잿빛곰팡이병의 전형적인 병징을 나타내는 병든 사과, 고추, 딸기, 오이, 토마토에서 곰팡이를 분리하고, 그들의 배양학적 특성과, 형태적 특성 및 PCR-RFLP을 통해 이 병원성 곰팡이를 모두 Botrytis cinerea로 동정하였다. 또한, 배양학적 특징에 따라 사과, 고추, 오이에서 분리한 잿빛곰팡이병균의 표현형은 균핵형이며, 딸기와 토마토에서 분리한 잿빛곰팡이병균은 균사형이었다. 각각의 잿빛곰팡이병균의 ITS 영역 염기서열을 포함한 4종의 유전자(RPB2, HSP60, G3PDH)의 염기서열을 결정하고 분자계통학적 유연관계를 분석하였다. RPB2 유전자 염기서열을 제외한 ITS 영역, HSP60유전자 및 G3PDH 유전자의 염기서열은 Botrytis cinerea 종 내 뿐만 아니라 Botrytis 속 종간에도 매우 높은 상동성을 나타내어 계통학적 유연관계 분석이 어려웠다. 하지만, 3종의 유전자(RPB2, HSP60, G3PDH)를 결합한 유전자 염기서열을 이용한 분자계통수 작성 결과, 본 연구에서 분리한 잿빛곰팡이병균은 Botrytis 속의 다른 종들과 구별되며, 사과, 고추, 오이, 토마토의 분리주는 아주 높은 근연관계에 있고, 딸기잿빛곰팡이병균은 다른 분리주와 달리 종내 다른 lineage를 형성하였다.
수중사진으로만 보고되었던 흑전갱이 (Carangonides ferdau)에 관해서 제주도 연안에서 채집된 표본 2개체를 근거로 하여 형태적 특징을 상세하게 기재하였다. 이 종의 특징은 제2 등지느러미 전반부가 길고, 몸에 7~8개의 가로줄 무늬가 있으며 문장이 눈의 지름과 거의 유사하다는 점이다. 그리고 흑전갱이는 제주도 주변해역에 분포하는 노랑점무늬유전갱이 (C. orthogroammus)와 형태적으로 매우 유사하지만 몸통에 있는 가로줄무늬로, 몸통에 노란 반점을 가지는 노랑점무늬유전갱이와 쉽게 구분된다. 한편, cytochrome b 염기서열을 이용하여 작성한 분자계통수에서 흑전갱이와 노랑점무늬유전갱이, 그리고 채찍유전갱이와 미늘전갱이가 각각 계통분류학적으로 가장 가깝게 묶여서 자매군을 형성하였으며, 이들의 염기서열 차이(p-distance)는 각각 8.2%를 나타내었다.
ISSR분자 마커를 이용하여 왕대속 대나무의 유연관계를 분석 실시하였다. 전세계적으로 왕대속에 속하는 4종은 경제학적, 생태학적으로 중요한 식물 자원중 하나이다. 총 11개의 ISSR 프라이머 중 9개의 프라이머에서 증폭이 일어 났으며 총 64개의 밴드를 확인 할 수 있었다. ISSR분석결과 왕대속 4종의 대나무에서 70.49%인 43개의 다형현상이 나타났다. 4개의 분류군으로 분류된 왕대속 대나무의 집단내 다양성(Hs)은 0.092,집단간 다양성(Gst)은 0.499로 나타났다. 각 종에 대한 유전자 유동(Nm)은 0.559로 나타났다. 따라서 왕대속에 속하는 4종의 유전자 유동(Nm)은 아주 낮음을 알 수 있었다 4종의 분류군에 대한 유전자 다양성(Ht)은 0.291로 낮게 나타났으며 ISSR 마커로 명확하게 그들은 분류가 되었다. 또한 왕대속의 4종은 단일계통임을 확인할 수 있었다.
왕대속은 벼과 또는 화본과에 속하는 다년생 목본성 초본이며 아시아의 인도와 중국에 많은 종이 주로 분포한다. 식물에서 속간 속내 계통관계 추론을 위해 널리 이용되고 있는 ITS 부위가 있다. 이 속에 속하는 우리나라 자생 식물 왕대 속내 네 식물종 간 계통 관계를 평가하기 위해 핵 게놈의 ITS 부위로 평가하였다. DNA 서열 배당은 많은 갭(gaps)을 가지고 있었다. 이 속 내 서열 변이는 일부 삽입과 결실이 발견되었고 속내 종간 변이는 자연도태에 의한 것으로 밝혀졌다. 이 속의 오죽과 분죽은 세 계통도(MP, ML, and NJ)에서 모두 같은 분지군을 형성하여 가장 근연관계에 있었다. 기존의 형태학적 특성과 단순 반복 서열(ISSR)의 결과와 유사한 계통 관계를 나타내어 왕대속에서 ITS의 서열이 이들 분류군에 매우 유익한 정보를 제공하고 있음을 시사하였다.
Background: Lumpy skin disease (LSD), a disease transmitted by direct and indirect contact with infected cattle, is caused by the Lumpy skin disease virus (LSDV). The disease affects cattle herds in Africa, Europe, and Asia. The clinical signs of LSD range from mild to the appearance of nodules and lesions in the skin leading to severe symptoms that are sometimes fatal with significant livestock economic losses. Objectives: This study aimed to characterize LSDV strains in the blood of infected cattle in Thailand based on the GPCR gene and determine the phylogenetic relationship of LSDV Thailand isolates with published sequences available in the database. Methods: In total, the blood samples of 120 cattle were collected from different farms in four provinces in the northeastern part of Thailand, and the occurrence of LSDV was examined by PCR based on the P32 antigen gene. The genetic diversity of LSDV based on the GPCR gene was analyzed. Results: Polymerase chain reaction assays based on the P32 antigen gene showed that 4.17% (5/120) were positive for LSDV. All positive blood samples were amplified successfully for the GPCR gene. Phylogenetic analysis showed that LSDV Thailand isolates clustered together with LSDVs from China and Russia. Conclusions: The LSD outbreak in Thailand was confirmed, and a phylogenetic tree was constructed to infer the branching pattern of the GPCR gene from the presence of LSDV in Thailand. This is the first report on the molecular characterization of LSDV in cattle in Thailand.
Paraphlomis koreana (Lamiaceae) was newly named and added to Korean flora in 2014. Paraphlomis belongs to the tribe Paraphlomideae, along with Ajugoides and Matsumurella. However, a recent study has suggested that P. koreana is morphologically similar to Matsumurella chinensis, making them difficult to distinguish from each other. Therefore, we aimed to examine the phylogenetic placement of P. koreana within the tribe and compare its genetic relationship with M. chinensis. We sequenced an additional complete plastid genome for an individual of P. koreana and generated sequences of nuclear ribosomal (nr) DNA regions of internal and external transcribed spacers (ITS and ETS) for two individuals of P. koreana. Maximum likelihood analyses based on two nrDNA regions (ITS and ETS) and four plastid DNA markers (rpl16 intron, rpl32-trnL, rps16 intron, and trnL-F) covering 13 Paraphlomis species and M. chinensis were conducted. Phylogenetic analyses concordantly supported that P. koreana forms a monophyletic group with M. chinensis. Moreover, our study revealed that P. koreana includes nrDNA sequences of M. chinensis as minor intra-individual variants, suggesting that the genetic divergence between the two taxa is incomplete and may represent intraspecific variation rather than distinct species. In conclusion, our findings suggest that the independent species status of P. koreana within Paraphlomis should be reconsidered.
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
/
제33권2호
/
pp.121-131
/
2016
Ten microsporidian isolates from Samia cynthia ricini, and Antheraea assamensis in India along with a Nosema reference strain (NIK-1s_mys) from B. mori India were characterised morphologically and molecular based tools. The test isolates observed elongated oval in shape while reference strain was oval and ranging from 3.80 to 4.90 m in length and 2.60 to 3.05 m in width. The ribosomal DNA region 'IGS' of test isolates assessed by PCR amplification, followed by cloning and sequencing. IGS sequence and phylogenetic analysis of test microsporidian isolates showed very close relationship with three Nosema references species: N. philosamia, N. antheraea isolated from Philosamia cynthia ricini and Antheraea perny in China respectively and N. disstriae from Malacosma disstriae in Canada. The clustering pattern of dendogram reveals all test isolates appear distinct from Nosema std. (NIK-1s_mys) India used as reference strain in the study. The result suggests IGS indeed a suitable and highly applicable molecular tool for identifying and characterise the microsporidian isolates in similar population.
유미류와 하등 무미류 정충의 미세구조를 비교하고 미세구조적 형질에 의한 계통적 관계를 고찰하였다. 대부분의 유미류 정충은 subacrosomal rod, endonuclear canal, perforatorium, ring, marginal filament, 꼬리의 구성과 꼬리의 주축이 axial rod인7가지 양서 류의 원시 공유형질(symplesiomorphies)을 나타내었다. 하등 무미류 정충은 marginalfilament가 없으며 subacrosomal rod와 ring의 구조는 단지 Ascaphus와 Discoglossus의 두 속에서만 각각 보고되었다. 이러한 미세구조적 형질은 유미류와 하등 무 미류의 원시 공유형질로 간주되며 두 분류군 사이의 계통적 연속성을 보여준다. 또한 정자 꼬리의 구성, endonuclear canal과 perforatorium의 형성에서도 매우 밀접한 계통적 관계를 보여주었다.
Soft coral Dendronephthya gigantea (Verrill, 1864) is a conspicuous species dominating shallow sea waters of Jejudo Island, Korea. Recently its whole mitochondrial genome sequencing was completed by us and the sequence information provided an opportunity to test the age of Octocorallia and time of evolutionary separation between some representative orders of the subclass Octocorallia. Molecular phylogenetic analyses based on 13 mitochondrial protein encoding genes revealed a polyphyletic relationship among octocorallians representing two orders (Alcyonacea and Gorgonacea) and four families (Alcyoniidae, Nephtheidae, Briareidae, and Gorgoniidae). Estimates of divergence times among octocorallians indicate that the first splitting might occur around end of or after Cretaceous period (50-79 million years ago (Ma)). The age is relatively young compared to the long history of stony sea corals (>240 Ma). Taken together our result suggests a possible relatively recent radiating evolution at least in the order Alcyonacea and Gorgonacea. Molecular dating and phylogenetic analysis based on much broader taxon sampling and many genes might give an insight into this interesting hypothesis.
rpoB DNAs (279 bp) from 34 species of 5 actinomycete genera were sequenced and a phylogenetic tree was constructed based on the sequences obtained. The genera were clearly differentiated in the rpoB tree, forming clades specific to their respective genus. In addition, 2 signature amino acid residues specific to Streptomyces were found in a multiple alignment of the deduced amino acid sequences. To empirically confirm that this rpoB gene analysis system could be used to differentiate actinomycete isolates, the proposed system was used to identify 16 actinomycete isolates from Jeju Island. All isolates were successfully differentiated into the genera Streptomyces and Micromonospora. Accordingly, this is the first report that an rpoB sequence analysis has been effectively used to differentiate actinomycete strains at the genus level.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.