Objective : The purpose of the study was to identify expression profiling of miRNAs associated with cancers after treating allergen-removed Rhus Verniciflua Stokes and allergen-removed Rhus Verniciflua Stokes fumigaed Angelica gigas on leukemia cell lines. Methods : miRNA expression has been analyzed using miRNA array method through denaturation and hybridization after isolating the total RNA from leukemic cell line treated with 100 ㎍/㎖ of aRVS and aRVS-A each. Microarray expressions were interpreted as 'significant' on miRNAs when decreased less than 0.5 fold or increased more than 1.5 fold compared with the control group. Results : Among 158 miRNAs in total, 32 miRNAs were significantly presented in miRNAs expression. miRNA has been activated with a variety of genes for predicted targets, and the overexpressed miRNAs were categorized according to proliferation and metastasis of cancer in this study. The findings were reported that seven miRNAs (let-7b, miR-193a-5p, 296-3p, 26a, 22, 124a, 92b) showed significant expressions on proliferation and growth, seven miRNAs (miR-193a-5p, 26a, 200c, 183, 124a, 198, 210) presented meaningful expressions on invasion and metastasis, two miRNAs (let-7b, miR-210) were highly expressed on angiogenesis, five miRNAs (let-7b, miR-26a, 181d, 181c, 296-5p) related with apoptosis, and six miRNAs (let-7b, miR-200c, 183, 370, 124a, 191) were associated with prognosis of cancer and early diagnostic factors for cancer. Conclusion : The mechanism of miRNA takes a role in diagnosis, treatment, and prognotic factors for cancer as well. This study suggested that further detailed research on overexpression of specific miRNA should be carried out continuously in the future.
Park, Jae Eun;Kim, Hyeon Woo;Yun, Sung Hwan;Kim, Sun Jung
Journal of Ginseng Research
/
제45권6호
/
pp.754-762
/
2021
Background: Ginsenoside Rh2, a major saponin derivative in ginseng extract, is recognized for its anti-cancer activities. Compared to coding genes, studies on long noncoding RNAs (lncRNAs) and microRNAs (miRNAs) that are regulated by Rh2 in cancer cells, especially on competitive endogenous RNA (ceRNA) are sparse. Methods: LncRNAs whose promoter DNA methylation level was significantly altered by Rh2 were screened from methylation array data. The effect of STXBP5-AS1, miR-4425, and RNF217 on the proliferation and apoptosis of MCF-7 breast cancer cells was monitored in the presence of Rh2 after deregulating the corresponding gene. The ceRNA relationship between STXBP5-AS1 and miR-4425 was examined by measuring the luciferase activity of a recombinant luciferase/STXBP5-AS1 plasmid construct in the presence of mimic miR-4425. Results: Inhibition of STXBP5-AS1 decreased apoptosis but stimulated growth of the MCF-7 cells, suggesting tumor-suppressive activity of the lncRNA. MiR-4425 was identified to have a binding site on STXBP5-AS1 and proven to be downregulated by STXBP5-AS1 as well as by Rh2. In contrast to STXBP5-AS1, miR-4425 showed pro-proliferation activity by inducing a decrease in apoptosis but increased growth of the MCF-7 cells. MiR-4425 decreased luciferase activity from the luciferase/STXBP5-AS1 construct by 26%. Screening the target genes of miR-4425 and Rh2 revealed that Rh2, STXBP5-AS1, and miR-4425 consistently regulated tumor suppressor RNF217 at both the RNA and protein level. Conclusion: LncRNA STXBP5-AS1 is upregulated by Rh2 via promoter hypomethylation and acts as a ceRNA, sponging the oncogenic miR-4425. Therefore, Rh2 controls the STXBP5-AS1/miR-4425/RNF217 axis to suppress breast cancer cell growth.
Kim, Kabsun;Kim, Jung Ha;Kim, Inyoung;Lee, Jongwon;Seong, Semun;Park, Yong-Wook;Kim, Nacksung
Molecules and Cells
/
제38권1호
/
pp.75-80
/
2015
Osteoclasts are unique cells responsible for the resorption of bone matrix. MicroRNAs (miRNAs) are involved in the regulation of a wide range of physiological processes. Here, we examined the role of miR-26a in RANKL-induced osteoclastogenesis. The expression of miR-26a was upregulated by RANKL at the late stage of osteoclastogenesis. Ectopic expression of an miR-26a mimic in osteoclast precursor cells attenuated osteoclast formation, actin-ring formation, and bone resorption by suppressing the expression of connective tissue growth factor/CCN family 2 (CTGF/CCN2), which can promote osteoclast formation via upregulation of dendritic cell-specific transmembrane protein (DC-STAMP). On the other hand, overexpression of miR-26a inhibitor enhanced RANKL-induced osteoclast formation and function as well as CTGF expression. In addition, the inhibitory effect of miR-26a on osteoclast formation and function was prevented by treatment with recombinant CTGF. Collectively, our results suggest that miR-26a modulates osteoclast formation and function through the regulation of CTGF.
Objective : Cerebral aneurysm (CA) is an important acquired cerebrovascular disease that can cause catastrophic results. MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs, playing essential roles in modulating basic physiologic and pathological processes. Currently, evidences have been established about biologic relationship between miRNAs and abdominal aortic aneurysms. However, biologic roles of miRNAs in CA formation have not been explained yet. We employed microarray analysis to detect and compare miRNA expression profiles in late stage of CA in rat model. Methods : Twenty-six, 7-week-old male Sprague-Dawley rats underwent a CA induction procedure. The control animals (n=11) were fed a normal diet, and the experimental animals (n=26) were fed a normal diet with 1% normal saline for 3 months. Then, the rats were sacrificed, their cerebral arteries were dissected, and the five regions of aneurysmal dilation on the left posterior communicating artery were cut for miRNA microarrays analysis. Six miRNAs (miRNA-1, miRNA-223, miRNA-24-1-5p, miRNA-551b, miRNA-433, and miRNA-489) were randomly chosen for validation using real-time quantitative PCR. Results : Among a set of differentially expressed miRNAs, 14 miRNAs were over-expressed more than 200% and 6 miRNAs were down-expressed lower than 50% in the CA tissues. Conclusion : The results show that miRNAs might take part in CA formation probably by affecting multiple target genes and signaling pathways. Further investigations to identify the exact roles of these miRNAs in CA formation are required.
Background: Although previous in vivo studies explored urinary microRNA (miRNA), there is no agreement on nephrotoxicity-specific miRNA biomarkers. Objectives: In this study, we assessed whether urinary miRNAs could be employed as biomarkers for nephrotoxicity. Methods: For this, literature-based candidate miRNAs were identified by reviewing the previous studies. Female Sprague-Dawley rats received subcutaneous injections of a single dose or repeated doses (3 consecutive days) of gentamicin (GEN; 137 or 412 mg/kg). The expression of miRNAs was analyzed by real-time reverse transcription-polymerase chain reaction in 16 h pooled urine from GEN-treated rats. Results: GEN-induced acute kidney injury was confirmed by the presence of tubular necrosis. We identified let-7g-5p, miR-21-3p, 26b-3p, 192-5p, and 378a-3p significantly upregulated in the urine of GEN-treated rats with the appearance of the necrosis in proximal tubules. Specifically, miR-26-3p, 192-5p, and 378a-3p with highly expressed levels in urine of rats with GEN-induced acute tubular injury were considered to have sensitivities comparable to clinical biomarkers, such as blood urea nitrogen, serum creatinine, and urinary kidney injury molecule protein. Conclusions: These results indicated the potential involvement of urinary miRNAs in chemical-induced nephrotoxicity, suggesting that certain miRNAs could serve as biomarkers for acute nephrotoxicity.
Mammalian milk including microRNAs (miRNAs) as a novel class of noncoding RNAs, that can be transferred to infants and it plays on a critical role in biological functions such as immune regulation and development. However, the origin and functional importance of milk-derived miRNAs are still undetermined. This study applied RNA sequencing to explore the featured profiles of miRNA expression in colostrum and mature milk-originated exosomes from human, bovine, and caprine milk. These dietary exosome-derived miRNAs are highly conserved in human, bovine and caprine milk. Interestingly, abundant miRNAs expressed in human milk are similarly conserved across species. In addition, we confirmed that immune-related miRNAs (miR-30a-5p, miR-22-3p, and miR-26a) are commonly observed in the colostrum and mature milk of cows and caprines as well as humans. Our results provide new insights and resources for investigating the functionality of immune-associated miRNAs and evaluating physiological and biological condition in human, bovine and caprine milk as biomarkers.
Maolin Chang;Qianrou Chen;Beike Wang;Zhen Zhang;Guangli Han
International Journal of Stem Cells
/
제16권2호
/
pp.202-214
/
2023
Background and Objectives: To investigate the role of exosomes from periodontal ligament cells (PDLCs) in bone marrow mesenchymal stem cell (BMSC) migration. Methods and Results: Human PDLCs were applied cyclic tension stretching. Exosomes were extracted from cultured PDLCs by ultracentrifugation, then characterized for their size, morphology and protein markers by NTA, TEM and western blotting. The process that PKH26-labeled exosomes taken up by BMSCs was assessed by confocal microscope. BMSC migration was examined by Transwell assay. Exosomes derived from PDLCs were identified. Cyclic tension stretch application on PDLCs can enhance the migration ability of BMSCs through exosomes. The exosomal miRNA expression profiles of unstretched and stretched PDLCs were tested by miRNA microarray. Four miRNAs (miR-4633-5p, miR-30c-5p, miR-371a-3p and let-7b-3p) were upregulated and six (miR-4689, miR-8485, miR-4655-3p, miR-4672, miR-3180-5p and miR-4476) were downregulated in the exosomes after stretching. Sixteen hub proteins were found in the miRNA-mRNA network. Gene Ontology and KEGG pathway analyses demonstrated that the target genes of differentially expressed exosomal miRNAs closely related to the PI3K pathway and vesicle transmission. Conclusions: The exosomes derived from cyclic tension-stretched PDLCs can promote the migration of BMSCs. Alternation of microRNA profiles provides a basis for further research on the regulatory function of the exosomal miRNAs of PDLCs during orthodontic tooth movement.
대장암은 세계적으로 3번째로 흔한 암종이며, 암으로 인한 사망의 주요 원인이 되고 있다. 비록 다양한 진단방법이나 치료 방법이 이용되고는 있으나 병의 진행에 관여하는 분자메커니즘 이해의 부족 때문에 여전히 완전한 치료는 어려운 실정이다. 마이크로알엔에이는 단백질 정보를 코딩하고 있지 않은 작은 알엔에이 단편이다. 이러한 마이크로알엔에이는 특정 유전자의 전사과정 또는 번역과정을 조절하는 강력한 유전자 조절자로서의 기능을 가진다. 암의 발생과정에서 중요한 세포신호 전달 과정의 손상이 빈번하게 발생 하는데, 다양한 마이크로알엔에이의 이상발현이 그 원인이 되고 있다. 마이크로알엔에이-31은 암유전자의 역할을 하며 발암과정에 관여하는 다양한 유전자를 조절한다고 알려져 있다. 따라서, 본 연구에서는 대장암에서 마이크로알엔에이-31 발현의 임상적의의를 규명하고자 하였다. 175례의 대장암 조직과 16례의 정상 대장조직에서 실시간 유전자 증폭장치를 이용하여 마이크로알엔에이-31의 발현을 분석하고, 임상병리적 요인들과의 상관관계를 분석하고 임상적 유용성을 연구해 보았다. 마이크로알엔에이-31은 정상조직에 비해 대장암 조직에서 과발현이 되어 있었다. 175례 대장암 조직을 이용한 분석에서 마이크로알엔에이-31의 발현은 병기의 진행 정도에 따라 발현이 증가 되고 있었으며, 실제 마이크로알엔에이-31의 발현이 높은 대장암 환자군의 생존률이 그렇지 않은 환자군에 비해 통계적으로 유의하게 나쁜 것으로 확인 되었다. Cox 비례위험 모형과 로지스틱 회귀 모형을 이용한 분석에서 마이크로알엔에이-31의 과발현이 직접적으로 대장암 환자의 예후 및 원발전이와 연관성이 있는 것이 확인 되었다. 따라서, 이상의 연구결과를 종합해볼 때 대장암에서 과발현 된 마이크로알엔에이-31은 대장암 환자의 예후예측 및 전이예측 바이오마커로서의 활용 가능성이 높다고 볼 수 있다.
Ji, Zhibin;Wang, Guizhi;Zhang, Chunlan;Xie, Zhijing;Liu, Zhaohua;Wang, Jianmin
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
/
제26권3호
/
pp.309-315
/
2013
MicroRNAs are a class of endogenous small RNAs that play important roles in post-transcriptional gene regulation by directing degradation of mRNAs or facilitating repression of target gene translation. In this study, three small RNA cDNA libraries from the mammary gland tissues of Laoshan dairy goats (Capra hircus) were constructed and sequenced, individually. Through Solexa high-throughput sequencing and bioinformatics analysis, we obtained 50 presumptive novel miRNAs candidates, and 55,448 putative target genes were predicted. GO annotations and KEGG pathway analyses showed the majority of target genes were involved in various biological processes and metabolic pathways. Our results discovered more information about the regulation network between miRNAs and mRNAs and paved a foundation for the molecular genetics of mammary gland development in goats.
Epithelial-mesenchymal transition (EMT) is known to be involved in airway remodeling and fibrosis of bronchial asthma. However, the molecular mechanisms leading to EMT have yet to be fully clarified. The current study was designed to reveal the potential mechanism of microRNA-21 (miR-21) and poly (ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) affecting EMT through the PI3K/AKT signaling pathway. Human bronchial epithelial cells (16HBE cells) were transfected with miR-21 mimics/inhibitors and PARP-1 plasmid/small interfering RNA (siRNA). A dual luciferase reporter assay and biotin-labeled RNA pull-down experiments were conducted to verify the targeting relationship between miR-21 mimics and PARP-1. The migration ability of 16HBE cells was evaluated by Transwell assay. Quantitative real-time polymerase chain reaction and Western blotting experiments were applied to determine the expression of Snail, ZEB1, E-cadherin, N-cadherin, Vimentin, and PARP-1. The effects of the PI3K inhibitor LY294002 on the migration of 16HBE cells and EMT were investigated. Overexpression of miR-21 mimics induced migration and EMT of 16HBE cells, which was significantly inhibited by overexpression of PARP-1. Our findings showed that PARP-1 was a direct target of miR-21, and that miR-21 targeted PARP-1 to promote migration and EMT of 16HBE cells through the PI3K/AKT signaling pathway. Using LY294002 to block PI3K/AKT signaling pathway resulted in a significant reduction in the migration and EMT of 16HBE cells. These results suggest that miR-21 promotes EMT and migration of HBE cells by targeting PARP-1. Additionally, the PI3K/AKT signaling pathway might be involved in this mechanism, which could indicate its usefulness as a therapeutic target for asthma.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.