• 제목/요약/키워드: SDS electrophoresis analysis

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Saccharomyces cerevisiae에서 효모 Superkiller 유전자(SK13)의 발현 (Expression of a Yeast Superkiller Gene(SK13) in Saccharomyces cerevisiae)

  • 이상기
    • 미생물학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.114-119
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    • 1990
  • 효모 Saccharomyces cerevisiae의 염색체상에 존재하는 superkiller 유전자인 SKIB 유전자를 cloning 시켜 ski 변이 주내에서 발현시켰다. 이 유전자의 C-말단부위에 E. coli의 tacZ 구조 유전자를 융합시켜 효모와 E. coli의 shuttle vector인 pSR605를 제조하고 이를 효모에 형질전환 시킨 후 나타나는 $\beta$-galactosidase의 융합단백질을 확인할 수 있었다.

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Anti-staphylococcal Bacteriocin from Enterococcus faecium

  • Kim, Kyung-Suk;Lee, Ung-Soo;Moon, Gi-Seong
    • Preventive Nutrition and Food Science
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    • 제15권1호
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    • pp.74-77
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    • 2010
  • Antibiotic-resistant Staphylococcus aureus is beginning to pose a social issue. Thus, there is an urgent need for the development of effective anti-staphylococcal agents to eradicate antibiotic-resistant S. aureus in food systems and to treat the pathogen in clinical areas. To address this need, lactic acid bacteria (LAB) from kimchi were screened for the production of anti-staphylococcal bacteriocin. From this screening, a bacteriocin generated by the MK3 strain, which was identified by 16S rRNA gene sequence analysis as Enterococcus faecium, demonstrated antimicrobial activity against an S. aureus strain, and was designated enterocin MK3. Enterocin MK3 also demonstrated activity against other gram-positive bacteria, including several LAB and Listeria monocytogenes, but not gram-negative Escherichia coli. The molecular mass of enterocin MK3 was estimated as approximately 6.5 kDa on an SDS-PAGE (sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis) gel.

분리균 Erwinia carotovora subsp. carotovora LY34의 병원성 및 CMCase Isozymes 생성

  • 임선택;박용우;조수정;윤한대
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제25권5호
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    • pp.468-476
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    • 1997
  • Soft-rot bacterial pathogen, Erwinia sp., was isolated from chinese cabbage tissue showing soft-rot symptom. This bacterial strain caused soft-rot to chinese cabbage and potato, and it was identified as Erwinia carotovora subsp. carotovora LY34 (E. c. subsp. carotovora LY34). Erwinia carotovora subsp. carotovora LY34 did not have hemicellulase but extracellular cellulase, pectinase, polygalacturonase, protease activity. The results of the microscopy showed that chinese cabbage tissue and potato tissue were macerated by infection of E. c. subsp. carotovora LY34. In analysis of the cellulases activity of the isolated cellulose-degradation enzymes from E. c. subsp. carotovora LY34 total protein, three cellulase activity bands were detected by non-denaturation gel electrophoresis method and five cellulase activity bands were detected by CMC-SDS-PAGE direct stain method.

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Cyanobacterium Synechocystis PCC6803 내에서 Bacillus thuringiensis sunsp. morrisoni PG-14 cryIVD 유전자의 발현

  • 이대원;박현우;진병래;정영호;박영목;강석권
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제24권2호
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    • pp.173-177
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    • 1996
  • Bacillus thuringiensis subsp. morrisoni PG-14 is a gram-positive soil bacterium producing mosquitocidal parasporal inclusions composed of several crystal proteins. Among these crystal protein genes, cryIVD gene is one of major component which has 72 kDa in size. However, these parasporal inclusions sink quickly from the surface of water where mosquito larval feeding occurred. To develope mosquitocidal cyanobacterium, therefore, we constructed the expression vector, pCYASK 5-1 harboring cryIVD gene. The expression vector, pCYASK5-1 was transformed into the cyanobacterium Syne- chocystis PCC6803 reported as a natural mosquito larval food source and the transformants were selected with kanamycin. Expression of IVD gene in transformant was characterized by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) and immunoblot analysis. The mosquitocidal activity of a transformant was determined with Culex tritaeniorhynchus. The results showed that, the transformed cyanobacterium is toxic to mosquito larvae and will be expected as a potential agent that is used for mosquito control.

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해양 천연물로부터 면역기능 조정제 렉틴 개발 : MLA-I, MLA-II, MLA-III의 특성 (Immunostimulating Lectins from Marine Natural Products: Characteristics of the MLA-I, MLA-II and MLA-III)

  • 정시련;김장환;전경희
    • 약학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.243-251
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    • 1995
  • Three new lectins, MLA-I, MLA-II and MLA-III, have been isolatedand purified from the hemolymph of Meretrix lusoria and reported previously. Biophysicochemical characteristics were investigated with these three MLA lectins. The MLA lectins agglutinated human erythrocytes non specifically and proved as D-galactose group carbohydrate specific. Molecular weight of ML.A-I. II and III were estimated to be 330, 500 and 310KD, respectively, by gel filtration on Sepharose CL-6B column. On SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, ML.A-I was dissociated into a single subunit of 42KD, MLA-II was into the twelve subunits of 46, 32, 30, 28, 25, 23. 22, 20. 19, 16, 15, and 14KD, and MLA-III was into the two subunits of 72 and 44KD. The pl of MLA-I, II, III were 4.0. 4.9 and 5.0. Amino acid analysis revealed a high contents of acidic and hydroxy amino acids, and a paucity of sulfur containing amino acids. Proline was not contained in MLA-II.

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Production, Isolation, and Purification of L-Asparaginase from Pseudomonas Aeruginosa 50071 Using Solid-state Fermentation

  • El-Bessoumy, Ashraf A.;Sarhan, Mohamed;Mansour, Jehan
    • BMB Reports
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    • 제37권4호
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    • pp.387-393
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    • 2004
  • The L-asparaginase (E. C. 3. 5. 1. 1) enzyme was purified to homogeneity from Pseudomonas aeruginosa 50071 cells that were grown on solid-state fermentation. Different purification steps (including ammonium sulfate fractionation followed by separation on Sephadex G-100 gel filtration and CM-Sephadex C50) were applied to the crude culture filtrate to obtain a pure enzyme preparation. The enzyme was purified 106-fold and showed a final specific activity of 1900 IU/mg with a 43% yield. Sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) of the purified enzyme revealed it was one peptide chain with $M_r$ of 160 kDa. A Lineweaver-Burk analysis showed a $K_m$ value of 0.147 mM and $V_{max}$ of 35.7 IU. The enzyme showed maximum activity at pH 9 when incubated at $37^{\circ}C$ for 30 min. The amino acid composition of the purified enzyme was also determined.

Disassembly of Chlorophyll-Protein Complexes in Arabidopsis thaliana during Dark-Induced Foliar Senescence

  • Lee, Choon-Hwan
    • Journal of Plant Biology
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    • 제39권4호
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    • pp.301-307
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    • 1996
  • The disassembly of Chl-protein complexes during dark-induced senescence (DIS) was investigated using detached third and fourthleaves of 21$\pm$1 day-old Arabidopsis thaliana. Although Chl content decreased linearly after 1 d, a significant decrease of photochemical effeciency (Fv/Fm) was observed after 2 d. In experiments using native green gel electrophoresis of Chl-protein complexes combined with additional two-dimensional SDS-PAGE analysis, we could observe the degradation of both photosystems after 2 d. Although light-harvesting complex(LHC) for PSI (LHCI) was degraded first in PSI complex, small PSII apoproteins including CP47/CP43 and D1/D2 apoproteins were degraded first in PSII complexes. LHC for PSII (LHCII) trimers were stable until 4 d. The level of LHCII monomers was increased until 3 and decreased thereafter, resulting in the increase of free pigments. These results suggest that the disassembly process of PSI is different from that of PSII.

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열무에서 분리한 오이모자이크바이러스 분리주의 특성 (Characterization of an Isolate of Cucumber mosaic virus from Raphanus sativus L.)

  • 이선주;홍진성;최장경;김은지;이긍표
    • 식물병연구
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    • 제17권2호
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    • pp.211-215
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    • 2011
  • 모자이크증상을 나타내는 열무로부터 Cucumber mosaic virus의 한 계통을 분리하고 특성을 조사하였다. Vigna unguiculata, Chenopodium amaranticolor and Gomphrena globosa에서 분리 바이러스의 기주반응과 dsRNA 분석, RT-PCR 검정, PCR-RFLP, 혈청학적 분석을 통하여 CMV의 한 계통임을 확인하였다. 이 CMV 계통을 다양한 지표식물에 접종하였을 때, Nicotiana benthamiana와 N. glutinosa, N. tabacum, 고추, 오이 그리고 멜론에서는 전형적인 강한 모자이크 병징이 나타났으나, 열무, 배추, 적갓은 매우 약한 병징을 나타내는 특징을 보였다. 새롭게 분리된 CMV 계통은 가지과, 박과 및 배추과 등 광범위한 작물에 감염성을 나타내었으며, 배추과에서의 감염성 차이를 근거로 Gn-CMV로 명명하였다. Double-stranded (ds) RNA를 분리한 분석에서 Gn-CMV는 기 보고된 CMV 계통과 마찬가지로 3.3, 3.0, 그리고 2.2 kb의 독립된 게놈으로 구성되어 있었으며, SDS-PAGE와 Western blotting 분석으로 통하여 28 kDa의 외피단백질을 확인할 수 있었다. RT-PCR로 얻어진 증폭산물을 Cac8I, ClaI and MspI을 이용한 PCR-RFLP를 통하여 CMV subgroup I 임을 확인할 수 있었다.

전통 메주 유래 미생물이 생산하는 효소에 의한 대두단백 분해물의 특성 (Characteristics of Soy Protein Hydrolysates with Enzymes Produced by Microorganisms Isolated from Traditional Meju)

  • 정낙현;신용서;김성호;임무현
    • 한국식품저장유통학회지
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    • 제10권1호
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    • pp.80-88
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    • 2003
  • 대두단백 가수분해 산물의 맛과 향을 개선하기 위해 효소에 의한 가수분해 system을 확립하기 위하여 단백질 가수분해 패턴이 서로 다른 효소로 생산된 단백 분해산물의 가수분해도와 표면 소수도 등을 측정하였다. 이들 분해물의 pattern을 SDS 전기영동으로 조사하였고, 효소반응에 의한 단백질분해물의 관능검사를 실시하였다. 각 균주가 생산한 단백질 분해효소의 pH 변화에 따른 효소의 활성은 No. 16 효소(Bacillu megarerium Bl6)와 No. 4효소(Aspergillus oryzae M4)는 pH 7.0에서 No. 95효소(Bacillu subtilis YG 95)와 No. 5효소(Mucor circinelloides M5)는 8.0에서 가장 높은 효소반응 활성을 보였다. 또한 반응온도에 따른 효소활성의 크기는 4가지 효소 모두 45$^{\circ}C$에서 가장 높은 활성을 나타내었다. 대두단백질 분해물의 SDS 전기영동 pattern변화에서, Bacillus megaterium Bl6과 Mucor circinelloides M5의 효소 (No. 16, No. 5)는 반응 후 분자량이 비교적 큰 peptide가 많이 생성되었으며, 효소반응 3시간 경과 후에도 분자량 66KD의 peptide를 확인할 수 있었다. 반면에 Bacillus subtilis YG 95와 Aspergillus oryzae M4의 효소(No. 95, No. 4)는 분자량 15KD∼45KD 미만의 작은 분자량의 peptide 물질이 주로 생성되었으며, 반응 2시간 경과후에는 30KD 미만의 저분자 Peptide가 주로 생성되었다. 이와 같은 결과는 HPLC 분석 결과와 일치하였다. 가수분해가 진행됨에 따라서 SDS 표면소수도가 크게 저하되었으며, Aspergillus oryzae M4 효소의 분해물의 가수분해도가 가장 높았다. 관능검사 결과, No. 4(Aspergillus oryzae M4)와 No. 95(Bacillus subtilis YG 95) 가 강한 쓴맛을 나타내었다. 각각의 효소들을 조합해서 분해한 단백분해물을 관능검사한 결과, Aspergillus oryzae M4 효소와 조합된 것의 대두단백질 분해물이 비교적 강한 쓴맛을 나타내었다. 분해물의 단맛은 시료별로 큰 차이가 나타나지 않았으나 Bacillu megarerium Bl6과 Aspergillus oryzae M4를 조합하였을 때 상대적으로 단맛의 정도가 높게 나타났다. 따라서 이와 같은 효소특성을 이용하여 대두단백질을 가수분해를 하였을 때 다양한 단백질 분해물의 제조에 이용이 가능할 것으로 사료된다.

Saccharomyces diastaticus의 포자형성 특이 글루코아밀라제의 특성 (Characterization of Sporulation-Specific Glucoamylase of Saccharomyces diastaticus)

  • 김은주;안종석;강대욱
    • 생명과학회지
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    • 제20권5호
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    • pp.683-690
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    • 2010
  • 효모 Saccharomyces diastaticus 는 세포 외로 분비되는 glucoamylase I, II, III 동위효소 중 하나를 생산하여 전분을 가수분해하여 포도당을 생성할 수 있다. Glucoamylase I, II, III는 STA1, STA2, STA3 유전자에 의해 각각 암호화된다. 효모 Saccharomyces 속이 포자가 형성되는 시기에 세포 내에서 특이적으로 발현된다고 알려진 glucoamylase (SGA)의 분자생물학적 및 생화학적 연구를 수행하기 위한 일환으로 S. diastaticus YIY 345 형질전환체의 배양 상등액으로부터 SGA 정제를 시도하였다. 황산암모늄 침전, DEAE-Sephadex A-50, CM-Sephadex C-50, Sephadex G-200 chromatography 등의 정제과정을 거쳐서 비특이 활성이 174배 증가된 0.22 mg의 순수한 SGA를 얻었다. HPLC와 SDS-PAGE 분석을 통해 이 효소는 63, 68 kDa의 단위체로 구성된 이합체임을 확인할 수 있었다. Con-A Sepharose 친화성 크로마토그피와 탈당쇄 효소를 처리한 결과로부터 SGA는 N-연결형 당쇄로 수식되었으며 단백질 부분은 59 kDa이었다. 정제한 SGA와 세포 외 분비성 glucoamylase의 효소학적 특성을 조사하고 비교한 결과 SGA의 최적 pH와 온도는 각각 5.5와 $45^{\circ}C$로 나타났으며 세포 외 분비성 glucoamylase는 5.0과 $50^{\circ}C$로 나타났다. SGA는 세포 외로 분비되는 glucoamylase에 비해 열처리 및 SDS에 대해 더 민감한 반응성을 나타내었다.