• Genomics & Informatics
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• 제14권4호
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• pp.255-264
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• 2016

The plethora of genome sequence information of bacteria in recent times has ushered in many novel strategies for antibacterial drug discovery and facilitated medical science to take up the challenge of the increasing resistance of pathogenic bacteria to current antibiotics. In this study, we adopted subtractive genomics approach to analyze the whole genome sequence of the Fusobacterium nucleatum, a human oral pathogen having association with colorectal cancer. Our study divulged 1,499 proteins of F. nucleatum, which have no homolog's in human genome. These proteins were subjected to screening further by using the Database of Essential Genes (DEG) that resulted in the identification of 32 vitally important proteins for the bacterium. Subsequent analysis of the identified pivotal proteins, using the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) Automated Annotation Server (KAAS) resulted in sorting 3 key enzymes of F. nucleatum that may be good candidates as potential drug targets, since they are unique for the bacterium and absent in humans. In addition, we have demonstrated the three dimensional structure of these three proteins. Finally, determination of ligand binding sites of the 2 key proteins as well as screening for functional inhibitors that best fitted with the ligands sites were conducted to discover effective novel therapeutic compounds against F. nucleatum.

• 미생물학회지
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• 제45권2호
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• pp.177-184
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• 2009

우수한 생균제를 개발하기 위하여 안전성이 알려진 유산균을 대상으로 인체의 분변으로부터 300여 균주를 분리하고 내산성, 내담즙성, 내열성, 항균력, 항암 및 항바이러스 효과를 가지는 균주들을 선발하여 생균제 특성을 나타내는지를 알아보기 위해 본 실험을 수행하였다. 인체에서 분리한 여러 균주 중 Miny-148 균주는 낮은 pH 및 높은 담즙산에 대한 내성, 열처리에 대한 열안정성을 지녀 기초적인 probiotic 특성을 가진 균주로 선발되어, Lactobacillus pentosus (99.9% 상동성)로 동정되었다. 항균력 실험에서 Escherichia coli O157:H7을 비롯한 Shigella flexneri, Bacillus anthracis, Staphylococcus aureus, E. coli, Vibrio cholerae, V. vulnificus, Salmonella typhimurium, 그리고 및 methicillin-resistant S. aureus (MRSA) 균주 8종 등 총 16종의 병원성세균을 억제하였다. 또한 Miny-148은 결장암 세포인 HT-29 cell을 억제하였을 뿐 아니라, transmissible gastroenteritis virus의 생육을 저해하여 세포변성 억제효과를 가진 우수한 probiotic 특성을 지닌 균주로 분석되었다.

• 생명과학회지
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• 제19권5호
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• pp.633-638
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• 2009

저온 진공 공정으로 건조된 참치를 유기용매로 추출하여 이들 참치 추출물 및 분획물들에 의한 인체 결장암 및 섬유육종세포에 대한 증식 및 세포 내 활성산소종 억제 효과에 대해 검토하였다. 건조 참치의 A+M 추출물과 MeOH 추출물을 0.5, 1, 및 5 mg/ml의 농도로 인체 섬유육종세포(HT1080)에 처리했을 때 농도 의존적으로 인체 암세포 증식을 억제시켰으며(p<0.05), 특히 A+M 추출물이 MeOH 추출물에 비하여 그 억제효과가 우수하였다. 건조 참치 추출물로부터 얻어진 분획물들의 경우 특히 hexane과 85% aq. MeOH 분획물들에 의한 암세포 증식 억제효과가 높았다. 인체 결장암세포(HT-29)에 대한 결과로 A+M 추출물은 인체 섬유육종세포(HT1080)의 결과와 비교했을 때 다소 암세포 증식 억제 효과가 낮았으나 5 mg/ml의 첨가농도에서 95%로 암세포 증식 억제효과를 보였고(p<0.05), MeOH 추출물도 앞서 A+M 추출물 결과와 유사하게 인체 섬유육종세포(HT1080)에 비해 낮은 암세포 성장 억제효과를 보였지만, 첨가농도 5 mg/ml에서는 93%로 높은 암세포 증식 억제효과를 나타내었다(p<0.05). 건조 참치 분획물들의 경우도 앞서의 인체 섬유육종세포(HT1080)와 유사하게 모든 분획물들에서 농도 의존적으로 억제효과가 높은 것을 살펴 볼 수가 있었고, 인체 결장암세포(HT-29)에서도 hexane과 85% aq. MeOH 분획물에 의한 항암효과가 우수하였다. In vitro 항산화실험에서 건조 참치 A+M 추출물 및 MeOH 추출물을 농도별로 인체 섬유육종세포(HT1080)에 처리하였을 때 A+M 추출물(10 mg/ml 농도)를 제외하고 측정기간 120분 동안 모든 추출물들이 blank군과 control군에 비해 세포 내 활성산소종을 크게 감소시켰다. 건조 참치 분획물들 중 BuOH 및 85% aq. MeOH 분획물들은 세포내 활성산소종을 크게 감소시키는 우수한 항산화 효과를 나타내었다.

• 대한핵의학회지
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• 제22권1호
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• pp.83-92
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• 1988

The cocktails of two $^{131}I$ labeled Monoclonal antibody (MCAB) (Anti CA 19-9 F$(ab')_2$ + Anti CEA $F(ab')_2$ fragment), which react specially, with human gastrointestinal cancers, were administered to 10 patients with colorectal (7), stomach(2) and pancreas(1) cancer for scintigraphic detection. All patients were known or postoperatively recurrent cases, and serum tumor markers, CA 19-9 and CEA, were measured with immunoradiometric assay, just before immunoscintigraphy (ISG). The tumor marker's level in serum is not correlated with positive tumor uptake in ISG. The sensitivity and specificity of ISG in detection of 21 tumor sites, based on surgery, CT, ultrasonography and pathology, were 90.5% and 100% One case of colon cancer showed gall bladder metastasis, which was neglected on CT study. Tumor/non tumor uptake ratio of radiolabelled antibody were progressively increased from day 3 to day 7 during study. We summerized as follows 1) The use of cocktails of CEA and CA 19-9 MCAB $F(at')_2$ increased sensitivity and specificity in ISG. 2) Delayed imaging (later than 5 days) increases sensitivitv and specificity due to exclusion of nonspecific iodine accumulation in stomach and lung. 3) Second tracer technique is essential for anatomical landmark by use of a double isotope scan, but subtraction technique, a possible source of artifacts, is no longer necessory when delayed imaging is performed. 4) It may be possible to use two MCAB cocktails of CA 19-9 and CEA in Radioimmunodetection of stomach and pancreas cancer. In conclusion, ISG using MCAB cocktails, $F(ab')_2$ fragment of anti CA 19-9 and Anti CEA, provide additional opportunity for tumor localization and detection of colorectal and other G-I cancer, such as stomach and pancreas.

• 한국환경성돌연변이발암원학회지
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• 제22권2호
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• pp.65-69
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• 2002

To elucidate the effect of microsphere coinjection on the administration of oligodeoxynucleotides (ODN), we have investigated biodistribution of ［S-35］-labeled antisense ODN targeted to cAMP-dependent protein kinase (PKA) RI-$\alpha$ subunit in nude mice xenografted with WiDr (human colon cancer, ATCC CCL218). The strategy of using microsphere has been proposed for cancer treatment as a carrier of therapeutic ODN so that it could offer an advantage with respect to maintaining constant ODN levels in blood and obtaining higher therapeutic ODN concentration at tumor sites. Comparative biodistribution studies were performed in nude mice (female, 20 g of body weight, n = 4-6) xenografted with WiDr cancer cells, when 0.1 $\mu$Ci (specific activity, 2.94 mCi/$\mu$mole) of ［S-35］-labeled RI-$\alpha$ antisense ODN was injected alone or with microsphere (PLG-18, polylactic copolymer with cationic surfactant DDAB18). Peak tumor uptake of ［S-35］-labeled ODN was significantly increased from 17.7% (at 6 h) of injected dose per gram of tissue (ID/g) to 42.5% (at 24 h) ID/g when microsphere was coinjected with ODN. The different biodistribution in the kidney accumulation (e.g., 100.2% ID/g for ODN alone and 54.9%/ID/g for microshpere coinjection) may contribute to higher blood concentration (e.g., 21.5%ID/$m\ell$ for ODN alone and 37.5%ID/$m\ell$ for microsphere coinjection) of radiolabeled ODN. Of importance is the fact that the whole body retention of radioactivity increased with microsphere coinjection from 50.8%ID/g to 68.0%ID/g after 24-h of injection. This decreased kidney accumulation and increased whole body retention of ［S-35］-labeled ODN resulted in a significant improvement of ODN targeting to the tumor site. In conclusion, the coinjection of microsphere appears to be an important carrier system in vehiculation of antisense oligonucleotide to the tumor tissue in vivo.

• 한국식품영양과학회지
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• 제42권7호
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• pp.1022-1028
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• 2013

러시아에서 여러 민간요법으로 사용되어지고 있는 차가버섯은 대장암, 위암 등에서 항암효능이 있다고 알려져 있다. 그러나 뇌종양에 대한 연구는 현재 이루어지지 않고 있으며 차가버섯의 항암 효능에 대한 기전 연구도 미미한 실정이다. 따라서 본 연구에서는 신경교모세포종 U-87 MG 세포주에 대한 성장억제 효과를 확인하고자 세포생존율 변화와 형태학적 변화, 세포주기에 미치는 영향과 세포사멸 관련 단백질 및 세포주기 조절 단백질의 발현 변화를 조사하였다. 그 결과 차가버섯 추출물을 처리한 U-87 MG 세포 생존율이 유의하게 감소하였으며, Bcl-2, Bax와 p-p53 단백질 수준차이는 없었고 caspase-3 활성에 영향을 미쳐 죽음 수용체 경로에 의한 세포사멸이 이루어졌다. 또한 세포주기를 관찰한 결과 $G_0/G_1$ 세포주기에서 성장 억제를 확인하였으며, 이는 cyclin D1, CDK2 단백질 발현량의 감소와 RB 단백질의 인산화 억제 때문이라는 결론에 도달하였다. 본 연구결과는 차가버섯을 뇌종양의 치료 및 보조제로서 역할을 수행할 수 있을 것으로 사료된다.

• Journal of Ginseng Research
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• 제44권2호
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• pp.282-290
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• 2020

Background: Ginseng is a commonly used herbal medicine in treating various medical conditions. Chronic gut inflammation is a recognized factor for the development of colorectal cancer (CRC). In this project, Asian ginseng berry polysaccharide preparations were used to assess their effects on CRC and related immune regulation mechanisms. Methods: Ginseng berry polysaccharide extract (GBPE) and purified ginseng berry polysaccharide portion (GBPP) were used to evaluate their activities on human HCT-116 and HT-29 CRC cell proliferation. Interleukin-8 secretion analysis was performed on HT-29 cells. Naive CD4 cell isolation and T-helper cell differentiation were performed and determined using flow cytometry for Th1 and Treg in addition to cell cycle and apoptotic investigation. Results: GBPE and GBPP significantly inhibited interleukin-8 secretion and cancer cell proliferation, inhibited CD4⁺IFN-γ⁺ cell (Th1) differentiation, and decreased CD4⁺FoxP3⁺ cell (Treg) differentiation. Compared to the GBPE, GBPP showed more potent antiinflammatory activities on the malignant cells. This is consistent with the observation that GBPP can also inhibit Th1-cell differentiation better, suggesting that it has an important role in antiinflammation, whereas Treg cells hinder the body's immune response against malignancies. Supported by cell cycle and apoptosis data, GBPE and GBPP, at various degrees, remarkably enhanced the anticancer activities of 5-fluorouracil. Conclusion: Data from this project suggested that Asian ginseng berry potentially has clinical utility in managing enteric inflammation and suppressing CRC through immunomodulation mechanisms.

• 한국식품과학회지
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• 제34권3호
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• pp.505-509
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• 2002

천마의 methanol 추출물로부터 VHR DS-PTPase 저해 물질을 분리하여 이를 HREI-MS와 $^1H-NMR$, $^{13}C-NMR$, DEPT 등의 기기 분석 자료에 의하여 baicalein으로 구조를 동정 하였다. 이 물질은 VHR에 대하여 $2.4{\mu}M$의 $IC_{50}$값을 나타내었고 T-cell PTPase나 PPase 1과 같은 다른 단백질 탈인산화 효소에 대하여는 저해 활성을 나타내지 않았다. 또한 7종류의 인간 암세포주(흑색종 세포주인 LOX-IMVI, 폐암 세포주인 NCI H23과 A549, 대장암 세포주인 HCT 116와 SW 620, 전립선암 세포주인 PC-3와 백혈병 세포주인 MOLT 4F)에 대한 세포독성을 조사하여 본 결과 $5.26{\sim}12.93\;{\mu}g/mL$에서 $GI_{50}$값을 나타내었다.

• 미생물학회지
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• 제42권4호
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• pp.319-325
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• 2006

칡을 첨가하여 배양한 아가리쿠스버섯(Agaricus blaxei Murill)으로 부터 열수추출, gel filtration chromatography, DEAE ion exchange chromatography를 통하여 아가리쿠스 $\beta$-glucan (AG)을 추출하였다. 추출한 아가리쿠스 $\beta$-glucan에 Bacillus megaterium 유래의 endo-$\beta$-(1$\rightarrow$6)-glucanase를 처리하여 올리고당류(AO)를 얻었다. 이렇게 얻은 AG와 AO를 이용하여 HT-29 인체 대장암 세포에 대한 항암 활성을 조사한 결과, 암세포의 성장 억제 효과는 시료의 처리 농도에 의존적으로 증가하였으며, apoptosis assay에서 암세포의 apoptosis 유발이 농도에 의존적으로 증가되었다. 또한, 암세포의 세포 주기를 분석한 결과, apoptosis 발생을 뜻하는 G0 (sub-G1)기와 G1기의 비율이 증가한 반면 S기와 G2/M기는 대조군에 비해 감소되었다. 이러한 결과를 바탕으로 암세포의 apoptosis 증가에 대한 AO의 작용이 어떤 유전자와 연관이 있는지를 알아보기 위하여 cDNA microarray를 통해 유전자의 발현율을 검색한 결과, apoptosis의 내부 외부 경로에 영향을 주는 유전자(TNESE9, TNFRSF9, FADD, CASP8, BAD, CRADD, CASP9 등)의 발현이 증가되었고 세포 분열 주기의 진행과 관련된 유전자(CCND2와 CDK2)의 발현이 감소되었으며, 세포 분열 주기를 지체시키는 유전자 (CDKN2A)의 발현은 증가되었다. 또한, 사이토카인을 암호하는 유전자 (IL6, IL18, IL6R 등)와 tumor suppressor와 관련된 유전자 (CEACAM1, TP53BP2, IRF1및 PHB)의 발현이 2배 이상 증가된 것을 확인할 수 있었다. 따라서 HT-29 인체 대장암세포에 대한 AO의 성장 억제 작용은 G0/Gl기를 지체시켜 암세포 증식을 억제하고 apoptosis에 의해 암세포를 사멸시키는 항암 활성을 나타내는 것으로 확인되었으며, 특허 AO가 AG보다 현저한 활성을 보였다. 더 나아가 아가리쿠스 $\beta$-glucan (AG)과 올리고당류 (AO)는 항암 활성을 가진 대체 의약 소재로 개발될 수 있을 것으로 기대된다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제49권3호
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• pp.227-232
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• 2006

미더덕(Styela clava)은 척색동물문 미색동물아문에 속하는 해양생물로서, 독특한 향과 맛으로 인해 식품에 널리 이용되고 있다. 본 연구에서는 미더덕의 생리활성물질로의 활용가능성을 탐색하고자 미더덕을 전체, 살 및 껍질 부분으로 나누어 아세톤으로 추출한 뒤 산화적 DNA 손상억제 및 항암 활성을 측정하였다. 미더덕 각 부위 추출물을 5, 10, $50\;{\mu}g/ml$의 농도로 백혈구에 처리한 후 200\;{\mu}M의 $H_2O_2$로 산화적 스트레스를 유발하여 DNA 손상 억제 정도를 검증하기 위해 comet assay를 실시하였다. 미더덕 전체 추출물을 5, 10, $50\;{\mu}g/ml$의 농도로 백혈구에 처리했을 때 손상된 DNA tail 부분의 DNA 함량을 측정한 % fluorescence in tail이 26.9, 27.0, 23.8%로 63.9%인 $H_2O_2$ 처리 양성대조구에 비해 유의적으로 감소하였으며 미더덕살 추출물의 경우, 5, 10, $50\;{\mu}g/ml$ 처리시 농도에 의한 효과 차이는 볼 수 없었지만 양성대조구에 비해 유의적으로 DNA 손상정도가 감소하였다. 미더덕 껍질 추출물의 경우 같은 농도로 처리했을 때 각각 농도 의존적이며 유의적으로 DNA 손상정도가 감소하였다. 인간 대장암 유래의 세포주 HT-29의 성장억제 효과에 조사하기 위해 미더덕 부위별 아세톤 추출물을 10, 50, 100, $500\;{\mu}g/ml$의 농도로 각각 처리한 뒤 MTT reduction assay 방법으로 측정한 결과, 각 추출물에 대해 전체적으로 농도의존적으로 암세포 성장 억제효과가 증가되었다. 전체, 살, 껍질 부위별 추출물을 $100\;{\mu}g/ml$의 농도로 첨가하였을 때 각각 90.5%, 82.0%, 75.2%로 비교적 낮은 활성을 보였지만, $500\;{\mu}g/ml$로 처리했을 때 각각 26.9%, 30.6%, 12.0%로 급격히 활성이 증가하는 것을 볼 수 있었다. 특히 껍질 부분의 아세톤 추출물이 강한 DNA 손상억제 및 암세포 성장 억제 효과를 보임을 알 수 있었다.