• The Plant Pathology Journal
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• 제36권5호
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• pp.428-439
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• 2020

Erwinia pyrifoliae is a Gram-negative bacterial plant pathogen that causes black shoot blight in apple and pear. Although earlier studies reported the genome comparison of Erwinia species, E. pyrifoliae strains for such analysis were isolated in 1996. In 2014, the strain E. pyrifoliae EpK1/15 was newly isolated in the apple tree showing black shoot blight in South Korea. This study aimed to better understand the similarities and differences caused by natural variations at the genomic level between newly isolated E. pyrifoliae EpK1/15 and the strain Ep1/96, which were isolated almost 20 years apart. Several comparative genomic analyses were conducted, and Clusters of Orthologous Groups of proteins (COG) database was used to classify functional annotation for each strain. E. pyrifoliae EpK1/15 had similarities with the Ep1/96 strain in stress-related genes, Tn3 transposase of insertion sequences, type III secretion systems, and small RNAs. The most remarkable difference to emerge from this comparison was that although the draft genome of E. pyrifoliae EpK1/15 was almost conserved, Epk1/15 strain had at least three sorts of structural variations in functional annotation according to COG database; chromosome inversion, translocation, and duplication. These results indicate that E. pyrifoliae species has gone natural variations within almost 20 years at the genomic level, and we can trace their similarities and differences with comparative genomic analysis.

• The Plant Pathology Journal
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• 제19권6호
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• pp.288-290
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• 2003

Shoot blight of suckers of common lilac plants (Syringa vulgaris) was found in an apartment garden in Daegu, Korea. The causal organism was a species of Phytophthora, which was homothallic with paragynous antheridium. Oogonia were globose and measured 21.5-34.0 $\mu\textrm{m}$ with an average of 29.7$\pm$3.2 $\mu\textrm{m}$ in diameter. Oospores in oogonia were round, light orange brown when mature, mostly plerotic, and measured an average of 25.6$\pm$3 $\mu\textrm{m}$ in diameter. Antheridia were ovoid and around 11.7$\times$7.8 $\mu\textrm{m}$. Sporangia seldom formed on agar media but formed abundantly in water. Sporangia that formed in water were semipapillate, ovoid obpyriform, non-caducous, and 23.4-66.3$\times$17.6-37.1 $\mu\textrm{m}$ in dimension with I/b ratio of 1.46. The causal organism was identified as Phytophthora citricola Sawada on the basis of morphological characteristics. This is the first report of shoot blight caused by P. citricola Sawada in lilac suckers in Korea.

• The Plant Pathology Journal
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• 제34권5호
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• pp.445-450
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• 2018

Bacteriophages, bacteria-infecting viruses, have been recently reconsidered as a biological control tool for preventing bacterial pathogens. Erwinia amylovora and E. pyrifoliae cause fire blight and black shoot blight disease in apple and pear, respectively. In this study, the bacteriophage phiEaP-8 was isolated from apple orchard soil and could efficiently and specifically kill both E. amylovora and E. pyrifoliae. This bacteriophage belongs to the Podoviridae family. Whole genome analysis revealed that phiEaP-8 carries a 75,929 bp genomic DNA with 78 coding sequences and 5 tRNA genes. Genome comparison showed that phiEaP-8 has only 85% identity to known bacteriophages at the DNA level. PhiEaP-8 retained lytic activity up to $50^{\circ}C$, within a pH range from 5 to 10, and under 365 nm UV light. Based on these characteristics, the bacteriophage phiEaP-8 is novel and carries potential to control both E. amylovora and E. pyrifoliae in apple and pear.

• 아시안잔디학회지
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• 제12권3호
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• pp.215-224
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• 1998

본 시험은 미국과 유럽으로부터 도입된 5개 초종 23개 품종의 한지형 잔디의 생육특성, 추위와 가뭄에 대한 내성, 내병성 및 녹색도를 조사하기 위하여 1995년 연암축산원예전문대학 잔디시험 포장에서 실시하였다. Kentucky bluegrass는 8개 품종중에 Newport 와 Glade가 우수하였는데 Newport는 균일성, 피복도, 질감 등에서 최고의 품질을 나타내었으며 여름철의 질병에도 강하였으나 녹색도가 옅고 가뭄에 대한 저항성, 가을철의 녹병에는 약하였고 늦가을의 녹색도가 유지되지 않는 단점이 있었으며 Glade 품종은 녹색도가 진하며 밀도, 피복도, 균일성, 여름철 질병과 녹병에 대한 저항성 등에서 모두 중상정도로 우수하였으나 가뭄에 대한 저항성과 질감이 다소 나쁘고 Pythium blight에 약하였다. Tall fescue는 5개 품종 중 Revel과 Revel Jr. 품종이 진한 녹색을 나타내었으며 밀도, 균일성, 피복도 등 거의 모든 조사항목에서 다른 품종에 비해 우수한 결과를 나타내었다. Red fescue는 봄철의 질감은 뛰어났지만 모든 품종이 여름장마철에 질병으로 사멸하였다. Ryegrass는 4개 품종중 Dandy 품종이 질감을 제외한 거의 모든 조사항목에서 다른 품종에 비해 매우 우수한 결과를 나타내었다.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
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• 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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• pp.128.2-128
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• 2003

Shoot blight was occurring on shoots of suckers of common lilac (Syringa vulgaris L.) growing in first author's apartment garden in May 2003. A species of Phytophthora was isolated from the lesions. The isolate did not sporulate on agar media but formed sporangia in water and also formed sex organs in single culture. Sporangia were semipapillate, ovoid obpyriform, measured 45.6-52.8 ${\times}$ 33.6-36.0$\mu\textrm{m}$. Sporagia were very variable in shape. Optimum temperature for mycelial growth was 25$^{\circ}C$. Oogonia were spherical and antheridia were paragynous. Optimum temp for mycelial growth was 25$^{\circ}C$. The isolate was identified as Phytopkhora citricola on the basis of the morphological characteristics and cardinal temperature.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
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• 한국식물병리학회 2002년도 총회 및 추계학술발표회
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• pp.44.3-45
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• 2002

• 미생물학회지
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• 제55권1호
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• pp.80-82
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• 2019

Pseudomonas syringae pv. syringae WSPS007 균주는 대한민국 경상북도 영주시 사과 과원에서 나타난 가지마름병 병징으로부터 2013년 분리되었다. 본 논문에서는 6,238,498 bp(59.04% G+C 함량)인 WSPS007 균주의 전체 염기서열을 보고한다. 전체 지놈은 5,379개의 코딩서열, 65개의 tRNA, 16개의 rRNA 유전자를 가지고 있다. 특히 WSPS007 균주의 전체 염기서열 분석은 냉해와 관련된 빙핵 활성 유전자 클러스터를 중심으로 분석을 수행하였으며, P. syringae pv. syringae 국외 대표 균주인 PssB728a와 유사한 빙핵활성 유전자 구성을 가지고 있는 것으로 나타났다. 따라서 본 논문에서의 염기서열 분석 결과를 바탕으로 경상북도 일원 사과 과원에서 동해로 추정되는 병원균의 원인을 규명하기 위한 기본 자료를 제공하는데 있어서 의의가 있다고 사료된다.

• 식물병연구
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• 제22권4호
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• pp.269-275
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• 2016

E. pyrifoliae에 의한 과수 가지검은마름병은 국내에서 1995년 최초 발생이래 2016년까지 꾸준히 발생하여 과수농가에 피해를 주고 있는 세균병해이다. 가지검은마름병 발생 농가의 폐원조치 및 공적방제로 인한 경제적 피해 감소를 위하여, 병징이 관찰되는 이병조직 및 건전조직 내의 병원 세균을 검출하여 효율적 관리방안을 마련하고자 본 연구를 수행하였다. 가지검은마름병원세균의 검출은 genomic DNA 추출과정을 생략한 순수 균총만을 이용하는 colony-PCR을 이용하였으며, 이를 위해 ERIC 지역에서 제작된 가지검은마름병원세균 특이 프라이머 EpSPF/EpSPR 프라이머쌍을 선발하였다. 특이 프라이머를 활용한 colony-PCR 방법으로 2014-2015년 4-10월까지 사과나무 생육기간 동안 가지검은마름병 발생상황을 모니터링한 결과, $25^{\circ}C$ 일 평균 온도 기간인 5월 중순부터 7월 초순까지 발병이 가장 빈번하였다. 발병가지 내 병원세균의 존재유무 검정 결과 병징 부위와 이로부터 20 cm 내 건전조직에서만 병원세균이 지속적으로 검출되었다. 따라서 이미 발생한 가지검은마름병을 효율적으로 관리하기 위해 이병조직과 건전조직 경계 부위로부터 20 cm 이상에서 가지치기를 하는 것이 매우 적절할 것으로 판단된다.

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
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• 한국자원식물학회 2021년도 춘계학술대회
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• pp.23-23
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• 2021

Apple (Malus×domestica Borkh.; Rosaceae) is an important fruit crop grown mainly in temperate regions of the world. Tissue culture in vitro is a biotechnological technique that has been used to genetically improve cultivars (scions) and rootstocks. This could be important in the production of genetically uniform scions and rootstocks for commercial apple production. In nurseries, apple plants are produced by grafting scions onto rootstocks. The Cornell-Geneva (Geneva® series) breeding program has bred several dwarf rootstocks that are resistant to diseases and pests and are also cold hardy. This study was conducted to determine the optimal medium strength to improve sprouting shoot rate of apical meristem of the apple rootstocks of fire blight resistance. The apple rootstocks apical meristem at size (0.2 mm to 0.3 mm) with axillary buds were cultured on the MS(Murashige & Skoog) medium supplemented with plant growth regulators. The sprouting ratio and growth characteristics was evaluated after eight weeks in vitro culture. The highest rate of bud differentiation and shoot formation were 23.8% and 55.6%, respectively. After 6 weeks, shoots were regenerated from apical meristem, and their growth characteristics was significantly varied on the respective basal medium with different plant growth regulators. Our studies showed that the apple rootstocks the apple rootstocks of fire blight resistance plantlets could be successfully produced from apical meristem differentiated out of young twigs via organogenic regeneration.

• 한국유기농업학회지
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• 제27권1호
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• pp.45-56
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• 2019

시험I은 여름철 고온에 의하여 발생되는 열매마름 증상 경감 대책을 마련하기 위하여 전라남도 일부 지역의 '캠벨얼리' 6개 포도과원을 중심으로 실태조사를 하였다. 열매마름 발생비율이 높은 과원은 주로 관수를 하지 않은 수세가 중간인 곳에서 관찰되었다. 시험II는 포도나무 수관 전체를 차광망을 씌워서 차광수준을 0%, 30%, 60%로 하여 과실마름 증상 등을 포함한 수체 반응을 조사하였다. 수확 시기는 30% 차광으로 0% 차광보다 2주일 정도 앞당겨졌다. 차광량이 증가하면 신초장은 길어지고 신초경은 가늘어지는 경향을 보였고, 신초수는 30% 차광에서 가장 많았다. 수관의 조도는 30% 차광에서 약 26% 감소가 관찰되었다. 상품성이 있는 수확 과방수는 30% 차광처리에서 주당 50.6송이로 0% 차광(주당 33.6송이)과 60% 차광(주당 42.8송이)보다 높은 수확량을 보였다. 열매마름 과방과 열매마름 과립률은 30% 차광처리에서 각각 11.8%와 11.2%로 가장 낮았다. 30% 차광처리는 과방중과 과립중, 당도, 안도시아닌 함량을 증가시켰다.