• 제목/요약/키워드: mutant strain

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분열효모에서 mRNA Export와 관련된 rgm1 유전자의 유전학적 분석 (Genetic Analysis of Fission Yeast rsm1 Which is Involved in mRNA Export)

  • 강숙희;윤진호
    • 미생물학회지
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    • 제44권2호
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    • pp.98-104
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    • 2008
  • mRNA의 핵에서 세포질로의 이동(mRNA export)에 관여하는 것으로 여겨지는 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 rsm1 유전자의 역할을 알아보기 위해 $kan^{r}$ 유전자를 이용하여 결실돌연변이주(deletion mutant)를 제조하였다. rsm1 유전자는 생장에 필수 유전자는 아니지만, rsm1 결실돌연변이주는 야생형에 비해 생장이 조금 늦고 mRNA export도 약간의 결함을 보였다. rsm1 유전자와 mRNA export의 중요 유전자와의 연관관계를 알아보기 위해, 이중돌연변이주(double mutants)를 제작하여 생장결함 정도와 mRNA export 결함 정도를 조사하였다. 조사한 유전자들 중에서 mex67 또는 npp106 돌연변이 유전자는 rsm1 결실돌연변이 유전자와 함께 존재하면 생장과mRNA export가 더욱 악화되었다. 반면, thp1 돌연변이 유전자는 rsm1 결실돌연변이 유전자와 함께 존재하면 오히려 생장과 mRNA export 정도를 야생형과 유사한 정도로 호전시켰다. 이와 같은 결과들은 rsm1 유전자가 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 중요한 역할을 담당하고 있음을 시사한다.

Salmonella enterica serovars Enteritidis, Gallinarum 및 Typhimurium의 마우스 면역반응의 비교평가 (Comparative evaluation of the murine immune responses to Salmonella enterica serovars Enteritidis, Gallinarum and Typhimurium infection)

  • 김기주;김두리;선지선;박소연;조영재;고현정;주홍구;한태욱
    • 대한수의학회지
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    • 제53권2호
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    • pp.95-101
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    • 2013
  • The study was carried out to evaluate and compare the immune responses in mice experimentally infected with either wild-type or isogenic mutants of Salmonella enterica serovars Enteritidis (SE), Salmonella Typhimurium (ST) and Gallinarum (SG). The mutant strains were constructed by allelic replacement of some virulence-associated genes in the wild-type strains. Seven-week-old female BALB/c mice were orally or intraperitoneally inoculated by injecting bacterial suspension. To evaluate the immune responses, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and enzyme-linked immunospot (ELISPOT) assay were conducted with serum and fecal samples. As a result, the mice group infected orally with the SE mutant strain showed the highest level of specific IgA-secreting splenocytes, compared to the other groups. The peritoneally injected groups showed the greater levels of IgG1 than the orally injected groups, which was in a good agreement with the previous studies. In addition, the mutant infected groups had the similar secretion levels of antibodies with the wild-type infected groups. These results demonstrated that the SE mutant strain elicited humoral immune response as much as wild-type, implying that it can be useful as a delivery vehicle as well as a candidate of a live attenuated vaccine.

Trichoderma reesei QM 9414의 섬유소 분해 호소 생산을 위한 조절변이주의 분리 및 특성에 관한 연구 (Isolation and Characterization of Regulatory Mutant for Cellulase Production from Trichoderma reesei QM 9414)

  • 최건호;구윤모;소재성
    • 한국균학회지
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    • 제26권1호통권84호
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    • pp.127-133
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    • 1998
  • Trichoderma reesei QM 9414를 N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine으로 처리하여 얻은 돌연변이주들을 여러 탄소원에서 배양했을 때 carboxymethylcellulose(CMC), fiter paper 등의 기질에 대한 활성측정결과 다음과 같은 결과를 얻었다. 모균주가 catabolite repression을 받는 반면에 돌연변이주들의 cellulase 활성은 glucose를 탄소원으로 사용한 배지에서 모균주에 비해 CMCase 8.4배, FPase가 $5.4{\sim}5.7$배 증가함으로써 glucose-derepression성질을 갖는 돌연변이주들을 얻었으며 glucose를 탄소원으로 사용하고 lactose로 효소의 생산을 유도시켜본 결과 모균주에 비해 효소의 생산에 안정성을 갖는 것으로 나타났으며 돌연변이주 1이 상대적으로 더 우수한 돌연변이주로 나타났다. 돌연변이주들에 의해 생산된 효소는 모균주와 마찬가지로 pH 4.8, $60^{\circ}C$에서 최적활성을 나타내었다.

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A Human Fungal Pathogen Cryptococcus neoformans Expresses Three Distinct Iron Permease Homologs

  • Han, Kyunghwan;Do, Eunsoo;Jung, Won Hee
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제22권12호
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    • pp.1644-1652
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    • 2012
  • Iron plays a key role in host-pathogen interactions. Microbial pathogens require iron for survival and virulence, whereas mammalian hosts sequester and withhold iron as a means of nutritional immunity. We previously identified two paralogous genes, CFT1 and CFT2, which encode homologs of a fungal iron permease, Cft1 and Cft2, respectively, in the human fungal pathogen Cryptococcus neoformans. Cft1 was shown to play a role in the high-affinity reductive iron uptake system, and was required for transferrin utilization and full virulence in mammalian hosts. However, no role of Cft2 has been suggested yet. Here, we identified the third gene, CFT3, that produces an additional fungal iron permease homolog in C. neoformans, and we also generated the cft3 mutant for functional characterization. We aimed to reveal distinct functions of Cft1, Cft2 and Cft3 by analyzing phenotypes of the mutants lacking CFT1, CFT2 and CFT3, respectively. The endogenous promoter of CFT1, CFT2 and CFT3 was replaced with the inducible GAL7 promoter in the wild-type strain or in the cft1 mutant for gain-of-function analysis. Using these strains, we were able to find that CFT2 is required for growth in low-iron conditions in the absence of CFT1 and that overexpression of CFT2 compensates for deficiency of the cft1 mutant in iron uptake and various cellular stress conditions. However, unlike CFT2, no clear phenotypic characteristic of the cft3 mutant and the strain overexpressing CFT3 was observed. Overall, our data suggested a redundant role of Cft2 in the high-affinity iron uptake and stress responses in C. neoformans.

고온내성 연료용 알코올 효모균주 Saccharomyces cerevisiae KNU5377에서 HSF1 유전자의 변이주 구축 (Construction of hsf1 Knockout-mutant of a Thermotolerant Yeast Strain Saccharomyces cerevisiae KNU5377)

  • 김일섭;윤혜선;최혜진;손호용;유춘발;김종국;진익렬
    • 생명과학회지
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    • 제16권3호
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    • pp.454-458
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    • 2006
  • 출아효모인 Sacharomyces cerevisiae S288C균주를 이용한 효모의 게놈이 완성된 후 S. cerevisiae는 다양한 연구 모델로 이용되어져 왔다. 현재까지 효모를 이용한 기능 유전체학 측면에서의 연구는 laboratory strainin인 S288C 균주 또는 그 유래의 균주들이다. 그러나 자연에서 분리된 효모 또는 산업적으로 이용되어지고 있는 S. cerevisiae의 유전학 측면에서의 연구는 낮은 포자형성률 및 형질전환률, 그리고 S288C 균주와의 게놈상의 상이성 때문에 거의 이루어지지 않고 있다. 여기서 우리 연구진은 자연에서 분리된 Saccharomyces cerevisiae KNU5377 균주를 이용하여 random spore analysis를 통해 MATa 및 $MAT{\alpha}$ 타입의 각각의 haploid cell을 분리 후 이미 보고된 KanMX module를 가지고 round PCR기법에 의한 short flanking homology 기법을 이용하여 전사조절인자인 HSF1 유전자가 치환된 변이주를 구축할 수 있었다. 덧붙여, 모든 유전자에 이 기법을 적용할 수는 없다는 것을 확인하였다. 앞으로 이 변이주를 통해 기능 유전체학적인 측면에서 이 유전자의 스트레스와의 관련성을 연구하고자 한다.

Bacillus subtilis ATP 조해(阻害) Ribonuclease에 관한 연구 (ATP-Inhibited Ribonuclease of Bacillus subtilis)

  • 이택수
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제18권3호
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    • pp.167-176
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    • 1975
  • ATP-저해 ribonuclease는 Bacillus subtilis와 같은 Bacillus속에서만 발견 되는 것으로서 이들 효소의 생리적 역활을 규명할 목적으로 Bacillus subtilis 균주를 사용하여 ATP저해성 negative ribonuclease변이주의 취득을 시도하고 선정된 균주가 생산하는 ribonuclease의 정제 및 몇 가지 성질에 대하여 실험한 결과는 아래와 같다. 1. Bacillus subtilis로 부터 ATP-저해 ribonuclease negative mutant의 취득을 시도한 결과 시험된 1817주의 균중에서 101균주가 변이주주로 선정 되었다. 2. 수개의 개별적인 column chromatography에 의하여 당균주가 생산하는 ATP-저해성 ribonuclease의 정제를 시도한 결과 DEAE-Sephadex A-50 column chromatography을 이용한 경우는 30배의 정제 효과와 99%의 회수율을 나타냈고 Sephadex G-75 column의 경우는 20배의 정제 효과와 98%의 회수율을 각각 나타냈다. 3. pH 5침전, 유안염석, Sephadex G-75 및 CM Sephadex를 연속적으로 통과시켜 당효소에 대한대량정제 시험을 시도한 결과 최초의 step(crude extract) 과정에 비하여 60배의 정제효과를 나타냈다. 4. 본정제 효소액에 대하여 전기영동을 실시한 결과 비정제 효소액에 비하여 매우 감소된 수의 담백 pattern을 나타냈다. 5. 당균주가 생산하는 ATP저헤 ribonuclease는 single stranded RNA를 분해하여 2',3'-cyclic AMP, 2',3'-cyclic CMP, 2',3'-cyclic GMP, 2',3'-cyclic UMP와 몇종의 미지물을 생성하였고 또한 본효소는 double stranded RNA를 분해하지 않었다.

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A NOVEL PHOTOHETEROTROPHIC MUTANT FOR psaB GENE OF Synechocystis sp. PCC 6803 GENERATED FROM TARGETED MUTAGENESIS

  • Kim, Soohyun;Kim, Seung-Il;Choi, Jong-Soon;Chung, Young-Ho;Chun, Soon-Bai;Park, Young-Mok
    • Journal of Photoscience
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    • 제3권1호
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    • pp.23-28
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    • 1996
  • To investigate the structure and function of photosystem I, cartridge mutagenesis technique was used to inactivate the psaB gene of photosystem I. From the screen, many strains which have potential defects in photosystem I were generated. Biochemical analysis revealed that B2, one of the mutant, had a reduced amount of chlorophyll. Electron transfer activitx from photosystem II to photosystem I as oxygen uptake was the rate of 64 % of wild type. Also B2 showed a decreased photosystem I activity when measured by 77 K fluorescence emission spectrum. Particularly, immunodetection analysis showed that the B2 had reduced amount of PsaA/PsaB, but a normal range of PsaC and PsaD. Here we present a photoheterotrophic mutant for psaB gene as a unique model strain for future study of structural/functional relationship and biogenesis of photosystem I.

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Tetraacctylphytospingosinc (TAPS) 생산을 위한 Pichia ciferrii의 균주 개량과 TAPS 생산에 대한 sodium acetate의 영향

  • 홍성갑;유연우
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2001년도 추계학술발표대회
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    • pp.370-373
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    • 2001
  • Ultroviolet과 NTG 처리를 통한 mutagenesis를 통해 TAPS 생산균주인 Pichia ciferrii ATCC 14091로부터 많은 mutant들을 얻었으나 Sudan Black B 염색법과 콜로니 형태 관찰을 통하며 TAPS 생산이 우수한 변이균주를 선별하였다. 또한 sodium acetate 첨가를 통하여 TAPS 생산을 향상시켰다. 이는 TAPS가 포화중성 지방산인 palmitate와 serine의 축합반응으로 생성되며, sodium acetate로 부터 생성된 acetyl-CoA에 의해 아세틸화되어 세포 밖으로 분비되기 때문이다.

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Cephalosporin C 생물전환을 위한 Trigonopsis variabilis (ATCC10679) 변이균주의 간편한 선별 및 D-amino acid oxidase 유전자 배열 (Rapid Screening of Mutant Strains of Trigonopsis variabilis (ATCC10679) for Cephalosporin C Bioconversion and Sequences of D-amino acid oxidase Genes)

  • 강용호;박선영
    • KSBB Journal
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    • 제14권2호
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    • pp.235-240
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    • 1999
  • Trigonopsis variabilis ATCC10679 (TW)의 변이균주를 선별하기 위하여 쉽고 간편한 균주 선별방법을 개발하였다. 변이 균주(T26)의 D-Amino acid oxidase (D-AAO)는 야생균주(TW)의 D-AAO 효소보다 cephalosporin C에 대한 기질특이성이 약 30% 높았다. 이들 두 균주에서 D-AAO 유전자를 클로닝하여 각 유전자를 비교해본 결과 811번 우치의 T가 C로 변경되었으며 이에 따른 아미노산은 Phe-258이 Ser-258로 바뀌었다.

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Overproduction of Cellulose in Acetobacter xylinum KCCM 10100 Defective in GDP-Mannosyltransferase

  • Park Sang-Tae;Kim Eung-Bin;Kim Young-Min
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제16권6호
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    • pp.961-964
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    • 2006
  • GDP-mannosyltransferase (GMT) is an enzyme responsible for the addition of a mannose to glucose ($\alpha$[1$\rightarrow$3]) during biosynthesis of the water-soluble branched polysaccharide acetan in Acefobacter species. In an effort to obtain a cellulose-overproducing bacterium, a mutant defective in GMT of Acetobacter xylinum KCCM 10100 was constructed by single crossover homologous recombination using part of the aceA gene encoding GMT amplified by polymerase chain reaction. The GMT-disrupted mutant produced 23% more cellulose, but 16% less water-soluble polysaccharide than those of the wild-type strain. Analysis of the sugar composition by gel permeation chromatography revealed that water-soluble polysaccharides produced by the GMT-defective mutant contained no mannose molecule.