• 컴퓨터교육학회논문지
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• 제6권3호
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• pp.75-85
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• 2003

본 연구는 SCORM 기반 학습 객체의 메타데이타 생성 즉 Asset, SCO, Contents Aggregation과 Contents Package에 대한 메타데이터를 생성하는 시스템(MetaGene)을 개발한다. SCORM 을 지원하는 LMS내 API 어댑터와 인터페이스를 위한 학습 객체 내에 API 활성화 함수를 내장시키고, 데이터 모델을 기반으로 학습 과정을 트래킹 하는 코드도 포함 시킨다. 또한 학습 객체들이 LMS에 전송되게 PIF(Package Interchange File)로 패키징 시킨다. MetaGene에 생성된 학습객체의 메타데이터와 컨텐츠 패키지의 manifest file을 $SCORM^{(TM)}$ Conformance Testsuite을 이용하여 유효성을 검증한다.

• 원예과학기술지
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• 제29권5호
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• pp.467-473
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• 2011

Flavonoid are large group of the polyphenolic compounds which are distinguished by an aromatic or phenolic ring structure and the phenolic compounds are induced by microbial infection, ultraviolet radiation, temperature and chemical stress. They are known for their antioxidant activity, anti-allergic, anti-inflammatory, anti-microbial and anti-cancer activities. In this study, changes in flavonoid content were investigated using heterologous chalcone isomerase (CHI) expression system. Also, phenolic compounds level was measured to examine the relation between flavonoids and phenols contents. Explants of lettuce (Lactuca sativa L.) were transformed with Agrobacterium tumefaciens LBA 4404 strain containing pFLH-CHI (derived from pPZP2Ha3) vector constructed with CHI gene from Brassica rapa. The putative transgenic plants were confirmed by genomic DNA PCR analysis. Also the transcription levels of the gene were analyzed by semi-quantitative RT-PCR with gene specific primers. The total flavonoid contents were increased at $T_0$ and $T_1$ generations over 1.4 and 4.0 fold, respectively. Total phenol contents also increased at $T_1$ generation. These results indicate that CHI gene plays an important role to regulate the accumulation of flavonoids and its component changes.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제25권8호
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• pp.1055-1062
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• 2012

Two SNPs, i.e. L127V and T172M, of bovine growth hormone (GH) causing the presence of GH gene haplotypes A, B, and C was previously shown to alter intramuscular fatty acid (FA) composition in Japanese Black (JB) heifers. To determine the SNP effect on somatotropic hormone concentration and lipogenesis, we measured plasma GH, insulin, and insulin-like growth factor-1 (IGF-1) concentrations. We also measured mRNA levels of fatty acid synthase (FASN), stearoyl-coA desaturase (SCD), and sterol regulatory element binding proteins-1 (SREBP-1) and FA composition in diaphragm tissues. Heifers with genotype CC had the lowest plasma insulin concentration and FASN and SCD mRNA levels among genotypes. FASN mRNA levels in haplotype A tended to positively correlate with saturated FA (SFA) content and negatively correlated with C18:2 and unsaturated FA (USFA) contents. SCD mRNA levels in haplotype A positively correlated with monounsaturated FA (MUFA) contents and negatively correlated with C18:0 content. They also tended to positively correlate with C16:1, C18:1, and USFA contents and USFA/SFA ratio and negatively correlate with SFA content. Taken together, GH gene polymorphism affects the lipogenic genes expression levels and their relationships with fatty acid compositions in diaphragm tissues of JB heifers at 31 months of age.

• 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
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• 한국콘텐츠학회 2018년도 춘계 종합학술대회 논문집
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• pp.549-550
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• 2018

We have developed a web server for the high throughput annotation of gene. This system processes entire data sets with an automated pipeline of 13 analytic services, then deposits the data into the MySQL database and transforms it into three kinds of reports: preprocessing, assembling and annotation.

• 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
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• 한국콘텐츠학회 2003년도 추계종합학술대회 논문집
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• pp.343-346
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• 2003

나날이 그 중요성이 증대되고 있는 생물정보학(Bioinformatics) 분야에서 이미 오래전에 유전자를 예측하고 분석할 수 있는 여러 가지 기법들이나 소프트웨어도구 들이 개발되어 있는 상태이며 현재 많은 생물학자들은 이러한 분석 도구들을 이용해 연구를 수행하고 있다. 비록 기존의 실험적인 방법 없이 여러 생물정보학 분석 도구를 이용해 효율적으로 유전자를 규명하고 기능을 분석하는 것이 가능해졌지만 아직까지 유전체 사업(Genome project)은 많은 시간과 비용이 드는 까다로운 작업임에는 틀림없다. 본 논문은 기존의 유전자 DB와 분석 도구들을 이용하여 유전체 사업 초기 단계에서 구체적인 유전자의 목록을 작성 할 수 있는 방법을 제안한다. 유전체 사업의 초기단계에서는 구체적인 유전자 정보를 얻기가 어려운 상황이나 제안된 기법을 사용하면 구체적인 유전자 정보를 초기에 파악 할 수 있게 된다.

• 한국콘텐츠학회논문지
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• 제13권8호
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• pp.466-473
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• 2013

유전자 염기서열의 직접적인 변화 대신 염기의 수정 또는 변형을 통해 유전자 발현이 조절되는 후성유전은 크게 DNA 메틸화(methylation), 히스톤 변형(modification), ncRNA(non-coding RNA)에 의해 제어가 가능하다. 본 연구에서는 후성유전을 이해하기 위해 노화 관련 유전자를 대상으로 데이터베이스를 구축하고, DNA 메틸화를 중심으로 후성 유전학적 특성을 분석하였다. 유전자의 upstream 부위와 프로모터(promoter) 부위에 있는 CpG island(CGI)에 메틸화가 될 경우 유전자 발현을 억제하기 때문에 CGI를 중심으로 전체 유전자 그룹과 노화 관련 유전자 그룹간의 분포도를 비교 분석하였다. 또한 메틸화와 관련된 CGI로부터 얻은 메틸화 관련 motif 패턴을 이용하여 노화 유전자와의 관계를 분석하였다. 노화 관련 유전자의 CGI 분포는 전사인자 결합자리의 분포와 일치하였다. 본 연구에서 제공하는 DNA 메틸화 중심의 후성유전학적 정보는 노화 관련 유전자의 조절과 노화를 이해하는데 도움이 될 것으로 사료된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제20권11호
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• pp.1539-1545
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• 2010

In beer, glutathione works as the main antioxidant compound, which also correlates with the stability of the beer flavor. In addition, high residual sugars in beer contribute to major nonvolatile components, which are reflected in a high caloric content. Therefore, in this study, the Saccharomyces cerevisiae GSH1 gene encoding glutamylcysteine synthetase and the Saccharomycopsis fibuligera ALP1 gene encoding ${\alpha}$-amylase were coexpressed in industrial brewing yeast strain Y31 targeting the ${\alpha}$-acetolactate synthase (AHAS) gene (ILV2) and alcohol dehydrogenase gene (ADH2), resulting in the new recombinant strain TY3. The glutathione content in the fermentation broth of TY3 increased to 43.83 mg/l as compared with 33.34 mg/l in the fermentation broth of Y31. The recombinant strain showed a high ${\alpha}$-amylase activity and utilized more than 46% of the starch as the sole carbon source after 5 days. European Brewery Convention tube fermentation tests comparing the fermentation broths of TY3 and Y31 showed that the flavor stability index for TY3 was 1.3-fold higher, whereas its residual sugar concentration was 76.8% lower. Owing to the interruption of the ILV2 gene and ADH2 gene, the contents of diacetyl and acetaldehyde as off-flavor compounds were reduced by 56.93% and 31.25%, respectively, when compared with the contents in the Y31 fermentation broth. In addition, since no drug-resistant genes were introduced to the new recombinant strain, it should be more suitable for use in the beer industry, owing to its better flavor stability and other beneficial characteristics.

• 생명과학회지
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• 제18권8호
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• pp.1090-1095
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• 2008

근내지방 축적이 왕성하게 진행되는 12개월 및 27개월령 사이에 유전자발현이 증가하는 inducible cAMP early repressor (ICER) 유전자의 클로닝 및 유전자발현 특성을 규명하기 위하여 한우조직별, 근육 내 조지방 함량에 따라 마블링 high- 및 low 한우 각 4두와 3두씩을 공시하였다. ddRT-PCR 분석을 통하여 증폭된 300 bp PCR 산물 및 EST 서열을 중심으로 1.5 kb 한우 ICER cDNA를 염기서열 분석하였으며, 조직별 유전자발현분석결과, 식이지방이 흡수되는 소장 조직에서 ICER 유전자의 발현량이 가장 높았다. 아울러, 같은 근육타입인 등심 및 우둔조직 사이에서 ICER 유전자발현은 등심조직에서 2.5배 많이 발현하였다. 한우 마블링 high, low 두 그룹 간 유전자발현 분석 결과, high 그룹에서 ICER 유전자발현이 4배 이상 증가하는 것으로 분석되었다. 따라서, ICER 유전자는 가축의 마블링과 밀접한 관련이 있는 유전자임이 사료된다.

• Nutrition Research and Practice
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• 제9권4호
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• pp.343-349
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• 2015

BACKGROUND/OBJECTIVES: Fermentation of dietary fiber results in production of various short chain fatty acids in the colon. In particular, butyrate is reported to regulate the physical and functional integrity of the normal colonic mucosa by altering mucin gene expression or the number of goblet cells. The objective of this study was to investigate whether butyrate modulates mucin secretion in LS174T human colorectal cells, thereby influencing the adhesion of probiotics such as Lactobacillus and Bifidobacterium strains and subsequently inhibiting pathogenic bacteria such as E. coli. In addition, possible signaling pathways involved in mucin gene regulation induced by butyrate treatment were also investigated. MATERIALS/METHODS: Mucin protein content assay and periodic acid-Schiff (PAS) staining were performed in LS174T cells treated with butyrate at various concentrations. Effects of butyrate on the ability of probiotics to adhere to LS174T cells and their competition with E. coli strains were examined. Real time polymerase chain reaction for mucin gene expression and Taqman array 96-well fast plate-based pathway analysis were performed on butyrate-treated LS174T cells. RESULTS: Treatment with butyrate resulted in a dose-dependent increase in mucin protein contents in LS174T cells with peak effects at 6 or 9 mM, which was further confirmed by PAS staining. Increase in mucin protein contents resulted in elevated adherence of probiotics, which subsequently reduced the adherent ability of E. coli. Treatment with butyrate also increased transcriptional levels of MUC3, MUC4, and MUC12, which was accompanied by higher gene expressions of signaling kinases and transcription factors involved in mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling pathways. CONCLUSIONS: Based on our results, butyrate is an effective regulator of modulation of mucin protein production at the transcriptional and translational levels, resulting in changes in the adherence of gut microflora. Butyrate potentially stimulates the MAPK signaling pathway in intestinal cells, which is positively correlated with gut defense.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제33권2호
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• pp.111-115
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• 2006

Rot 3 유전자로 형질전환된 들깨를 이용하여 aromatic compounds, brightness, 안토시아닌 함량, leaf index를 조사하여 모본과의 품질적인 차이가 있는가를 조사하여 형질전환체의 안정성을 확보하기 위한 연구이다. Rot 3 유전자는 T1 과T2 세대에서 유전자발현이 되었으며, 형질전환이 확인된 개체는 주요 농업형질이 형질전환 되지 않은 들깨와는 차이가 없는 것으로 나타났다. 또한 aromatic compounds와 leaf brightness도 차이를 나타내지 않았다. 그러나 leaf index는 유전자의 표현을 나타내어 형질전환체와 형질전환되지 않은 들깨잎의 모양은 차이가 나타났다.