• 한국작물학회지
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• 제49권6호
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• pp.533-538
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• 2004

화성벼와 O. minuta 간 여교잡을 통해 반복친인 화성벼와 출수기, 간장 등 여러 작물학적 특성에서 뚜렷한 차이를 보이는 염색체단편 치환계통 "WH79006"을 육성하였는데 화성벼와 WH79006의 차이는 WH79006에 이입된 O. minuta 염색체 단편에 의한 것이라고 할 수 있다. WH79006이 화성벼의 유전적 배경에 O. minuta의 어느 염색체 단편을 가지고 있는지를 검정하기 위해 SSR마커를 이용하였다. 벼 염색체에 골고루 분포한 294개의 SSR 마커를 검정한 결과 최소한 28개의 이입 단편을 검정하였는데 이들은 2번 염색체를 제외한 모든 염색체에 분포하였으며 전체 길이는 약 168cm이었다. 간장 관여 QTL을 탐색하기 위해 화성벼/WH79006 조합의 75개 $F_2$ 개체를 육성, 간장을 조사하였다. QTL분석 결과 6번 염색체의 RM225부근에서 간장에 관여하는 QTL cl6가 탐지되었다. cl6는 전체 표현형변이의 $9.6\%$를 설명하였으며 O. minute의 대립유전자가 간장을 크게 하는 방향으로 작용하였다. 이 결과는 O. minuta가 포복형임에도 불구하고 간장 조절 유전자들 중에는 간장을 크게 하는 방향으로 작용하는 유전자가 있음을 제시하고 있으며, 이 유전자들은 앞으로 QTL 분석을 통해 그 작용을 밝힐 예정이다. 추후교잡 집단을 이용 O. minuta 특이적 단편들이 어느 형질과 관련이 있는지를 밝힐 예정이다.

• Molecules and Cells
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• 제24권1호
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• pp.16-26
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• 2007

Wild progenitor species provide potential gene sources for complex traits such as yield and multiple resistances to biotic and abiotic stresses, and thus are expected to contribute to sustainable food supplies. An introgression line 'IR71033-121-15' was derived from a wild species Oryza minuta (2n = 48, BBCC, Acc No. 101141) at IRRI. Introgression analysis using 530 SSR and STS markers revealed that at least 14 chromosomal segments distributed over 12 chromosomes had been introgressed from O. minuta. An $F_{2:3}$ population from the cross between IR71033 and Junambyeo (a Korean japonica cultivar) consisting of 146 lines was used for quantitative trait loci (QTL) analysis of 16 agronomic traits. A total of 36 single-locus QTLs (S-QTLs) and 45 digenic epistasis (E-QTLs) were identified. In spite of it's inferiority of O. minuta for most of the traits studied, its alleles contributed positively to 57% of the QTLs. The other QTLs originated from either parent, IR71033 or Junambyeo. QTLs for phenotypically correlated traits were mostly detected on introgressed segments. Fourteen QTLs corresponded to QTLs reported earlier, indicating that these QTLs are stable across genetic backgrounds. Twenty-two QTLs controlling yield and its components had not been detected in previous QTL studies. Of these, thirteen consisted of potentially novel alleles from O. minuta. QTLs from O. minuta introgression could be new sources of natural variation for the genetic improvement of rice.

• Molecules and Cells
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• 제23권1호
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• pp.108-114
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• 2007

The mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling cascade is critical for regulating plant defense systems against various kinds of pathogen and environmental stresses. One component of this cascade, the MAP kinase kinases (MAPKK), has not yet been shown to be induced in plants following biotic attacks, such as those by insects and fungi. We describe here a gene coding for a blast (Magnaporthe grisea)- and insect (Nilaparvata lugens)-responsive putative MAPK kinase, OmMKK1 (Oryza minuta MAPKK 1), which was identified in a library of O. minuta expressed sequence tags (ESTs). Two copies of OmMKK1 are present in the O. minuta genome. They encode a predicted protein with molecular mass 39 kDa and pI of 6.2. Transcript patterns following imbibition of plant hormones such as methyl jasmonic acid (MeJA), ethephone, salicylic acid (SA) and abscisic acid (ABA), as well as exposure to methyl viologen (MV), revealed that the expression of OmMKK1 is related to defense response signaling pathways. A comparative analysis of OmMKK1 and its O. sativa ortholog OsMKK1 showed that both were induced by stress-related hormones and biotic stresses, but that the kinetics of their responses differed despite their high amino acid sequence identity (96%).

• 한국작물학회:학술대회논문집
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• 한국작물학회 2005년도 추계학술발표회 요지
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• pp.132-133
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• 2005

• 한국작물학회:학술대회논문집
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• 한국작물학회 2004년도 추계학술발표회
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• pp.94-95
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• 2004

• 한국작물학회:학술대회논문집
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• 한국작물학회 2004년도 춘계 학술대회지
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• pp.108-109
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• 2004

• 한국작물학회지
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• 제56권2호
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• pp.124-133
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• 2011

벼 흰잎마름병은 세계적으로 벼 재배치에서 가장 문제시되는 병해충의 하나이다. 우리나라의 경우 상습발생지를 중심으로 Xa1과 Xa3 이 저항성 유전자로 활용되었으나, 소수의 저항원이 집중적으로 활용됨으로 인해 최근 이병화가 급속히 진행되고 있다. 특히 최근 Xa1과 Xa3 모두를 침해하는 새로운 균계 K3a가 확인됨에 따라 새로운 저항성 유전자의 동정 및 활용의 중요성이 높아가고 있다. 국내육성 자포니카품종 화성벼와 야생벼 O. minuta 간의 종간교잡을 통해 확립된 수원506호의 흰잎마름병에 대한 유전분석을 실시하였다. 수원506호와 통일계 품종인 밀양23호간의 교잡을 통해 확보한 F2 개체들을 활용하여 흰잎마름균주 HB3011 의 접종에 따른 병반장의 변이와 유전자지도 작성에 사용된 SSR 마커의 유전자형간의 연관성분석을 수행하였다. 수원506호의 흰잎마름병 저항성을 지배하며 우성유전자로 작용하는 주동유전인자가 염색체 4변 하단에서 SSR 마커 RM255 에 의해 표지 되었는데, 해당 염색체영역은 Xa1과 Xa2 및 Xa22 등이 보고되었던 영역과 매우 유사할 것으로 추정되었다.

• 한국육종학회지
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• 제49권3호
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• pp.280-284
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• 2017

화성벼의 유전적 배경에 O. minuta의 유용유전자가 이입된 근동질계통을 육성하기 위해 화성벼와 O. minuta를 교배하고, 계속적인 여교배와 MAS를 병행 실시하여 유망계통 CR1135-64-2를 선발하였다. CR1135-64-2는 생산력검정 시험 결과 조사된 형질 중 수당립수를 제외한 기타 형질은 화성벼와 유사한 근동질계통으로, 품종보호 출원 조건에 부합하여 '화원6호'로 명명하고 품종보호원을 출원하였다. '화원6호'는 출수기가 보통기재배에서 8월 12일로 화성벼와 유사한 중생종 품종이다. 현미천립중은 21.9g으로 화성벼보다 무거웠으나 통계적으로 유의한 차이는 없었다. '화원6호'는 줄무늬잎마름병을 제외한 다른 병해충에는 약한 반응을 보였으며, 완전미율은 화성벼에 비해 약간 낮았고, 아밀로스 함량은 화성벼와 유사하였으나 통계적인 차이는 없었다. '화원6호'의 정조수량은 '09~'10년 2개년간 실시한 생산력 검정 시험에서 평균 6.57 MT/ha로 화성벼 대비 103% 수준이었다. '화원6호'는 화성벼에 비해 수당립수가 많았는데 이는 O. minuta에서 이입된 qSPP7 유전자의 영향으로 판단된다.(품종보호권 등록번호: 제 5133호)

• 한국작물학회:학술대회논문집
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• 한국작물학회 2022년도 추계학술대회
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• pp.33-33
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• 2022

Rice (Oryza sativa L.) is a widely studied domesticated model plant. Seed awning is an unfavorable trait during rice harvesting and processing. Hence, awn was one of the target characters selected during domestication. However, the genetic mechanisms underlying awn development in rice are not well understood. In this study, we analyzed the genes for awn development using a mapping population derived from a cross between the Korean indica cultivar 'Milyang23' and NIL4/9 (derived from a cross between 'Hwaseong' and O. minuta). Two quantitative trait loci (QTLs), qAwn4 and qAwn9 were mapped on chromosome 4 and 9, respectively, increased awn length in an additive manner. Through comparative sequencing analyses parental lines, LABA1 was determined as the causal gene underlying qAwn4. qAwn9 was mapped to a 199-kb physical region between markers RM24663 and RM24679. Within this interval, 27 annotated genes were identified, and five genes, including a basic leucine zipper transcription factor 76 (OsbZIP76), were considered candidate genes for qAwn9 based on their functional annotations and sequence variations. Haplotype analysis using the candidate genes revealed tropical japonica specific sequence variants in the qAwn9 region, which partly explains the non-detection of qAwn9 in previous studies that used progenies from interspecific crosses. This provides further evidence that OsbZIP76 is possibly a causal gene for qAwn9. The O. minuta qAwn9 allele was identified as a major QTL associated with awn development in rice, providing an important molecular target for basic genetic research and domestication studies. Our results lay the foundation for further cloning of the awn gene underlying qAwn9.

• 한국육종학회지
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• 제43권1호
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• pp.81-91
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• 2011

야생벼은 재배벼의 친환경적성을 강화시킬 수 있는 병해충 저항성 및 불량환경에 견딜 수 있는 유용한 유전자들의 보고로 알려져 왔다. 국내에서 육성된 벼 품종인 '화성'(AA게놈)와 야생벼인 Oryza. minuta(BBCC 게놈; Acc.=101141)간의 교잡을 통하여 종간잡종 후대들이 육성되었다. 불화합성과 초기분리세대의 극심한 불임을 극복하기 위해 배주배양으로 $F_1$ 개체를 확보하였으며, '화성'으로의 여교잡을 수 차례 실시하였다. 확립된 계통들에 대한 표현형 평가를 통하여 흰잎마름 병에 저항성을 발현하는 계통을 확인하고 '수원497호'라 명명하였다. '수원497호'와 '밀양23호'간의 교잡에서 작성된 $F_2$ 개체들을 유전자지도 작성 및 표현형조사에 활용하였다. 유전자지도 작성에 사용된 SSR 마커의 유전자형과 흰잎마름병균 접종에 따른 병반장길이간의 연관성분석을 수행하였다. '수원 497호'의 흰잎마름병저항성을 지배하는 주동유전자가 염색체 11번 말단에 표지 되었는데, 기존에 보고되어 온 흰잎마름병 저항성유전자들인 Xa3, Xa4, Xa26 및 Xa31 등이 표지 된 곳과 동일하였다.