• 제목/요약/키워드: genebank

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Enzyme-linked Immunosorbent Assay를 이용한 CMV-P1 저항성 고추 유전자원 평가 (CMV-P1 Resistance Evaluation Using Enzyme-linked Immunosorbent Assay of Pepper Genetic Sources (Capsicum spp.))

  • 신지은;서생군;김준영;우제현;김한길;박용주;홍세진;김병섭
    • 원예과학기술지
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    • 제31권6호
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    • pp.764-771
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    • 2013
  • 최근 고추재배에 있어 CMV-P1감염은 상품성 저하와 생산량 감수를 발생시키는 매우 심각한 문제이다. 본 실험에서는 역병 저항성 품종인 PR계통을 포함한 국내 시판 56품종과 미국에서 도입해 온 31품종 도입자원 및 농촌진흥청 유전자원센터(RDA Genebank)로부터 받은 112개의 고추 유전자원을 CMV-P1 저항성 검정에 사용하였다. 저항성 검정은 인공 접종 후 24일 후와 51일 후 ELISA를 실시하였다. 36개 시판품종 중 '무한질주' 품종이 CMV-P1에 저항성이었다. 모든 PR품종과 중도저항성인 'NuMex Twilight'와 'Chainese Giant'를 제외한 29개 외국 도입고추는 감수성이었다. RDA Genebank의 112계통의 고추 유전자원에서는 저항성 계통이 9, 중도저항성을 나타내는 계통이 17, 나머지 86계통은 모두 감수성으로 조사되었다. 국내 시판 고추품종은 거의 CMV-P1에 높은 감수성을 보이는 것으로 확인되는 반면, 외국 도입자원과 유전자원의 17.2%가 저항성이거나 중도저항성으로 확인되었다. 본 연구 결과로 확인된 저항성 고추는 CMV-P1 저항성 고추육종에 유용한 유전자원으로 이용될 수 있다.

Comparison of Seed Viability Among 42 Species Stored in a Genebank

  • Lee, Ho-Sun;Jeon, Young-Ah;Lee, Young-Yi;Lee, Sok-Young;Kim, Yeon-Gyu
    • 한국작물학회지
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    • 제58권4호
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    • pp.432-438
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    • 2013
  • This study was conducted to compare seed viability among 42 species after ten years of storage in the midterm storage complex ($4^{\circ}C$, 30-40% RH) at the National Agrobiodiversity Center (NAC) Korean genebank maintained by the Rural Development Administration (RDA), Republic of Korea and to suggest the relative seed longevity and suitable monitoring intervals. The germination data from initial tests and after ten years of storage were compared to measure changes in viability during storage. The decline in seed viability varied greatly among seeds from -11.5% for Triticum sp. to 80% for melon. Coriander, crowndaisy, safflower, cosmos, Chinesebellflower, waxgourd, melon, castorbean, Welch-onion, hollyhock, wild barley, and tallfescue showed significant decreases in viability of 34.2%, 73.4%, 36.5%, 30.0%, 40.2%, 71.3%, 80.0%, 65.9%, 45.5%, 51.4%, 53.0%, and 33.5%, respectively. Gardenpea, soybean, perilla, onion, wild rice, Italian-ryegrass, and pepper showed a 15-30% decline in viability, while the viability of morningglory, adzukibean, maize, and Capsicum sp. decreased by 15% to 5%. Chicory, radish, Chinese-cabbage, bottlegourd, watermelon, cucumber, pumpkin, Cucurbita sp., groundnut, kidneybean, clubwheat, sesame, wheat, Triticum sp., rice, barley, orchardgrass, buckwheat, and wild tomato showed changes in viability of <5%. The changes in storage viability also varied within families. The wild types of rice and barley showed rapid viability loss and presented different aspects from cultivars. Since seed viability of species, classified as index 1 or 2, showed germination losses >15% after ten years of storage, a viability test should be conducted with five year intervals, while species with germination loss of <15% (in index 3 or 4) can be retested at ten year intervals.

벼 유전자원의 저장수명 예측을 위한 건열처리 효과 (Dry-heat Treatment Effect for Seed Longevity Prediction in Rice Germplasm)

  • 나영왕;백형진;최유미;이석영;이정로;정종욱;박용진;김석현
    • 한국작물학회지
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    • 제59권3호
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    • pp.230-238
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    • 2014
  • 벼 유전자원의 효율적인 보존관리를 위해 종자수명 예측방법을 규명하고자 본 시험을 수행하였다. 효과적인 종자수명 예측 방법을 규명하기 위해 전년도에 수확한 벼 106품종을 대상으로 인위노화처리 방법인 노화촉진(AA)처리, 퇴화조절(CD) 및 건열처리(DHT)를 실시하고, $4^{\circ}C$ 저장고에 26.5년간 보존된 벼 유전자원 3,066점의 종자수명 자료와 비교분석한 결과는 다음과 같다. 벼 유전자원의 효과적인 종자수명 예측 방법으로는 건열처리($90^{\circ}C$, 36시간)였다. 전년도 수확한 벼 품종의 건열처리 후 발아율 성적을 사분위수로 4개의 분류군으로 나누었을 때, 분류군별로 분포하는 벼 생태형별 품종 비율이 $4^{\circ}C$ 저장고 보존자원의 최종발아율에 따른 4개 분류군의 분포비와 흡사하였다. 갱신 된 벼 유전자원을 $4^{\circ}C$ 저장고 보존시 효율적인 첫 활력모니터링 시점은 4개 분류군 중 I군에 속하는 자원은 저장 후 14년, II군, III군, IV군에 속한 자원들은 각각 저장 후 17, 20, 45년을 기준으로 하여 설정할 수 있겠다. 건열처리는 벼 유전자원 종자수명 예측뿐만 아니라 종자은행에서 보존자원의 효율적인 활력검정 주기 설정 및 갱신 주기 결정에도 도움이 되겠다.

Genetic Structure of Mongolian Goat Populations Using Microsatellite Loci Analysis

  • Takahashi, H.;Nyamsamba, D.;Mandakh, B.;Zagdsuren, Yo.;Amano, T.;Nomura, K.;Yokohama, M.;Ito, S.;Minezawa, M.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제21권7호
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    • pp.947-953
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    • 2008
  • We studied genetic diversity and relationships among Mongolian goat populations on the basis of microsatellite DNA polymorphisms. DNA samples from eight populations (Bayandelger, Ulgii Red, Zavkhan Buural, Sumber, Zalaajinst White, Erchim Black, Dorgon, and Gobi Gurvan Saikhan) from geographically distinct areas of Mongolia were analyzed by using 10 microsatellite DNA markers. Since the 10 markers were highly polymorphic, the genetic characteristics of these native goat populations could be estimated. Genetic diversity within populations, as estimated by the expected heterozygosities, was high, ranging from 0.719 to 0.746, but genetic differentiation between populations was low, representing only 1.7% of the total genetic variation. The results suggest that Mongolian native goat populations still have a semi-wild genetic structure reflecting traditional Mongolian nomadism and the short history of artificial selection. The genetic relationships among the populations were not clear in the neighbor-joining tree generated from the modified Cavalli-Sforza chord genetic distances. By using principal components analysis, the five core populations of Mongolian native goats (Bayandelger, Ulgii Red, Zavkhan Buural, Sumber, and Dorgon) and the populations crossed with Russian breeds (Zalaajinst White, Erchim Black, and Gobi Gurvan Saikhan) were distinguished. There was no correlation between genetic relationships among the populations and the geographical distribution of the populations.

Genetic Diversity Assessment and Phylogenetic Analysis of Peanut (Arachis hypogaea L.) in RDA Genebank Collection using SSRs

  • Yi, Jung-Yoon;Lee, Gi-An;Lee, Jeong-Ran;Lee, Myung-Chul;Kang, Man-Jung;Baek, Hyung-Jin;Kim, Chung-Kon
    • 한국자원식물학회지
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    • 제24권3호
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    • pp.272-279
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    • 2011
  • It is very crucial to evaluate the genetic diversity of peanut genetic resources for identification of peanut germplasm accessions and variety improvement. Cultivated peanut generally has two subspecies, hypogaea and fastigiata. In this study, we identified peanut into three plant types, virginia (var. hypogaea), spanish (var. vulgaris), and valencia (var. fastigiata). Former one belongs to ssp. hypogaea and latter two are involved in ssp. fastigiata. Twenty SSR markers were used to assess the genetic variation of three sets, hypogaea, vulgaris, and fastigiata, respectively. Out of variety-specific SSR primers tried in this study, ten pairs of SSR primers showed polymorphisms. Each accession could be identified by a specific set of polymorphic SSR primers, and allele number was evaluated among accessions, with an average of 6.7 in var. hypogaea and 5.4 in var. vulgaris and fastigiata. For evaluation of genetic diversity, gene diversity ranged from 0.336 to 0.844 and PIC (polymorphism information contents) ranged from 0.324 to 0.827 were investigated. Dendrograms based on genetic distances were constructed, which showed the existence of three different clusters. And these three different clusters might be associated with the genes involved in three plant types. The results also suggested that there were plentiful SSR polymorphisms among peanut germplasm accessions in RDA (Rural Development Administration, Korea) Genebank and SSRs might play an important role in evaluating peanut accessions and cultivar improvement.

Genetic diversity and population structure of mongolian wheat based on SSR markers

  • Ya, Narantsetseg;Raveendar, Sebastin;Bayarsukh, N;Ya, Myagmarsuren;Lee, Jung-Ro;Lee, Kyung-Jun;Shin, Myoung-Jae;Cho, Yang-Hee;Ma, Kyung-Ho;Lee, Gi-An
    • 한국작물학회:학술대회논문집
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    • 한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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    • pp.82-82
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    • 2017
  • The production of spring wheat, the major crop in Mongolia, is accounting for 98% of the cultivated area. Collection, conservation and utilization of wheat germplasm resources play an important role in wheat breeding and production in Mongolia. Understanding genetic variability in the existing genebank accessions is important for collection and conservation of wheat germplasms. To determine the genetic diversity and population structure among a representative collection of Mongolian local wheat cultivars and lines, 200 wheat accessions were analyzed with 15 SSR markers distributed throughout the wheat genome. A total of 85 alleles were detected, with 3 to 5 alleles per locus and a mean genetic diversity value of 5.66. The average genetic diversity index was 0.68, with values ranging from 0.37 to 0.80. The 200 Mongolian wheat accessions were divided into two subgroups based on STRUCTURE, un-rooted NJ cluster and principal coordinate analyses. The results from this study will provide important information for future wheat germplasm conservation and improvement programs with Mongolian genebank.

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농업유전자원은행의 식물유전자원 분양 활용에 대한 수요자 요구도 분석 (Customers' Needs Analysis for Distribution and Utilization of Plant Genetic Resources in RDA-Genebank)

  • 김창영;조규택;백형진;이석영;이명철;이영이;최유미
    • 한국자원식물학회지
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    • 제26권2호
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    • pp.328-335
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    • 2013
  • 농촌진흥청 농업유전자원센터의 식물유전자원 확보, 보존 및 활용과 관련하여 수요자가 요구하는 유전자원 확보 및 유전자원의 품질향상 방안을 도출하기 위하여 2010년도에 종자 유전자원을 분양받아 활용한 수요자를 대상으로 2011년에 우편설문 방법에 의하여 설문조사를 실시하고 분석한 결과는 다음과 같다. 1. 분양된 유전자원에 대한 만족도는 종자의 순도, 발아율 및 기대 특성 발현도 등에서 '보통이상이다'고 답변한 비율이 각각 87.5%, 88.9%, 84.2%로 높게 나타났으며, 유전자원을 분양신청한 후 자원을 수령하기까지는 76.7%가 15일 이내에 수령한 것으로 만족도를 나타내었다. 2. 유전자원을 분양받은 후 자원을 활용하여 추진하고 있는 경과상황 및 예상 성과, 분양자원의 활용결과보고서 제출 여부 등에 관한 설문조사에서는 89.2%가 '분양받은 자원이 목적한대로 활용 중이다'는 답변을 나타내었다. 자원 활용 예상성과에 대해서는 자원정보 축적과 논문발표가 비교적 높은 비율이고 신품종 등록과 특허 출원이 상대적으로 낮은 비율을 나타내었는데 현시점에서의 유전자원 분양요청자의 성향을 나타낸 것으로 해석할 수 있다. 분양자원의 활용결과보고서 제출여부에 대한 답변결과는 자원분양 시 별도의 조치가 필요한 것으로 나타났다. 3. 유전자원 분양과 관련한 개선사항에 대한 설문에서는 특성이 있는 유전자원의 확보 제공과 유전자원의 특성정보 제공에 대한 답변 합계가 75.0%로서 유전자원 분양업무 절차보다는 현실적으로 필요한 자원이나 정보가 보다 더 절실함을 나타내었다. 금후 필요한 유전자원에 대한 설문에서의 답변은 국내의 재래종이 23.8%로 가장 많았고, 국제농업연구기관 보유 유전자원 21.4%, 외국국가가 보유한 유전자원 21.4%로 외국의 유전자원에 대한 희망이 42.8%로 나타나고 있으며, 다음이 해당 작물의 야생종 또는 야생근연종 10.7%, 외국의 육성품종 또는 계통 9.5%, 국내의 육성품종 또는 계통 9.5%의 순이었다. 또한, 수요자 소속별로 희망하는 유전자원이 다르게 나타났다. 4. 설문조사 분석결과, 유전자원 관리 단계별로 반영하여 수요자가 요구하는 유전자원을 우선적으로 확보하고 보존자원의 품질향상 관리가 되도록 하는 것이 중요한 것으로 나타났다. 수요자 맞춤형 자원도입 및 우선순위에 의한 자원 확보가 요구되었고, 보유 자원의 품질향상을 위해서는 자원 도입 시부터 특성 있는 자원을 확보하고 보존자원의 특성평가가 조속히 추진될 필요가 있으며, 유전자원 정보의 확충 및 확대 제공 노력이 요구되었다.