• 제목/요약/키워드: Pyrimidine

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Regulation of Expression of the Bacillus caldolyticus Pyrimidine Biosynthetic Operon by pyrR Gene, an Autogenous Regulator

  • Ghim, Sa-Youl
    • Journal of Life Science
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    • 제11권2호
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    • pp.120-125
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    • 2001
  • The pyrR gene of the pyrimidine biosynthesis (pyr) operon of the thermophile Bacillus caldolyticus, encoding a uracil phosphoribosyltransferase (UPRTase), turned to rely as a pyr operon regulator. It has been proposed that PyrR mediates transcriptional termination-antitermination at three intercistronic regions of the par operon (S.-Y Ghim and J. Neuhard, J. Bacteriol.,176, 3698-3707, 1994). In this research, a plasmid carrying the pyrR region of B. caldolyticus could restore a pyrimidine regulation in a pyrR mutant of B. subtilis. Expression of pyrR was found to increase 6-7 fold during pyrimidine starvation. Additionally, a highly conserved nucleotide sequence which may constitute the binding site for a PyrR protein (PyrR-binding loop) in transcript was staggested. Alternative antiterminator and terminator structures involving three conserved motifs in front of the pyrR, pyrP and pyrB genes, respectively, are proposed to account for the observed regulation pattern.

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An Improved Protocol on the Synthesis of Thiazolo[3,2-a]pyrimidine Using Ultrasonic Probe Irradiation

  • Tan, Sian Hui;Chuah, Tse Seng;Chia, Poh Wai
    • 대한화학회지
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    • 제60권4호
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    • pp.245-250
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    • 2016
  • An improved protocol on the synthesis of thiazolo[3,2-a]pyrimidine-6-carboxylate derivatives are reported. Previously, the thiazolo[3,2-a]pyrimidine-6-carboxylate derivatives were prepared in a two-step procedure. Under the improved procedure, the thiazolo[3,2-a]pyrimidine-6-carboxylate derivatives was readily prepared in a one-step reaction. This procedure was found to be more efficient than the previous protocol and also compared to the ultrasound bath and conventional heating methods in terms of yield and reaction time.

관상혈관 확장제인 8-tert-Butyl-6, 7-Dihydro-5-Methyl-8H-Pyrrolo[3,2-e]-s-Triazolo-[1,5-a] Pyrimidine (Bumepidil)의 합성 (Novel Synthesis of 8-tert-Butyl-6,7-Dihydro-5-Methyl-8H-Pyrrolo[3,2-e]-s-Triazolo-[1,5-a] Pyrimidine (Bumepidil), a New Cardiovascular Agent)

  • 서명은;김혜경;김중협
    • 약학회지
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    • 제31권5호
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    • pp.338-342
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    • 1987
  • 8-tert-Butyl-6,7-dihydro-5-methyl-8H-pyrrolo [3,2-e]-s-triazolo [1,5-a] pyrimidine (Bumepidil), one of the s-triazolo [1,5-a] pyrimidine derivatives, has been recently found to be the most promising potential coronary vasodilator and antihypertensive agent. In this report, a new synthetic approach for Bumepidil, via direct N-amination of amino pyrimidine intermediate, was studied and found to be useful method. The novel synthetic method comprise the following steps, acylation of $\gamma$-butyrolactone, condensation with guanidine, direct N-amination, cyclization, chlorination, and finally cyclization using tert-butyl amine.

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프로테옴 분석에 의한 Bacillus subtilis PyrR 돌연변이체의 특성 (Characterization of a PyrR-deficient Mutant of Bacillus subtilis by a Proteomic Approach)

  • 설경조;조현수;김사열
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제39권1호
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    • pp.9-19
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    • 2011
  • Bacillus subtilis의 pyrimidine biosynthetic (pyr) operon은 UMP의 de nove 생합성에 관여하는 enzyme들을 encode할 뿐만 아니라, 조절단백질인 PyrR도 encode한다. PyrR은 pyr mRNA-binding 조절 기능과 uracil phosphoribosyltransferase activity를 동시에 가지는 bifunctional 단백질이다. 본 연구에서는 Proteomic analysis를 이용하여 Uracil - 환경에서 DB104${\Delta}$pyrR의 단백질 패턴을 분석하여 단백질 레벨에서 PyrR 단백질의 실질적인 조절 양상을 관찰하였다. 두 균주의 세포질 단백질은 다양한 발현의 차이를 보였으며, Silver 염색된 2D-gel의 pI 4~10 사이에서는 1,300여개의 단백질이 검출되었으며, 단백질 발현 차이를 보이는 172개의 spot 중에서 42개의 단백질이 identification 되었다. 그 결과 pyr operon의 단백질(PyrAa, PyrAb, PyrB, PyrC, PyrD, and PyrF)이 모두 Up regulation이 이루어지고 있음을 확인할 수 있었으며, 이것은 단백질 레벨에서 Pyrimidine 생합성 과정이 PyrR에 의해서 정확히 Regulation 되어짐을 확인할 수 있었다. 또한 Pyrimidine 생합성의 Up regulation과 Down regulation 상태의 단백질의 패턴 양상도 분석할 수 있게 되었다. Pyrimidine의 생합성 과정은 DNA를 구성하는 기본적인 구성 요소를 생산하는 과정으로서 여러가지 Metabolism 가운데 중요한 위치를 차지하고 있다. 만약 Pyrimidine의 생합성 과정이 Over- expression된다면 다른 Metabolism의 균형에도 변화가 올 것이다. Proteomics Analysis에 이용한 DB104${\Delta}$pyrR 균주는 Pyrimidine 생합성의 조절에 관여하는 PyrR knock out 균주로서 Uracil - 환경에서는 전체적인 Pyrimidine 생합성 조절이 Up regulation이 되어지므로 Up regulation 동안 어떤 Metabolism에 영향을 주는지 관찰을 할 수 있게 되었다. 특히 Amino Acid Metabolism에 관계있는 단백질의 Up regulation이 이루어짐을 관찰할 수 있었으며 이것은 현재 각광을 받고 있는 단백질 산업에 응용함으로써 산업적으로 많은 기대를 할 수 있을 것으로 예상되어진다.

마이크로파와 금속 촉매를 이용한 Pyrrolo[3,2-d]-pyrimidine 유도체의 다양화 (Diversification of 4,5-disubstituted Pyrrolo[3,2-d]-pyrimidines by Microwave Assisted Metal Catalyzed Reaction)

  • 변정섭;염을균;김영준
    • 대한화학회지
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    • 제66권6호
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    • pp.442-450
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    • 2022
  • 생리학적 활성을 보일 것으로 기대되는 다양한 pyrrolopyrimidine 유도체를 O-arylation과 Suzuki 짝지움 반응을 통해 합성하였다. 금속 촉매 Cu를 사용하고 마이크로파 조사 조건에서O-arylation을 성공적으로 진행하여 pyrrolo[3,2-d]pyrimidine의 4번 위치에 phenol기를 도입할 수 있었다. 또한, 금속촉매 Pd를 사용하는 Suzuki짝지움 반응도 마이크로파를 사용하여 pyrrolo[3,2-d]pyrimidine의 4번 위치에 aryl 기를 도입할 수 있었다. 유도체의 다양화를 위한 반응 조건으로 마이크로파를 사용함으로써 긴 반응 시간과 열전달 효율성 문제를 가지고 있는 전통적인 열 반응의 단점을 획기적으로 극복할 수 있었다. 본 연구 결과는 신약개발 연구에 중요한 역할을 할 것으로 기대되는 pyrrolo[3,2-d]pyrimidine 유도체를 다양화하는데 사용할 수 있다.

Coumarins and a Pyrimidine from Angelica gigas Roots

  • Lee, Sang-Hyun;Kang, Sam-Sik;Shin, Kuk-Hyun
    • Natural Product Sciences
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    • 제8권2호
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    • pp.58-61
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    • 2002
  • Five coumarins and a pyrimidine were isolated from the roots of Angelica gigas. Their structures were elucidated as bergapten (1), decursinol angelate (2), decursin (3), nodakenetin (4), uracil (5) and nodakenin (6) by spectral analysis. Among them, bergapten (1) and uracil (5) were isolated for the first time from this plant part.

NMR PEAK ASSIGNMENT FOR THE ELUCIDATION OF THE SOLUTION STRUCTURE OF T4 ENDONUCLEASE V

  • Im, Hoo-Kang;Jee, Jun-Goo;Yu, Jun-Suk;Lee, Bong-Jin
    • 한국생물물리학회:학술대회논문집
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    • 한국생물물리학회 1996년도 정기총회 및 학술발표회
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    • pp.18-18
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    • 1996
  • Bacteriophage T4 endonuclease V initiates the repair of ultraviolet (UV)-induced pyrimidine dimer photoproducts in duplex DNA. The mechanism of DNA strand cleavage involves four sequential steps: linear diffusion along dsDNA, pyrimidine dimer-specific binding, pyrimidine dimer-DNA glycosylase activity, and AP lyase activity. (omitted)

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새로운 AIDS 치료제로서 3'-메틸아미노 피리미딘의 합성 (Sythesis of 3'-Methylamino Pyrimidine as Potential Anti AIDS Agents)

  • 백기현;윤인권
    • 자연과학논문집
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    • 제7권
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    • pp.165-167
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    • 1995
  • 3'-Methylamino pyrimidine 3 was prepared from deoxy pyrimidine via the following 8 step reaction sequences; silyl protection, mesylation, cyclization, azide substitution, hydrogenation, t-Boc protection, methylation, and deprotection in 23% overall yield as a potential anti-AIDS agents.