• 제목/요약/키워드: pseudomonas

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유류 오염 토양으로부터 분리한 디젤 분해 세균 Pseudomonas sp. GENECO 1의 분리 및 특성 규명 (Isolation and Characterization of Diesel Oil Degrading Bacterium, Pseudomonas sp. GENECO 1 Isolated from Oil Contaminated Soil)

  • 이종광;김무훈;박형수
    • 미생물학회지
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    • 제39권2호
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    • pp.102-107
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    • 2003
  • 유류오염 토양으로부터 디젤에 대한 분해능이 있는 균주를 순수분리하였고, 이들 분리 균주의 액체 배양을통하여 균체 생육과 유화활성이 우수한 균주를 최종적으로 선별하였다. 생리,생화학적 특성 및 165 rDNA 염기서열 분석을 실시한 결과, Pseudomonas sp.로 분류 되었으며, Pseudomonas sp. GENECO 1으로 명명하였다. Bioscreen C를 이용하여 디젤 분해를 위한 배양 조건을 조사한 결과 최적 배양온도는 $30^{\circ}C$, 초기 pH는 7.0로 나타났다. Gas chromatography를 이용한 배양 시간별 잔류 디젤 성분분석 결과 96시간 이내에 1.0%의 디젤을 95%이상 분해하였다.

Enhanced Biological Control of Phytophthora Blight of Pepper by Biosurfactant-Producing Pseudomonas

  • Ozyilmaz, Umit;Benlioglu, Kemal
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제29권4호
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    • pp.418-426
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    • 2013
  • Pseudomonas isolates from different crop plants were screened for in vitro growth inhibition of Phytophthora capsici and production of biosurfactant. Two in vivo experiments were performed to determine the efficacy of selected Pseudomonas strains against Phytophthora blight of pepper by comparing two fungicide treatments [acibenzolar-S-methyl (ASM) and ASM + mefenoxam]. Bacterial isolates were applied by soil drenching ($1{\times}10^9$ cells/ml), ASM ($0.1{\mu}g$ a.i./ml) and ASM + mefenoxam (0.2 mg product/ml) were applied by foliar spraying, and P. capsici inoculum was incorporated into the pot soil three days after treatments. In the first experiment, four Pseudomonas strains resulted in significant reduction from 48.4 to 61.3% in Phytophthora blight severity. In the second experiment, bacterial treatments combining with olive oil (5 mL per plant) significantly enhanced biological control activity, resulting in a reduction of disease level ranging from 56.8 to 81.1%. ASM + mefenoxam was the most effective treatment while ASM alone was less effective in both bioassays. These results indicate that our Pseudomonas fluorescens strains (6L10, 6ba6 and 3ss9) that have biosurfactant-producing abilities are effective against P. capsici on pepper, and enhanced disease suppression could be achieved when they were used in combination with olive oil.

Colonizing Ability of Pseudomonas fluorescens 2112, Among Collections of 2,4-Diacetylphloroglucinol-Producing Pseudomonas fluorescens spp. in Pea Rhizosphere

  • Kim, Sang-Dal;Fuente, Leonardo De La;Weller, David M.;Thomashow, Linda S.
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제22권6호
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    • pp.763-770
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    • 2012
  • Pseudomonas fluorescens 2112, isolated in Korea as an indigenous antagonistic bacteria, can produce 2,4-diacetylphloroglucinol (2,4-DAPG) and the siderophore pyoveridin2112 for the control of phytophthora blight of red-pepper. P. fluorescens 2112 was classified into a new genotype C among the 17 genotypes of 2,4-DAPG producers, by phlD restriction fragment length polymorphism (RFLP). The colonizing ability of P. fluorescens 2112 in pea rhizosphere was equal to the well-known pea colonizers, P. fluorescens Q8r1 (genotype D) and MVP1-4 (genotype P), after 6 cycling cultivations for 18 weeks. Four tested 2,4-DAPG-producing Pseudomonas spp. could colonize with about a 96% dominance ratio against total bacteria in pea rhizosphere. The strain P. fluorescens 2112 was as good a colonizer as other Pseudomonas spp. genotypes in pea plant growth-promoting rhizobacteria.

Degradation of Trichloroethylene by a Growth-Arrested Pseudomonas putida

  • Hahm, Dae-Hyun
    • Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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    • 제3권1호
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    • pp.11-14
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    • 1998
  • A toluene-oxidizing strain of Pseudomanas mendocina KR1 containing toluene-4-mono-oxygenase (TMO) completely degrades TCE with the addition of toluene as a co-substrate in aerobic condition. In order to construct in situ bioremediation system for TCE degradation without any growth-stimulating nutrients or toxic inducer such as toluene, we used the carbon-starvation promoter of Pseudomonas putida MK1 (Kim, Y. et al., J. bacteriol., 1995). Upon entry into the stationary phase due to the deprivation of nutrients, this promoter is strongly induced without further cell growth. The TMO gene cluster (4.5 kb) was spliced downstream of the carbon starvation promoter of Pseudomonas putida MK1, already cloned in pUC19. TMO under the carbon starvation promoter was not expressed in E. coli cells either in stationary phase or exponential phase. For TMO expression in Pseudomonas strains, tmo and carbon starvation promoter region were recloned into a modified broad-host range vector pMMB67HES which was made from pMMB67HE(8.9 kb) by deletion of tac promoter and lacIq (about 1.5 kb). Indigo was produced by TMO under the carbon starvation promoter in a Pseudomonas strain of post-exponential phase on M9 (0.2% glucose and 1mM indole) or LB. 18% of TCE was degraded in 14 hours after entering the stationary phase at the initial concentration of 6.6 ${\mu}$M in liquid phase.

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Isolation of Phytase-Producing Pseudomonas sp. and Optimization of its Phytase Production

  • Kim, Young-Hoon;Gwon, Moon-Nam;Yang, Si-Yong;Park, Tae-Kyu;Kim, Chan-Gil;Kim, Chang-Won;Song, Min-Dong
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제12권2호
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    • pp.279-285
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    • 2002
  • Phytase (myo-inositol hexakisphosphate phospho-hydrolase, EC 3.1.3.8) catalyzes the hydrolysis of phytate (myo-inositol hexakisphosphate) to release inorganic phosphate. A bacterial strain producing phytase was isolated from soil around a cattle shed. To identify the strain, cellular fatty acids profiles, the GC contents, a quinine-type analysis, and physiological test using an API 20NE kit were carried out. The strain was identified to be a genus of Pseudomonas sp. and named as Pseudomonas sp. YH40. The optimum culture condition for the maximum productivity of phytase by Pseudomonas sp. YH40 were attained in a culture medium composed of $1.0\%$ (w/v) glycerol, $2.0\%$ (w/v) peptone, and $0.2\%$ (w/v) $FeSO_4{\cdot}7H_2O$. Within the optimal medium condition, the production of phytase became highest after 10 h of incubation, and the maximal phytase production by Pseudomonas sp. YH40 was observed at $37^{\circ}C$ and pH 6.0.

Pseudomonas mandelii의 lipase 유전자 클로닝, 발현 및 정제 (Cloning, Expression, and Purification of a Lipase from Psychrotrophic Pseudomonas mandelii)

  • 김준성;이창우
    • 생명과학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.306-311
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    • 2012
  • 내냉성 세균인 Pseudomonas mandelii로부터 lipase 유전자(lipT)를 클로닝하고 염기서열을 분석하였다. 열린해독틀 (open reading frame)은 1,686 bp로 구성되어 있고, 562개의 아미노산을 코딩한다. 서열분석 결과 많은 세린 효소에서 발견되는 Gly-X-Ser-X-Gly 모티프가 존재한다(Gly-His-Ser-Leu-Gly). 재조합 LipT 단백질은 대장균에서 주로 inclusion body 형태로 발현되었다. 니켈 친화성 크로마토그라피 방법으로 LipT 단백질을 분리하였으며 소량의 LipT 단백질이 refold 되었다. 이 효소는 p-nitrophenyl butyrate (C4)과 p-nitrophenyl octanoate (C8)에 대해 기질 특이성을 나타내었다.

수종의 식물생장촉진 근권세균이 암면과 코코피트경 오이의 생장에 미치는 영향 (Effects of Virious Plant Growth Promoting Rhizobacteria on the Growth of Hydroponically Grown Cucumber Plants in Rockwool and Cocopeat Culture)

  • 조자용;지연태;정순주
    • 한국유기농업학회지
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    • 제7권1호
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    • pp.105-113
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    • 1998
  • 수종의 근권세균이 양액재배 오이의 생장에 미치는 영향을 구명하기 위하여 Azospirillum sp., Rhodopseudomonas sp., Pseudomonas sp., Bacillus sp.와 Corynebacterium glutamicum간의 융합균주 등을 근권처리하였다. 융합균주의 근권처리후 4일에 세균의 밀도변화르르 보면 코코피트 > 암면 > 배양액 등의 순으로 나타났다. 균주의 근권처리에 따른 오이의 생장촉진효과는 암면경보다 코코피트경에서 더 높았으며, 균주의 종류별 오이의 생장촉진효과를 보면 Azospirillum sp. > 광합성세균 $\ge$ 융합균주 Pseudomonas sp. > 대조구 등의 순으로 나타났다.

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Pseudomonas sp. G314가 생산하는 생물 계면활성제의 특성 (Characteristics of Biosurfactant Produced by Pseudomonas sp. G314)

  • 심소희;박경량
    • 생명과학회지
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    • 제22권2호
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    • pp.239-244
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    • 2012
  • 대전일원의 유류오염 지역의 토양에서 분리된, 생물 계면활성제 생성능이 우수한 Pseudomonas sp. G314균주 [23]가 생산하는 생물 계면활성제의 특성을 조사하고 그 성분을 확인하였다. Pseudomonas sp. G314가 생산하는 생물 계면활성제는 상온에서 10일 보관 후에도 26.2 dyne/cm 정도의 표면장력을 유지해 냉장 보관한 계면활성제와 비슷하게 안정하였고, 5 l 발효조를 이용한 배양에서 회분배양의 25 dyne/cm 보다는 약간 높은 27 dyne/cm 정도의 계면활성제를 생산해 대량 배양 할 수 있음을 확인하였다. 또 이 계면활성제는 acetone과 methanol에 잘용해 되고 benzene과 toluene에 약하게 용해되어 glycolipid 계열의 생물계면활성제임이 추정되었고[23], 이를 silica gel column을 통해 용출하고, TLC로 전개하여 확인된 Rf 0.58인 spot이 bial's reagent와 rhodamine 6G에서 양성반응을 나타내 Pseudomonas sp. G314가 생산하는 생물 계면활성제는 탄수화물과 지질이 함유된 glycolipid 계열의 생물 계면활성제임을 확인하였다.

토마토 종자로부터 PCR을 이용한 Pseudomonas syringae pv. tomato의 검출 (Development and Evaluation of PCR-Based Detection for Pseudomonas syrinage pv. tomato in Tomato Seeds)

  • 조정희;임규옥;이혁인;예미지;차재순
    • 식물병연구
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    • 제17권3호
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    • pp.376-380
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    • 2011
  • P. syringae pv. tomato는 토마토에서 bacterial speck병을 일으키는 종자전염 세균으로, 감수성 품종에서 주로 발병하여 경제적으로 큰 손실을 입힌다. 따라서 P. syringae pv. tomato는 한국을 비롯한 많은 나라에서 식물 검역대상 세균으로 지정하여 관리되고 있다. 본 연구에서 우리는 토마토 종자로부터 PCR을 이용하여 Pst를 검출할 수 있는 방법을 개발하였다. P. syringae pv. tomato의 hrpZ 유전자에서 특이적인 프라이머를 개발하였다. 개발된 프라이머는 P. syringae pv. tomato에서만 501 bp 크기의 특이적 DNA를 증폭하였으며, P. syringae pv. glycinea, P. syringae pv. maculicola, P. syringae pv. atropurpurea, P. syringae pv. morsprunorum와 같은 다른 토마토 세균병원균과 P. syringae pathovar 균주들에서는 증폭되지 않았다. Nested PCR 프라이머를 이용한 PCR에서도 오직 P. syringae pv. tomato에서만 119 bp 크기의 특이적 DNA가 증폭되었고, 토마토 종자에서 P. syringae pv. tomato을 정확하고 민감하게 검출하였다. 본 연구는 현재까지 사용되고 있는 Pst의 검출방법의 민감도를 비교한 최초의 보고로 본 연구에서 개발된 PCR방법들은 토마토 종자에서 Pst을 검출하는 매우 유용한 방법으로 생각된다.

버섯 세균갈색무늬병균(Pseudomonas tolaasii)에 대한 길항세균 Pseudomonas azotoformans HC5의 대량배양을 위한 최적 배양조건 (Optimum cultivation conditions for mass production of antagonistic bacterium Pseudomonas azotoformans HC5 effective in antagonistic of brown blotch disease caused by Pseudomonas tolaasii)

  • 이찬중;문지원;유영미;한주연;정종천;공원식
    • 한국버섯학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.97-102
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    • 2015
  • 버섯 세균갈성색무늬병원균인 Pseudomonas tolaasii에 대한 길항미생물로 보고된 Pseudomonas azotoformans HC5 균주의 배양적 특성과 대량 배양을 위한 최적배양 조건을 설정하였다. HC5 균주의 생육온도는 $10{\sim}20^{\circ}C$, pH는 6.0~9.0의 범위에서 왕성한 생육을 보였다. 대량배양을 위한 효율적인 영양원 선발을 위하여 기본배지에 탄소원 fructose 등 18종, 무기질소원 $NH_4Cl$ 등 6종, 유기질소원 peptone 등 6종 그리고 아미노산 asparagine 등 11종을 각각 1%씩 첨가하였고, 무기염류 13종을 1 mM 농도로 첨가하여 각각에 대한 생육에 미치는 영향을 조사하였다. 또한 선발된 각각의 영양성분들에 대한 최적 농도를 조사하기 위하여 각각의 성분을 최소 0.1%에서 최대 4.0%까지 배지에 첨가하여 배양 후 생육정도를 조사하였다. 그 결과, 대량배양을 위한 생육최적조건은 온도 $15^{\circ}C$, pH 6, 탄소원 0.6% adonitol, 유기질소원 1.5% yeast extract, 무기질소원 0.8% $NH_4H_2PO_4$, 아미노산 0.2% asparagine 그리고 무기염류는 5 mM $MgSO_4$에서 왕성한 생육을 보였다.