To evaluate the involvement of translation initiation factors eIF4E and eIFiso4E in Chilli veinal mottle virus (ChiVMV) infection in pepper, we conducted a genetic analysis using a segregating population derived from a cross between Capsicum annuum 'Dempsey' containing an elF4E mutation ($pvr1^2$) and C. annuum 'Perennial' containing an elFiso4E mutation (pvr6). C. annuum 'Dempsey' was susceptible and C. annuum 'Perennial' was resistant to ChiVMV. All $F_1$ plants showed resistance, and $F_2$ individuals segregated in a resistant-susceptible ratio of 166:21, indicating that many resistance loci were involved. Seventy-five $F_2$ and 329 $F_3$ plants of 17 families were genotyped with $pvr1^2$ and pvr6 allele-specific markers, and the genotype data were compared with observed resistance to viral infection. All plants containing homozygous genotypes of both $pvr1^2$ and pvr6 were resistant to ChiVMV, demonstrating that simultaneous mutations in elF4E and eIFiso4E confer resistance to ChiVMV in pepper. Genotype analysis of $F_2$ plants revealed that all plants containing homozygous genotypes of both $pvr1^2$ and pvr6 showed resistance to ChiVMV. In protein-protein interaction experiments, ChiVMV viral genome-linked protein (VPg) interacted with both eIF4E and eIFiso4E. Silencing of elF4E and eIFiso4E in the VIGS experiment showed reduction in ChiVMV accumulation. These results demonstrated that ChiVMV can use both eIF4E and eIFiso4E for replication, making simultaneous mutations in eIF4E and eIFiso4E necessary to prevent ChiVMV infection in pepper.
Park, Bong-Kum;Ahn, Hye-Jin;Yum, Hye-Jung;Lee, Jae-Hwa;Park, Chang-Won;Ryu, Ki-Hyun
한국식물병리학회:학술대회논문집
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한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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pp.76.2-77
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2003
The complete nucleotide sequences of genomic RNA of an isolate of soybean mosaic virus (SMV-CN18), which has ability to overcome Rsv resistance of soybean, have been determined. A large open reading frame encodes a polyprotein of 3068 amino acids with a predicted Mr of 350 kDa. Based on comparison with the proposed cleavage site of other potyviral polyproteins, nine mature proteins are predicted as a following order, P1, HC-Pro, P3, CI, 6K, VPg, NIa, NIb and coat protein (CP). The mature proteins of the strain share various amino acid identity with known SMV-G2, -G7 and -N strain, with the greatest variability occurring in the P1 (91 %, 88 %, 96%)and the lowest variability in the CP (100 %, 99 %, 100 %). In addition, 5' untranslated region determined by 5' RACE is much more various than any coding regions. Difference in amino acid sequences throughout the genome is discussed in relation to resistance and susceptibility of soybean cultivars to SMV-CNl8.
Barley Yellow Dwarf Virus (BYDV) has been a major disease causing a severe loss of yield in winter cereals worldwide. It has been recently reported that BYDV occurs frequently in wheat field and also causes serious yield reduction in Korea. This study was performed to investigate the regional distributions of BYDV strains in Korea and to identify the resistant cultivars or lines of wheat to the predominant BYDV strains, providing basic information for the breeding of BYDV-resistant wheat varieties. Using RT-PCR and EcoRI digestion methods, the regional distribution of BYDV strains in Korea from 1999 to 2000 showed that PAV strain was mainly detected about 65% (Vic-PAV 52.6% ; CN-PAV 47.4%) and MAV strain about 3%. Using ELISA test for the examination of BYDV resistance with 17 cultivars and 4 lines among Korean wheat, three cultivars, Gurumil, Topdongmil, and Olgurumil, were susceptible to BYDV and the others were resistant. In plant growth and yield component responses to BYDV infection, Gurumil showed significant difference between the uninfected and the infected, suggesting the most susceptible to BYDV among Korean wheat, but Eun-pamil and Seohae118 did no difference, an indication that they have the highest resistance.
Tobacco mosaic virus (TMV), TMV-common strain, causes severe damage on flue-cured tobacco in Korea. As the results, breeding programs were conducted to transfer the TMV resistance from NC567 to other cultivars. Advantage of F1, hybrid may not lie only in their heterotic value but also in directly combining of valuable dominant traits, e.g. for disease resistance, either in pairs or as groups already assembled in the two parents. A new TMV resistant flue-cured tobacco variety KF114 was developed from a cross as maternal parent MSNC567 and NC82 at the Suwon Experiment Station. KF114 was more vigorous growth characteristics in early stage than that of NC82, standard variety in Korea, and other characters were similar to those of NC82. It os high resistance to TMV, but bacterial wilt(Pseudomonas solanacerum) and black shank (Phytophthora parasitica var. nicotianae) is comparable to NC82. It should adapt well to the flue-cured production area and can reduce premature flowering under unfavorable weather conditions. Yield of KF114 is 1% to 5% higher, and nearly equal in value per KG compared with NC82. This variety, F1 hybrid, met acceptable standards for chemical and physical characteristics of cured leaf and high ranked good smoking taste by panel members in Korea Ginseng and Tobacco Research Institute.
Four newly developed cotton mutants (M-111, M-7662, M-358 and M-218) were compared for their resistance against Cotton leaf curl virus(CLCuV) together with commercial resistant (CIM-443, CIM-482, CIM-473, FH-900 and FH-901) and susceptible (5-12) varieties by artificial inoculation through grafting and under natural field conditions. Infectivity and success of grafting were 100% in all cases. None of the grafted plants were found immune or asymptomatic. All the grafted mutants and most of their single plant progeny rows (SPPRs) showed highly resistant responses as the symptoms displayed by these mutants were milder than the commercial cultivars. Grafted mutants also had delayed disease reactions as they took more time (25-30 days) to produce disease symptoms, as compared with resistant commercial varieties that produced disease 18-22 days after inoculation. Growth of the grafted SPPRs of tested mutants was normal, which is an indication that there will be no production losses. Observations under natural infestation of whitefly showed that two SPPRs of M-ll/CE and M-7662-1/2 and one resistant variety CIM-443 exhibited slight incidence of disease, while one SPPR of M-l1/59 and S-12 were moderately susceptible and highly susceptible with 21% and 97.l% disease incidence, respectively. This study also showed that plants displaying more disease symptoms through grafting were easily infected under natural conditions. These results suggest that preference should be given to those plants that exhibited highly resistant responses after artificial inoculation.
Cho, Won Kyong;Lian, Sen;Kim, Sang-Min;Park, Sang-Ho;Kim, Kook-Hyung
The Plant Pathology Journal
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제29권3호
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pp.223-233
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2013
Rice stripe virus (RSV) is one of the most destructive viruses of rice, and greatly reduces rice production in China, Japan, and Korea, where mostly japonica cultivars of rice are grown. RSV is transmitted by the small brown plant-hopper (SBPH) in a persistent and circulative-propagative manner. Several methods have been developed for detection of RSV, which is composed of four single-stranded RNAs that encode seven proteins. Genome sequence data and comparative phylogenetic analysis have been used to identify the origin and diversity of RSV isolates. Several rice varieties resistant to RSV have been selected and QTL analysis and fine mapping have been intensively performed to map RSV resistance loci or genes. RSV genes have been used to generate several genetically modified transgenic rice plants with RSV resistance. Recently, genome-wide transcriptome analyses and deep sequencing have been used to identify mRNAs and small RNAs involved in RSV infection; several rice host factors that interact with RSV proteins have also been identified. In this article, we review the current statues of RSV research and propose integrated approaches for the study of interactions among RSV, rice, and the SBPH.
Yoon, Ju-Yeon;Ryu, Ki Hyun;Choi, Seung-Kook;Choi, Gug Sun;Kwon, Soon Bae;Park, Jin Woo;Palukaitis, Peter
식물병연구
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제18권4호
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pp.268-276
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2012
Broad bean wilt virus 2 (BBWV2), genus Fabavirus, subfamily Comovirinae, family Secoviridae, causes damage in many economically important horticultural and ornamental crops. Sequence alignments showed several conserved sequences in 5' non-coding regions (5' NCRs) of RNA 1 and RNA 2 in all BBWV2 strains characterized so far. Based on this observation, we generated a hpRNA construct (pIR-BBWV2) harboring an inverted repeat containing a 210 bp cDNA fragment homologous to 5' NCR portion of BBWV2 RNA 1 to investigate the silencing potential for its ability to interfere with a rapidly replicating BBWV2. Agrobacterium-mediated transient expression of the IR-BBWV2 had a detrimental effect on BBWV2 infection, showing no distinct symptoms in non-inoculated leaves of the agroinfiltrated Nicotiana benthamiana plants. BBWV2 genomic RNAs were not detected by RT-PCR from tissues of both the inoculated leaves and upper leaves of the agroinfiltrated plants. Accumulation of virus-derived small interfering RNAs was detected in the inoculated leaf tissues of N. benthamiana plants elicited by transient expression of IR-BBWV2 indicating that RNA silencing is responsible for the resistance to BBWV2.
Molee, A.;Kongroi, K.;Kuadsantia, P.;Poompramun, C.;Likitdecharote, B.
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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제29권1호
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pp.29-35
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2016
The aim of the present study was to investigate the effect of single nucleotide polymorphisms in the major histocompatibility complex (MHC) class II gene on resistance to Newcastle disease virus and body weight of the Thai indigenous chicken, Leung Hang Khao (Gallus gallus domesticus). Blood samples were collected for single nucleotide polymorphism analysis from 485 chickens. Polymerase chain reaction sequencing was used to classify single nucleotide polymorphisms of class II MHC. Body weights were measured at the ages of 3, 4, 5, and 7 months. Titres of Newcastle disease virus at 2 weeks to 7 months were determined and the correlation between body weight and titre was analysed. The association between single nucleotide polymorphisms and body weight and titre were analysed by a generalized linear model. Seven single nucleotide polymorphisms were identified: C125T, A126T, C209G, C242T, A243T, C244T, and A254T. Significant correlations between log titre and body weight were found at 2 and 4 weeks. Associations between single nucleotide polymorphisms and titre were found for C209G and A254T, and between all single nucleotide polymorphisms (except A243T) and body weight. The results showed that class II MHC is associated with both titre of Newcastle disease virus and body weight in Leung Hang Khao chickens. This is of concern because improved growth traits are the main goal of breeding selection. Moreover, the results suggested that MHC has a pleiotropic effect on the titre and growth performance. This mechanism should be investigated in a future study.
전 세계적으로 주요 작물에서 기후변화, 무역의 다변화 등 여러 요인에 의해 식물바이러스에 의한 작물 생산량 감소 등의 경제적 손실이 심각하다. 이에 경제 작물에서 심각한 바이러스 병 피해를 줄이기 위한 여러 바이러스에 대한 광범위한 저항성 작물개발이 시급하다. 식물바이러스 병 예방 및 방제를 위해서 지금까지 연구해왔던 바이러스-식물간의 상호작용 기초 연구결과물 뿐만 아니라 식물면역 관련 과학적 방법 종합화를 통한 응용화된 연구 진행이 필요하다. 본 리뷰에서는 바이러스 저항성 작물 도입을 위해 지금까지 연구되어 왔던 식물면역 기작을 소개하고 이를 활용한 작물 개발 사례를 소개하였다. 또한 유전자교정기술과 같은 게놈 공학 기술을 활용한 바이러스 저항성 작물의 필요성과 연구 방향에 대해 기술하였다. 본 리뷰를 통해 현재까지 알려져 있는 바이러스 면역 기작에 대한 이해를 돕고, 최신 바이러스 병방제 기술들을 소개함으로써 농민들뿐만 아니라 연구자들에게도 도움이 되기를 바라며, 식물면역 연구가 작물 재배 중 발생할 수 있는 바이러스 병 농가 피해를 감소시킬 수 있는 효과적인 대응 방안으로 이어지길 바란다.
무(Raphanus sativus L.) 육종 계통들에 대한 순무모자이크 바이러스(Turnip mosaic virus, TuMV) 저항성을 평가하기 위하여, 20개 무 육종계통들의 잎에 순무모자이크바이러스 BR 병원성을 가지는 국내 분리 계통을 즙액 접종하였다. 순무모자이크바이러스를 접종한 무 개체들은 $22^{\circ}C{\pm}3^{\circ}C$에서 재배하였으며 4주 동안 바이러스 병징 발현을 육안으로 조사하여 저항성을 평가하였다. 순무모자이크바이러스 감염에 의해서 무 육종계통들의 다른 병징 발현에 의해 분석한 결과, 16개 무 계통은 약한 모자이크, 모틀링에서 심한 모자이크 전신 병징을 보였으며 감수성으로 판별되었다. 이러한 결과는 순무모자이크바이러스 외피단백질 유전자에 대한 특이적 역전사중합효소연쇄반응에 의하여 확인되어, 순무모자이크바이러스가 병징을 발현시킨 원인이었다. 이와는 다르게 4개 무 육종계통들에서는 모자이크 등 전신 감염 병징이 발현되지 않았으며, 동일한 무 육종 계통들의 개체들에서 8주 동안 병징이 관찰되지 않았다. 역전사중합효소연쇄반응으로 조사한 결과 4개 무 육종 계통들의 상엽들에서 순무모자이크바이러스가 검출되지 않았다. 이런 결과는 4개 무 육종계통들이 순무모자이크바이러스에 대한 강한 저항성을 가지고 있음을 예시해준다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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