• 제목/요약/키워드: homologous chromosome

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C-banding 패턴에 의한 한국 재래종 찰옥수수 염색체의 Heterochromatic knob 수와 핵형 (Heterochromatic Knob Number And Karyotype in Korean Indigenous Waxy Corn by Giemsa C-banding Pattern of Mitotic Chromosome)

  • 이인섭
    • 생명과학회지
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    • 제17권6호통권86호
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    • pp.762-765
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    • 2007
  • Giemsa C-banding방법으로 한국 재래종 찰옥수수의 핵형 및 염색체 상에 존재하는 knob의 수와 위치 등을 확인하고 모식도를 통하여 염색체의 특성을 나타내고자 재래종 찰옥수수 5개의 자식 계통 (inbred stock)을 조사하였다. knob의 수는 6-12개이었고 평균 9.2개이었으며 계통별로 차이가 있었으며, knob을 가지고 있는 염색체도계통별로 차이가 있었다. YS-1의 경우 6번, 7번, 8번 그리고 9번 염색체에서 knob을 가지고 있었는데, MY-1의경우 1번, 2번, 3번, 6번, 「번 그리고 9번 염색체에서 knob을 가지고 있었다. 염색체의 장완과 단완의 비율, 염색체의 상대적 길이 등을 비교해 보기 위하여 YS-1과 MY-1 두 계통을 조사해 본 결과 두 계통 간에 차이가 있었고, 염색체의 상대적 길이는 YS-1이 큰 것으로 나타났다. Giemsa C-banding법은 재래종 찰옥수수의 계통별 특성과 이를 이용한 계통 분류에도 효과적으로 이용할 수 있을 것으로 생각된다.

Formation of a New Solo-LTR of the Human Endogenous Retrovirus H Family in Human Chromosome 21

  • Huh, Jae-Won;Kim, Dae-Soo;Ha, Hong-Seok;Kim, Tae-Hong;Kim, Wook;Kim, Heui-Soo
    • Molecules and Cells
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    • 제22권3호
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    • pp.360-363
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    • 2006
  • Human endogenous retroviruses (HERVs) contribute to various kinds of genomic instability via rearrangement and retrotransposition events. In the present study the formation of a new human-specific solo-LTR belonging to the HERV-H family (AP001667; chromosome 21q21) was detected by a comparative analysis of human chromosome 21 and chimpanzee chromosome 22. The solo-LTR was formed as a result of an equal homologous recombination excision event. Several evolutionary processes have occurred at this locus during primate evolution, indicating that mammalian-wide interspersed repeat (MIR) and full-length HERV-H elements integrated into hominoid genomes after the divergence of Old World monkeys and hominoids, and that the solo-LTR element was created by recombination excision of the HERV-H only in the human genome.

여우원숭이속(Lepilemuridae)의 핵형 분석을 통해 나타난 Lepilemur 6종(L. mustelinus, L. edwardsi, L. dorsalis, L. leucopus, L. ruficaudatus, L. septentrionalis)의 종 분화 양상 (Speciation Mode Reconstruction for Lepilemur six species (L. mustelinus, L. edwardsi, L. dorsalis, L. leucopus, L. ruficaudatus, L. septentrionalis) Based on the Lepilemur Karyotype Analysis)

  • 정기윤
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제5권2호
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    • pp.141-149
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    • 2004
  • 이 연구의 목적은 Lepilemuridae(여우원숭이속) 4종의 핵형은 그들의 선조격인 두 종의 교잡된 핵형으로부터 형성되었음을 검증하는데 목적이 있다. 여우원숭이 속의 가상적인 선조종의 반수체 핵형은 18개의 상염색체와 x염색체로 구성된다. L. mustelinus(LMU)의 핵형은 염색체 4개가 연속적으로 융합된 염색체와 하나의 Robertsonian 전이 염색체 쌍을 가진다. LSS의 핵형은 단지 2쌍의 상호전위된 염색체를 가지고 있다. 우리들은 LMU와 LSS의 조상핵형(anc LMU and ant LSS)을 재구성할 수 있었고, 그로부터 다른 4종의 Lepilemur가 생성될 수 있었다. anc LMU와 anc LSS의 교잡종은 배우자 형성시 환형의 배치를 거치면서 전혀 다른 형태로 융합된 유전적으로 완전한 배우자를 형성할 수 있다. L. dorsalis의 핵형이 구성되기 위해서는 교잡종의 5조의 Trivalent염색체가 감수분열 중기에 환의 모양으로 배열되면서 인접한 단부동원체들이 융합되어 새로운 핵형인 L. dorsalis의 핵형이 만들어진다. L. leucopus의 핵형은 위와 같이 환모양을 구성하기 위해 배열된 Trivalent 염색체 조들 중에서 단지 한 조가 먼저와 다른 방향으로 환속에 위치하게 되므로써 이웃한 단부동원체들이 융합되어 L. leucopus의 핵형을 형성한다. L. ruficaudatus의 반수체 핵형이 만들어 지는 데에는 환으로 배열될 때 7개의 상동염색체 쌍이 배열되고 이웃하는 단부동원체들의 융합에 의해 새로운 조합으로 된 L. ruficaudatus의 반수체 핵형이 형성된다. L. edwardsi의 반수체 배우자가 형성될 때는 LRE가 만들어 질 때의 환형에서 단지 하나의 삼동염색체 쌍이 분리되므로써 LED의 반수체 핵형이 생성된다. 이러한 기전에 의해서 만들어진 새로운 완전한 배우체들은 동일한 형태의 배우자와 수정되므로써 새로운 상동염색체를 가진 종 L. dorsalis, L. leucopus, L. ruficaudatus, L. edwardsi가 형성되었다 이 결과들은 유전적으로 완전한 새로운 종이 교잡종의 군집으로부터 활성화된 염색체들의 융합, 접합기에서 환형으로의 배열 기전을 통해 형성될 수 있다는 이론을 뒷받침한다.

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DNA 이중나선파손의 수복 과정과 이와 연관된 두경부암 발생 유전자 (PATHWAYS AND GENES OF DNA DOUBLE-STRAND BREAK REPAIR ASSOCIATED WITH HEAD AND NECK CANCER)

  • 오정환;이덕원;류동목
    • Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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    • 제35권1호
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    • pp.1-6
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    • 2009
  • DNA double-strand breaks (DSBs) occur commonly in the all living and in cycling cells. They constitute one of the most severe form of DNA damage, because they affect both strand of DNA. DSBs result in cell death or a genetic alterations including deletion, loss of heterozygosity, translocation, and chromosome loss. DSBs arise from endogenous sources like metabolic products and reactive oxygen, and also exogenous factors like ionizing radiation. Defective DNA DSBs can lead to toxicity and large scale sequence rearrangement that can cause cancer and promote premature aging. There are two major pathways for their repair: homologous recombination(HR) and non-homologous end-joining(NHEJ). The HR pathway is a known "error-free" repair mechanism, in which a homologous sister chromatid serves as a template. NHEJ, on the other hand, is a "error-prone" pathway, in which the two termini of the broken DNA molecule are used to form compatible ends that are directly ligated. This review aims to provide a fundamental understanding of how HR and NHEJ pathways operate, cause genome instability, and what kind of genes during the pathways are associated with head and neck cancer.

균류 Coprinus cinereus에서 DNA 회복에 관여하는 RAD4 유사유전자의 분리와 특성 (Characterization of RAD4 Homologous Gene from Coprinus cinereus)

  • Choi, In-Soon
    • 생명과학회지
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    • 제13권4호
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    • pp.522-528
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    • 2003
  • 본 연구는 출아형 효모 Saccharomyces cerevisiae에서 자외선의 상해 시 이를 정상으로 회복시키는 절제회복 (excision repair) 유전자로 알려진 RADA4의 특성 규명을 위하여 균류 Coprinus cinereus에서 이와 유사한 유전자를 분리하였다. RAD4 유사 유전자를 분리하기 위하여 균류 C. cinereus의 염색체 DNA를 전기영동하여 분리한 다음 효모 RAD4 DNA를 probe로하여 이와 hybridization하였다. 이 결과 RAD4 유사 유전자는 3.2 kb의 insert DNA를 갖고 있었다. 또한 Southern hybridization으로 이 유사 유전자는 fungus C. cinereus의 염색체에 존재함을 확인하였다. 분리한 RAD4 유사 유전자의 전사체 크기는 2.5 kb 였으며, 자외선의 상해 시 전혀 'inducibility가 없음을 Northern hybridization으로 확인하였다. 또한 유사유전자 부분을 삭제하였을 때 이 부분이 없는 세포는 전혀 생존을 못하였다. 이 결과 분리한 RAD4 유사유전자는 세포의 생존에 관여함을 알 수 있었다.

Haploidy of somatic cells in mouse oocyte using somatic cell nuclear transfer

  • Yeonmi Lee;Eunju Kang
    • 한국동물생명공학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.213-217
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    • 2022
  • Haploidization in somatic cells is the process of reducing the diploid somatic chromosomes to haploid. Several studies have attempted somatic haploidization using oocytes in mice and humans. Some researchers showed partial somatic haploidization, but none observed embryo development. Our study attempted somatic haploidization using the modified somatic nuclear transfer (SCNT) protocol with various combinations of chemicals or proteins in mice. This study induced the proper segregation of somatic homologous chromosomes and full embryo development in vitro. Furthermore, somatic haploid embryos established embryonic stem cells and produced live births. The current review summarizes this recent study on the success of somatic haploidization and provides an overview of other related studies on somatic haploidization.

A Modified PCR-Directed Gene Replacements Method Using $lambda$-Red Recombination Functions in Escherichia coli

  • KIM SANG-YOON;CHO JAE-YONG
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제15권6호
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    • pp.1346-1352
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    • 2005
  • We have developed a modified gene replacement method using PCR products containing short homologous sequences of 40- to 50-nt. The method required $\lambda$-Red recombination functions provided under the control of a temperature-sensitive CI857 repressor expressed from the $P_{lac}$ promoter in the presence of IPTG on an easily curable helper plasmid. The method promoted the targeted gene replacements in the Escherichia coli chromosome after shifting cultures of the recombinogenic host, which carries the helper plasmid, to $42^{\circ}C$ for 15 min. Since this method employs $\lambda$-Red recombination functions expressed from the easily curable helper plasmid, multiple rounds of gene replacements in the E. coli chromosome would be possible. The procedures described herein are expected to be widely used for metabolic engineering of E. coli and other bacteria.

물두꺼비의 核型에 관한 硏究 (Karyological Studies of an Anuran Species, Bufo kangii Yoon)

  • Kang, Yung-Sun;Yangil Sunwoo
    • 한국동물학회지
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    • 제16권3호
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    • pp.171-176
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    • 1973
  • 空氣乾燥法을 이용하여 B. kangii Yoon의 骨髓細胞에서 分裂像을 얻었다. 本種의 核型에 관한 특징은 다음과 같다. (1) 本種의 2倍體數는 22로서 큰 染色體 6쌍과 작은 染色體 5쌍으로 구분할 수 있다. (2) 모든 相同染色體는 metacentric 이었다. (3) 染色體에 第 2 收縮環이 없다. (4) 특이한 性染色體를 찾아볼 수 없었다.

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Fast and Precise: How to Measure Meiotic Crossovers in Arabidopsis

  • Kim, Heejin;Choi, Kyuha
    • Molecules and Cells
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    • 제45권5호
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    • pp.273-283
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    • 2022
  • During meiosis, homologous chromosomes (homologs) pair and undergo genetic recombination via assembly and disassembly of the synaptonemal complex. Meiotic recombination is initiated by excess formation of DNA double-strand breaks (DSBs), among which a subset are repaired by reciprocal genetic exchange, called crossovers (COs). COs generate genetic variations across generations, profoundly affecting genetic diversity and breeding. At least one CO between homologs is essential for the first meiotic chromosome segregation, but generally only one and fewer than three inter-homolog COs occur in plants. CO frequency and distribution are biased along chromosomes, suppressed in centromeres, and controlled by pro-CO, anti-CO, and epigenetic factors. Accurate and high-throughput detection of COs is important for our understanding of CO formation and chromosome behavior. Here, we review advanced approaches that enable precise measurement of the location, frequency, and genomic landscapes of COs in plants, with a focus on Arabidopsis thaliana.

FREQUENCY OF GIEMSA C-BAND CHROMOSOMES IN THREE INBRED LINES OF CHICKENS

  • Yeo, J.S.;Shoffner, R.N.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제2권1호
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    • pp.35-38
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    • 1989
  • Giemsa C-banded mitotic chromosome prepatations from White Leghorn, New Hampshire and Rhode Island Red inbred lines were compared for frequency of C-band regions on individual chromosomes. Except for autosomes 3, 6, 8 and 9 and W sex chromosomes, C-banding was extremely variable in other macrochromosomes. No divergence for C-band difference between homologous chromosomes of these lines was detected. Approximately 75% of the mitotic metaphase microchromosomes have recognizable C-band regions with the current technique.