Nine strains of xyl mutants that could not utilize xylose as a carbon source were isolated from E. coli JM109 by the treatment of NTG in order to investigate the regulation of xylose operon and to use recipient cells for the cloning of xylR gene. For the characterization of all isolated mutants, colony colors of all mutants on MacConkey-xylose and MacConkey-xylulose agar plate were observed for the utilization of xylose and xylulose, and the growth level and the activity of xylose isomerase and xylulokinase were determined in need. The isolated xylR/T mutants formed the white colony on MacConkey-xy-lose and MacConkey-xylulose agar plate. They did not detect the activity of xylose isomerase, and the activity of xylose isomerase was not restored in transformants of xylR/T mutant with pEX13 which contained xylA gene. xylR and xylT mutants were classified from xylR/T mutants depending upon the growth level in minimal medium. xylT mutants; DH13, DH121 and DH125 could grow a little in that medium, but xylR mutants; DH10, DH53, and DH60 could not grow that medium.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.24
no.2
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pp.247-253
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1995
This paper was performed to investigate the changes of non-cellulosic neutral sugars composition in cell wall of persimmon fruit by treatment of cell wall degrading enzyme in vitro. Rhamnose, xylose and galactose in cell wall by polygalacturonase treatment, arabinose, galactose and rhamnose in cell wall by mixed enzyme treatment and arabinose and galactose in cell wall by ${\beta}-galactosidase$ treatment decreased, respectively. Noncellulosic neutral sugars of pectins extracted cell wall by enzyme treatments decreased and those by polygalacturonase treatment decreased remarkably. Rhamnose, arabinose and xylose in hemicellulose I of cell wall by polygalacturonase treatment were higher than those of untreated, and rhamnose and xylose in that by ${\beta}-galactosidase$ treatment were higher but arabinose, mnnose and galactose decreased. Xylose, mannose and glucose in that by mixed enzyme treatment were higher than those of untreatment and arabinose and galactose decreased. Contents of total non-cellulosic neutral sugars in hemicellulose of untreatment, and contents xylose, and glucose in hemicellulose II of cell wall by polygalacturonase treatmet decreased but those of other treatments were not changed.
A bacterium producing the extracellular xylanase was isolated from soil and has been identified as a Bacillus sp. strain. The isolate, named Bacillus sp. AMX-4, was shown to be similar to B. subtilis strain on the basis of its chemical compositions. The xylanase of culture supernatant was most active at 50℃ and pH 6.0. The additional carbon sources including monosaccharides, disaccharides, wheat bran, and rice straw increased the enzyme productivity. Especially, the maximum xylanase productivity was reached 29.2 units/ml in LB medium supplemented with 1.5% (w/v) xylose, which was 16-folds more than that in LB medium. As the results of investigating the effects of xylose on cell growth and xylanase productivity of Bacillus sp. AMX-4, increase of xylanase production was owing to the induction of xylanase biosynthesis. It was also found that the enzyme production was in association with the growth of Bacillus sp. AMX-4.
Two stage fermentations of glucose/xylose mixture which is similar composition with rice straw hemicellulose hydrolysate were performed by Candida mogii ATCC 18364. In first stage, glucose was consumed rapidly for cell growth in aerobic condition (2 vvm, 300 rpm), then D-xylose was used for xylitol production in semi-aerobic condition (1 vvm, 300 rpm). After 4 days of fermentation, about $24\;g/{\ell}$ xylitol was produced with a yield of 0.58 g/g and volumetric productivity of $0.25\;g/{\ell}{\cdot}h$. To improve the xylitol yield by reduction of xylose consumption for cell growth and maintenance, D-glucose was continuously supplemented during the second stage of fermentation. By D-glucose feeding of $6.8\;g/{\ell}{\cdot}$ day, xylitol was produced up to $29\;g/{\ell}$ with a yield of 0.8 g/g and volumetric productivity $0.30\;g/{\ell}{\cdot}h$ which are 1.2-1.3 times higher than those obtained without D-glucose feeding.
Green layer, Enteromorpha prolifera, is regarded as one of important materials for food processing in Korea. The acidic water-soluble polysaccharide (CPC-PS) isolated from the alga with hot water and cetylpyridium chloride was mainly constituted of rhamnose, xylose, uronic acid and sulfate. To determine the glycosyl-linkages and positions of sulfate by methylation, the CPC-PS was reduced and/or sulfates. A marked increase of glucose content in the reduced polysaccharide indicated that glucuronic acid was a major sugar in the polymer and sulfation was deduced to occur on O-3 of rhamnose and O-2 of xylose. According to the methylation analysis of the native, reduced, desulfated and reduced-desulfated polymers, CPC-PS mainly composed of 1,4- and 1,2,3-linked rhamnose 3-sulfate, 1,4-linked xylose 2-sulfate, 1,4-linked xylose and 1,4-linked glucuronic acid. Minor 1,4-linked rhamnose and 1,4,6-linked galactose residues were also detected.
The biochemical study of sugar uptake in yeasts started five decades ago and led to the early production of abundant kinetic and mechanistic data. However, the first accurate overview of the underlying sugar transporter genes was obtained relatively late, due mainly to the genetic complexity of hexose uptake in the model yeast, Saccharomyces cerevisiae. The genomic era generated in turn a massive amount of information, allowing the identification of a multitude of putative sugar transporter and sensor-encoding genes in yeast genomes, many of which are phylogenetically related. This review aims to briefly summarize our current knowledges on the biochemical and molecular features of the transporters of pentoses in yeasts, when possible establishing links between previous kinetic studies and genomic data currently available. Emphasis is given to recent developments concerning the identification of D-xylose transporter genes, which are thought to be key players in the optimization of S. cerevisiae for bioethanol production from lignocellulose hydrolysates.
Furfural is a platform chemical that is produced from xylose, one of the hemicellulose components of lignocellulosic biomass. Furfural can be used as an important feedstock for phenolic compounds or biofuels. In this study, we compared and optimized the conditions for producing furfural from xylose in a batch system using two types of catalysts: sulfuric acid, which is commonly used in the furfural production process, and formic acid, which is an environmentally friendly catalyst. We investigated the effects of xylose initial concentration (10 g/L~100 g/L), reaction temperature (140~200 ℃), sulfuric acid catalyst (1~3 wt%), formic acid catalyst (5~10 wt%), and reaction time on the furfural yield. The optimal conditions according to the type of catalyst were as follows. For sulfuric acid catalyst, 3 wt% of catalyst concentration, 50 g/L of xylose initial concentration, 180 ℃ of temperature, and 10min of reaction time resulted in a maximum furfural yield of 59.0%. For formic acid catalyst, 5 wt% of catalyst concentration, 50 g/L of xylose initial concentration, 180 ℃ of temperature, and 150 min of reaction time resulted in a furfural yield of 65.3%.
Xylitol is widely used in the food and medical industry. It is produced by the reduction of xylose (lignocellulosic biomass) in the Saccharomyces cerevisiae strain, which is considered genetically safe. In this study, the expression system of the GRE3 (YHR104W) gene that encodes xylose reductase was constructed to efficiently produce xylitol in the S. cerevisiae strain, and the secretory production of xylose reductase was investigated. To select a suitable promoter for the expression of the GRE3 gene, pGMF-GRE3 and pAMF-GRE3 plasmid with GAL10 promoter and ADH1 promoter, respectively, were constructed. The mating factor ${\alpha}$ ($MF{\alpha}$) signal sequence was also connected to each promoter for secretory production. Each plasmid was transformed into S. cerevisiae $SEY2102{\Delta}trp1$, and $SEY2102{\Delta}trp1$/pGMF- GRE3 and $SEY2102{\Delta}trp1$/pAMF-GRE3 transformants were selected. In the $SEY2102{\Delta}trp1$/pGMF-GRE3 strain, the total activity of xylose reductase reached 0.34 unit/mg-protein when NADPH was used as a cofactor; this activity was 1.5 fold higher than that in $SEY2102{\Delta}trp1$/pAMF-GRE3 with ADH1 as the promoter. The secretion efficiency was 91% in both strains, indicating that most of the recombinant xylose reductase was efficiently secreted in the extracellular fraction. In a baffled flask culture of the $SEY2102{\Delta}trp1$/pGMF-GRE3 strain, 12.1 g/l of xylitol was produced from 20 g/l of xylose, and ~83% of the consumed xylose was reduced to xylitol.
Fermentation characteristics of recombinant Saccharomyces cerevisiae containing the xylose reductase gene from Pichia stipitis were analyzed in an attempt to convert xylose to xylitol, a natural five-carbon sugar alcohol used as a sweetener. Xylitol was produced with a maximum yield of 0.95 (g xylitol/g xylose consumed) in the presence of glucose that is used as a cosubstrate for cofactor regeneration. However addition of glucose caused inhibition of xylose transport and accumulation of ethanol. Such problems were solved by adopting glucose-limlted fed-batch fermentation. This process done with S, cerevisiae EHl3.15:pY2XR at$30\;^{\circ}C$ resulted in 105.2g/L xylitol concentration with maximum productivity of 1.69 g $L^{-1}$$hr^{-1}$.
A yeast strain, BT001, which can directly ferment D-xylose to ethanol was isolated from forest soils, and then identified as Candida sp. Cultural conditions for the optimum ethanol production, along with the effects of aeration on cell growth and ethanol production were investigated. Aeration stimulated the cell growth and the volumetric rate of ethanol production, but decreased the ethanol yield. Optimum temperature and initial pH for the ethanol production were $33{\circ}^C$ and 6.0, respectively. In a shake flask culture, this strain produced 52.3 g ethanol per liter from 12%(w/v) D-xylose after incubation for 96 hours. Ethanol yield was 0.436 g per g D-xylose consumed. This corresponds to 85.8% of theoretical yield. Also, this yeast strain produced ethanol from D-galactose, D-glucose and D-mannose, but not from L-arabinose and L-rhamnose. Among these sugars, D-glucose was the fastest in being converted to ethanol sugars.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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