참다래 잎으로부터 궤양병균인 Pseudomnoas syringae pv. actinidiae를 배양하여 PCR을 통해 검출하는 방법을 개발하였다. Nested PCR을 위해 두 set의 primer를 식물 독소인 coronatine의 생합성에 관여하는 유전자 cfl의 염기서열로부터 설계하였다. 이 primer set를 사용하여 665rhk 310-bp의 절편이 증폭되었으며 nested PCR을 통한 궤양병균의 검출한계는 20 CFU/ml이었다. 4 그루의 참다래 나무로부터 노란색 무리로 나타나는 궤양병 초기 증상을 보이는 잎을 채취하여 pepton-sucrose 액체배지에 넣어 $16^{\circ}$C에서 12시간 배양 한뒤 PCR 을 시행한 결과 한 시료에서 예상했던 밴드가 증폭되었고 이듬해 봄 이 나무가 궤양병에 감염되었음을 확인하였다.
We have collected eight high-level streptomycin-resistant strains of Pseudomonas marginalis and P. syringae pv. actinidiae which were isolated from kiwifruit orchards in Korea and Japan, The molecular mechanisms of resistance were investigated by the PCR, susceptibility tests, and nucleotide sequence analysis. Of the eight high-level streptomycin-resistant strains, four harbored strA-strB genes, which encode streptomycin-inactivating enzymes. While the three Korean strains of R marginalis did not have plasmid and carried the resistant genes in the chromosomes, the Japanese strain of P. syringae pv. actinidiae had a plasmid containing strA-strB genes. The myomycin susceptibility test demonstrated that the high-level resistance to streptomycin of the remaining four strains is associated with mutations in the rpsL gene. Nucleotide sequence analyses revealed that they contain a single base-pair mutation in codon 43 of their rpsL gene.
Citrus blast caused by bacterium Pseudomonas syringae is a very important disease of citrus occuring in many areas of the world, but with few data about genetic structure of the pathogen involved. Considering the above fact, this study reports genetic characterization of 43 P. syringae isolates obtained from plant tissue displaying citrus blast symptoms on mandarin (Citrus reticulata) in Montenegro, using multilocus sequence analysis of gyrB, rpoD, and gap1 gene sequences. Gene sequences from a collection of 54 reference pathotype strains of P. syringae from the Plant Associated and Environmental Microbes Database (PAMDB) was used to establish a genetic relationship with our isolates obtained from mandarin. Phylogenetic analyses of gyrB, rpoD, and gap1 gene sequences showed that P. syringae pv. syringae causes citrus blast in mandarin in Montenegro, and belongs to genomospecies 1. Genetic homogeneity of isolates suggested that the Montenegrian population might be clonal which indicates a possible common source of infection. These findings may assist in further epidemiological studies of this pathogen and for determining mandarin breeding strategies for P. syringae control.
2002년 봄, 순천시 비닐 하우스에서 육묘중인 차나무에 세균병이 발견되었다. 초기 병반은 신엽에 작은 수침상 병반이 나타났으며 갈색반점으로 변하였다. 이 병반은 점점 커졌으며, 중륵 또는 엽맥을 따라 신장하였으며 검은색으로 변하였고, 병든 잎은 쉽게 낙엽이 되었다. 병반으로부터 10균주를 분리하여 잎에 접종한 결과 자연 병반과 동일한 병징이 나타났다. 병원세균은 염색반응, 형태적 특성, colony 패턴, 생리적, 생화학적 반응에 따라 Pseudomonas syringae pv. theae로 동정되었다. 국내에서 이 균에 의한 차나무 세균병은 아직 보고되지 않았으므로 병명을 차나무 갈색마름병(brown blight)으로 명명할 것을 제안한다.
Pseudomonas syringae pv. tabaci 11528은 담배를 숙주로 하여 wildfire disease를 일으키는 식물 병원성 세균이다. P. syringae pv. tabaci psyR deletion mutant를 이용하여 swarming motility, tabtoxin 생산능, siderophore 생산능, AHL 생산능 등의 phenotypic test를 수행하였다. psyR deletion mutant는 wild-type 균주보다 swarming motility가 증가하였고, tabtoxin 생산 또한 증가하였다. 하지만 siderophore와 AHL 생산능은 감소하였고 virulence 또한 지연되었다. 이러한 결과로 PsyR이 QS regulator로 작용한다는 사실과 더불어 병원성 유전자의 조절에도 관여한다는 것을 확인하였다. PsyR이 각각의 병원성 유전자의 발현을 조절하는 regulator들에게 미치는 영향을 전사단계에서 확인하기 위해 fur, gacA, psyI, prhI, prhA, hrpR, hrpA 유전자들을 정량적 real-time PCR (qRT-PCR) 방법으로 확인하였다. 또한 PsyR에 의한 병원성 유전자 조절이 DNA상에 직접적으로 결합하여 일어나는 것인지 아니면 다른 경로를 통해 간접적으로 일어나는 것인지를 확인할 필요가 있어 정제한 PsyR 단백질과 병원성 관련 유전자들의 upstream region 서열을 이용하여 electrophoretic mobility shift assay (EMSA)를 수행한 결과 본 연구에서 선정한 병원성 관련 유전자들이 PsyR에 의해 직접적으로 조절되지는 않는다는 사실을 밝혔다.
Pseudomonas syringae pv. actinidiae는 참다래 속(genus Actinidia) 식물에 궤양병을 일으키는 원인세균이다. 7개의 필수 유전자와 11개의 타입 III 효과기 유전자에 대한 다중염기서열 분석을 통해 전 세계 여러 곳에서 분리된 병원성 균주들은 세 그룹으로 나눌 수 있었고 각각 Psa1-Psa3 그룹으로 명명되었다. 본 연구에서는 3개의 Psa1, 3개의 Psa2 및 우리나라와 이탈리아에서 분리된 3개씩의 Psa3 균주 등 총 12 균주를 대상으로 그룹별 표현형을 비교하였다. 그 결과 모든 그룹의 균주가 $22^{\circ}C$ 이하에서 최대의 성장을 보였으며, Psa3 균주들은 $30^{\circ}C$ 이상의 온도에서 성장이 정지되었다. 또한 우리나라의 Psa3 균주의 지연기가 이탈리아 Psa3 균주 보다 긴 특징을 보였다. API 20NE 시험에서 Psa2 균주는 potassium gluconate, capric acid 및 trisodium citrate를 이용하지 못하는 점에서 Psa1과 Psa3 균주와 구별되었다. 다른 그룹과 달리 우리나라 Psa3 균주는 esculin을 가수분해할 수 있었다. API ZYM 시험에서는 Psa3에 속하는 균주들에서만 ${\beta}$-glucosidase 활성이 있는 것으로 나타났다. Psa 그룹에 따라 ampicillin, novobiocin 및 oleandomycin 등의 항생물질에 대한 민감성 양상이 서로 달랐다.
Genetic diversity among Pseudomonas syringae pv. morsprunorum isolates from Prunus mume in Korea and Japan was investigated by comparative sequence analysis of the 16S rRNA gene. The strains included 24 field isolates recovered from P. mume in Korea along with seven Japanese strains. Two strains isolated from P. salicina in Japan, one strain from P. avium in the United Kingdom, and the pathotype strain were also used for comparison with their 16S rRNA gene sequences. Nearly complete 16S rRNA gene sequences were sequenced in all 35 strains, and three sequence types, designated types I, II and III, were identified. Eleven strains consisting of five Korean isolates, five Japanese strains, and one strain from the United Kingdom belonged to type I, whereas the pathotype strain and another 19 Korean isolates belonged to type III. Another four Japanese strains belonged to type II. Type I showed 98.9% sequence homology with type III. Type I and II had only two heterogeneous bases. The 16S rRNA sequence types were correlated with the races of P. syringae pv. morsprunorum. Type I and II strains belonged to race 1, whereas type III isolates were included in race 2. Sequence analyses of the 16S rRNA gene from P. syringae pv. morsprunorum were useful in identifying the races and can further be used for epidemiological surveillance of this pathogen.
Plant matrix metalloproteases (MMPs) are a family of apoplastic metalloproteases closely related to human matrilysins. Up-regulation of Nicotiana benthamiana matrix metalloprotease 1 (NMMP1) expression by treatment with pathogens, ethephon and aging indicates that the gene is related to plant defense and the aging process through ethylene signaling. NMMP1 expression was higher than in normal growth leaves following infection with an incompatible pathogen Pseudomonas syringae pv. tomato T1 or a compatible pathogen P. syringae pv. tabaci and in aged leaves. Transient overexpression of NMMP1 in N. benthamiana leaves lowered the growth of P. syringae pv. tabaci. However, NMMP1-silenced leaves showed increased growth of P. syringae pv. tabaci. These data strongly suggest that NMMP1 in N. benthamiana is a defense related gene, which is positively regulated by ethylene.
Yu, Ji-Gang;Lim, Jeong-A;Song, Yu-Rim;Heu, Sunggi;Kim, Gyoung Hee;Koh, Young Jin;Oh, Chang-Sik
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제26권2호
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pp.385-393
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2016
Pseudomonas syringae pv. actinidiae causes bacterial canker disease in kiwifruit. Owing to the prohibition of agricultural antibiotic use in major kiwifruit-cultivating countries, alternative methods need to be developed to manage this disease. Bacteriophages are viruses that specifically infect target bacteria and have recently been reconsidered as potential biological control agents for bacterial pathogens owing to their specificity in terms of host range. In this study, we isolated bacteriophages against P. syringae pv. actinidiae from soils collected from kiwifruit orchards in Korea and selected seven bacteriophages for further characterization based on restriction enzyme digestion patterns of genomic DNA. Among the studied bacteriophages, two belong to the Myoviridae family and three belong to the Podoviridae family, based on morphology observed by transmission electron microscopy. The host range of the selected bacteriophages was confirmed using 18 strains of P. syringae pv. actinidiae, including the Psa2 and Psa3 groups, and some were also effective against other P. syringae pathovars. Lytic activity of the selected bacteriophages was sustained in vitro until 80 h, and their activity remained stable up to 50℃, at pH 11, and under UV-B light. These results indicate that the isolated bacteriophages are specific to P. syringae species and are resistant to various environmental factors, implying their potential use in control of bacterial canker disease in kiwifruits.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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