• 제목/요약/키워드: Pseudomonas spp.

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Isolation and Identification of Pathogenic Microorganisms from Soybean Sprouts

  • Kim, Hye-Jung;Koo, Kyoung-Mo;Kim, Gi-Nahm;Lee, Dong-Sun;Paik, Hyun-Dong
    • Preventive Nutrition and Food Science
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    • 제7권3호
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    • pp.305-309
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    • 2002
  • Raw soybean sprouts were tested for contamination with the following bacteria which have potential for pathogenesis or food spoilage : Salmonella spp., Escherichia coli O157:H7, Yersinia enterocolitica, Vibrio parahae-molyticus, Aeromonas hydrophila, Plesidomonas shigeloides, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Lis-teria monocytogenes, Bacillus cereus, Clostridium perfringens, Campylobacter jejuni, Erwinia spp., and Fusarium spp. Three of the above strains were isolated from the sprouts, and identified by morphological and biochemical methods including an API kit and ATB automated identification system. The isolate cultured in Cereus selective agar, a selective medium, was a Gram-positive, rod shaped, anaerobic spore former. The biochemical and culture tests revealed the following characteristics: catalase-positive, no growth on Simmon's citrate, NO₂ production and requirement of arginine for growth; the ATB automated identification system gave 99.8 % agreement for the identification of Bacillus cereus to the species level. The isolate cultured in Macconkey agar selective medium was Gram-negative, rod shaped and a gas former; the ATB-system gave 99.9% agreement for the identification of Aeromonas hydrophila to the species level. The isolate found in Pseudomonas isolation agar was Gram-negative, rod shaped, cytochrome oxidase-positive, a reducer of nitrates to nitrogen, and pyocyanin producer; the ATB-system gave 99.9 % agreement for the identification of Pseudomonas aeruginosa to the species level. These results indicate that the three bacteria species present in the soybean sprouts were Bacillus cereus, Aero-monas hydrophila, and Pseudomonas aeruginosa. Salmonella spp., Escherichia coli O157:H7, and Yersinia enter-ocolitica, which are associated with serious disease in humans, were not isolated from soybean sprouts examined in this study.

Arthrobacter spp. 와 Pseudomonas putida 의 세포융합에 의한 난분해성 방향족 화합물 분해세균의 균주개량 (Improvement of the Strains Degrading Recalcitrant Aromatic Compounds by Cell Fusion Between Arthrobacter spp. and Pseudomonas putida)

  • 홍진표;이주실;이영록
    • 미생물학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.207-212
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    • 1992
  • 합성세제 분해능이 월등한 Pseudomonas putida 와 프탈산에스테르를 분해하는 Arthobacter spp. 의 세포융합을 통해 합성세제와 프탈산에스테르의 분해능을 모두 갖는 융합균주를 개발하였다. Ampicillin-Lysozyme-EDTA 에 의한 각 균주의 원형진체 생성율은 98.4%-99.9% 이었고 원형질체의 재생율은 5-8%이었다. Fusogen으로 40%PEG4000 을 이용하였을 때 효과적으로 융합이 이루어졌으며 융합율은 $1.8{\times}10^{4} $-2.9{\times}10^{4}$ 이었다. 선별된 융합체는 프탈산에스테르와 ABS 를 모두 분해하였으며 ABS 의 분해능은 모균주보다 약 20% 정도 분해능이 증가하였고 DEHP 의 분해능은 모균주와 비슷한수준이었으나 모균주보다 더 빨리 기질을 분해하였다.

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포도 잿빛곰팡이병의 생물적 방제를 위한 길항세균 선발 (Selection of Antagonistic Bacteria for Biocontrol of Botrytis cinerea Causing Gray Mold on Vitis spp)

  • 서상태;박종한;한경숙;정승룡
    • 식물병연구
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    • 제12권3호
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    • pp.267-271
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    • 2006
  • Botrytis cinerea에 의한 포도 잿빛곰팡이병은 특히 하우스 재배시 큰 피해를 주는 병원 진균이다. Pseudomonas속 세균들은 토양 미생물중 가장 잘 연구되어 있고, 토양 내에서 중요한 역할을 담당하고 있다. 근권토양에서 분리한 형광성 Pseudomonas속 세균 83균주 중 P84균주는 실내 항균력 실험결과 다양한 식물병원진균(Phytophthora capsici, Sclerotium spp., Botryosphaeria dothidea, Fusarium spp.)에 대해 항균효과를 나타내었다. 생리적 실험과 유전적 실험결과 P84균주는 P. putida로 동정되었다. 이 세균의 항균력은 항생물질(2,4-diacetylphloroglucinol)의 생산과 관련되어 있는 것으로 사료되며, 이 세균이 포도 잿빛곰팡이병의 생물적 방제에 이용될 수 있는 가능성이 시사되었다.

명태의 보관시간에 따른 품질 예측 모델링 (Using Modeling to Predict Alaska Pollack Quality during Storage)

  • 심수동;김대욱;안수림;이다선;김선봉;홍광원;이양봉;이승주
    • 한국수산과학회지
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    • 제43권3호
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    • pp.195-204
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    • 2010
  • Several quality parameters affecting Alaska pollack, Theragra chalcogramma, were measured and modeled kinetically under storage at different temperatures: the K-value, trimethylamine (TMA), volatile basic nitrogen (VBN), Torry meter, pH, acid value (AV), total viable cell count (TVC), and colony forming units (CFU) of Pseudomonas spp. The off-flavor development time (ODT) was also measured using the R-index sensory test and modeled kinetically. Among the quality parameters, the CFU of Pseudomonas spp. was an indicator of the ODT according to a similarity in the Arrhenius temperature dependence, which was derived as a criterion mathematically. The temperature dependence was represented by the Arrhenius's activation energy ($E_a$). On comparing the $E_a$ of the quality factors and the ODT, the similarity in the temperature dependence was found to be high in the order Pseudomonas spp., pH, VBN, TVC, K-value, TMA, AV, and Torry meter. Therefore, Pseudomonas spp. was identified as the primary indicator of ODT.

Facultative Psychrophilic Pseudomonas spp.의 생장 및 SDBS분해능에 대하여 (Growth and Biodegradability of Facultative Psychrophilic SDBS-degrading Pseudomonas spp.)

  • 이혜주
    • 미생물학회지
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    • 제19권4호
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    • pp.179-185
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    • 1981
  • 한강 수계에서 SDBS (Sodium Dodecyl Benzene Sulfonate)를 유일한 탄소원으로 가지는 최소배지에서 서란 120 균주중 $4^{\circ}C$에서 생장이 좋은 8균주를 선택하여 동정하였으며. 이들의 온도에 따른 생장파 분해능을 흡광도 분석기를 이용하여 측정하였다. 동정 결과. Ps. fluorescens가 4균주, Ps. putida가 2균주 이었다. 이들중 Ps. fluorescens LP6, Ps. lido Lei, Ps. fluorescens LS 6의 비생장율은 모두 $25^{\circ}C$에서 가장 높은 값을 나타냈으나 정체기에서의 균체량은 $5^{\circ}C$ 에서 가장 높았다. 따라서 이들 3 균주는 faculfative psychrophilic bacteria로 사료된다. 한편 SDBS의 분해는 세포가 정체기에 들어가면서 시작되었으며, 분해능은 $25^{\circ}C$C에서 가장 좋았다.

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분자생물학적 방법인 PCR-REBA를 이용한 대중목욕탕 수질 중 수인성병원성미생물 검출 (Detection of Waterborne Pathogens in Public Bath Houses by PCR-Reverse Blot Hybridization Assay (PCR-REBA))

  • 송운흥;최승구;양병선;이재상
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제12권8호
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    • pp.3517-3522
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    • 2011
  • 수인성 병원성 미생물에 의한 공중목욕탕의 오염은 질병발생의 원인이 된다. 본 연구에서는 공중목욕탕내에 존재하는 수인성 병원성미생물들을 확인하고자 하였다. 서울지역내의 30 곳 공중목욕탕에서 욕조수 시료를 채수하여 진행하였다. 수인성 병원성미생물의 검출은 0.45 ${\mu}m$의 여과막을 이용하여 전통적인 배양방법으로 분리 및 동정하였다. 분자생물학적 기법을 사용하기 위해 미생물학적인 배양을 하지 않고 핵산을 추출하여 16S rRNA유전자를 표적으로 polymerase chain reaction-reverse blot hybridization (PCR-REBA)을 실시하였다. 미생물학적 배양방법에서는 지표세균인 Escherichia coli와 Shigella spp.가 검출되었으며, 분자생물학적 기법인 PCR-REBA을 수행한 결과 E. coli, Shigella spp., Salmonella spp., Pseudomonas spp., Mycobacterium spp. 등의 수인성 병원성미생물이 7곳에서 검출되었다. 본 연구결과를 토대로 공중목욕탕의 욕조수내에 수인성병원성미생물에 의한 감염을 줄이기 위해 적절한 위생관리과 E. coli를 포함한 유해미생물을 선정하여 지속적인 모니터링이 필요할 것으로 사료된다.

Characterization of the Biodiversity of the Spoilage Microbiota in Chicken Meat Using Next Generation Sequencing and Culture Dependent Approach

  • Lee, Hee Soo;Kwon, Mirae;Heo, Sunhak;Kim, Min Gon;Kim, Geun-Bae
    • 한국축산식품학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.535-541
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    • 2017
  • This study investigated the psychrotrophic bacteria isolated from chicken meat to characterize their microbial composition during refrigerated storage. The bacterial community was identified by the Illumina MiSeq method based on bacterial DNA extracted from spoiled chicken meat. Molecular identification of the isolated psychrotrophic bacteria was carried out using 16S rDNA sequencing and their putrefactive potential was investigated by the growth at low temperature as well as their proteolytic activities in chicken meat. From the Illumina sequencing, a total of 187,671 reads were obtained from 12 chicken samples. Regardless of the type of chicken meat (i.e., whole meat and chicken breast) and storage temperatures ($4^{\circ}C$ and $10^{\circ}C$), Pseudomonas weihenstephanensis and Pseudomonas congelans were the most prominent bacterial species. Serratia spp. and Acinetobacter spp. were prominent in chicken breast and whole chicken meat, respectively. The 118 isolated strains of psychrotrophic bacteria comprised Pseudomonas spp. (58.48%), Serratia spp. (10.17%), and Morganella spp. (6.78%). All isolates grew well at $10^{\circ}C$ and they induced different proteolytic activities depending on the species and strains. Parallel analysis of the next generation sequencing and culture dependent approach provides in-depth information on the biodiversity of the spoilage microbiota in chicken meat. Further study is needed to develop better preservation methods against these spoilage bacteria.

신선 채소류의 부패에 따른 세균의 다양성 변화 및 세균에 의한 채소 부패 조사 (Changes of Bacterial Diversity Depend on the Spoilage of Fresh Vegetables)

  • 이동환;유정일;박소연;노은정;오창식;정규석;윤종철;허성기
    • 식물병연구
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    • 제17권1호
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    • pp.38-43
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    • 2011
  • 채소류가 소비되기까지 약 10~30%에 이르는 양이 부패에 의해 버려지고 있다. 채소류는 수확 후 수많은 세균이나 곰팡이와 같은 다양한 미생물들에 의해 부패가 이루어진다. 채소류의 부패와 세균과의 관계를 알아보고자 세균의 다양성에 관한 조사를 하였다. 신선한 상추와 깻잎, 치커리에서의 총 호기성 균 수는 각각 $2.6{\sim}2.7{\times}10^6$, $4.6{\times}10^5$, $1.2{\times}10^6\;CFU/g$ of fresh weight이었으며, Pseudomonas spp., Alysiella spp., Burkholderia spp.와 그 외의 18개의 다양한 속들이 확인되었다. 신선한 채소류를 $28^{\circ}C$에서 일주일 동안 배양하였을 때 세균 다양성에 변화가 생겼다. 총 호기성 균의 수는 상추와 깻잎, 치커리에 대하여 각각 $1.1{\sim}4.6{\times}10^8$, $4.9{\times}10^7$, $7.6{\times}10^8\;CFU/g$ of fresh weight로 나타났으며, 이는 약 $10^2$배 정도 증가한 수치이다. 하지만 세균 다양성은 단순해져서 보다 적은 수의 세균이 분리, 동정되었다. Pseudomonas spp.가 대부분을 차지하였으며(~48%), Arthrobacter sp., Bacillus sp.가 그 뒤를 이었다. 동정된 세균 각각의 부패능을 검정하고자 무균배양한 상추에 접종하였으며, 그 결과 Pseudomonas fluorescence와 Pantoea agglomerans가 상당한 부패를 야기하였다.

Identification and Characterization of Putative Integron-Like Elements of the Heavy-Metal-Hypertolerant Strains of Pseudomonas spp.

  • Ciok, Anna;Adamczuk, Marcin;Bartosik, Dariusz;Dziewit, Lukasz
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권11호
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    • pp.1983-1992
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    • 2016
  • Pseudomonas strains isolated from the heavily contaminated Lubin copper mine and Zelazny Most post-flotation waste reservoir in Poland were screened for the presence of integrons. This analysis revealed that two strains carried homologous DNA regions composed of a gene encoding a DNA_BRE_C domain-containing tyrosine recombinase (with no significant sequence similarity to other integrases of integrons) plus a three-component array of putative integron gene cassettes. The predicted gene cassettes encode three putative polypeptides with homology to (i) transmembrane proteins, (ii) GCN5 family acetyltransferases, and (iii) hypothetical proteins of unknown function (homologous proteins are encoded by the gene cassettes of several class 1 integrons). Comparative sequence analyses identified three structural variants of these novel integron-like elements within the sequenced bacterial genomes. Analysis of their distribution revealed that they are found exclusively in strains of the genus Pseudomonas.

어류 병원성 세균의 MIC 결정을 위한 MIC Panel의 최적화 배양 조건 확립 (Establishing of Optimal Culture Conditions for MIC Panels for MIC Determination of Fish Bacterial Pathogens)

  • 김예지;전려진;강미래;이다원;우수지;김명석;정준범
    • 한국수산과학회지
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    • 제53권3호
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    • pp.443-450
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    • 2020
  • No established method can be used to select effective antibiotics in antibiotic susceptibility tests for fish bacterial pathogens quickly and accurately. Here, we established the optimal conditions for determining the minimal inhibitory concentration (MIC) of major fish bacterial pathogens (Streptococcus spp., Edwardsiella tarda, Vibrio spp., Aeromonas spp., and Pseudomonas spp.) using the KRAQ1 and CAMPY2 panels. The MIC panel used 18 antibiotics of two types and we conducted experiments to establish the optimal culture medium and temperature for each species. The optimal conditions for incubating Streptococcus spp. were in cation-adjusted Mueller-Hinton broth with TES buffer (CAMHBT) at 28℃, using 5% lysed horse blood (LHB) as recommended by the Clinical Laboratory Standards Institute. For Vibrio spp., the optimal culture conditions were 28℃ in CAMHBT supplemented with 1% NaCl. The optimal conditions for culturing E. tarda, Aeromonas spp., and Pseudomonas spp. were in CAMHBT at 28℃.