• 제목/요약/키워드: strains identification

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사료 첨가용 생균제를 위한 Probiotics 유산간균의 분리 및 동정 (Isolation and Identification of Probiotic Lactobacillus Isolates for Calf Meal Supplements)

  • 이승배;최석호
    • 한국축산식품학회지
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    • 제26권1호
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    • pp.106-112
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    • 2006
  • 한우와 홀스타인의 분변으로부터 MRS 배지와 LAPT 배지를 이용하여 무작위 선발법으로 54균주의 유산균을 1차로 분리하였다. 1차로 분리된 54균주에 대해 내담즙성이 우수한 10균주를 분리한 다음 내산성을 조사한 결과 인공위액 pH 2.5에서 LS1, LS15 및 LL6 균주가 각각 66.5%, 82.6% 및 80.7%의 생존율을 나타내었다. Sal. typhimurium, Sta. aureus 및 Cl. perfringens의 병원균에 대해 가장 큰 항균력을 보인 균주는 LL6와 LL7이었다. API CHL kit로 동정한 결과 LS1, LS2 및 LMI 균주는 모두 L. fermentum, LL6와 LL7 균주는 L. acidophilus, LS3 균주는 L. plantarum으로 각각 동정되었고, 나머지 4균주는 Lactobacillus spp. 로 동정되어 분리된 10균주 모두 안전성 있는 유산간균임을 확인하였다. 10종류의 항생제에 대한 내성을 조사한 결과 ampicillin, amoxicillin과 erythromycin에 대해서는 감수성이 있으나 colistin과 ciprofloxacin에 대해 모두 내성을 나타내었다. LB1, LL6 및 LL7 균주는 gentamicin과 neomycin에 대해 내성을 보여 주었다. 분리 동정된 균주 중에 내산성, 내담즙성 및 병원성 균에 대한 특성을 기준으로 판단할 경우 probiotic 유산균으로 사용 가능성이 높은 것은 LL6인 L. acidophilus로 나타났다.

제주도 토양에서 분리한 xylanase 생산균주 Streptomyces glaucescens subsp. WJ-1의 동정 및 효소의 생화학적 특성 연구 (Identification and Biochemical Characterization of Xylanase-producing Streptomyces glaucescens subsp. WJ-1 Isolated from Soil in Jeju Island, Korea)

  • 김다솜;정성철;배창환;지원재
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제45권1호
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    • pp.43-50
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    • 2017
  • 본 연구로부터 WJ-1 균주는 제주도에서 수집된 토양샘플로부터 동정되었는데, 형태분화관찰 및 16S rRNA 유전자 염기서열분석과 DNA-DNA hybridization 분석을 통하여 S. glaucescens의 신아종으로 분류되었다. 균주 WJ-1의 주요 cellular fatty acid와 게놈내 G+C 농도는 각각 $C_{15:0}$ anteiso (42.99%)와 74.73 mol%였다. 이 균은 배양액으로부터 준비된 조효소액의 xylanase 활성은 중성 pH 조건 및 $55^{\circ}C$에서 활성이 가장 높았다. S. glaucescens의 조효소액을 이용하여 xylan으로부터 xylotriose 및 xylotetraose를 포함하는 xylooligosaccharide를 제조할 수 있다. 본 연구는 S. glaucescens의 아종에 관한 최초의 보고이며, 관련 종에서 xylanase 활성에 관한 최초의 보고이다. 본 연구 결과로부터, WJ-1 균주는 lignocellulosic biomass의 이용 및 기능성 xylooligosacchade 생산에 유용하게 활용될 수 있을 것으로 기대된다.

곶감으로부터의 오염미생물 분리 및 동정 (Isolation and Identification of Contaminated Organisms on Dried Persimmon)

  • 강복희;조미영;허상선;신기선;이동선;이상한;이진만
    • 한국식품저장유통학회지
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    • 제19권6호
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    • pp.939-945
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    • 2012
  • 상주 지역 곶감의 제조 및 저장 중의 품질열화를 방지하기 위한 기초 연구로서 상주 곶감으로부터 오염균을 분리하여 동정을 실시하였다. 7종의 배지를 사용하여 곶감으로부터 오염균을 분리한 결과 배지 종류별로 오염균수가 $5.18{\times}10^2{\sim}2.31{\times}10^4$ CFU/g으로 나타났다. 곰팡이에 의해 오염된 곶감의 경우 배지 종류에 따라 오염균수가 $1.17{\times}10^6{\sim}1.68{\times}10^7$ CFU/g으로 나타났다. 곶감의 주요 오염균을 조사하기 위해 우점종으로 존재하는 균수를 확인한 결과, 분리된 3종의 곰팡이 중에서 푸른 곰팡이 K2-1이 가장 많은 비율을 차지하여 곶감 오염에 있어 주요 원인균으로 판단하였다. 다음으로 크림색 효모와 연보라색 효모가 많이 상재하고 있는 것으로 나타났다. 분리한 15종의 균주 중 주요 오염 원인균으로 판단되는 푸른 곰팡이 K2-1에 대한 균주 동정을 실시한 결과Penicillium sp.으로 동정되었으며, 곰팡이 K-1과 K-3는 각각 Caldosporium sp.와 Aspergillus sp.으로 동정되었다.

Modified T-RFLP Methods for Taxonomic Interpretation of T-RF

  • Lee, Hyun-Kyung;Kim, Hye-Ryoung;Mengoni, Alessio;Lee, Dong-Hun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제18권4호
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    • pp.624-630
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    • 2008
  • Terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) is a method that has been frequently used to survey the microbial diversity of environmental samples and to monitor changes in microbial communities. T-RFLP is a highly sensitive and reproducible procedure that combines a PCR with a labeled primer, restriction digestion of the amplified DNA, and separation of the terminal restriction fragment (T-RF). The reliable identification of T-RF requires the information of nucleotide sequences as well as the size of T-RF. However, it is difficult to obtain the information of nucleotide sequences because the T-RFs are fragmented and lack a priming site of 3'-end for efficient cloning and sequence analysis. Here, we improved on the T-RFLP method in order to analyze the nucleotide sequences of the distinct T-RFs. The first method is to selectively amplify the portion of T-RF ligated with specific oligonucleotide adapters. In the second method, the termini of T-RFs were tailed with deoxynucleotides using terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) and amplified by a second round of PCR. The major T-RFs generated from reference strains and from T-RFLP profiles of activated sludge samples were efficiently isolated and identified by using two modified T-RFLP methods. These methods are less time consuming and labor-intensive when compared with other methods. The T-RFLP method using TdT has the advantages of being a simple process and having no limit of restriction enzymes. Our results suggest that these methods could be useful tools for the taxonomic interpretation of T-RFs.

살라미 외피로부터 분리한 곰팡이의 동정 (Identification of Fungal Strains Isolated from Salami Casing)

  • 유영현;김대호;정구용;홍승범
    • 한국균학회지
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    • 제42권1호
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    • pp.74-78
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    • 2014
  • 각종 육류를 세균, 곰팡이 등의 다양한 미생물로 발효시켜 만든 살라미는 서양인들에게는 치즈만큼이나 널리 애용되는 식품이다. 국내의 살라미 소비는 수입에 의존하였었는데, 최근에 국내산 육류를 이용하여 살라미를 제조하고자 하는 시도가 진행되고 있다. 살라미 제조 시의 곰팡이는 살라미 껍질에 주로 발생하여 내부의 육류가 세균에 의하여 안정되게 발효될 수 있도록 돕고, 살라미의 풍미에 영향을 미치는 것으로 알려져 있다. 우리나라에서 제조 중에 있는 살라미의 껍질을 실체현미경으로 관찰하고 주요곰팡이를 직접 분리하였으며, 형태적, 분자적 방법에 의하여 동정하였다. 이들은 Aspergillus cibarius S.B. Hong & R.A. Samson, Penicillium echinulatum Raper & Thom ex Fassat., Cladosporium sphaerospermum Penz.으로 동정되었는데, A. cibarius는 살라미 껍질에 흰색 또는 엷은 녹색으로 자라며 전체에 넓게 분포하였다. P. echinulatum은 살라미 껍질에 띄엄띄엄 발생하였으며 흰색의 덩어리를 형성하였다. C. sphaerospermum은 살라미 껍질에 드물게 발생하였으며 검은 반점을 형성하였다. 이들의 살라미 제조에서의 역할 및 살라미 제조에의 활용에 대한 추가적인 연구가 필요할 것으로 생각된다.

모아레 간섭계와 모델교정법을 이용한 솔더 합금의 점소성 물성치 역추정 (Inverse Estimation of Viscoplastic Properties of Solder Alloy Using Moir$\acute{e}$ Interferometry and Computer Model Calibration)

  • 강진혁;이봉희;주진원;최주호
    • 한국전산구조공학회논문집
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    • 제24권1호
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    • pp.97-106
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    • 2011
  • 본 연구에서는 전자패키지에 사용되는 솔더 재료의 점소성 물성치를 규명하였다. 이를 위해 전자패키지와 비슷한 변형을 보이는 시편을 제작하였고 모아레 간섭계를 이용하여 열사이클 하에서의 변형을 측정한 뒤 시편의 굽힘 변위와 솔더의 전단 변형률을 구하였다. 시편에 대해 점소성 유한요소해석을 실시하였고 해석 결과가 실험 결과에 일치하도록 물성치를 역으로 추정하였다. 실험에서 발생한 측정오차와 실험횟수 부족 등의 불확실성을 고려하기 위해 컴퓨터 모델 교정법을 이용하였고, 그 결과 추정된 물성치는 평균 및 신뢰구간으로 표현되었으며, 이로 인한 유한요소해석 결과도 마찬가지로 평균 및 신뢰구간으로 표현되었다.

Antibacterial, Anti-Diarrhoeal, Analgesic, Cytotoxic Activities, and GC-MS Profiling of Sonneratia apetala (Buch.-Ham.) Seed

  • Hossain, Sheikh Julfikar;Islam, M Rabiul;Pervin, Tahmina;Iftekharuzzaman, M;Hamdi, Omer AA;Mubassara, Sanzida;Saifuzzaman, M;Shilpi, Jamil Ahmad
    • Preventive Nutrition and Food Science
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    • 제22권3호
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    • pp.157-165
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    • 2017
  • Fruits of Sonneratia apetala (Buch.-Ham.), (English: mangrove apple, Bengali: keora) both seeds and pericarps, are largely consumed as food besides their enormous medicinal application. The fruit seeds have high content of nutrients and bioactive components. The seeds powder of S. apetala was successively fractionated using n-hexane, diethyl ether, chloroform, ethyl acetate, and methanol. The fractions were used to evaluate antibacterial, anti-diarrhoeal, analgesic, and cytotoxic activities. Methanol fraction of seeds (MeS) stronly inhibited Escherichia coli strains, Salmonella Paratyphi A, Salmonella Typhi, Shigella dysenteriae, and Staphylococcus aureus except Vibrio cholerae at $500{\mu}g/disc$. All the fractions strongly inhibited castor oil induced diarrhoeal episodes and onset time in mice at 500 mg extract/kg body weight (P<0.001). At the same concentration, MeS had the strongest inhibitory activity on diarrhoeal episodes, whereas the n-hexane fraction (HS) significantly (P<0.05) prolonged diarrhoeal onset time as compared to positive control. Similarly, HS (P<0.005) inhibited acetic acid induced writhing in mice at 500 mg extract/kg, more than any other fraction. HS and diethyl ether fractions of seed strongly increased reaction time of mice in hot plate test at 500 mg extract/kg. All the fractions showed strong cytotoxic effects in brine shrimp lethality tests. Gas chromatography-mass spectrometry analysis of HS led to the identification of 23 compounds. Linoleic acid (29.9%), palmitic acid (23.2%), ascorbyl palmitate (21.2%), and stearic acid (10.5%) were the major compounds in HS. These results suggest that seeds of S. apetala could be of great use as nutraceuticals.

Identification and Characterization of Gliocladium viride Isolated from Mushroom Fly Infested Oak Log Beds Used for Shiitake Cultivation

  • Kim, Jun-Young;Yun, Yeo-Hong;Hyun, Min-Woo;Kim, Myeong-Ho;Kim, Seong-Hwan
    • Mycobiology
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    • 제38권1호
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    • pp.7-12
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    • 2010
  • A green mold species that has not previously been reported in Korea was isolated from oak log beds used for shiitake (Lentinula edodes) cultivation that were infested by mushroom flies. In this study, we identify the mold species as Gliocladium viride (an anamorph of Hypocrea lutea) and describe its mycological properties. The fungus was cottony on both potato dextrose agar (PDA) and Czapek yeast extract agar (CYA), but was colored white on PDA and became yellowish green and brown on CYA. Mycelial growth on PDA attained a diameter of 73 mm at $30^{\circ}C$ after 5 days. The fungus grew faster on malt extract agar (> 80 mm, 5 days at $25^{\circ}C$) compared to CYA and PDA (< 68 mm, 5 days at $25^{\circ}C$). Penicillate conidiophores of the fungus are hyaline, smooth walled, branching above typically in four stages, and $120\sim240\;{\mu}m$ in length. Club-shaped or slender phialides are formed on the metulae. Conidia of the fungus were ovate and elliptic, yellowish brown and green, and $2.5\sim3.0\;{\mu}m\times1.8\sim2.3\;{\mu}m$ in size. Typically, slimy conidia are formed in a mass and colored brown to dark green to almost black. The internal transcribed spacer rDNA and translation elongation factor 1 alpha gene sequences of the fungus isolated here show 99% identity with previously identified G. viride strains.

Auxin과 항진균물질을 생산하는 식물생장촉진근권세균의 분리동정 및 특성 (Selection and Identification of Auxin-Producing Plant Growth Promoting Rhizobacteria having Phytopathogen-antagonistic activity)

  • 권도형;최준형;정희경;임종희;주길재;김상달
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제47권1호
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    • pp.17-21
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    • 2004
  • 경작지 근권토양에서 식물생장촉진물질인 auxin라 항진균물질을 동시에 생산하는 농업용 미생물제제로 사용할 PGPR 균주를 선발하고 동정하였다. 경북 경산 일대의 다수확 밭토양의 근권토양에서 균주를 선발하고 그 중 auxin 생산성이 높은 2균주 K36, N21를 분리하였다. 이들 균주를 동정한 결과 K36은 Pantoea agglomerans이고 N21은 Pseudomonans fulva로 동정되었다. 선발된 균주의 식물생장촉진능을 in vivo 녹두발아촉진검사법으로 확인하였으며, 식물병원진균에 대한 길항력을 확인하였다. 배양조건에 따른 auxin 생산성을 조사한 결과 K36 균주는 $pH\;7.5,\;35^{\circ}C$, 37시간에서 최대로 나타났고, N21균주는 $pH\;7.5,\;35^{\circ}C$, 20시간에서 최대값을 나타내었다.

양식해산어(養殖海産漁)에서 분리(分離)한 Vibrio anguillarum의 혈청형(血淸型)에 대(對)하여 (Serotyping of Vibrio anguillarum isoated from cultured marine fishes)

  • 이종연;전세규;박수일
    • 한국어병학회지
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    • 제1권1호
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    • pp.45-50
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    • 1988
  • 1985년(年) 7월(月)부터 1986년(年) 12월사이에 양식(養殖)방어, 참돔 및 돌돔으로 부터 분리(分離)한 26균주(菌株)의 Vibrio anguillarum에 대한 혈청학적(血淸學的) 동정(同定)의 실시(實施)하였다. 이 분리균(分離菌)들을 Kitao et al. (1983)이 보고(報告)한 6가지 혈청형(血淸型)의 V. anguillarum에 대하여 내열성(耐熱性) O항원(抗原)을 이용(利用)하여 상호응집반응(相互凝集反應)시켜본 결과(結果), 1. 본(本) 분리균(分離菌)은 모두 하나의 동일(同一)한 혈청형(血淸型)을 가지고 있었으며 Kitao et al. (1983)이 보고(報告)한 혈청형(血淸型)C(대표균주(代表菌株) PT-213)와 만이 응집반응(凝集反應)하였다. 2. 본(本) 분리균(分離菌)은 모두 PT-213혈청(血淸)에 대하여 동일(同一)한 2중(重)의 침강선(沈降線)을 형성(形成)하였다. 3. 본(本) 분리균(分離菌)은 모두 PT-213의 인자항혈청(因子抗血淸)에 대하여만 특이반응(特異反應)을 하였다. 따라서 본(本) 분리균(分離菌)들의 혈청형(血淸型)은 모두 Kitao et al.(1983) 이 보고(報告)한 혈청형(血淸型)C와 동일한 것으로 판단되었다.

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