• 한국균학회지
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• 제25권4호통권83호
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• pp.276-290
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• 1997

1990년부터 1996년에 걸쳐 전국 35개 골프장에서 한지형잔디인 creeping bentgrass, Kentucky bluegrass 그리고 난지형잔디인 zoysiagyass의 잎마름 증상으로부터 Pythium spp. 125균주를 분리 하였고, 이를 동정한 결과 P. aphanidermatum, p. arrhenomanes, P. catenulatum, p. gramlnicola, p. myriotylum, P. oligandrum, P. periplocum, P. rostratum, P. torulosum, P. ultimum Trow var. ultimum 그리고 P. vanterpoolii로 모두 11개 종으로 동정되었다. 본 실험에서 사용한 semi-solid 상태의 'sucrose-asparagine bentgrass leaf culture' 방법을 이용할 경우 Pythium spp.의 동정에 필요한 포자낭, 장란기, 장정기 그리고 난포자의 형태적 특징의 관찰이 용이하였다. 동정된 Pythium spp.는 국내에서는 잔디류에 대하여 처음 보고되는 것이고, 이 중에서 P. arrhenomunes, P. cutenulatum, P. graminioota, P. oligandrum, P. periplocum, P. rostratum, P. torulosum 그리고 P. vanterpoolii는 국내에서 처음 보고되는 미기록종이다. P. myriotylum, P. rostratum, P. torulosum, P. vanterpoolii의 경우는 PCA 배지상에서 특이한 균사생장형을 나타내므로 이를 균 동정에 이용할 수 있었다.

• 한국동물위생학회지
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• 제39권1호
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• pp.41-49
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• 2016

In the present study, fast and robust methods for the next generation sequencing (NGS) were developed for analysis of PRRSV full genome sequences, which is a positive sensed RNA virus with a high degree of genetic variability among isolates. Two strains of PRRSVs (VR2332 and VR2332-R) which have been maintained in our laboratory were used to validate our methods and to compare with the sequence registered in GenBank (GenBank accession no. EF536003). The results suggested that both of strains had 100% coverage with the reference; the VR2332 had the coverage depth from minimum 3 to maximum 23,012, for the VR2332-R from minimum 3 to maximum 41,348, and 22,712 as an average depth. Genomic data produced from the massive sequencing capacities of the NGS have enabled the study of PRRSV at an unprecedented rate and details. Unlike conventional sequence methods which require the knowledge of conserved regions, the NGS allows de novo assembly of the full viral genomes. Therefore, our results suggested that these methods using the NGS massively facilitate the generation of more full genome PRRSV sequences locally as well as nationally in regard of saving time and cost.

• 미생물학회지
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• 제23권1호
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• pp.1-8
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• 1985

일산화 탄소를 이용한 enrichment 배양 방법을 통하여 흙으로부터 일산화탄소를 이용하여 성장 할 수 있는 세가지 종류 (JC1, JC2, HY1)의 호기성 Acinetobacter 들을 분리했다. 이세균들은 모두Gramdma성 세균들로 운동성이 없었으며, 지수성장기에는 간균의 형태를 나타내었으나 성장이 정지되었을 때에는 구균으로 변하였다. 이들은 페니실린에 대해 내성이 있었고 $42^{\circ}C$에서도 성장을 할 수 있었다. DNA의 G+C함량은 43%-44.5%이였고 모든 세균에서 oxidase의 활성이 나타나지 않았다. 이 세균들의 coloy들은 모두 둥글고 매끄러웠으며 연한 노란색을 띄었다. 이들은 또 여러가지 종류의 당이나 유기산, 아미노산. 알코올 등을 이용하여 생장할 수 있였다. JC1과 J JC2 벚 HY1이 30%의 일산화탄소를 이용하여 $30^{\circ}C$에서 성장할 때의 doubling time은 각각 19시간. 25시간, 그리 고 35시간 이었다. JC1의 자가영양적 성장을 위한 최적조건은 pH가 6.8이였L 온도는 $42^{\circ}C$ 그리고 일산화탄소의 농도는 30%이였다. JC1 의 자가영양적 성장에는 몰리브데늄이 필요치 않았고, 또 이 세균은 100ppm의 CO만으로도 성장할 수 있는 것으로 밝혀졌다.

• 미생물학회지
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• 제52권4호
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• pp.415-420
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• 2016

북극 유래 박테리아인 Pseudomonas aeruginosa 균주의 대사산물에 대한 화학적 연구는 벤조산 유도체 6번을 포함하여, 두 개의 diketopiperazine 1과 2, 두 개의 phenazine alkaloid 3과 4, indole carbaldehyde 5번을 분리하였다. 화합물들의 구조는 1D 과 2D NMR, 및 MS 기법들과 기존 보고된 문헌 값 과의 비교에 의하여 동정되었다. 분리된 화합물들 중 5번과 6번은 북극 척지해 해수의 P. aeruginosa로 부터 처음으로 보고 되었다. 대사산물들 1-6의 항균 활성은 Staphylococcus aureus과 and Candida albicans에 대하여 측정하였다.

• 대한의생명과학회지
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• 제5권1호
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• pp.95-100
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• 1999

일반적으로 임상검사실에서 vancomycin resistant enterococci (VRE)를 검출하는 일은 어렵고, 시간이 많이 들며, 검체처리 비용도 많이 든다. 따라서 본 실험은 임상검체에서 분리된 세균으로부터 VRE를 신속하게 확인하고, 진단하기 위한 방법으로서 다중 중합효소 연쇄반응을 확립하였다. 본 실험에 사용된 primer는 장구균에 특이 한 유전자인 vanA, vanB, vanC-1, vanC-2/3 각각의 염기서열을 기초로 primer를 제작하고, 다중 중합효소 연쇄 반응을 실시하여 임상검체로부터 분리된 VRE 유전자의 type및 분포율을 조사하고자 하였다. 국내에서 분리된 75주의 장구균을 대상으로 다중 중합효소 연쇄반응을 실시한 결과 36주의 분리균주에서 vancomycin에 대해 높은 저항성을 보이는 vanA 유전자를 가진 것으로 나타났다. 그리고 18주에서는 vancomycin에 낮은 저항성을 내성을 보이는 vanC-1 또는 vanC-2/3 유전자를 보유한 것으로 나타났다. 따라서 본 실험에서 확립한 다중 중합효소 연쇄 반응 기법은 신속한 VRE 진단 방법으로 이용할 수 있을 것이다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제33권3호
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• pp.318-328
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• 2017

Chitinase-producing Paenibacillus elgii strain HOA73 has been used to control plant diseases. However, the antimicrobial activity of its extracellular chitinase has not been fully elucidated. The major extracellular chitinase gene (PeChi68) from strain HOA73 was cloned and expressed in Escherichia coli in this study. This gene had an open reading frame of 2,028 bp, encoding a protein of 675 amino acid residues containing a secretion signal peptide, a chitin-binding domain, two fibronectin type III domains, and a catalytic hydrolase domain. The chitinase (PeChi68) purified from recombinant E. coli exhibited a molecular mass of approximately 68 kDa on SDS-PAGE. Biochemical analysis indicated that optimum temperature for the actitvity of purified chitinase was $50^{\circ}C$. However, it was inactivated with time when it was incubated at $40^{\circ}C$ and $50^{\circ}C$. Its optimum activity was found at pH 7, although its activity was stable when incubated between pH 3 and pH 11. Heavy metals inhibited this chitinase. This purified chitinase completely inhibited spore germination of two Cladosporium isolates and partially inhibited germination of Botrytis cinerea spores. However, it had no effect on the spores of a Colletotricum isolate. These results indicate that the extracellular chitinase produced by P. elgii HOA73 might have function in limiting spore germination of certain fungal pathogens.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제56권11호
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• pp.477-481
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• 2013

Purpose: Ureaplasma colonization is related with perinatal complications in preterm infants. Little is known about the difference in virulence among various Ureaplasma urealyticum serovars. The aim of this study was to determine U. urealyticum serovars of preterm infants in order to assess whether any of the serovars were associated with bronchopulmonary dysplasia (BPD). Methods: Three hundred forty-four preterm infants with a gestational age less than 34 weeks admitted to Gangnam Severance Hospital neonatal intensive care unit from July 2011 to December 2012 were included in this study. Tracheal and gastric aspirations were conducted on infants to confirm Ureaplasma colonization. Ureaplasma colonization was confirmed in 9% of infants, of these, serovars were determined by real-time polymerase chain reaction. Results: A total of 31 infants (gestational age, $29.3{\pm}3.1$ weeks; birth weight, $1,170{\pm}790g$) were U. urealyticum positive. The Ureaplasma positive group treated for more days with oxygen and ventilation than the negative group (P<0.05). Histologic chorioamnionitis and moderate to severe BPD were more frequent in the Ureaplasma positive group than in the negative group (P<0.05). U. urealyticum isolates were either found to be a mixture of multiple serovars (32%), serovar 9 alone or combined with other serovars (39%), serovar 11 (26%), 2 (13%), 8 (10%), 10 (13%), and 13 (25%). No individual serovars were significantly associated with moderate to severe BPD and chorioamnionitis. Conclusion: This is the first study to describe the distribution of U. urealyticum serovars from Korean preterm infants. Ureaplasma -colonized infants showed higher incidence of BPD and chorioamnionitis.

• Applied Biological Chemistry
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• 제40권2호
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• pp.144-147
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• 1997

식물체의 향기성분을 분리하는데 사용되는 몇가지 방법을 비교하기 위해서 headspace(purge & trap)법, simultaneous distillation extraction(SDE)법, steam distillation법, 용매추출법 등으로 분리된 휘발성 성분의 조성차이를 분석하여 각각의 사용된 방법들의 특징을 비교하였다. 휘발성 성분 분석시료로는 Anise(Pimpinella anisum L.)씨앗을 사용하였으며 분리된 휘발성분중 GC/MSD를 이용하여 43종의 성분을 확인하였다. Headspace (purge & trap)법에서는 휘발성이 강한 2-butanol, pentanal, 3-hexen-1-ol 등과 같은 alcohol류 및 aldehyde류 성분들을 주요성분으로 확인할 수 있었으며, 용매추출에서는 비점이 높은 성분들인 myristic acid, oleic acid 등의 acid류 성분들과 ethyl hexadecanoate, ethyl octadecanoate 등과 같은 ester 화합물들이 주요성분으로 확인되었다. SDE법과 steam distillation법에서 추출된 성분의 조성은 유사하였으며 terpene 화합물들이 주요성분으로 확인되었다. Anise의 주성분인 anethole은 SDE법, headspace(purge & trap)법으로 추출하였을때 가장 많이 추출되었다.

• 생약학회지
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• 제47권1호
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• pp.1-6
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• 2016

Phytochemical investigation of the twigs of Corylopsis coreana afforded 10 phenolic compounds, bergenin (1), 6'-O-galloylbergenin (2), 3'-O-galloylbergenin (3), (-)-catechin (4), (-)-epicatechin (5), (-)-epicatechin-3-O-galloyl ester (6), 4-methoxy-3,-5-dihydroxybenzoic acid (7), gallic acid (8), 2,4,6-trimethoxyphenol-1-O-${\beta}-\small{D}$-glucopyranoside (9), and 2,4,6-trimethoxyphenol-1-O-${\beta}-\small{D}$-(6-O-galloyl)-glucopyranoside (10). Their structures were characterized by spectroscopic data and identified by comparing these data with those in the literatures. The compounds 3, 9 and 10 were isolated for the first time from this source. All the isolates (1-10) were tested for their cytotoxic activity against A549, SK-OV-3, SK-MEL-2, and HCT15 cell lines in vitro using the SRB bioassay. The compounds 5, 7 and 8 exhibited selective cytotoxic activity against SK-MEL-2 cell line.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제18권11호
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• pp.1848-1852
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• 2008

Salmonella remains a primary cause of food poisoning worldwide, and massive outbreaks have been witnessed in recent years. Therefore, this study investigated the antimicrobial activity of methyl gallate (MG), which exhibited good antibacterial activity ($MIC=3.9-125{\mu}g/ml$) against all the bacterial strains tested. In a checkerboard dilution test, MG markedly lowered the MICs of ciprofloxacin (CPFX) against Salmonella. The combined activity of CPFX and MG against Salmonella resulted in fractional inhibitory concentrations (FICs) ranging from 0.0037 to 0.015 and from 0.24 to $7.8{\mu}g/ml$, respectively. Meanwhile, the FIC index ranged from 0.31-0.37, indicating a marked synergistic relationship between CPFX and MG against Salmonella. Time-kill assays also showed a decrease in the CFU/ml between the combination and the more active compound. Therefore, this study demonstrated that MG and CPFX can act synergistically in inhibiting Salmonella in vitro.