Kim, Yu-Na;Khan, Muhammad Aaqil;Kang, Sang-Mo;Hamayun, Muhammad;Lee, In-Jung
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제30권10호
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pp.1500-1509
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2020
Drought is a major abiotic factor and has drastically reduced crop yield globally, thus damaging the agricultural industry. Drought stress decreases crop productivity by negatively affecting crop morphological, physiological, and biochemical factors. The use of drought tolerant bacteria improves agricultural productivity by counteracting the negative effects of drought stress on crops. In this study, we isolated bacteria from the rhizosphere of broccoli field located in Daehaw-myeon, Republic of Korea. Sixty bacterial isolates were screened for their growth-promoting capacity, in vitro abscisic acid (ABA), and sugar production activities. Among these, bacterial isolates YNA59 was selected based on their plant growth-promoting bacteria traits, ABA, and sugar production activities. Isolate YNA59 highly tolerated oxidative stress, including hydrogen peroxide (H2O2) and produces superoxide dismutase (SOD), catalase (CAT), and ascorbate peroxidase (APX) activities in the culture broth. YNA59 treatment on broccoli significantly enhanced plant growth attributes, chlorophyll content, and moisture content under drought stress conditions. Under drought stress, the endogenous levels of ABA, jasmonic acid (JA), and salicylic acid (SA) increased; however, inoculation of YNA59 markedly reduced ABA (877 ± 22 ng/g) and JA (169.36 ± 20.74 ng/g) content, while it enhanced SA levels (176.55 ± 9.58 ng/g). Antioxidant analysis showed that the bacterial isolate YNA59 inoculated into broccoli plants contained significantly higher levels of SOD, CAT, and APX, with a decrease in GPX levels. The bacterial isolate YNA59 was therefore identified as Variovorax sp. YNA59. Our current findings suggest that newly isolated drought tolerant rhizospheric Variovorax sp. YNA59 is a useful stress-evading rhizobacterium that improved drought-stress tolerance of broccoli and could be used as a bio-fertilizer under drought conditions.
Jiwon Kim;Seong-Ho Ahn;Ji Sun Yang;Seonwoo Choi;Ho Won Jung;Junhyun Jeon
The Plant Pathology Journal
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제39권5호
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pp.513-521
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2023
Seed-borne diseases reduce not only the seed germination and seedling growth but also seed quality, resulting in the significant yield loss in crop production. Plant seed harbors diverse microbes termed endophytes other than pathogens inside it. However, their roles and application to agricultures were rarely understood and explored to date. Recently, we had isolated from soybean seeds culturable endophytes exhibiting in-vitro antagonistic activities against common bacterial and fungal seed-borne pathogens. In this study, we evaluated effects of seed treatment with endophytes on plant growth and protection against the common seed-borne pathogens: four fungal pathogens (Cercospora sojina, C. kikuchii, Septoria glycines, Diaporthe eres) and two bacterial pathogens (Xanthomonas axonopodis pv. glycines, Pseudomonas syringae pv. tabaci). Our experiments showed that treatment of soybean seeds with seed endophytes clearly offer protection against seed-borne pathogens. We also found that some of the endophytes promote plant growth in addition to the disease suppression. Taken together, our results demonstrate agricultural potential of seed endophytes in crop protection.
비식량 바이오매스 대상작물인 억새의 생육을 촉진하는 균주를 선발하기 위하여 충북 청원군 대청호 주변에서 서식하는 물억새 뿌리로부터 64균주를 분리하였다. 분리균의 식물생육촉진 활성을 확인하기 위하여 옥신, 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid (ACC) deaminase 생선능 및 기타 배양조건에 따른 생육 특성을 조사한 결과, 8균주가 선발되었으며 Agrobacterium sp. BE516 균주가 억새 줄기의 생육을 2배 이상 증가시켜 가장 활성이 뛰어난 균주로 선발되었다. Agrobacterium sp. BE516 균주는 식물호르몬 indole acetic acid를 64 ${\mu}g/mL$ 생산하고, 염 및 건조 등의 환경 스트레스 저항성 ACC deaminase 를 생산하며, $4-15^{\circ}C$, pH 4.0 및 4% NaCl 농도에서 생육하였다. 따라서, Agrobacterium sp. BE516 균주가 간척지와 같은 조건불리지역에서 비식용 바이오매스 대상작물인 억새의 생육을 촉진시키기 위한 미생물비료제 개발에 유용한 균주임을 확인하였다.
Goes, Kelly Campos Guerra Pinheiro De;Fisher, Maria Luisa De Castro;Cattelan, Alexandre Jose;Nogueira, Marco Antonio;Carvalho, Claudio Guilherme Portela De;Oliveira, Andre Luiz Martinez De
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제22권4호
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pp.437-447
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2012
Natural and beneficial associations between plants and bacteria have demonstrated potential commercial application for several agricultural crops. The sunflower has acquired increasing importance in Brazilian agribusiness owing to its agronomic characteristics such as the tolerance to edaphoclimatic variations, resistance to pests and diseases, and adaptation to the implements commonly used for maize and soybean, as well as the versatility of the products and by-products obtained from its cultivation. A study of the cultivable bacteria associated with two sunflower cultivars, using classical microbiological methods, successfully obtained isolates from different plant tissues (roots, stems, florets, and rhizosphere). Out of 57 plant-growth-promoting isolates obtained, 45 were identified at the genus level and phylogenetically positioned based on 16S rRNA gene sequencing: 42 Bacillus (B. subtilis, B. cereus, B. thuringiensis, B. pumilus, B. megaterium, and Bacillus sp.) and 3 Methylobacterium komagatae. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis showed a broad diversity among the Bacillus isolates, which clustered into 2 groups with 75% similarity and 13 subgroups with 85% similarity, suggesting that the genetic distance correlated with the source of isolation. The isolates were also analyzed for certain growth-promoting activities. Auxin synthesis was widely distributed among the isolates, with values ranging from 93.34 to 1653.37 ${\mu}M$ auxin per ${\mu}g$ of protein. The phosphate solubilization index ranged from 1.25 to 3.89, and siderophore index varied from 1.15 to 5.25. From a total of 57 isolates, 3 showed an ability to biologically fix atmospheric nitrogen, and 7 showed antagonism against the pathogen Sclerotinia sclerotiorum. The results of biochemical characterization allowed identification of potential candidates for the development of biofertilizers targeted to the sunflower crop.
E. intermedium 60-2G possessing a strong ability to solubilize insoluble phosphate, has plant growth-promoting activity, induced systemic resistance activity against scab pathogen in cucumber, and antifungal activity against various phytopathogenic fungi. The phosphate solubilizing activity of 60-2G may be mainly accomplished by production of gluconic acid through a direct extracellular oxidation of glucose by glucose dehydrogenase that required a PQQ cofactor for its activation. A pqq gene cluster conferred Phosphate-solubilizing activity in E. coli DH5${\alpha}$ was cloned and sequenced. The 6,783 bP pqq sequence had six open reading frames (from A to F) and showed 50-95% homology to pqq genes from other bacteria. The E. coli strain expressing the pqq genes solubilized phosphate from hydroxyapatite after a pH drop to 4.0, which paralleled in time the secretion of gluconic acid. To study the role of PQQ in biocontrol traits of E. intermedium, PQQ mutants of 60-2G were constructed by marker exchangee mutagenesis. The PQQ mutants of E. intermedium were lost activities of solubilizing phosphate, growth inhibition of phytopathogenic fungi, and plant growth promotion. These findings suggest that PQQ plays an important role, possibly activation of certain enzymes, in several beneficial bacterial traits of E. intermedium by as yet an unknown mechanism.
Sharma, Sushil K.;Johri, Bhavdish Narayan;Ramesh, Aketi;Joshi, Om Prakash;Sai Prasad, S.V.
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제21권11호
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pp.1127-1142
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2011
The aim of this investigation was to select effective Pseudomonas sp. strains that can enhance the productivity of soybean-wheat cropping systems in Vertisols of Central India. Out of 13 strains of Pseudomonas species tested in vitro, only five strains displayed plant growth-promoting (PGP) properties. All the strains significantly increased soil enzyme activities, except acid phosphatase, total system productivity, and nutrient uptake in field evaluation; soil nutrient status was not significantly influenced. Available data indicated that six strains were better than the others. Principal component analysis (PCA) coupled cluster analysis of yield and nutrient data separated these strains into five distinct clusters with only two effective strains, GRP3 and HHRE81 in cluster IV. In spite of single cluster formation by strains GRP3 and HHRE81, they were diverse owing to greater intracluster distance (4.42) between each other. These results suggest that the GRP3 and HHRE81 strains may be used to increase the productivity efficiency of soybean-wheat cropping systems in Vertisols of Central India. Moreover, the PCA coupled cluster analysis tool may help in the selection of other such strains.
In vivo expression technology (IVET) has been developed to study bacterial gene expression in Salmonella typhimurium during host infection. The expression of selected genes by IVET has been elevated in vivo but not in vitro. The selected genes turned out to be important for bacterial virulence and/or pathogenicity. IVET depends on a synthetic operon with a promoterless transcriptional fusion between a selection marker gene and a reporter gene. The IVET approach has been successfully adapted in other bacterial pathogens and plant-associated bacteria using different selection markers. Pseudomonas putida suppresses citrus root rot caused by Phytophthora parasitica and enhances citrus seedling growth. The WET strategy was adapted based on a transcriptional fusion, pyrBC'-lacZ, in P. putida to study the bacterial traits important far biocontrol activities. Several genes appeared to be induced on P. parasitica hyphae and were found to be related with metabolism and regulation of gene expression. It is likely that the biocontrol strain took a metabolic advantage from the plant pathogenic fungus and then suppressed citrus root rot effectively. The result was parallel with those from the adaptation of IVET in P. fluorescens, a plant growth promoting rhizobacteria (PGPR). Interestingly, genes encoding components for type III secretion system have been identified as rhizosphere-induced genes in the PGPR strain. The type III secretion system may play a certain role during interaction with its counterpart plants. Application of IVET has been demonstrated in a wide range of bacteria. It is an important strategy to genetically understand complicated bacterial traits in the environment.
To screen the effective materials for hair loss treatment, several natural extracts were tested using in vivo and in vitro test models. Firstly, all test materials were applicated onto the back skin of C57BL/6 mouse and then hair growth pormoting effect were measured using hair growth index As a result, Polygonum muitifiorum Thunb and Terrninalia chebula Retz. showed potent hair growth promoting effect, ranking as 1.5-2.0 of hair growth index. However, there were no plant extracts, which have remarkable potential of growth promotion of human hair dermal papilla cells cultured in vitro. In the experiments of 5${\alpha}$-reductase type Ⅱ inhibition assay, Morus alba L., Chaenomelis Fructus, Saussureae Radix, Angelicae Gigantis Radix, Polygonum multifiorum Thunb, and Angelica dahurica (Fischer) Bentham et Hooker f. showed effective potential to inhibit the activity of 5${\alpha}$-reductase type Ⅱ. To investigate the possible involvement of effects of several plant extracts on the gene expression of growth factors in human hair dermal papilla cells, RT-PCR analyses were performed. As a consequences, Mentha haplocalyx Briq., Cimicifuga foetida L., Eclipta prostrata (L.) L., Pinus densiflora S. et. Z, and Polygonum muitifiorum Thunb revealed the regulatory roles on the expression of growth factors such as IGF-I, KGF, HGF and VEGF in the dermal papilla cells. Another test for inhibition of microbial such as P. acne and P. ovale were also carried out to find whether these plant extracts have anti-microbial activities. Morus alba L. and Chaenomelis Fructus showed anti-microbial effects on Propionibacterium acnes, which is believed as a pathogen of acne. Together, these results showed several plant extracts can be used for hair growth promotion.
Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol) and Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), are the causal agent of Fusarium wilt disease of tomato and banana, respectively, and cause significant yield losses worldwide. A cost-effective measure, such as biological control agents, was used as an alternative method to control these pathogens. Therefore, in this study, six isolates of the Streptomyces-like colony were isolated from soils and their antagonistic activity against phytopathogenic fungi and plant growth-promoting (PGP) activity were assessed. The results showed that these isolates could inhibit the mycelial growth of Fol and Foc. Among them, isolate STRM304 showed the highest percentage of mycelial growth reduction and broad-spectrum antagonistic activity against all tested fungi. In the pot experiment study, the culture filtrate of isolates STRM103 and STRM104 significantly decreased disease severity and symptoms in Fol inoculated plants. Similarly, the culture filtrate of the STRM304 isolate significantly reduced the severity of the disease and symptoms of the disease in Foc inoculated plants. The PGP activity test presents PGP activities, such as indole acetic acid production, phosphate solubilization, starch hydrolysis, lignin hydrolysis, and cellulase activity. Interestingly, the application of the culture filtrate from all isolates increased the percentage of tomato seed germination and stimulated the growth of tomato plants and banana seedlings, increasing the elongation of the shoot and the root and shoot and root weight compared to the control treatment. Therefore, the isolate STRM103 and STRM104, and STRM304 could be used as biocontrol and PGP agents for tomato and banana, respectively, in sustainable agriculture.
Application of rhizospheric fungi is an effective and environmentally friendly method of improving plant growth and controlling many plant diseases. The current study was aimed to identify phytohormone-producing fungi from soil, to understand their roles in sesame plant growth, and to control Fusarium disease. Three predominant fungi (PNF1, PNF2, and PNF3) isolated from the rhizospheric soil of peanut plants were screened for their growth-promoting efficiency on sesame seedlings. Among these isolates, PNF2 significantly increased the shoot length and fresh weight of seedlings compared with controls. Analysis of the fungal culture filtrate showed a higher concentration of indole acetic acid in PNF2 than in the other isolates. PNF2 was identified as Penicillium sp. on the basis of phylogenetic analysis of ITS sequence similarity. The in vitro biocontrol activity of Penicillium sp. against Fusarium sp. was exhibited by a 49% inhibition of mycelial growth in a dual culture bioassay and by hyphal injuries as observed by scanning electron microscopy. In addition, greenhouse experiments revealed that Fusarium inhibited growth in sesame plants by damaging lipid membranes and reducing protein content. Co-cultivation with Penicillium sp. mitigated Fusarium-induced oxidative stress in sesame plants by limiting membrane lipid peroxidation, and by increasing the protein concentration, levels of antioxidants such as total polyphenols, and peroxidase and polyphenoloxidase activities. Thus, our findings suggest that Penicillium sp. is a potent plant growth-promoting fungus that has the ability to ameliorate damage caused by Fusarium infection in sesame cultivation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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