• 제목/요약/키워드: NADH dehydrogenase subunit

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PCR 기법을 사용한 옥수수 미토콘드리아 변이체 (NADH-dehydrogenase)의 선별과 재분화 (Identification of mitochondrial mutant (NADH-dehydrogenase) using PCR method and regeneration of mutants from Zea mays)

  • 설인환
    • 생명과학회지
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    • 제8권1호
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    • pp.8-13
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    • 1998
  • 옥수수의 미토콘드리아 변이체(NGS2)는 전자전달계 내의 NADH dehydrogenase를 구성하고 있는 subunit 4와 7 유전자의 재조합에 의해서 생성된 변이체이다. 이들의 변이체들은 식물의 성장과 발육에 절대적인 영양을 미치며, 또한 기내에서의 callus line들의 생성과 발달에도 상당한 영향을 미친다. 이들의 미토콘드리아 mutant 들은 3개의 primer를 사용하는 PCR 방법에 의해서 쉽게 선별이 가능하며, 세포 내의 키토콘드리아 변이 정도를 간접적으로 추측케 하며, 체시포 분열시 세포질 내의 기관들이 random으로 분리되는 현상을 간법적으로 알 수 있다. NGS2 mutant들에서 유기된callus line들은 식물체 재문화에도 영향을 미쳐 murant 미토콘드리아가 많은 call line들에슨 실질적인 부정 줄기의 유기를 방해하는 것으로 사료된다. 결론적으로 NADH-dehydrogenase는 식물체가 재분화 또는 성장하는데 있엇 필요한 요소라고 생각된다.

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한국산 연어의 미토콘드리아 NADH Dehydrogengse Subunit 3 영역의 클로닝 및 DNA 염기서열 분석 (Cloning and DNA Sequences Anaylsis of Mitochondrial NADH Dehydrogenase Subunit 3 from Korean Chum Salmon, Oncorhynchus keta)

  • 최윤실;이윤호;진덕희
    • 한국수산과학회지
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    • 제36권2호
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    • pp.94-99
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    • 2003
  • Mitochondrial DNAs has been used frequently as genetic markers for the population genetic studies of salmonid fishes. Samples used in this experiment were chum salmons (Oncorhynchus keta) from Korea. We analyzed variation of mitochondrial NADH dehydrogenase subunit 3 gene (ND3) among 4 individuals of the Korea population. Genomic DNA was extracted from the liver of the chum salmon samples. Then, the ND3 gene was amplified by polymerase chain reaction (PCR) including the 3' region of cytochrome oxidase III gene (COIII) and the 5` region of NADH dehydrogenase subunit 4L gene (ND4L). The size of the PCR product was 752 Up and the sequences showed some genetic variation among those four individuals. Genetic variations were observed in 7 sites as single nucleotide polymorphism (SNP). Within the open reading frame of the ND3 gene which encodes 116 amino acids, 5 nucleotide substitutions were found. Both transitional and transversional changes occurred more frequently with transitional changes. Comparison of these sequences with the others of a Japanese chum salmon in GenBank showed 5 sites of SNPs. This study provided the basic information of SNP in ND3 gene among Korean chum salmons and demonstrated the possible use of the SNP data as a genetic marker.

전라남도 해남과 무안의 풀무치 개체군에 대한 마이토콘드리아 NADH dehydrogenase subunit 들을 이용한 계통분석 (Phylogenic Analysis of Locusta migratoria (Orthoptera: Acridae) in Haenam-gun and Muan-gun, Jeollanam-do, Korea Using Mitochondrial NADH dehydrogenase subunits)

  • 이관석;김영하;정진교;고영호
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제56권4호
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    • pp.371-376
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    • 2017
  • 풀무치의 전국적인 발생현황 및 밀도조사의 결과, 한국에서는 전라남도 해남군 산이면과 전라남도 무안군 망운면 간척지에서 2015년 이후 지속적으로 높은 밀도의 발생이 관찰되었다. 우리는 두 지점에서 발생하는 풀무치의 기원을 알아내기 위하여 NADH dehydrogenase subunit (NAD) 2, NAD4 와 NAD5의 염기서열을 분석하였다. 그 결과 해남풀무치의 경우는 중국동북부의 Liaoning성 과 Heilongjiang성 개체군과 기원이 비슷하고, 무안풀무치의 경우는 일본풀무치와 기원이 비슷하다는 결론에 도달했다. 이전의 전 세계적인 풀무치의 진화에 관한 연구에서 한국의 풀무치가 포함이 되지 않아서 한반도 풀무치의 기원은 알 수 없었다. 본 연구의 결과는 중국북동부 지방에서 8만 년 전에 분리된 풀무치 중 일부가 한반도로 이동을 하여 해남 지역에 정착을 하고 일부는 러시아 사할린과 일본 홋카이도섬을 거쳐서 무안으로 이동하였을 가능성을 보여주고 있다. 하지만, 한반도로 내려온 풀무치가 해남과 무안계통으로 분리된 후 일본으로 이동하였을 가능성도 배제할 수 없다.

Chemical Modification of Brain Glutamate Dehydrogenase Isoproteins with Phenylglyoxal

  • Ahn, Jee-Yin;Cho, Eun-Hee;Lee, Kil-Soo;Choi, Soo-Young;Cho, Sung-Woo
    • BMB Reports
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    • 제32권5호
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    • pp.515-520
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    • 1999
  • Incubation of two types of glutamate dehydrogenase isoproteins from bovine brain with the arginine-specific dicarbonyl reagent phenylglyoxal resulted in a biphasic loss of enzyme activity. Reaction of the glutamate dehydrogenase isoproteins with phenylglyoxal caused a rapid loss of 53~62% of the enzyme activities and modification of two residues of arginine per enzyme subunit. Prolonged incubation of the glutamate dehydrogenase isoproteins with phenylglyoxal resulted in the modification of an additional four residues of arginine per enzyme subunit without further loss of the residual activities. Partial protection against inactivation was provided by the coenzyme NADH or substrate 2-oxoglutarate. The most marked decrease in the rate of inactivation was observed by the combined addition of NADH and 2-oxoglutarate, suggesting that the first two modified arginine residues are in the vicinity of the catalytic site. However, inactivation of the glutamate dehydrogenase isoproteins by phenylglyoxal appears to be partial with approximately 40% activity remained after an extended reaction time with excess reagent, suggesting that the modified arginine residues may not be directly involved in catalysis. The lack of complete protection by substrates also suggest the possibility that the modified arginine residues are not directly involved at the active site, and the partial loss of activity by the modification of arginine residues may be due to a conformational change. There were no significant differences between the two glutamate dehydrogenase isoproteins in sensitivities to inactivation by phenylglyoxal, indicating that the microenvironmental structures of the glutamate dehydrogenase isoproteins are very similar to each other.

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Genetic Variation of Korean Masu Salmon (Oncorhynchus masou) Populations Inferred from Mitochondrial DNA Sequence Analysis

  • Yoon, Moon-Geun;Jin, Hyung-Joo;Seong, Ki-Baek;Jin, Deuk-Hee
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제11권1호
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    • pp.36-40
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    • 2008
  • We analyzed the nucleotide sequences of about 500 bp of the mitochondrial NADH dehydrogenase subunit 3 (ND3) gene to estimate the genetic variation of Korean masu salmon (Oncorhynchus masou) populations. DNA samples were collected from 104 river-only specimens and 52 anadromous specimens from three hatcheries and one river. There are no records of artificial release into the river. We amplified the ND3 gene by polymerase chain reaction, targeting areas that included parts of the cytochrome oxidase III gene and the NADH dehydrogenase subunit 4L gene, and defined 14 haplotypes based on 12 variable nucleotide sites in the examined region. Among the haplotypes, ten were specific to river-only specimens within hatchery populations. Haplotype diversity of river-only populations in hatcheries was higher than that of anadromous and wild populations. Pairwise population $F_{ST}$ estimates and neighbor-joining tree analyses inferred that anadromous and river-only populations were distinct. These results suggest that sequence polymorphism in the ND3 region may be a useful marker for analyzing the genetic variation and population structure of masu salmon.

옥수수 미토콘드리아 NAD4유전자의 cDNA cloning과 특이한 RNA editing 현상 (Molecular cDNA cloning and unusual RNA editings of NAD4 gene from Zea mays mitochondrion)

  • 설일환
    • 생명과학회지
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    • 제8권2호
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    • pp.203-207
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    • 1998
  • 본 연구는 옥수수에서 분리한 미토콘드리아에서 NADH-dehydrogenase 유전자 (subunit 4)의 cDNA를 RT-PCR의 방법을 사용하여 조제 한 ㅜ 염기서열 수행한 경과 특이한 점을 감지 할 수 있었다. 일반적인 RNA cditing은 C에서 U로 또는 U에서 C로 치환되는 현장으로 옥수수의 NAD4유전자에서도 이러한 editing 형상이 일어나는 것을 발견하였다. 또는 T가 G로 그리고 G 가 A로 변화되는 특이한 부분들이 생성되는 것을 관찰하였다. 이러한 RNA ediring은 주로 exon 1과 exon 4 에 많이 일어나며, 염기 치환되는 부분들은 에서늬 NAD4유전자의 RNA edting site들과 일피하지 않은 점으로 미루어 보아 RNA editing 현상은 무작의로 생성된다고 본다.된다고 본다.

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First Report of Echinococcus equinus in a Donkey in Turkey

  • Simsek, Sami;Roinioti, Erifylli;Eroksuz, Hatice
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제53권6호
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    • pp.731-735
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    • 2015
  • A 2-year-old female donkey (Equus asinus) was euthanized in the Pathology Department of Firat University, Elazig, Turkey. Necropsy disclosed the presence of 7 hydatid cysts distributed throughout the lung parenchyma. One of those cysts represented the parasite material of the present study and was molecularly identified through sequencing of a fragment of cytochrome c oxidase subunit 1 (CO1) and nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase subunit 1 (NADH1) gene, as Echinococcus equinus. The generated CO1 sequence supports the presence of the dominant haplotype as has been described in Europe and Africa. The NADH1 sequence was found similar to sequences reported in equids in Egypt and the United Kingdom. The molecular identification of E. equinus in a donkey is being reported for the first time in Turkey.