Fang, Ying;Choi, Jae Young;Park, Dong Hwan;Park, Min Gu;Kim, Jun Young;Wang, Minghui;Kim, Hyun Ji;Kim, Woo Jin;Je, Yeon Ho
The Plant Pathology Journal
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v.36
no.3
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pp.280-288
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2020
RNA interference (RNAi) has attracted attention as a promising approach to control plant viruses in their insect vectors. In the present study, to suppress replication of the rice stripe virus (RSV) in its vector, Laodelphax striatellus, using RNAi, dsRNAs against L. striatellus genes that are strongly upregulated upon RSV infection were delivered through a rice leaf-mediated method. RNAi-based silencing of peroxiredoxin, cathepsin B, and cytochrome P450 resulted in significant down regulation of the NS3 gene of RSV, achieving a transcriptional reduction greater than 73.6% at a concentration of 100 ng/μl and, possibly compromising viral replication. L. striatellus genes might play crucial roles in the transmission of RSV; transcriptional silencing of these genes could suppress viral replication in L. striatellus. These results suggest effective RNAi-based approaches for controlling RSV and provide insight into RSV-L. striatellus interactions.
Jonson, Miranda Gilda;Choi, Hong-Soo;Kim, Jeong-Soo;Choi, Il-Ryong;Kim, Kook-Hyung
The Plant Pathology Journal
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v.25
no.2
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pp.142-150
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2009
The complete genome sequences of RNA3 and RNA4 of the 13 different Rice stripe virus (RSV) isolates were determined and characterized in this study to address the possible causes of the recent re-emergence of RSV that affected many rice fields in Korea. The genome size of each RNA segment varied among isolates and significant differences were observed in the intergenic region. There was up to 4% average divergence in the RNA4 nucleotide sequence among 13 Korean isolates and only 1.4% in the RNA3. Phylogenetic relationships among different Korean isolates revealed that there were at least 2 types of RNA3 and 4 distinct types of RNA4 genomes present in Korea. However, Korean isolates with one type of RNA3 predominate over the other while the occurrences of the RSV Korean isolates with the 4 types of RNA4 genome were not correlated to specific geographical areas. Results further indicate that RNA4 had diverged more than RNA3 and these differences in accumulation of mutations in the individual RNA segments indicate that genetic reassortment were likely to contribute to the genetic divergence in the 13 Korean isolates. All of the Korean-RNA3 sequences except for one isolate grouped with Chinese isolates (JY and Z). In contrast, the RNA 4 sequences segregated together with either Chinese (JY and Z) and Japanese (M and T) isolates but genetic relationships of Korean isolates- RNAs 3 and 4 segments to Chinese-Y isolate were low. Altogether, these results suggest that the occurrence of mixtures of RNAs 3 and 4 genotypes in the natural population of RSV may have contributed to the sudden outbreak in Korea.
Rice stripe virus (RSV) has been the main viral disease of rice plant in western coastal region of Korea since 2000. The control of the vector insect, small brown planthopper (Laodelphax striatellus), is the most effective management method of the persistently-transmitted viral disease. Thus, ecological study between RSV and the vector insect was needed and investigated in order to make effective control plan, especially about study on the feeding and transmission of the virus by the vector insect. Each larval stage of vector insect differed in vector competence; larvae over 4th stage were shown as higher transmission after feeding on RSV-infected rice plant. These 4th and 5th larvae had higher transmission rates, 69.2% and 67.9% respectively, than 44.8% of the adult stage. The vector competence, however, was changed according to temperature; the highest transmission rate was 93.3% on $30^{\circ}C$ in comparison to 70.6% on $25^{\circ}C$ and 43.8% on $20^{\circ}C$.
Lee, Bong Choon;Cho, Sang-Yun;Yoon, Young-Nam;Kang, In Jeong;Lee, Jong Hee;Kwak, Do Yeon;Shin, Dong Bum;Kang, Hang-Won
Research in Plant Disease
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v.18
no.4
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pp.402-405
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2012
We surveyed the occurrence of Rice stripe virus (RSV) disease in 672 fields from 29 rice representative area in July 2012 as nationwide survey for RSV occurrence since 2008. We confirmed occurrence of virus disease in 18 areas, in west coast region including Secheon, Taean, Buwan and Cheorwon. RSV incidence rates of plant in Sacheon and Buan were less than 0.01% and 0.15%, respectively, showing similar rate with the nationwide survey carried out in 2008, whereas incidence rate of field declined from 19.9% in 2008 to 4.9% in 2012. Earlier, RSV occurred largely across the southern region of Korea. In 2001, RSV disease was found in Gangwha and Gyeonggi-do, the northern region of Korea. In 2007, RSV appeared in west coast; Buan in Jeollabuk-do and Seocheon in Choongnam-do. After migration of the vector, small brown plant hopper, from China in 2009, RSV is becoming a pandemic.
A rapid and simple RT-PCR diagnosis method for detection of Rice stripe virus (RSV), one of major virus infecting rice, was developed using porous ceramic cubes in this study. The porous ceramic cube can rapidly absorb biological molecules such as small-sized proteins and nucleic acid fragments into its pores. We examined whether this ability of porous ceramic cubes could be applied for isolating viral nucleic acids or particles from the RSV- infected plant tissues. In this study, we found that the porous ceramic cube was capable of absorbing a detection level of viruses from the rice tissues infected with RSV and established RT-PCR-based RNA diagnosis method using porous ceramic cubes.
The occurrence of Rice stripe virus (RSV) has been confirmed in some parts of South Korea. In the current year, this was observed to be limited in the double cropping zones of the southern region. Earlier, RSV occurred largely in the west coast regions of the country, particularly in Gangwha, Gyeonggi-do in 2001; and Buan, Jeollabuk-do and Seocheon, Chungcheongnam-do in 2007. This study was carried out to determine the nationwide extent of RSV occurrence by investigating RSV infestations in different latitudes and altitudes. Result revealed a recent reported occurrence of RSV in the southern region (Milyang, latitude $35^{\circ}$), a reported occurrence in the northern region (Cheolwon, latitude $38^{\circ}$) in 2005, and in the middle northern region of the east coast (Goseon, latitude $38^{\circ}$) as newly confirmed from this investigation. Results also confirmed the occurrence of RSV in a wide range of altitude from the plains (Milyang, 17 m altitude) to the alpine regions (Jinbu, 576 m) including the middle mountains (Sangju, altitude 285 m). The RSV occurrence in Jinbu in the alpine region and at Goseong and most of the northern end regions were confirmed only this year. The results of the present study confirmed that RSV is a fast-spreading disease in rice plant cultivation regions of the entire country.
Virus diseases often cause serious damage to rice production in Asia. The lack of information on virus resistance genes has been a major obstacle for the breeding of resistant varieties. In order to identify DNA marker associated with resistance against rice stripe virus (RSV), the quantitative trait locus (QTL) was carried out using advanced backcross population developed from a cross between RSV-resistant tongil type cultivar Shinkwang and susceptible japonica cultivar Ilpum. A RSV resistance QTL $qSTV11^{SG}$ explaining 44.2% of the phenotypic variation was identified on chromosome 11 of Tongil type rice cultivar 'Shingwang'. $qSTV11^{SG}$ was tightly linked to DNA marker RM6897. The RM6897 divided as resistance type allele and susceptible type alleles. Twenty seven resistant varieties showed the resistant-type allele and 23 susceptible varieties were susceptible-type allele to the marker of RM6897. This results and the molecular markers presented here may be useful in rice breeding for improving RSV resistance in japonica rice.
Kim, Byung-Ryun;Jeong, Tae-Woo;Han, Kwang-Seop;Hahm, Soo-Sang;Kim, Young-Jin;Nam, Yun-Gyu;Choi, Hong-Soo;Kim, Jeong-Soo;Yu, Seung-Hun
Research in Plant Disease
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v.19
no.2
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pp.84-89
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2013
The incidence factors of Rice stripe virus (RSV) were analyzed by studying the population density and the viruliferous insect rate (VIR) of small brown planthopper (SBPH), the incidence of stripe disease, alternate host, and susceptible cultivar in Chungnam Province. The population of overwintering SBPH had been decreasing, but the VIR of overwintering SBPH had not been differing for three years, 2008 to 2010. No RSV was detected in the natural host plants, such as short awn, annual bluegrass, and barley. In 2009, relatively large population of SBPH with the VIR of 5.4% migrated from China. However, there was no evidence relating of migration large amount of SBPH from China in 2008 and 2010. Also the infection rate of RSV in rice was less than 1% in these periods. The cultivation area of the susceptible varieties had steadily decreased from 41% to 19% from 2007 to 2009. Therefore, the reduction factors of rice stripe disease in Chungnam Province with higher influx of inoculum could be with an appropriate forecasting and chemical control, cultivation of resistant varieties, changes in the cropping system, and the low winter-spring temperature.
The occurrence factors of Rice stripe virus (RSV) in Chungcheongbukdo were analyzed by investigating the viruliferous insect rate (VIR) of overwintered small brown plant hopper (SBPH), the population density of SBPH, the infection rate of natural host plants, and the occurrence rate of RSV on rice paddy fields at the 3 areas of Cheongwon, Jincheon, and Boeun in 2008 and 2009. The average VIR of overwintered SBPH was 0.0% in 2008 and 1.1% in 2009. From SBPH collected on early June in 2009, VIR was higher as 1.4% at Jincheon and 4.2% at Boeun than those of overwintered SBPH, and this higher VIR might relate stronlgy with the adult population of SBPH immigrated from China. The populations of SBPH at Cheongwon, Jincheon and Boeun in 2008 were 3.8, 7.5 and 20.8 Head/$m^2$, respectively. However, those of Cheongwon and Jincheon increased up to about two folds as 8.4 and 13.1 in 2009. No RSV was detected on the natural host plants including barley. The factors involved in RSV occurrence were affected negatively by the low VIR of overwintered SBPH, the low population of overwintered SBPH, the low infection rate of RSV on the natural host plants, and the clean cultivation environment in Chungcheongbukdo.
Rice stripe virus (RSV) is one of Tenuivirus Group, which is carried by small brown planthopper. There is an outbreak of RSV in South Korea at 20Ot, and 2007. The infection caused by RSV had been investigated on weeds around the rice cultivated areas 13 region and 26 site including Jeonbuk Buan and Chungnam Seocheon. There have a doubt as to alternate host of RSV is total 15 Family and 50 Species including Gramineae 24 species of Duksaepul (Alopecurus aequalis), H. sativum var. vulgare etc.. There is identified the infected RSV in Festuca myuros, Alopecurus aequalis, Hordeum sativum var. vulgare, Trisetum bifidum, Echinochloa crus-galli var. crus-galli, Digitaria ciliaris among this species. Deulmuksae is the overwintering exotic weed which sprout in Autumn and wither in Spring and commonly growed as green manure crop or cover crop. In order to identify the infection rate furthermore, 111 samples which were collected at Buan Gyehwa-myeon region, and 50 samples from Seocheon Maseo-myeon in June, 2008, were ELISA tested. The results are 32 positives from Buan, 28.8% infection rate, 8 positives from Seocheon 16.0% infection rate. RSV infection of Deulmuksae is not reported currently, and follow report first describes the Deulmuksae as an alternate host of RSV.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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