• 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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• 한국미생물생명공학회 1978년도 춘계학술대회
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• pp.98.5-99
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• 1978

항생물질과 RNA 분해효소를 동시에 생산하는 방선균의 한 균주를 토양으로부터 분리하여 이 균주가 생산하는 RNA 분해효소의 물리화학적 성질 및 분해산물에 대해 검토하였다. 효소반응의 최적 pH 및 온도는 명명 pH 5.6과 $50^{\circ}C이었다.$ $37^{\circ}C$ 에서 90분간 열처리 시켰을 때, 이 효소의 활성은 비교적 안정하였지마는 $50^{\circ}C$ 에서 90분간 열처리 시켰을 때는 효소활성이 심하게 저하되었다. 이 효소의 활성은 $Ba^{2+}$ 에 의하여 50% 정도의 저해 작용을 나타내었지만 EDTA에 의해서는 저해되지 않았다. 이 효소에 의한 RNA분해로 이 효소가 대사산물로서 guanosine, adenosine과 밝혀지지 않은 두 가지의 핵산관연물질을 생산함을 알 수 있었다. 제2보에서는 ENase의 효소학적 성질을 검토하였으며 이후 항생물질 측면에서 검토할 예정이다.

• 한국어류학회지
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• 제22권1호
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• pp.17-24
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• 2010

본 연구에서는 감성돔의 염분과 수온 변화에 따른 스트레스 반응을 알아보기 위하여 glucocorticoid receptor (GR) mRNA 발현을 조사하였다. 감성돔 신장으로부터 전장의 GR cDNA를 클로닝하였고, 염분과 수온이 변화하는 동안 아가미, 신장 및 장에서 GR mRNA 발현 변화를 quantitative real-time PCR (QPCR)을 이용하여 조사하였다. 염분 변화시, 아가미, 신장 및 장에서 GR mRNA 발현은 0 psu에서 가장 높게 나타났으며, 혈장 cortisol과 glucose 농도도 증가한 반면, triiodothyronine ($T_3$) 농도는 감소하였다. 수온 변화시, 아가미, 신장 및 장에서 GR mRNA 발현은 $30^{\circ}C$에서 가장 높게 관찰되었다. 혈장 cortisol, glucose 및 $T_3$ 농도 또한 고수온 ($30^{\circ}C$)에서 증가하였다. GR mRNA 발현의 증가는 염분과 수온 변화와 같은 환경 요인에 대한 좋은 스트레스 지표로 여겨진다.

• 한국양식학회지
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• 제19권4호
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• pp.315-322
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• 2006

본 연구에서는 담수사육 감성돔을 대상으로 수온을 상승시켰을 때, 세포적 스트레스 측면에서 HSP90 및 HSP70 mRNA의 발현 정도를, 신경-내분비적 스트레스 측면에서 혈장 cortisol 및 glucose 농도를 조사하였다. RT-PCR법을 이용하여 생식소로부터 HSP90 (891 bp) 및 HSP70 (465 bp) cDNA 단편을 클로닝 하여, 타 종과 그 상동성을 비교해 본 결과, 감성돔 HSP90은 참돔 HSP90과 99%, 무지개송어 HSP90과 95%, 대서양 연어HSP90과 94%, zebrafish HSP90과 94%로 나타났으며, 감성돔 HSP70은 무지개송어 HSP70과 96%, silver seabream HSP70과 95%, zebrafish HSP70과 95%의 상동성을 나타내었다. 감성돔의 사육수온을 $30\;^{\circ}C$로 상승시켰을 때, HSP90 mRNA는 모든 조직에서 그 발현 정도가 $20\;^{\circ}C$ 실험구에 비하여 $7{\sim}9$배 정도 높았으나, HSP70 mRNA는 생식소에서만 발현하는 것으로 나타났다. 혈장 cortisol 및 glucose 농도는 $20\;^{\circ}C$ 실험구에 비하여 $30\;^{\circ}C$ 실험구에서 유의하게 증가한 것으로 나타났다.

• 한국어류학회지
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• 제23권1호
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• pp.61-69
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• 2011

멸종위기 어류 미호종개(Cobitis choii)로부터 중금속해독 단백질(metallothionein) 유전자를 분리, 클로닝하고 중금속 및 고온 스트레스에 대한 전사 발현 특정을 분석하였다. 미호종개 metallothionein는 gDNA, mRNA 및 아미노산 서열 모두에서 경골 어류 MT들의 구조적 특징을 잘 보전하고 있었으며, 생물정보분석을 통해 미호종개 MT 유전자 5'-upstream 영역은 중금속 조절, 면역 반응 및 온도 반응에 관여하는 다양한 전사 조절인자들의 부착 위치들을 포함하는 것으로 관찰되었다. 카드뮴(Cd), 구리(Cu), 니켈(Ni), 망간(Mn) 및 아연(Zn)을 이용한 침지 노출 실험(0.5 및 $1.0\;{\mu}M$; 24시간)에서 미호종개 MT mRNA 발현은 구리 및 카드뮴 처리군에서 가장 많이 유도되었고($1.0\;{\mu}M$ Cu 처리군에서 최대 10배), 망간 처리군에서는 비교적 적은 양의 MT 발현이 유도된 반면(2배), 아연 및 니켈 노출 군에서는 유의적인 MT 발현의 증감이 관찰되지 않았다. 또한 미호종개 MT 전사 발현은 고온 자극 ($25^{\circ}C$로부터 $31^{\circ}C$까지 증가)에도 민감하게 반응하는 것으로 나타나, $31^{\circ}C$ 도달시점에서 $25^{\circ}C$ 초기 MT mRNA 발현 수준보다 9배 높은 mRNA 발현이 관찰되었다. 본 연구 결과는 MT 기반의 유전자 발현 분석을 이용함으로써, 향후 멸종위기 어류 미호종개의 스트레스 반응 연구에 유용한 기초 자료를 제공할 수 있다고 기대된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제32권7호
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• pp.938-948
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• 2022

Gastric cancers (GC) are generally malignant tumors, occurring with high incidence and threatening public health around the world. Circular RNAs (circRNAs) play crucial roles in modulating various cancers, including GC. However, the functions of circRNAs and their regulatory mechanism in colorectal cancer (CRC) remain largely unknown. This study focuses on both the role of circCOL1A2 in CRC progression as well as its downstream molecular mechanism. Quantitative polymerase chain reaction (qPCR) and western blot were adopted for gene expression analysis. Functional experiments were performed to study the biological functions. Fluorescence in situ hybridization (FISH) and subcellular fraction assays were employed to detect the subcellular distribution. Luciferase reporter, RNA-binding protein immunoprecipitation (RIP), co-immunoprecipitation (Co-IP), RNA pull-down, and immunofluorescence (IF) and immunoprecipitation (IP) assays were used to explore the underlying mechanisms. Our results found circCOL1A2 to be not only upregulated in GC cells, but that it also propels the migration and invasion of GC cells. CircCOL1A2 functions as a competing endogenous RNA (ceRNA) by sequestering microRNA-1286 (miR-1286) to modulate ubiquitin-specific peptidase 10 (USP10), which in turn spurs the migration and invasion of GC cells by regulating RFC2. In sum, CircCOL1A2 sponges miR-1286 to promote cell invasion and migration of GC by elevating the expression of USP10 to downregulate the level of RFC2 ubiquitination. Our study offers a potential novel target for the early diagnosis and treatment of GC.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제27권2호
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• pp.131-141
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• 2023

Compelling evidence has demonstrated the critical role of circular RNAs (circRNAs) during lung adenocarcinoma (LUAD) progression. Herein, we explored a novel circRNA, circ_0129047, and detailed its mechanism of action. The expression of circ 0129047, microRNA-665 (miR-665), and protein tyrosine phosphatase receptor type B (PTPRB) in LUAD tissues and cells was determined using reverse transcription quantitative polymerase chain reaction and Western blotting. Cell Counting Kit8 and colony formation assays were conducted to detect LUAD cell proliferation, and western blotting was performed to quantify apoptosis-related proteins (Bcl2 and Bax). Luciferase reporter and RNA immunoprecipitation assays were used to validate the predicted interaction between miR-665 and circ_0129047 or PTPRB. A xenograft assay was used for the in vivo experiments. Circ_0129047 and PTPRB were downregulated in LUAD tissues and cells, whereas miR-665 expression was upregulated. Overexpression of circ_0129047 suppresses LUAD growth in vivo and in vitro. Circ_0129047 is the target of miR-665, and the miR-665 mimic ablated the antiproliferative and pro-apoptotic phenotypes of LUAD cells by circ_0129047 augmentation. MiR-665 targets the 3'UTR of PTPRB and downregulates PTPRB expression. PTPRB overexpression offsets the pro-proliferative potential of miR-665 in LUAD cells. Circ_0129047 sequestered miR-665 and upregulated PTPRB expression, thereby reducing LUAD progression, suggesting a promising approach for preventing LUAD.

• Plant Biotechnology Reports
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• 제3권1호
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• pp.75-85
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• 2009

We report here a first evaluation of chilling-responsive gene regulation in the sweetpotato. The growth of sweetpotato plants was severely retarded at $12^{\circ}C$; the lengths of the leaf, petiole, and root were markedly reduced and microscopic observation revealed that the elongation growth of the epidermal cells in each of these organs was significantly reduced. We examined the transcriptional regulation of three sweetpotato expansin genes (IbEXP1, IbEXP2 and IbEXPL1) in response to various chilling temperatures (12, 16, 22, and $28^{\circ}C$). In the leaf and petiole, the highest transcript levels were those of IbEXP1 at $28^{\circ}C$, whereas IbEXPL1 transcript levels were highest in the root. IbEXP1 mRNA levels in the $12^{\circ}C-treated$ petiole showed a fluctuating pattern (transient decrease-recovery-stable decrease) for 48 h. In the leaf and petiole, IbEXP1 and IbEXPL1 exhibited a similar response to chilling in that their mRNA levels decreased at $22^{\circ}C$, increased at $16^{\circ}C$, and decreased dramatically at $12^{\circ}C$. In contrast, mRNA levels of IbEXP2 in the leaf fell gradually as the temperature fell from 28 to $12^{\circ}C$, while they remained unaltered in the petiole. In the root, mRNA levels of IbEXPL1 and IbEXP1 reached maximum levels at $16^{\circ}C$, and decreased significantly at $12^{\circ}C$. These data demonstrated that expression of these three expansin genes was ultimately down-regulated at $12^{\circ}C$; however, transcriptional regulation of each expansin gene exhibited its own distinctive pattern in response to various chilling temperatures.

• BMB Reports
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• 제53권2호
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• pp.82-87
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• 2020

Circular RNAs (circRNAs), one kind of non-coding RNA, have been reported as critical regulators for modulating gene expression in cancer. In this study, microarray analysis was used to screen circRNA expression profiles of bladder cancer (BC) 5637 cells, T24 cells and normal control SV-HUC-1 cells. The data from the microarray showed that hsa_circ_0075828 (named circCASC15) was most highly expressed in 5637 and T24 cells. circCASC15 was highly expressed in BC tissues and cells. Overexpression of circCASC15 was closely associated with BC tumor stage and promoted cell proliferation significantly in vitro and in vivo. Mechanistically, circCASC15 could act as miR-1224-5p sponge to activate the expression of CREB1 to promote cell proliferation in BC. In short, circCASC15 promotes cell proliferation in BC, which might be a new molecular target for BC diagnosis and therapy.

• 한국균학회지
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• 제20권3호
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• pp.234-239
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• 1992

Virus 이병(罹病) 느타리버섯 (Pleurotus spp.)으로부터 이중나선(二重螺腺) ribo 핵산(核酸 )(ds RNA)을 분리(分離)하였다. Ds RNA 는 8100 base pairs(bp)의 큰 band 와 2170, 2120, 1980 및 1840 bp의 4개 작은 band로 이루어졌다. Ds RNA 분석법(分析法)으로 느타리버섯의 Virus 이병여부(罹病與否)를 조사(調査)한 결과(結果) 균사생장(菌絲生長)이 부진(不振)하고 세균성(細菌性) 갈색(褐色) 부패병(腐敗病) 등(等)에 이병(罹病)되고 이상자실체(異常子實體)를 형성(形成)하는 느타리버섯으로부터 Virus 이병(罹病)을 확인(確因)하였으나 건전(健全)버섯으로부터는 ds RNA를 분리(分離)하지 못하였다. 이 병(病)은 해외(海外)로부터 전래(傳來)한 것으로 보인다. Ds RNA 는 저농도염류액(底濃度鹽類液) (0.1XSSC)에서 RNase A 에 용해(鎔解)되었으며 $85^{\circ}C$ 에서 특성변화(特性變化)가 발생(發生)하였다.

• Molecules and Cells
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• 제42권5호
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• pp.379-385
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• 2019

Non-coding RNAs (ncRNAs) comprise various RNA species, including small ncRNAs and long ncRNAs (lncRNAs). ncRNAs regulate various cellular processes, including transcription and translation of target messenger RNAs. Recent studies also indicate that ncRNAs affect organismal aging and conversely aging influences ncRNA levels. In this review, we discuss our current understanding of the roles of ncRNAs in aging and longevity, focusing on recent advances using the roundworm Caenorhabditis elegans. Expression of various ncRNAs, including microRNA (miRNA), tRNA-derived small RNA (tsRNA), ribosomal RNA (rRNA), PIWI-interacting RNA (piRNA), circular RNA (circRNA), and lncRNA, is altered during aging in C. elegans. Genetic modulation of specific ncRNAs affects longevity and aging rates by modulating established aging-regulating protein factors. Because many aging-regulating mechanisms in C. elegans are evolutionarily conserved, these studies will provide key information regarding how ncRNAs modulate aging and lifespan in complex organisms, including mammals.