• 한국작물학회지
• /
• 제65권1호
• /
• pp.1-21
• /
• 2020

Association mapping is widely used in rice and other crops to identify genes underlying important agronomic traits. Most association mapping studies use diversity panels comprising accessions with various geographical origins to exploit their wide genetic variation. While locally adapted breeding lines are rarely used in association mapping owing to limited genetic diversity, genes/alleles identified from elite germplasm are practically valuable as they can be directly utilized in breeding programs. In this study, we analyzed genetic diversity of 179 rice varieties (161 japonica and 18 Tongil-type) released in Korea from 1970 to 2006 using 192 microsatellite markers evenly distributed across the genome. The 161 japonica rice varieties were genetically very close to each other with limited diversity as they were developed mainly through elite-by-elite crosses to meet the specific local demands for high quality japonica rice in Korea. Despite the narrow genetic background, abundant phenotypic variation was observed in heading time, culm length, and amylose and protein content in the 161 japonica rice varieties. Using these varieties in association mapping, we identified six, seven, ten, and four loci significantly associated with heading time, culm length, and amylose and protein content, respectively. The sums of allelic effects of these loci showed highly significant positive correlation with the observed phenotypic values for each trait, indicating that the allelic variation at these loci can be useful when designing cross combinations and predicting progeny performance in local breeding programs.

• 한국작물학회지
• /
• 제44권2호
• /
• pp.112-116
• /
• 1999

Genetic diversity of 31 rice varieties including 25 japonica and 6 indica varieties was evaluated using a combination of 19 microsatellite or simple sequence repeats (SSRs) and 28 random decamer oligonucle-otide primers. All 19 microsatellite primer sets representing 19 loci in the rice genome showed polymorphisms among the 31 varieties and revealed 91 alleles with an average of 4.80 bands per primer. Also all 28 random decamer primers used were informative and generated 114 non-redundant bands with a mean of 4.07 bands. Microsatellite markers detected higher number of alleles than random primers .although the mean difference was not statistically significant. A cluster analysis based on Nei＇s genetic distances calculated from the 205 bands resolved the 31 varieties into two major groups that correspond to indica and japonica subspecies, which is consistent with the genealogical information. As few as six random decamer primers or a combination of one microsatellite and four random decamer primers were sufficient to uniquely differentiate all 31 varieties. These combinations would be potentially useful in rice variety protection and identification considering that 25 out of 31 varieties used in this study are japonica rices with high grain quality and have close make up.

• 원예과학기술지
• /
• 제30권6호
• /
• pp.635-641
• /
• 2012

In Korea, slurry composted and biofiltered (SCB) liquid fertilizer is produced through the composting and biofiltering of animal waste. An appropriate guidelines involving proper treatment of SCB liquid fertilizer on turfgrass should be considered. An experiment was conducted to determine the optimum application amount, timing, and frequency of SCB liquid fertilizer for Zoysia japonica 'Millock'. The SCB liquid fertilizer was applied in low, medium, and high amount (N at 15, 25, and 40 $g{\cdot}m^{-2}$ per year in 2010, and 10, 20, and 40 $g{\cdot}m^{-2}$ per year in 2011, respectively) and treated during the growing season or dormancy period. During the growing season, SCB liquid fertilizer was applied twice or four times. The greatest improvement in turf quality for both years was in SCB plots applied four times with N at 40 $g{\cdot}m^{-2}$ per year during the growing season (SH4). This treatment exhibited turf color retention in the fall, and enhanced clipping yield during the growing and fall seasons. SCB plots with four times during the growing season (SL4, SM4, and SH4) exhibited higher shoot density relative to the same amount of other SCB treatments. Plots treated during the dormancy period also showed a high turf color index during the next growing season in 2011. The results indicate that SCB with high amount up to N at 40 $g{\cdot}m^{-2}$ per year applied four times during the growing season and dormant application produced high turf quality and growth, and could be recommended as an optimum application guide.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
• /
• 제22권3호
• /
• pp.289-295
• /
• 2018

Large quantity of eggs fail to be fertilized and many of fertilized eggs are unable to hatch in the eel, Anguilla japonica. Larvae of eel absorb egg yolk up to 8 days after hatching but the majority of hatched larvae die before they reach the stage of first feeding in this species. Genes of key enzymes for yolk processing (cathepsin B, D, L and lipoprotein lipase - abbreviated as ctsb, ctsd, ctsl and lpl, respectively) could be associated with egg quality. In this study, we investigated differences in the expression of these genes between floating eggs and sinking eggs, and also the relationship between the gene expressions of the enzymes and fertilization rates in the fertilized eggs obtained from artificially matured female eels. Expressions of yolk processing enzyme genes did not show significant difference between floating and sinking egg groups. Expression of ctsb decreased when fertilization rate was high. Expression of ctsd, ctsl and lpl, however, did not show any significant differences. These results suggest that ctsb expression could be an indicator of egg quality, and that some proteins prone to be digested by ctsb could be very important in the process of fertilization and normal cleavage in this species. Further study should identify these critical proteins to improve our understanding on the quality of fish eggs.

• 대한본초학회지
• /
• 제23권2호
• /
• pp.51-58
• /
• 2008

Objectives : Trimellitic anhydride (TMA), a sensitizer that induces occupational asthma and atopic dermatitis, is widely used industrially to make epoxy and alkyd resins, plasticizers, high temperature polymer, and surfactants. The aim of this study was to investigative the effects of aqueous extracts of Lonicera japonica Flower(LJFAE) on TMA-induced contact hypersensitivity (CHS) in Balb/c mice. Methods : The dried flowers of L. japonica were extracted with distilled water at $100^{\circ}C$ for 7 h. The extract was freeze-dried following filteration through 0.45 ${\mu}m$ filter. Mice were orally administrated with or without LJFE of a different doses(25-100 mg/kg) for 28 days. In the challenge period, mice were externally applied at difference doses of LJFAE one time per day 30 min before TMA treatment. We examined the effects of LJFAE on the the serum levels of IgE and prostagladin E2 (PGE2), the Thl/Th2 cytokine production of spleen cells, ear swelling responses, and the leukocyte infiltration induced by TMA. Results : The orally and externally administration of LJFAE dose-dependently reduced the serum levels of IgE and PGE2 production as well as ear swelling responses and leukocyte infiltration in TMA-induced Balb/c mice. Furthermore, the levels of Thl (TNF-${\alpha}$, IFN-${\gammer}$, IL-2)/Th2 (IL-4, IL-5, IL-13) cytokine production from spleen cells stimulated with anti-CD3 and CD28 mAbs was markedly suppressed by the orally and externally treatment with LJFAE in a concentration dependent manner. Conclusions : These results suggest that LJFAE suppresses the inflammatory mediators and regulates the Thl/Th2 cytokines. Therefore, these properties may contribute to the strong anti-CHS response effect of LJFAE.

• 한국작물학회지
• /
• 제52권2호
• /
• pp.123-128
• /
• 2007

Demand for high quality rice has always been a major factor in the international rice marketing. In the present study, doubled haploid (DH) population derived from anther culture of a Tongil/japonica hybrid was used for genetic analysis of rice grain quality. The average values of DH lines for grain weight, grain length and the ratio of grain length to width were near the mid-parent value. More than 40% DH lines showed transgressive segregation for grain weight, length, amylose and lipid content, but less than 10% DH lines observed on ratio of length to width and grain thickness were transgressive segregation. Correlation analysis between appearance qualities and physicochemical characters indicated that grain width and grain thickness both significantly and negatively correlated to protein and lipid content. A highly significant negative correlation between protein content and amylose content was observed.

• 한국작물학회지
• /
• 제38권5호
• /
• pp.413-417
• /
• 1993

우리나라 japonica 벼의 일대잡종을 다양하게 육성할 목적으로 세포질 유전자적 웅성불임인 BTCMS에 대한 임성회복력이 있는 계통 AR-3을 교잡하여 그 F1을 모본으로 하고 조ㆍ중ㆍ만생의 한국 japonica형 벼 4품종씩을 교본 반복친으로 5회 backcross하여 우리나라 벼 품종 배경의 우엉불임 계통과 임성회복계통을 육성하고 이들의 주요 작물학적 특성을 각각의 반복친과 비교한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 우리나라 japonica형 품종의 배경을 갖는 세포질 유전자적 웅성불임계통을 조ㆍ중ㆍ만생군으로 각각 4개씩 도합 12계통 육성하였으며, 동일한 품종의 배경을 갖는 임성회복계통친도 조ㆍ중ㆍ만생군으로 각각 4개씩 12계통 육성하였다. 2. 육성된 웅성불임계통은 조중군에서 소백벼 A, 오대벼,A, 관악벼A, 대성벼A, 중생군에서 화진벼A, 팔달A, 수원 224A, 이리 386A, 만생군에서 낙동벼A, 팔굉A, 화청벼A 및 밀양 97A 등으로 명명하였다. 3. 육성된 임성회복계통은 조생군에서 소백벼R, 오대벼R, 팔달R, 수원 224R, 이리 386R, 만생군에서 낙동벼R, 팔굉R, 화청벼R 및 밀양 97R 등으로 명명하였다. 4. 육성된 웅성불임계통들은 반복친(불임유지친)에 비하여 간장이 단축되는 경향이었으나 출수기, 수장 및 수량구성요소 등은 대체로 비슷하였다. 5. 육성된 임성회복계통들은 반복친과 비교하면 대체로 간장, 수장, 수량구성요소 및 수량의 차이가 없었다.

• 한국작물학회지
• /
• 제60권2호
• /
• pp.146-152
• /
• 2015

본 연구는 국내 조생종 벼 품종들과 농촌진흥청 국립식량과학원에서 육성된 자포니카(Oryza sativa L. ssp. Japonica)의 조생 다수성 품종인 남일 돌연변이 계통인 중모1024의 등숙기 고온내성을 비교 평가하여 등숙기 고온내성의 기초자료를 얻고자 수행하였다. 본 연구를 통하여 국내 조생종벼 품종들 중 대봉, 운광, 및 만안과 돌연변이 계통인 중모 1024가 고온에서 상대적으로 양호한 고온내성을 가지고 있는 것으로 평가되었으며. 특히 중모1024는 다른 공시품종들에 비하여 상당히 양호한 고온내성을 가진 것으로 평가되었다. 본 연구의 주요 결과는 등숙기간 동안 고온에 의하여 현미의 길이와 너비가 감소하였으며, 현미 너비의 감소율이 현미 길이의 감소율에 비하여 평균 4배 이상 높았다. 이러한 결과로 보아, 등숙기간 동안 고온에 의하여 현미의 길이보다는 너비가 더 많은 영향을 받는다고 사료된다. 등숙기간 동안 고온에 의해 가장 문제가 되는 완전미율과 미숙립율을 공시품종들간 비교 평가한 결과, 상대적으로 중모 1024, 태봉, 운광 및 만안이 고온에서 높은 현미완전미율을 보였으며, 상대적으로 적온에서 낮은 현미완전미율을 보인 품종들이 상대적으로 고온에 의한 현미완전미율 감소율이 적온에서 높은 현미완전미율을 보인 품종들에 비해 낮았다. 또한, 다른 공시품종들에 비하여 고온내성이 양호한 중모 1024는 고온에서도 좋은 쌀 외관품위와 안정적 수확성 향상을 위한 육종모재로서 유용형질을 교배를 통해 고품질 벼의 보완을 위해 이전할 수 있는 것이 용이할 것으로 사료된다.

• 한국작물학회지
• /
• 제49권3호
• /
• pp.251-255
• /
• 2004

최근 비교적 재배면적이 넓은 일미벼, 대산벼, 동안벼와 이들의 모본들로 구성된 23품종의 유전적 다양성을 조사한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 1999년에서 2001년에 잎도열병과 이삭도열병이 심하게 발병한 일미벼. 대산벼, 동안벼는 밀양95호를 모본으로 육성되었다. 2. 밀양95호를 모본으로 하는 품종들에 대해 SSR 마커를 이용하여 유전적 다양성을 조사한 결과 57개 유전자좌위에서 170개(평균 3.0개)의 alleles이 관찰되었으며 대립유전자수는 2개에서 7개까지 다양하였다. 특히, RM249, RM206, OSR20은 6개 이상의 대립유전자를 가져 근연의 자포니카 벼품종간의 유전적 다양성 평가에 유용하게 이용될 수 있을 것으로 판단된다. 3.증폭된 밴드의 유무를 바탕으로 품종간 유전적 거리를 산출하여 군집분석을 실시한 결과 크게 4개의 군으로 나뉘었으며 일미벼, 대산벼, 동안벼는 모본인 밀양95호와 유전적 배경이 매우 유사하였다. 4. 같은 계보상의 품종들에 대해 도열병 저항성 유전자 인근의 마커를 이용한 유전적 다양성 분석결과가 계보도와 일치하여 이들 품종들의 저항성 유전자형 또한 유사할 것으로 추청할 수 있었다. 5. 조사품종의 계보상의 allele 전이를 분석한 결과 11번 염색체의 RM254의 3번째 allele과 12번 염색체의 OSR32의 2번째 allele이 밀양95호로부터 계속 전이되었음을 알 수 있었으며 이들 alleles의 도열병 이병화와의 연관성 여부는 추후에 검토가 이루어져야할 것이다.

• 생물환경조절학회지
• /
• 제28권4호
• /
• pp.404-410
• /
• 2019

본 연구는 고부가가치 약용작물인 잔대(Adenophora triphylla var. japonica Hara)의 종자 형태특성과 휴면 유형을 조사하고, 발아율 향상을 위한 소독제와 광질을 선발하기 위해서 수행되었다. 종자 소독은 증류수(대조구), NaClO 4%, $H_2O_2$ 4%와 benomyl $500mg{\cdot}L^{-1}$를 이용하여 실시하였으며, 광질처리는 암조건(control I), 형광등(control II), LEDs[red, blue, green, RB LEDs(red:blue = 8:2, 6:4, 4:6, 2:8)]를 광주기 12/12(light/dark), 광도 $150{\mu}mol{\cdot}m^{-2}{\cdot}s^{-1}$ photosynthetic photon flux density로 설정하였다. 잔대 종자는 emryo (E):seed (S) ratio가 0.4로 미숙배 종자지만 30일 이내에 발아가 되며, 침지 6시간 만에 포화상태에 도달하였다. 종자 소독 후 benomyl 처리에서 곰팡이 발생이 유의적으로 억제되었으며, 최종 발아율이 87%로 가장 높았다. 적색광에서 최종 발아율이 92%로 가장 높았으며, 일일평균발아수는 R2B8에서 가장 적었다. 따라서 잔대 종자는 휴면이 거의 없으며, benomyl 소독제와 적색광이 발아율 향상에 효과적이여, 향후 약용작물 잔대 재배에 이용가치가 높을 것이라 판단된다.