• 제목/요약/키워드: domain expression

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Expression of the EPO-like Domains of Human Thrombopoietin in Escherichia coli

  • Koh, Yeo-Wook;Koo, Tai-Young;Ju, Sang-Myoung;Kwon, Chang-Hyuk;Chung, Joo-Young;Park, Myung-Hwan;Yang, Jai-Myung;Park, Seung-Kook
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제8권6호
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    • pp.553-559
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    • 1998
  • cDNA of human thrombopoietin (hTPO) amplified by polymerase chain reaction from a cDNA library of human fetal liver was cloned. EPO-like domains ($hTPO_{153} \;or\; hTPO_{l63})\; of\; hTPO(hTPO_{332}$) were expressed in Escherichin coli using several kinds of expression systems, such as ompA secretion, thioredoxin fusion, and the $P_L$ and T7 expression systems. To obtain $hTPO_{153}$ in soluble form, $hTPO_{153}$ cDNA was fused in-frame behind the gene encoding ompA signal sequence and thioredoxin protein. When fused with either of the genes, $hTPO_{153}$ was not expressed to the detectable level. However, a high level expression of the EPO-like domain of hTPO was obtained using the PL and T7 expression system. $hTPO_{153} \;or\; hTPO_{l63} cDNA were subcloned into the pLex and pET-28a(+) vectors under the control of the inducible$ P_L\;T_7$ promoter, respectively. Proteins expressed using pl.ex vector and pET-28a(+) detected in insoluble forms with an expression level of about 14% and 9% of total cellular proteins, respectively, and the level of expression was rapidly diminished in 2 h after the maximum level of expression was reached.

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재사용성 향상을 위한 도메인 명세화 컴포넌트(DSC)의 설계 (Domain Specification Component Design to Improve Software Reusability)

  • 권영희;조은경;이권일
    • 대한전자공학회:학술대회논문집
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    • 대한전자공학회 2002년도 하계종합학술대회 논문집(3)
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    • pp.161-164
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    • 2002
  • The informal specification technique lacks abstraction and preciseness. On the other hand, the formal specification technique makes the developer difficult to express and understand the software specification, because it contains mathematical expression. This paper proposes DSC(Domain Specification Component) to solves these problems. DSC supports the understanding of problem domain and improves reusability with selecting the strong point of informal and formal specification technique. We applied the proposed DSC to CMIP-based network management manager software. And we analyzed the effects of the reusability and confirmed the increase of the reusability.

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초등학교 체육교과서 무용교육 내용 분석 (Analysis of Dance Education Content in Elementary School Physical Education Textbooks)

  • 배명훈
    • 한국응용과학기술학회지
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    • 제39권2호
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    • pp.261-270
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    • 2022
  • 이 연구는 무용교육 활성화를 위해 학교 현장에서 활용되고 있는 3, 4, 5, 6학년 체육교과서 8종 32권을 확보하여 관련 내용을 분석하고자 하였다. 그 결과, 3학년 표현 영역은 움직임 언어와 표현 요소를 중심으로 교과서를 편성하고 있었다. 4학년은 대다수 교과서들이 공, 후프, 리본을 이용한 체조를 제시하고 있었으며, 5학년의 경우 우리나라 민속춤과 관련하여 강강술래, 탈춤이 제시되어 있었으며, 외국 민속 무용과 관련하여 티니클링, 구스타프스콜이 제시되어 있었다. 6학년의 경우 주제표현과 관련하여 표현 요소 탐색과 표현 과정을 제시하였으며, 창작체조를 중심으로 주제 표현을 할 수 있도록 하였다. 또한, 실용 무용 중 라인댄스가 대다수의 교과서에서 제시되고 있었다. 표현 영역은 그 가치의 중요성에도 불구하고 다양한 내외적 문제들로 인해 학교 현장교사들은 교수·학습에 어려움을 호소하고 있는 실정이다. 표현 영역은 인지, 심동, 정의적 영역 모두에서 효과를 발휘 할 수 있다는 점에서 활성화의 필요성이 제기되며, 이 연구는 이러한 맥락에서 현장에서의 표현 영역 수업 활성화에 기여할 수 있을 것으로 생각된다.

Expression and phosphorylation analysis of soluble proteins and membrane-localised receptor-like kinases from Arabidopsis thaliana in Escherichia coli

  • Oh, Eun-Seok;Eva, Foyjunnaher;Kim, Sang-Yun;Oh, Man-Ho
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제45권4호
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    • pp.315-321
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    • 2018
  • Molecular and functional characterization of proteins and their levels is of great interest in understanding the mechanism of diverse cellular processes. In this study, we report on the convenient Escherichia coli-based protein expression system that allows recombinant of soluble proteins expression and cytosolic domain of membrane-localised kinases, followed by the detection of autophosphorylation activity in protein kinases. This approach is applied to regulatory proteins of Arabidopsis thaliana, including 14-3-3, calmodulin, calcium-dependent protein kinase, TERMINAL FLOWER 1(TFL1), FLOWERING LOCUS T (FT), receptor-like cytoplasmic kinase and cytoplasmic domain of leucine-rich repeat-receptor like kinase proteins. Our Western blot analysis which uses phospho-specific antibodies showed that five putative LRR-RLKs and two putative RLCKs have autophosphorylation activity in vitro on threonine and/or tyrosine residue(s), suggesting their potential role in signal transduction pathways. Our findings were also discussed in the broader context of recombinant expression and biochemical analysis of soluble and membrane-localised receptor kinases in microbial systems.

Characterization of histone gene expression in sevenband grouper, Hyporthodus septemfasciatus against nervous necrosis virus infection

  • Lee, Dong-Ryun;Lee, A-Reum;Krishnan, Rahul;Jang, Yo-Seb;Oh, Myung-Joo;Kim, Jong-Oh
    • 한국어병학회지
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    • 제35권1호
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    • pp.121-128
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    • 2022
  • Recent studies revealed that histone proteins are involved in innate immune responses during pathogen invasion as well as DNA packing. This study characterized the histone genes (H2A.V) of sevenband groupers and analyzed gene expression in NNV-infected sevenband groupers. The open reading frame (ORF) of H2A.V is 387 bp which encoded 128 amino acid residues. The deduced amino acid sequence of H2A.V harbor a highly conserved domain for H2A/H2B/H3 and H2A_C binding domain. Quantitative real-time PCR analysis showed that H2A.V had a high gene expression level in the brain and blood after being NNV-infected. An increase in extracellular histone protein in the blood has been identified as a biomarker for vascular function in humans. More research is required to understand histone's immune response at the protein level or in aquatic animals.

The C-terminal domain of PLD2 participates in degradation of protein kinase CKII β subunit in human colorectal carcinoma cells

  • Lee, Young-Hoon;Uhm, Jong-Su;Yoon, Soo-Hyun;Kang, Ji-Young;Kim, Eun-Kyung;Kang, Beom-Sik;Min, Do-Sik;Bae, Young-Seuk
    • BMB Reports
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    • 제44권9호
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    • pp.572-577
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    • 2011
  • Elevated phospholipase D (PLD) expression prevents cell cycle arrest and apoptosis. However, the roles of PLD isoforms in cell proliferation and apoptosis are incompletely understood. Here, we investigated the physiological significance of the interaction between PLD2 and protein kinase CKII (CKII) in HCT116 human colorectal carcinoma cells. PLD2 interacted with the CKII${\beta}$ subunit in HCT116 cells. The C-terminal domain (residues 578-933) of PLD2 and the N-terminal domain of CKII${\beta}$ were necessary for interaction between the two proteins. PLD2 relocalized CKII${\beta}$ to the plasma membrane area. Overexpression of PLD2 reduced CKII${\beta}$ protein level, whereas knockdown of PLD2 led to an increase in CKII${\beta}$ expression. PLD2-induced CKII${\beta}$ reduction was mediated by ubiquitin-dependent degradation. The C-terminal domain of PLD2 was sufficient for CKII${\beta}$ degradation as the catalytic activity of PLD2 was not required. Taken together, the results indicate that the C-terminal domain of PLD2 can regulate CKII by accelerating CKII${\beta}$ degradation in HCT116 cells.

파수영역 이산 웨이블릿 변환을 이용한 효율적인 그린함수 표현에 관한 연구 (An Application of k-domain Discrete Wavelet Transform for the Efficient Representation of Green Function)

  • 주세훈;김형동
    • 한국전자파학회논문지
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    • 제12권7호
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    • pp.1110-1114
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    • 2001
  • 그린함수의 효율적인 표현을 위하여 파수영역 웨이블릿 변환 개념을 이용하였다. 파수영역 웨이블릿 변환을 공간영역에서 가변 윈도우를 사용하여 등가적으로 구현하였다. 제안된 방법은 공간영역 그린함수에 대하여 윈도우 함수를 이용한 필터링과정, 고유함수의 전개를 통한 중심이동과정, 그리고 푸리에 변환과정으로 이루어진다. 파수영역 이산 웨이블릿 변환이 적용된 그린함수의 수식을 유도하였고, 근거리 그린함수와 원거리 그린함수를 표현하여 파수영역에서 비교하여 특성에 대하여 논의하였다.

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Purification and NMR Studies of RNA Polymerase II C-Terminal Domain Phosphatase 1 Containing Ubiquitin Like Domain

  • Ko, Sung-Geon;Lee, Young-Min;Yoon, Jong-Bok;Lee, Weon-Tae
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제30권5호
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    • pp.1039-1042
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    • 2009
  • RNA polymerase II C-terminal domain phosphatase 1 containing ubiquitin like domain (UBLCP1) has been identified as a regulatory molecule of RNA polymerase II. UBLCP1 consists of ubiquitin like domain (UBL) and phosphatase domain homologous with UDP and CTD phosphatase. UBLCP1 was cloned into the E.coli expression vectors, pET32a and pGEX 4T-1 with TEV protease cleavage site and purified using both affinity and gel-filtration chromatography. Domains of UBLCP1 protein were successfully purified as 7 mg/500 mL (UBLCP1, 36.78 KDa), 32 mg/500 mL (UBL, 9 KDa) and 8 mg/500 mL (phosphatase domain, 25 KDa) yielded in LB medium, respectively. Isotope-labeled samples including triple-labeled ($^2H/^{15}N/^{13}C$) UBLCP1 were also prepared for hetero-nuclear NMR experiments. $^{15}N-^{1}H$ 2D-HSQC spectra of UBLCP1 suggest that both UBL and phosphatase domain are properly folded and structurally independent each other. These data will promise us further structural investigation of UBLCP1 by NMR spectroscopy and/or X-ray crystallography.

현사시나무에서 Dormancy-associated protein 1 (DRM1) 유전자의 분리와 발현특성 구명 (Isolation and Expression of Dormancy-associated protein 1 (DRM1) in Poplar (Populus alba × P. glandulosa))

  • 윤서경;배은경;최현모;최영임;이효신
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제44권1호
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    • pp.69-75
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    • 2017
  • Dormancy-associated protein (DRM)은 식물의 휴면생리에 관여하는 대표적인 단백질로 거의 모든 식물에 보존되어 있다. 최근 DRM 유전자가 비생물적 스트레스 반응에 관여하는 것으로 알려지면서 이 유전자의 특성구명 연구가 여러 식물에서 이루어지고 있다. 그러나 아직까지 나무에서는 DRM 유전자에 대한 연구가 거의 없는 실정이다. 따라서 본 연구에서는 DRM 유전자를 현사시나무(Populus alba ${\times}$ P. glandulosa)에서 분리하여 이를 PagDRM1이라 명명하고, 유전자의 구조와 발현특성을 조사하였다. PagDRM1 유전자는 123개의 아미노산으로 구성된 단백질을 암호화하며, 2개의 영역(Domain I과 Domain II)이 잘 보존되어 있다. PagDRM1은 현사시나무의 염색체에 1 ~ 2 copy가 존재하며, 줄기에서 가장 높게 발현하였고 성숙 잎, 뿌리 및 꽃에서도 높은 발현 수준을 나타내었다. 현탁배양세포의 생장주기에서는 늦은 지수생장기부터 정지기까지 높게 발현하였다. 또한 PagDRM1은 건조와 염 스트레스에 반응하여 발현이 증가하는 것으로 나타났다. 식물호르몬 처리에 의해서는 ABA와 GA 처리에 의한 발현 증가를 나타내었다. 따라서 PagDRM1은 식물의 휴면유도 과정에서 중요한 역할을 할 뿐만 아니라 환경 스트레스 내성에도 기여하는 것으로 생각된다.

임신 자궁 내막에서 Two-pore Domain 칼륨 통로의 발현 변화 (Alteration in Two-pore Domain K$^+$ Channel Expression in Endometrium of Pregnant Korean Cattle)

  • 최창용;탁현민;김창운;한재희;강다원
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제26권3호
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    • pp.209-214
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    • 2011
  • 임신의 성립 및 유지에 중요한 자궁 내막과 호르몬의 변화는 생식기관에서 발현되는 K$_{2P}$ 통로의 발현을 변화시킬 수 있다. 본 연구는 한우의 임신 자궁 내막에서 K$_{2P}$ 통로의 발현 변화가 나타나는지 그리고 프로게스테론에 의해 그 발현량이 변화되는지를 확인하고자 수행하였다. 역전사중합효소 중합반응과 웨스턴블닷 분석을 통하여 임신한 한우의 자궁 내막에서 mRNA와 단백질의 발현 변화를 조사하였다. TREK-1을 제외한 K$_{2P}$ 통로의 mRNA 발현량이 임신 자궁 내막에서 변화되었다. mRNA가 크게 변화되는 TASK-3, TREK-2, TRAAK 및 TRESK의 단백발현 변화량을 임신 자궁 내막에서 확인하였는데, TREK-2와 TRESK만 mRNA 발현 변화 양상과 동일하게 임신 자궁 내막에서 각각 7.9배, 2배 증가하였다. 자궁 내막세포에 프로게스테론(10 ${\mu}g$/mL)을 처리하였을 때 TREK-2와 TRESK는 자궁 내막 조직에서 보여준 결과와 유사하게 단백 발현량이 각각 10배, 6배 증가하였다. 이상의 결과로부터 K$_{2P}$ 통로, 특히 TREK-2와 TRESK는 프로게스테론 변화에 의해 임신 자궁 내막에서 발현량이 증가할 것으로 생각된다. 그리고 증가된 TREK-2와 TRESK는 임신에 의해 유발되는 생리학적 변화를 조절하는데 기여할 것으로 생각된다.