• 제목/요약/키워드: filamentous bacteria

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사상성 진균 Aspergillus nidulans에서 아쿠아포린 유전자 aqpA의 분리 및 분석 (Identification and Characterization of the Aquaporin Gene aqpA in a Filamentous Fungus Aspergillus nidulans)

  • 오동순;육함연;한갑훈
    • 미생물학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.295-301
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    • 2011
  • 아쿠아포린(aquaporin)은 MIP (Major Intrinsic Protein) 패밀리에 속하는 물 수송 채널(water transport channel) 단백질로 단세포 생물인 박테리아부터 다세포 고등생물인 인간에 이르기까지 다양한 기관계에서 잘 보존되어 있다. 아쿠아포린은 정통아쿠아포린(orthodox aquaporin)과 아쿠아글리세로포린(aquaglyceroporin)으로 구분되는데, 정통아쿠아포린은 주로 세포내의 물 유입 및 수송에 관여하며 아쿠아글리세로포린은 glycerol, polyol, urea를 비롯한 작은 비극성 분자의 수송에 관여하는 것으로 알려져 있다. 최근까지 효모에서 아쿠아포린 기능이 일부 밝혀졌지만 Aspergillus 속을 포함하는 사상성 진균에서는 거의 연구가 되어있지 않은 실정이다. 본 연구에서는 A. nidulans의 유전체 염기서열 정보를 분석하여 하나의 정통아쿠아포린(aqpA)과 네 개의 아쿠아글리세로포린(aqpB-E)을 발견하였다. 이를 바탕으로 aqpA 유전자 결실돌연변이들을 만들어 그 기능을 분석하였다. aqpA 결실돌연변이는 각종 삼투 스트레스(osmotic stress)에서는 표현형의 변화가 거의 관찰되지 않았으며 이는 이들 유전자가 삼투 스트레스에 반응하지 않거나 유전자의 중복성 때문으로 여겨진다. 그러나 항진균제인 fluconazol에 대해서 그 감수성이 적어지는 것이 관찰 되었다. 이는 aqpA 유전자가 삼투스트레스 반응보다 항진균제의 감지에 더 기능을 가지고 있을 수 있음을 시사한다.

혐기성 암모늄 산화 반응기 내 붉은색 입상슬러지의 미생물 군집구조 분석 (Analysis on the Microbial Community Structure of Red Granule in the Anaerobic Ammonium Oxidation Reactor)

  • 배효관;박경순;정윤철;정진영
    • 대한환경공학회지
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    • 제28권10호
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    • pp.1055-1064
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    • 2006
  • 본 연구소에서는 혐기성 입상슬러지를 충진한 UASB 반응기와 탄소섬유를 충진한 배양기를 조합하여 아주 느린 성장특성을 가진 혐기성 암모늄 산화균의 배양을 시도하였다. 연속배양 180일 이후, 유입질소부하가 0.6 kg $N/m^3-d$였을 때, 평균 질소전환율은 0.54 kg $N/m^3-d$로 나타났다. 검은 혐기성 입상슬러지는 연속배양시간이 지남에 따라 갈색과 붉은 색으로 변화되었으며, anammox 반응기는 붉은색 입상슬러지가 많을수록 높은 활성도를 나타내었다. 따라서, 붉은색 입상슬러지를 채취하여 분자생물학적 방법을 이용하여 미생물 군집구조를 분석하였다. 클로닝 및 계통분류학적 분지도 작성 결과, anammox UASB 반응조의 붉은색 입상슬러지에서 발견된 미생물 종류는 anammox 미생물과 더불어 문단위의 4가지 다른 미생물, Proteobacteria, Acidobacteria, Chlorobi와 Chloroflexi로 나타났다. Anammox UASB 반응조내의 붉은색 입상슬러지에서는 clone의 개수를 기준으로 anammox 미생물이 약 25%가 존재하였고 $\beta$-proteobacteria가 우점하고 있는 양상을 보여주었으며, 본 연구의 클로닝 정보와 AMX368 FISH 탐침자를 이용해 in silico 실험을 수행한 결과 AMX368과 정확히 들어맞는 anammox 미생물 clone 하나와 하나의 염기서열이 변이를 일으킨 11개의 anammox 미생물 clone을 확인할 수 있었다. 사상균 형태의 Chloroflexi는 혐기조건 입상 슬러지의 형성과 관련이 있는 것으로 판단되었다. FISH 수행결과, anammox 미생물은 붉은색 입상 슬러지에 우점하고 있는 것으로 나타났다.

치근단 병변에서 Actinomyces 종의 검정을 위한 간접 면역형광법적 연구 (INDIRECT IMMUNOFLUORESCENCE FOR THE IDENTIFICATION OF ACTINOMYCES SPECIES IN PATIENTS WITH PERIAPICAL LESION)

  • 장원정;윤수한;권오양
    • Restorative Dentistry and Endodontics
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    • 제21권1호
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    • pp.121-135
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    • 1996
  • Actinomyces are Gram-positive, non-acid-fast, anaerobic or microaerophilic filamentous bacteria. These organisms are frequently detected from infected root canals and periapical lesion. The purpose of this study was to use indirect immunofluorescence to determine the prescence of select Actinomyces species in a survey of teeth associated with periapical lesion, to clarify the relationship between clinical symptoms of periapical lesions and the Actinomyces species and to study on the cross reaction among Actinomyces. Actinomyces israelii serotype I (ATCC 12102), Actinomyces israelii serotype II (ATCC 29322), Actinomyces viscosus serotype II (ATCC 19246), Actinomyces naslundii serotype I (ATCC 12104) were cultured in anaerobic condition. Rabbit antisera were prepared by intravenous injection of formalized whole cells. Indirect immunofluorescence method was used to achieve the purpose. The following results were obtained. 1. There was a relationship between Actinomyces and periapical disease. 2. A. israelii serotype I, II were frequently identified with Indirect Immunofluorescence and most often assosiated with periapical disease. In culture finding, there was no significant difference between each group. 3. Indirect Immunofluoresence is both more sensitive and more rapid than culture for identification of Actinomyces species in patients with periapical lesion. 4. A. israelii serotype I, II was highly isolated in infected root canals with local swelling, A. naslundii serotype I was highly isolated in those with foul odor, and A. israelii serotype I was found in higher frequncy in those with exudate than other bacteria. 5. In the Indirect Immunofluorescence (1 : 320), A positive cross reaction was obtained between A. israelii serotype I and A. israelii serotype II, also, A. viscosus serotype II and A. naslundii serotype I. There was no cross reaction between A. israelii serotype I, II and A. viscosus serotype II, A. naslundii serotype I.

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Functional Properties of Filamentous Fungi Isolated from the Indonesian Fermented Dried Cassava, with Particular Application on Poultry

  • Sugiharto, Sugiharto;Yudiarti, Turrini;Isroli, Isroli
    • Mycobiology
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    • 제43권4호
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    • pp.415-422
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    • 2015
  • The study aimed to evaluate the probiotic properties, antioxidant activity and fermentative capacity of Acremonium charticola and Rhizopus oryzae isolated from the Indonesian fermented dried cassava, with particular application on poultry. A. charticola inhibited the growth of Escherichia coli and Aspergillus flavus. A. charticola and R. oryzae grew in potato dextrose agar (PDA) adjusted to pH 3 and 8 or in PDA supplemented with bile salt up to 0.8%. After soaking for 8 hr, the survival rate of A. charticola in the simulated gastric juice (pH 2) and bile solutions (2% bile salt) was lower than that of R. oryzae. A. charticola and R. oryzae exhibited strong antioxidant activities. Compared to unfermented cassava pulp (control), the fibre content of cassava pulp tended to be lower after fermentation with A. charticola for 14 days. The populations of A. charticola and R. oryzae were significantly higher in fermented cassava pulp than in unfermented one. Coliform was higher in cassava pulp fermented with R. oryzae or A. charticola + R. oryzae compared to control after 7 days of fermentation, however, the bacteria were not different between A. charticola-fermented cassava pulp and control. Lactic acid bacteria (LAB) were higher in A. charticola- and R. oryzae-fermented cassava pulp than those in control, however, no difference of LAB was observed between A. charticola + R. oryzae-fermented cassava pulp and control. In conclusion, A. charticola exhibited antibacterial, antifungal and antioxidant activity, gastrointestinal persistence and fermentative capacity that may be beneficial for poultry industry.

A Study on the Development of "Korean-style Button Mushroom Cultivation Compost Post-Fermentation System"

  • Rho, Si-Young;Kwak, Kang-Su;Lee, Hyun-Dong;Yu, Byeong Kee
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제26권11호
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    • pp.183-189
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    • 2021
  • 이 연구는 한국형 양송이버섯 재배 배지 후발효 시스템의 개발을 통해 양송이버섯 농가의 노동력 절감, 생산 사이클 단축을 통한 농가 소득 증가를 목적으로 두고 있다. 한국형 양송이버섯 재배 배지 후발효 시스템은 국내 양송이버섯 농가의 현실을 반영하여 설계되었으며, 후발효 시스템 내의 발효 배지의 온도 차를 줄여 균일한 품질을 보장하는 양송이버섯 재배 배지를 생산할 수 있다. 또한, 성능 실험 결과 배지 후발효 시스템이 40시간의 작업 시간이 단축되었으며, 양송이버섯 배지에 도움이 되는 호기성 세균 및 방선균은 증가함을 알 수 있었으며, 양송이버섯 품질을 저하시키는 사상균은 살균됨을 확인하였다.

박테리아의 활주운동 (Bacterial Gliding Motility)

  • 조경연
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.199-205
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    • 2002
  • 활주운동은 편모의 작용없이 고체의 표면을 미끄러지듯이 이동하는 박테리아의 운동방식으로 분류학상 다양한 종의 박테리아에서 발견된다. 지금까지 밝혀진 바에 의하면 활주 운동은 type IV pili(Tfp)를 필요로 하는 경우와 이를 필요로 하지 않는 두 가지로 크게 구분될 수 있는데, Tfp를 필요로 하는 경우에는 T룰의 확장과 수축에 의해 이루어지는 twitching motility와 운동기작이 흡사할 것으로 추정된다 Tfp를 필요로 하지 않는 활주운동에 대해서는 여러 다양한 모델이 제시되었는데, 이중 한 모델은 활주박테리아가 점액을 분출함으로서 추진력을 얻어 앞으로 진행한다는 설명이며, 다른 모델들은 외벽에 세포 전체를 감싸는 운동기구가 존재한다는 것이다. 이와 같이 활주운동은 일반적으로 잘 알려진 편모에 의한 운동과는 전혀 다른 운동방식에 의해 이루어지는데, 그 작용 기작이 매우 흥미로운 반면에 많은 부분들이 풀어야 될 숙제로 남아있어 앞으로의 연구결과들이 기대된다.

지치 발거 후 안면부에 발생한 방선균증의 치험례 (FACIAL ACTINOMYCOSIS FOLLOWING THE EXTRACTION OF LOWER THIRD MOLAR.)

  • 허지영;김일규;오성섭;최진호;오남식;차상권
    • Maxillofacial Plastic and Reconstructive Surgery
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    • 제23권1호
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    • pp.82-86
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    • 2001
  • 저자 등은 하악 우측 제3대구치 발거 후 발치와를 통해 하악골에 이환되어 발생한 경안부 방선균증에서 병소부의 적출술과 소파술을 시행하고, 항생제 요법 및 개방창 유지등의 방법을 통해 양호한 경과를 보였기에 문헌고찰과 함께 보고하는 바이다.

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Influence of Growth Conditions on Plasmid DNA Production

  • Silva, Filomena;Passarinha, Luis;Sousa, Fani;Queiroz, Joao A.;Domingues, Fernanda C.
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제19권11호
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    • pp.1408-1414
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    • 2009
  • The obtention of high yields of purified plasmid DNA is viewed as an essential issue to be considered towards efficient production of DNA vaccines and therapeutic plasmids. In this work, Escherichia coli $DH5\alpha$. bearing the pVAXI-LacZ plasmid was grown in a developed semi-defined medium at different temperatures and tryptone concentrations. Analysis of pDNA yields and E. coli morphology revealed that at higher temperatures (37 and $40^{\circ}C$), higher specific yields and E. coli filamentation were obtained. However, the best results were achieved when a lower tryptone concentration was used. This approach was shown to be a powerful tool to promote plasmid amplification, keeping the desirable plasmid structure, and favoring the attainment of quality. Our results suggest that by using tryptone alone as an amino acid source, pDNA amplification was improved and a specific yield of 20.43 mg pDNA/g dcw was achieved, proving that this strategy can improve pDNA yield even at a small scale.

Transformation of a Filamentous Fungus Cryphonectria parasitica Using Agrobacterium tumefaciens

  • Park, Seung-Moon;Kim, Dae-Hyuk
    • Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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    • 제9권3호
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    • pp.217-222
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    • 2004
  • As Agrobacterium tumefaciens, which has long been used to transform plants, is known to transfer T-DNA to budding yeast, Saccharomyces cerevisiae, a variety of fungi were subjected to the A. tumefaciens-mediated transformation to improve their transformation frequency and feasibility. The A. tumefaciens-mediated transformation of chestnut blight fungus, Cryphonectria parasitica, is performed in this study as the first example of transformation of a hardwood fungal pathogen. The transfer of the binary vector pBIN9-Hg, containing the bacterial hygromycin B phosphotransferase gene under the control of the Aspergillus nidulans trpC promoter and terminator, as a selectable marker, led to the selection of more than 1,000 stable, hygromycin B-resistant transformants per 1${\times}$10$\^$6/ conidia of C. parasitica. The putative transformants appeared to be mitotically stable. The transformation efficiency appears to depend on the bacterial strain, age of the bacteria cell culture and ratio of fungal spores to bacterial cells. PCR and Southern blot analysis indicated that the marker gene was inserted at different chromosomal sites. Moreover, three transformants out of ten showed more than two hybridizing bands, suggesting more than two copies of the inserted marker gene are not uncommon.

C/N비 변화가 호기성 그래뉼 슬러지의 안정성에 미치는 영향 (Effects on the Stability of Aerobic Granular Sludge (AGS) at Different Carbon/Nitrogen Ratio)

  • 김현구;안대희
    • 한국환경과학회지
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    • 제28권9호
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    • pp.719-727
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    • 2019
  • In this study, the effect on the stability of Aerobic Granular Sludge (AGS) with different Carbon/Nitrogen (C/N) ratios was investigated. The C/N ratios were controlled to 10.0, 7.5, 5.0, and 2.5 using the sequencing batch reactor, and the results showed that the removal efficiency of organic matter and total nitrogen decreased simultaneously with the decrease of C/N ratio. The removal efficiency of organic matter and total nitrogen at C/N ratio of 2.5 was 70.7% and 52.3% respectively. In addition, the AGS/mixed liquor suspended solids (MLSS) ratio showed a tendency to decrease from 85.7% to 73.7%, while the sludge volume index showed a tendency to increase from 82 mL/g to 102 mL/g as the C/N ratio decreased. At the same time, the apparent deviation of polysaccharide (PS) content in extracellular polymeric substances was observed, and polysaccharides/protein (PS/PN) ratio decreased from 0.62 to 0.31 as the C/N ratio decreased. Optical microscope observations showed that the reduction in C/N ratio caused the growth of filamentous bacteria and significantly affected the stability of AGS.