕군, 함안군, 합천군과 전남 무안군, 신안군, 해남군에 발생하는 P. destructor의 4종의 유전자 염기서열 모두 100% 상동성을 보였고, 유연관계 분석에서도 모두 동일한 계통으로 확인되었다. 본 연구에서는 ITS 영역 유전자 염기서열을 이용하여 P. destructor 검출용 PCR법을 개발하였고, 노균병균만을 특이적으로 검출하였다. 또한 식물체를 포함한 total genomic DNA로 검출한계를 검정한 결과, $0.7ng/{\mu}L$까지 가능하였다. 양파 노균병균 검출용 PCR법은 육안상 병징이 나타나지 않을 때도 충분히 감염유무가 확인되었다.

분열형 효모에서 mas3 유전자의 세포내 기능 연구 (Studies on Intracellular Functions of the mas3 Gene in the Fission Yeast, Schizosaccharomyces pombe)

  • 황미라;차재영;신상민;박종군
    • 생명과학회지
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    • 제15권1호
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    • pp.124-131
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    • 2005
  • 세포주기 조절에서 유전자 발현의 조절은 매우 중요한 부분이다. 본 연구에서는 인간의 유전자인 SMARCADl과 상동성을 가지는 분열형 효모의 새로운 유전자 $mas3^+$를 분리하였다. 이 두 유전자는 $87\%$의 상동성을 보인다. $mas3^+$유전자는 DEAD/H box를 포함한 7개의 motif를 가지고 있어서 helicase superfamily 중에서도 SNF2 family에 속한다. kanMX6를 선별 표지로 이용하여 $mas3^+$유전자 결손 세포를 구성하였고 $mas3^+$ 유전자 결손 세포는 UV와 MMS처리 실험에서 정상의 세포와 생존율이 비슷하여 DNA상해회복과는 관련이 없음을 알 수 있었다. $mas3^+$ 유전자의 세포주기별 발현 양을 분석한 결과 $G_2$단계부터 점차적으로 발현양이 늘어났다. $mas3^+$결손 돌연변이를 $26^{\circ}C$$35^{\circ}C$에서 배양한 결과, 비정상적인 세포질 분열 과정으로 인해 다중 격막 세포의 빈도가 증가하였다. 이상의 결과들은 $mas3^+$유전자는 세포질 분열과 세포형태 형성에 연관되어 있음을 시사한다.

고추(Capsicum annuum)의 항균성 단백질(PR-5) 유전자의 클로닝과 발현 분석 (Cloning and Expression of Antifungal Protein (PR5) Genes from Hot Pepper (Capsicum annuum L.))

  • 박해진;이정훈;윤용휘;김학윤;신동현;이인중;김달웅;김길웅
    • 생명과학회지
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    • 제12권3호
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    • pp.264-273
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    • 2002
  • 식물은 병원균이나 여러 가지 환경스트레스에 내하여 사기 방어기작을 가지며, 특히 PR 단백질은 병원균의 침입시에 동물의 면역반응과 유사한 생체방어반응을 나타내는 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 고추에서 항균 특성을 나타내는 PR5 유전자를 클로닝하고 이들의 특성을 구명하였다. 고추에서 서로 다른 3종의 PR5 유전자, CAPR5-1, CAPR5-2, CAPR5-3를 클로닝하였다. 이들 유전자의 특성을 조사하고 아미노산 수준에서 유사성을 비교하여 본 결과, 서로간에는 90% 이삳의 상동성을 나타내었고 이들의 2차구조를 비교한 결과 중요한 domain은 높은 상동성을 나타내어 PR5 유전자들이 항균 특성을 나타내는데 매우 중요한 motif로 작용할 것으로 사료된다. CAPR5-1, CAPR-2, CAPR5-3 유전자들의 항균성 정도를 조사하기 위하여 이들 유전자를 대장균에서 발현시켜 단백질을 분리하여 고추 역병균인 phytophthora capsici에 처리한 결과, 균사의 성장이 억제되어 CAPR5-1, CAPR5-2, CAPR5-3 단백질들이 항균성을 지니고 있는 것으로 나타났다.

키토사네이즈 유전자의 클로닝과 키토산 올리고머의 정량적 생산 (Molecular Cloning of Chitosanase Gene and Quantitative Production of Chitosan Oligomer)

  • 박유미;장혜란;허태린;김사열
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제32권1호
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    • pp.16-21
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    • 2004
  • Chitosanase분비 세균을 찾아내기 위해 남해안의 서로 다른 다섯 치역의 해안 갯벌과 게를 채취하였다. 시료를 키토산선별 배지에 도말하여 얻은 균주 중에 투명환을 형성하는 6종의 균주를 선택하여 분리하였다. 그들은 FE-SEM을 이용한 형태 관찰과 165 rDNA sequence analysis를 통해 Bacillus cereus KNUC51, B. cereus KNUC52, B. cereus KNUC53, B. cereus KNUC54, B. cereus KNUC55, Paenibacillus favisporus KNUC56 등으로 균주명이 정해졌다. Chitosnase 활성을 측정한 결과 기존에 알려진 B. subtilis 168과 유사한 활성을 나타내었다. 효소 활성을 높이기 위해 강력한 돌연변이 유발 물질인 MNNG를 사용하여 돌연변이주를 만든 결과 원균주와 비교해 효소활성이 높은 3개 균주를 선별할 수 있었다. B. cereus 5균주의 chitosnase를 지정하며 생산하는 csn유전자를 분리 정제하여 DNA염기서열을 결정하고 아미노산 서열을 예상하였다. 예상된 아미노산의 잔기는 453 잔기였고 B. cereus ATCC14579의 것과 93% 이상의 상동성을 나타내었다. 분리 균주의 배양 상등액을 키토산 중합체와 반응시킨 후 반응물로 박층크로 마토그래피를 실시한 결과 5분 이하로 반응을 시켰을 때 효능이 좋은 3-10개 사이의 잔기를 가진 키토산 올리고당을 만들 수 있다는 것을 볼 수 있었다.

대전광역시와 충청남도 밭 토양으로부터 야생효모의 분리 및 동정 (Isolation and Identification of Wild Yeasts from Soils of Fields in Daejeon Metropolitan City and Chungcheongnam-do, Korea)

  • 한상민;한재원;배상민;박원종;이종수
    • 한국균학회지
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    • 제44권1호
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    • pp.1-7
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    • 2016
  • 우리나라 토양에서 효모 종 분포특성을 조사하기 위해 먼저 대전광역시를 포함하는 충청남도 전 지역의 밭 토양 61점을 2015년 6월부터 8월까지 수집하여 97균주 20종의 야생효모들을 분리하였고, polymerase chain reaction (PCR)을 통해 internal transcribed spacer (ITS) 부위와 26S rDNA의 D1/D2 부위의 염기서열 상동성 비교법을 이용하여 종을 동정하였다. 이들 가운데 Cryptococcus podzolicus가 11균주를 포함하는 Cryptococcus 속 균이 전체 분리 균주 중 16균주(16%)로 가장 많이 분리되었고, 다음으로 Debaryomyces hansenii와 Trichorsporon asahii도 각각 6주씩 분리되었다.