• 제목/요약/키워드: Morphological identification

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Comparative Analysis of Anticancer and Antibacterial Activities among Seven Trametes Species

  • Ha Thi Kim Nguyen;Jiwon Lee;Yejin Park;Hyon Jin Park;Soon Kil Ahn;Jae Kwang Kim;Dong-Ku Kang;Minkyeong Kim;Chorong Ahn;Changmu Kim;Jaehyuk Choi
    • Mycobiology
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    • 제51권4호
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    • pp.256-263
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    • 2023
  • Species in the genus Trametes (Basidiomycota, Polyporales) have been used in natural medicine for a long time. Many studies reported that mycelia or fruiting bodies of Trametes spp. exhibited effects of antioxidant, anti-inflammatory, anticancer, and antimicrobial activities. However, comparative analysis in this genus is scarce due to limitation of morphological identification and the sample number. In this study, the 19 strains of seven Trametes species were chosen to generate a five-gene-based phylogeny with the 31 global references. In addition, 39 culture extracts were prepared for 13 strains to test for anticancer and antibacterial activities. Strong anticancer activities were found in several extracts from T. hirsuta and T. suaveolens. Anticancer activities of T. suaveolens, T. cf. junipericola and T. trogii were first described here. The antibacterial ability of T. versicolor and T. hirsuta extracts has been confirmed. The antibacterial activities of T. suaveolens have been reported at the first time in this study. These results suggest an efficient application of the genus Trametes as the drug resources especially for anticancer agents.

땅콩에서 Macrophomina phaseolina에 의한 균핵마름병 발생 보고 (First Report of Charcoal Rot Caused by Macrophomina phaseolina on Peanut Plants in Korea)

  • 최수연;이유경;금창옥;김신화;정현정;김상민;이용훈
    • 한국균학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.383-387
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    • 2023
  • Peanut plants showing mild wilt were found in fields of Iksan, Korea, in August 2021. The diseased peanut plants were collected, and the causal pathogens were isolated using potato dextrose agar (PDA) medium. The isolated IS-1 strain formed white mycelia on PDA, which turned black with age. Sclerotia were produced on the PDA and barley leaves laid on water agar 7 d after incubation at 30℃. The sequences of both the internal transcribed spacer (ITS) region and calmodulin gene of IS-1 showed a 100% similarity with that of Macrophomina phaseolina. A phylogenetic tree constructed using the ITS regions of fungal pathogens causing disease in peanut plants indicated that the IS-1 stain belongs to M. phaseolina. The inoculation of IS-1 sclerotia into peanut seedlings resulted in yellowing and wilt symptoms in aboveground plants and brown to dark rots in roots 35-40 d after inoculation. Overall, the morphological characteristics, molecular identification, and pathogenicity of IS-1 indicate that the causal pathogen is M. phaseolina. This is the first report of charcoal rot caused by M. phaseolina on peanut plants in Korea. Further study is needed to develop the control measures for charcoal rot in peanut plants.

Re-identification of Colletotrichum gloeosporioides Species Complex Isolates in Korea and Their Host Plants

  • Le Dinh Thao;Hyorim Choi;Yunhee, Choi;Anbazhagan Mageswari;Daseul Lee;Dong-Hyun Kim;Hyeon-Dong Shin;Hyowon Choi;Ho-Jong Ju;Seung-Beom Hong
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제40권1호
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    • pp.16-29
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    • 2024
  • The Colletotrichum gloeosporioides species complex includes many phytopathogenic species, causing anthracnose disease on a wide range of host plants and appearing to be globally distributed. Seventy-one Colletotrichum isolates in the complex from different plants and geographic regions in Korea were preserved in the Korean Agricultural Culture Collection (KACC). Most of them had been identified based on hosts and morphological features, this could lead to inaccurate species names. Therefore, the KACC isolates were re-identified using DNA sequence analyses of six loci, comprising internal transcribed spacer, gapdh, chs-1, his3, act, and tub2 in this study. Based on the combined phylogenetic analysis, KACC strains were assigned to 12 known species and three new species candidates. The detected species are C. siamense (n = 20), C. fructicola (n = 19), C. gloeosporioides (n = 9), C. aenigma (n = 5), C. camelliae (n = 3), C. temperatum (n = 3), C. musae (n = 2), C. theobromicola (n = 2), C. viniferum (n = 2), C. alatae (n = 1), C. jiangxiense (n = 1), and C. yulongense (n = 1). Of these, C. jiangxiense, C. temperatum, C. theobromicola and C. yulongense are unrecorded species in Korea. Host plant comparisons showed that 27 fungus-host associations are newly reported in the country. However, plant-fungus interactions need to be investigated by pathogenicity tests.

Peony Stem Rots by Neopestalotiopsis clavispora and Sclerotinia sclerotiorum, and Antifungal Propineb and Bacillus siamensis H30-3 against the Two Fungal Species

  • Jeum Kyu Hong;Young Hee Lee;Yeon Sook Jo;Su Min Kim;Seoung Bin Lee;Juyeoung Um;Kyoung-Ok Choi;Mee Kyung Sang;Chung-Ryul Jung;Chang-Jin Park;Sung Hwan Choi
    • 식물병연구
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    • 제30권2호
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    • pp.114-123
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    • 2024
  • In July 2022, stem rot symptom was found in a peony plant grown in a pot under a greenhouse at Jinju, Gyeongnam Province, South Korea. Two fungal species were isolated from the infected peony stems and cultured on 1/2-strength potato dextrose agar for identification. The morphological characteristics of the fungal isolates were examined, and nucleotide sequences of the internal transcribed spacer region, β-tubulin and translation elongation factor 1-α were analysed. The pathogenicity of the two isolates was confirmed in detached peony leaves, according to Koch's postulates. To our knowledge, this is the report of Neopestalotiopsis clavispora and Sclerotinia sclerotiorum as the causal agents of peony stem rots. Antifungal activity of chemical fungicide propineb and rhizobacterium Bacillus siamensis H30-3 was shown against the two plant pathogenic fungi N. clavispora and S. sclerotiorum.Unidentified diffusible and volatile compounds from B. siamensis H30-3 could suppress in vitro mycelial growths of N. clavispora JJ 8-2-1 and S. sclerotiorum JJ 8-2-2.

Diversity and distribution of goby-fry fish in Tomini Bay, Gorontalo, Indonesia

  • Femy M. Sahami;Sri Nuryatin Hamzah;Philippe Keith;Sitty Ainsyah Habibie
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제27권5호
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    • pp.294-305
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    • 2024
  • Tomini Bay in Gorontalo offers significant potential for amphidromous goby-fry, a group of fish found in at least five estuaries in the area, namely Bone-Bolango, Paguyaman, Bilungala, Tombulilato, and Taludaa Estuaries. Preliminary results were limited to only two locations in estuarine waters, namely the Bone-Bolango and Paguyaman rivers. Further exploration of goby-fry species in various locations within Tomini Bay is essential to enhance knowledge about the abundance and aid conservation efforts. Therefore, this study identified the goby-fry species and created their distribution map in the waters of Tomini Bay Gorontalo. The samples used were obtained from daily catches of fishermen in the five estuaries during the recruitment period from February to September 2022. These samples were categorized based on their morphological similarities and specific melanophore patterns. Distinct groups with different melanophore patterns from those previously reported were identified as newly recorded species, photographed, and described in terms of their morphology. Furthermore, two specimens from each newly recorded species underwent molecular identification using the cytochrome oxidase subunit 1 (COI) gene for DNA amplification and were analyzed through the Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) method. The phylogenetic tree was constructed using the Maximum Likelihood Method. The results showed the existence of nongoby-fry species caught together with goby fry school. A total of 75,881 goby-fry and 1,687 nongoby-fry were successfully collected. Among the goby-fry species, 13 were identified, including three new records, namely Eleotris fusca (Forster, 1801), Sicyopterus microcephalus (Bleeker, 1855), and Sicyopus zosterophorus (Bleeker, 1856). This study also documented the existence of nongoby-fry species, namely Anguilla celebesensis (Kaup, 1856), Moringua microchir (Bleeker, 1853), and Microphis leiaspis (Bleeker, 1854). It significantly contributed to the understanding of fish biodiversity in Tomini Bay.

Epicoccum sorghinum에 의한 국화 점무늬병 발생 (First Report of Leaf Spot Disease on White Chrysanthemum (Chrysanthemum morifolium) Caused by Epicoccum sorghinum in Korea)

  • 김시은;신종환;이하경;이성찬;한유경
    • 식물병연구
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    • 제30권3호
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    • pp.283-287
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    • 2024
  • 임실군농업기술센터에서 전시용으로 재배 중인 국화 잎에 갈색에서 검은색의 반점이 형성되고, 시간이 지날수록 병반이 확대되며 심하면 식물체가 고사하는 증상이 나타났다. 국화의 병든 잎 부위에서 병원균을 분리하여 ITS, TUB2, ACT 유전자 염기 서열 분석을 통해 동정한 결과 Epicoccum sorghinum으로 확인되었다. 분리된 균의 균학적 특성을 확인해 본 결과, PDA 배지에서 배양한 균을 UV 광에 12시간 동안 노출 후 암실에 두었을 때 병자각이 형성되었으며, 격벽이 없는 타원형의 무색 투명한 분생포자(3.2-6.0×1.7-3.0 ㎛)가 형성되는 것을 확인할 수 있었다. PDA 배지에서 배양한 균주의 agar plug를 국화 잎에 접종하여 병원성을 검정한 결과, 접종한 국화 잎에서 담갈색에서 검은색의 불규칙한 모양의 병반이 형성되었다. 따라서 E. sorghinum에 의한 국화 점무늬병을 국내 처음으로 보고하고자 한다.

지자체 사이버 공간 안전을 위한 금융사기 탐지 텍스트 마이닝 방법 (Financial Fraud Detection using Text Mining Analysis against Municipal Cybercriminality)

  • 최석재;이중원;권오병
    • 지능정보연구
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    • 제23권3호
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    • pp.119-138
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    • 2017
  • 최근 SNS는 개인의 의사소통뿐 아니라 마케팅의 중요한 채널로도 자리매김하고 있다. 그러나 사이버 범죄 역시 정보와 통신 기술의 발달에 따라 진화하여 불법 광고가 SNS에 다량으로 배포되고 있다. 그 결과 개인정보를 빼앗기거나 금전적인 손해가 빈번하게 일어난다. 본 연구에서는 SNS로 전달되는 홍보글인 비정형 데이터를 분석하여 어떤 글이 금융사기(예: 불법 대부업 및 불법 방문판매)와 관련된 글인지를 분석하는 방법론을 제안하였다. 불법 홍보글 학습 데이터를 만드는 과정과, 데이터의 특성을 고려하여 입력 데이터를 구성하는 방안, 그리고 판별 알고리즘의 선택과 추출할 정보 대상의 선정 등이 프레임워크의 주요 구성 요소이다. 본 연구의 방법은 실제로 모 지방자치단체의 금융사기 방지 프로그램의 파일럿 테스트에 활용되었으며, 실제 데이터를 가지고 분석한 결과 금융사기 글을 판정하는 정확도가 사람들에 의하여 판정하는 것이나 키워드 추출법(Term Frequency), MLE 등에 비하여 월등함을 검증하였다.

답토양(沓土壤)의 형태적(形態的) 특징(特徵)에 따른 철(鐵) 및 망간의 이동집적(移動集積)에 관(關)한 연구(硏究) (Study on the Accumulation of Iron and Manganese in Relation to the Morphological Characteristics of Paddy Soils)

  • 신천수
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제18권3호
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    • pp.123-144
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    • 1975
  • 답토양(畓土壤)의 특징적(特徵的) 현상(現象)인 철(鐵) 및 망간의 이동집적(移動集積) 양상(樣相)을 그의 형태적(形態的) 특성(特性)과 관련(關聯)하여 추구(追求)하는 동시(同時), 철(鐵)의 집적증(集積層)을 정량적(定量)的)으로 판단(判斷)하는 방법(方法)을 모색(模索)하기 위(爲)하여 우리나라 답토양(畓土壤)의 표토중(表土中)에 함유(含有)하고 있는 활성철(活性鐵) 및 역환원성(易還元性) 망간 함량(含量)을 조사(調査)하였고 주요(主要) 답토양(畓土讓)의 형태(形態) 및 이화학적(理化學的) 특성(特性)과 층위별(層位別) 철(鐵) 및 망간의 관계(關係)를 검토(檢討)한 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 1. 표토(表土)의 활성철(活性鐵) 및 역환원성(易還元性) 망간 함량(含量)은 토양(土壞) 배수(排水)가 불량(不良)할수록 많으며 동일배수조건(同一排求條件)에 있어서는 모래가 많을수록 적었다. 2. 표토(表土)의 활성철함량(活性鐵含量)은 배수조건(排水條件) 및 토성(土性)과는 관계(關係)없이 점토(粘土) 및 미사(微砂)의 총함량(總含豊)과 고도(高度)의 유의성(有意性) 있는 정(正)의 상관(相關)이 있었다. $$\hat{y}=0.3929+(0.0352{\times}clay%)+(0.0001023{\times}silt%)$$ 그러나 점토함량(粘土含量)과 역환원성(易還元性) 망간함량간(含量間)에는 상관(相關)이 없 었다. 3. 토양통별(土壤統別) 각(各) 층위(層位)의 활성철함량(活性鐵含量)(y)과 전철함량(全鐵含量)(x)간(間)에는 유의성(有意性) 있는 정(正)의 상관(相關)이 있어 다음과 같은 회귀식(回歸式)으로 표시(表示)할 수 있었다. $$y=0.361x-0.480(r=0.651^{**})$$ 그러나 역환원성(易還元性) 망간 함량(含量)은 전(全)망간 함량(含量)이 많아짐에 따라 증가(增加)하는 경향(傾向)은 있을 뿐 유의성(有意性)은 없었다. 4. 철(鐵) 및 망간의 집적(集積)은 어느 답토양(畓土壤)에서나 볼수 있으나 현저(顯著)한 집적(集穫)은 배수(排水)가 약간(若干) 양호(良好)한 식질(植質) 및 식양질토양(植壤質土壤)에 형성(形成)되며 배수(排水)가 불량(不良)한 답토양(畓土壤)에서는 토성(土性)에 관계(關係)없이 표토(表土)에 집적(集積)됨을 볼 수 있다. 5. 철(鐵)의 집적층판단(集積層判斷)은 단면관찰(斷面觀察) 또는 층위간(層位間) 활성철함량(活性鐵含量)만으로는 불충분(不充分)하며 전철(全鐵) 대(對) 활성철(活性鐵)의 비(比) 그리고 점토(粘土) 및 미사함량(微砂含量)으로 측정(推定)한 활성철함량(活性鐵含量)을 기초(基礎)로 하여야 하며 망간의 집적층(集積層)은 전(全)망간 및 역환원성(易還元性) 망간 함량(含量)과 그들의 비(比)로 추정(推定)하여야 할 것이다.

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전통메주로부터 대두단백질 가수분해효소 생산성 미생물의 분리 및 동정 (Isolation and Identification of Microorganisms Producing the Soy Protein-Hydrolyzing Enzyme from Traditional Mejus)

  • 강민정;김성호;주현규;이갑상;임무현
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제43권2호
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    • pp.86-94
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    • 2000
  • 대두 단백질의 효소적 가수분해에 의한 분해물의 맛과 향을 개선시킬 수 있는 효소적 가수분해 system을 확립하기 위하여, 전통메주로부터 대두단백질 분해능이 우수한 균주를 분리하여, 분해 양상이 상이한 효소를 생산하는 곰팡이와 세균 3균주를 선별하여 동정을 실시하였다. 단백질 분해능이 우수한 균주 중 곰팡이 M4는 leucine 활성이, 곰팡이 M5는 azodye 활성이 높았으며, 세균은 leucine활성이 가장 낮은 B16을 선별하여 효소의 작용에 의한 대두 단백의 분해 양상이 상이한 균주로 분리하였다. 분리한 곰팡이 M4는 배양배지에서 균사는 백색이었으며 균핵은 흰색에서 검은 색으로 변화하였다. Slide배양 결과, 분생자두는 방사형이었고, 정낭은 곤봉형이었다. 분생자는 반구형으로 기경자와 단경자가 존재하였다. 분생자병은 무색으로 매끈한 표면이었다. 분류학상 Aspergillus oryzae(ahlburg)종의 특징과 유사하여 이 종으로 분류 동정하고 Aspergillus oryzae M4로 명명하였다. 곰팡이 M5는 MEA배지에서 흰색과 검은색의 균사가 혼재되어 있었다. Slide배양 결과, 회녹색의 균총과 긴(7 mm) 포자낭병이 존재하였다. 포자낭은 회갈색이었고, 큰 포자낭과 기저막에서 작은 포자낭들이 떨어져 나오는 형태를 보였다. 중축은 구형으로 절단된 유리질의 형태이었고, 포자낭 포자는 직경이 작은$(80\;{\mu}m)$ 타원형이었다. 따라서 분류학상 접합균의 Mucor circinelloides의 종과 유사하여 이 종으로 분류 동정하고 Mucor circinelloides M5라 명명하였다. 세균 B16은 백색의 불투명한 colony로서 circular, lobate한 형태였고, 간상형으로 내생포자를 함유하였다. 또한, gram염색, catalase, oxidase, ${\beta}-glucosidase$, V-P test 등에서 양성이었고, D-fructose, ${\alpha}-D-glucose$, maltose, D-mannose, D-raffinose, stachyose, sucrose등의 이용성이 있었다. B16의 형태학적, 생리학적인 특징의 결과, Bacillus megaterium의 특징과 일치하였다. 그러나, 균체 지방산은 Paenibacillus marcerans의 균종과 유사하여 B16은 더 자세한 동정방법과 분류체계를 통해 명확한 동정이 필요하리라 사료되었다. 따라서 B16은 잠정적으로 Bacillus megaterium B16이라 명명하였다.

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한국산 도둑놈의갈고리족(콩과)의 DNA 바코드 및 계통학적 연구 (DNA barcode and phylogenetic study of the tribe Desmodieae (Fabaceae) in Korea)

  • 진동필;박종원;박종수;최병희
    • 식물분류학회지
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    • 제49권3호
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    • pp.224-239
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    • 2019
  • 본 연구에서는 DNA 바코드, 즉 엽록체 DNA의 rbcL, matK와 핵 리보솜 DNA의 ITS 염기서열을 이용하여 한국산 도둑놈의갈고리족 식물들의 종 식별을 실시하였다. 총 5개속 25분류군(총 75개체)의 식물에 대한 염기서열이 밝혀졌고, DNA 바코드 구간 조합에 따라 neighbor-joining 계통수들이 작성되었다. 그 결과, 종 식별률은 DNA 바코드 3개의 구간을 모두 사용하였을 때 가장 높게 나타났다(72%). rbcL+matK+ITS 계통수에서 본 족의 두 개의 아족과 다섯 속들은 단계통군으로 유집되었다. 도둑놈의갈고리아족군에서 도둑놈의 갈고리속과 갈고리속이 된장풀속보다 더 가깝게 묶였다. 갈고리속군에서 큰도둑놈의갈고리는 개도둑놈의갈고리 복합체의 자매군으로 형성되었고, 개도둑놈의갈고리의 종내분류군들은 각각 단계통을 형성하였다. 특히 형태적 변이로 인해 도둑놈의갈고리의 변종 또는 개도둑놈의갈고리와의 중간형으로 인식된 바 있는 긴도둑놈의갈고리는 개도둑놈의갈고리와 가장 가깝게 묶였다. 한편 도둑놈의갈고리의 변종이나 이명으로 인식되어온 애기도둑놈의갈고리는 변종으로 판단되었다. 싸리아족군의 경우, 매듭풀속 분류군들은 계통수상에서 각각 단계통으로 지지되었으나, 싸리속의 식물 16분류군 중 9분류군만 종식별이 가능하였다. 특히 싸리속내 땅비수리절보다 싸리절에서 낮은 종판별 해상능이 나타났다(싸리절=28.5%, 비수리절=77.8%). 싸리속 식물 중에 비수리는 계통수상에서 형태적으로 유사한 자주비수리와 확연히 구분되었다. 잡종으로도 인식된 바 있는 해변싸리와 청비수리 중, 해변싸리는 독립종으로 판단되었다. 반면 청비수리는 잡종 여부를 판단할 수는 없었지만, 땅비수리와 근연 관계에 있는 것으로 사료된다.