• 제목/요약/키워드: HDF5

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천리안해양관측위성 산출물 활용성 향상을 위한 오픈소스 R 기반 데이터 처리기술 연구 (A Study on Data Processing Technology based on a open source R to improve utilization of the Geostationary Ocean Color Imager(GOCI) Products)

  • 오정희;최현우;이철용;양현;한희정
    • 한국지리정보학회지
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    • 제22권4호
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    • pp.215-228
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    • 2019
  • 해양관측 정지궤도 위성인 GOCI(Geostationary Ocean Color Imager) 데이터는 대용량 산출물을 효과적으로 저장, 배포하기 위해 HDF5 자료 형식을 사용하고 있다. 해양위성센터에서는 HDF5(Hierarchical Data Format version5) 포맷에 익숙지 않은 일반 사용자를 위해 GDPS(GOCI Data Processing System)를 개발하여 관측자료와 함께 제공하고 있다. 그럼에도 불구하고 위성데이터 특성에 대한 이해와 GDPS의 사용법을 익혀야 하는 점, 그리고 위치정보와 속성정보가 분리되어 있는 HDF5 형식의 자료를 병합하고 가공하는 일은 쉽지 않은 일이다. 따라서 본 연구에서는 오픈소스 R과 rhdf5, data.table, matrixStats 패키지를 이용하여 GDPS를 이용하는 과정 없이도 HDF5 형식의 위성데이터를 손쉽게 활용할 수 있는 알고리즘을 개발하였다.

The Effect of Trigonella foenum-graceum L. (Fenugreek) Towards Collagen Type I Alpha 1 (COL1A1) and Collagen Type III Alpha 1 (COL3A1) on Postmenopausal Woman's Fibroblast

  • Yusharyahya, Shannaz Nadia;Bramono, Kusmarinah;Sutanto, Natalia Rania;Kusuma, Indra
    • Natural Product Sciences
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    • 제25권3호
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    • pp.208-214
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    • 2019
  • Trigonella foenum-graceum L. (fenugreek) is a phytoestrogen, a nonsteroidal organic chemical compound from plants which has similar mechanism of action to sex hormone estradiol-$17{\beta}$. This study aims to assess the effectivity of fenugreek seeds extract on collagen type I alpha 1 (COL1A1) and collagen type III alpha 1 (COL3A1) which are both decreased in aging skin and become worsen after menopause. This in vitro experimental study used old human dermal fibroblast from leftover tissue of blepharoplasty on a postmenopausal woman (old HDF). As a control of the fenugreek's ability to trigger collagen production, we used fibroblast from preputium (young HDF). Subsequent to fibroblast isolation and culture, toxicity test was conducted on both old and young HDF by measuring cell viability on fenugreek extract with the concentration of 5 mg/mL to $1.2{\mu}g/mL$ which will be tested on both HDF to examine COL1A1 and COL3A1 using ELISA, compared to no treatment and 5 nM estradiol. Old HDF showed a 4 times slower proliferation compared to young HDF (p<0.05). Toxicity test revealed fenugreek concentration of $0.5-2{\mu}g/mL$ was non-toxic to both old and young HDF. The most significant fenugreek concentration to increase COL1A1 and COL3A1 secretion was $2{\mu}g/mL$ (p<0.05).

Spatial Region Estimation for Autonomous CoT Clustering Using Hidden Markov Model

  • Jung, Joon-young;Min, Okgee
    • ETRI Journal
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    • 제40권1호
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    • pp.122-132
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    • 2018
  • This paper proposes a hierarchical dual filtering (HDF) algorithm to estimate the spatial region between a Cloud of Things (CoT) gateway and an Internet of Things (IoT) device. The accuracy of the spatial region estimation is important for autonomous CoT clustering. We conduct spatial region estimation using a hidden Markov model (HMM) with a raw Bluetooth received signal strength indicator (RSSI). However, the accuracy of the region estimation using the validation data is only 53.8%. To increase the accuracy of the spatial region estimation, the HDF algorithm removes the high-frequency signals hierarchically, and alters the parameters according to whether the IoT device moves. The accuracy of spatial region estimation using a raw RSSI, Kalman filter, and HDF are compared to evaluate the effectiveness of the HDF algorithm. The success rate and root mean square error (RMSE) of all regions are 0.538, 0.622, and 0.75, and 0.997, 0.812, and 0.5 when raw RSSI, a Kalman filter, and HDF are used, respectively. The HDF algorithm attains the best results in terms of the success rate and RMSE of spatial region estimation using HMM.

이너뷰티 소재로서의 시계꽃 추출물의 활용 가능성 (Availability of Passiflora Caerulea Extract as Inner Beauty Material)

  • 이재남;김영삼
    • 한국응용과학기술학회지
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    • 제37권5호
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    • pp.1180-1189
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    • 2020
  • 본 연구는 시계꽃 추출물의 생리활성 효능을 확인하여 이너뷰티 소재로서의 활용 가능성을 검증하여 기초자료를 제공하고자 한다. 실험 방법으로는 항산화, 항염증, 항노화 효과를 확인하기 위하여 총폴리페놀 함량, 총 플라보노이드 함량, DPPH radical 소거능, RAW 264.7 대식세포와 HDF 세포 내에서의 세포 독성 및 NO 생성 억제 효과, HDF 세포에서의 MMP-1의 발현 억제능 효과를 측정하였다. 실험결과, 시계꽃 추출물의 폴리페놀함량과 플라보노이드 함량은 10 mg/mL의 농도에서 각 157 mg/g, 173.5 mg/g의 우수한 함량을 확인하였고, DPPH radical 소거능을 확인하였다. RAW 264.7 대식세포와 HDF 세포에서는 시계꽃 추출물에 대해 세포독성은 나타나지 않았다. 또한 RAW 264.7 대식세포에서의 NO 생성억제를 통해 100 ㎍/mL에서 69.3%의 항염증 효과를 확인하였으며, HDF 세포에서 MMP-1의 발현 억제능이 유의하게 억제되는 것을 확인하였다. 이상과 같이 본 연구의 시계꽃 추출물은 항산화 효과와 항염증 효과, 피부세포에 대한 낮은 독성, MMP-1의 발현 억제를 통한 항노화 효과가 확인됨에 따라 다양한 이너뷰티 소재로서의 활용이 가능할 것으로 사료된다.

적작약 꽃 추출물의 활성산소 억제와 항염증 및 MMP-1 발현 억제능 효과에 관한 연구 (The Effects of Paeonia Lactiflora Pallas on Inhibition of Oxygen Free Radical, Anti-inflammation and MMP-1 Inhibitory Activity)

  • 이재남;김영삼
    • 한국응용과학기술학회지
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    • 제35권3호
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    • pp.797-806
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    • 2018
  • 본 연구는 적작약 꽃 추출물의 활성산소 억제와 항염증 및 MMP-1 발현 억제능 효과에 관해 알아보고 기능성 화장품 소재로써의 가능성을 확인하고자 하였다. 본 실험 방법으로는 세포 내 ROS 측정을 통한 활성산소 억제효과와 세포 독성 평가 및 항염증 측정, HDF 세포에서의 MMP-1의 발현 억제능 효과를 측정하고자 하였다. 실험 결과, RAW 264.7 세포와 HDF 세포 내에서 ROS로 억제효과를 확인하였고, 세포 독성평가는 적작약 꽃 추출물 5, $10{\mu}g/mL$ 처리 농도에서 90% 이상의 세포 생존율, 그 외 처리 농도에서는 80% 이상의 세포 생존율을 확인하였다. 또한 RAW 264.7 세포에서의 NO 생성 억제와 HDF 세포에서 MMP-1의 발현 억제능이 유의하게 억제되는 것을 확인하였다. 이상의 결과를 종합하면, 적작약 꽃 추출물의 세포 내 ROS 생성억제와 NO 생성 억제로 항산화와 항염증 효과, 피부세포에 대한 낮은 독성, MMP-1의 발현 억제를 통한 노화 효과가 확인됨에 따라 기능성 화장품 소재로써의 활용 가능성을 확인할 수 있었다.

Formaldehyde Emissions and Moisture Content Change of Wood Composites during Bake-out

  • Lee, Young-Kyu;Kim, Hyun-Joong
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제40권2호
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    • pp.101-109
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    • 2012
  • Wood composites are a hygroscopic material and have ability to exchange its moisture content with air. This study investigated the formaldehyde emission and moisture content change of four wood composites (particleboard (PB), medium density fiberboard (MDF), high density fiberboard (HDF), laminated HDF (L-HDF)) as a function of bake-out temperature and time. The composites were baked out for 1, 3, 5, 7, 10, 14, 21, and 28 days at temperatures of $20{\pm}2$, $35{\pm}2$, and $50{\pm}2^{\circ}C$ in a dry oven. The moisture content change was used to determine the emission bake-out of the composites. Best bake-out time results were obtained with after 7 days all composites. Formaldehyde emission values of composites decreased with decreasing moisture content for both temperatures. The formaldehyde emission results of bake-out temperature 35 and $50^{\circ}C$ showed a similar tendency.

인공하천에서 유량감소로 모사한 가뭄효과가 수질 및 부착돌말류 군집에 미치는 영향 (The Effect of Drought Simulated by Discharge Control on Water Quality and Benthic Diatom Community in the Indoor Experimental Channel)

  • 박혜진;김백호;공동수;황순진
    • 생태와환경
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    • 제45권1호
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    • pp.129-138
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    • 2012
  • 본 연구는 하천에서 가뭄으로 인해 나타나는 갈수현상을 단기간의 유량의 감소로 모사하여 수질 및 부착돌말류 군집에 미치는 생태학적 영향을 인공수로에서 분석하였다. 아크릴로 제작한 실내 인공수로에 부착돌말 인공기질로는 슬라이드글라스를 설치하고, 부영양 저수지의 표층수를 유입시켜 실험수로 이용하였다. 실험기간 중 부착돌말 군체형성기 동안 모든 실험군의 유량은 6 L $min^{-1}$, 이후 유량감소기 동안 각 실험군의 유량은 NDF(No depletion of flow rate (Control): 6 L $min^{-1}$), LDF (Low depletion of flow rate: 3 L $min^{-1}$), 그리고 HDF (High depletion of flow rate: 1 L $min^{-1}$)로 설정하였다. 유량감소의 영향을 비교하기 위하여 16일간의 실험기간 동안 유입수와 배출수의 수온, 전기전도도, 용존산소, pH, 탁도, 부유물질, 영양염 및 Chl-$a$ 농도를 분석하였으며, 또한 부착기질의 Chl-$a$와 AFDM(ash free dry matter), 그리고 부착돌말류의 조성과 세포밀도를 1일 간격으로 분석하였다. 광도는 처리 유량이 적어질수록 유의하게 증가했다(F=229.5, p=0.000). $NH_4$-N는 NDF보다 HDF에서 현저하게 높은 농도를 유지하였다. 유입수의 SS 농도(100%) 대비 배출수의 SS 농도는 HDF에서 88%로 감소하였으며 LDF (97%)와 NDF (99%)에 비하여 높은 감소율을 보였다. 기질의 Chl-$a$는 NDF에 비하여 유량감소 처리군에서 약 2배 이상 유의하게 증가하였다(F=8.399, p=0.001). 또한 기질의 AFDM과 부착돌말류 총밀도는 NDF에 비하여 두 처리군에서 유의하게 증가하였다(F=9.390, p=0.001; F=6.088, p=0.007). 실험기간 동안 대조군과 처리군 모두에서 $Aulacoseira$ $ambigua$, $Achnanthes$ $minutissima$, $Aulacoseira$ $granulata$ 등 총 3종의 부착규조류가 총 밀도의 10% 이상을 보인 우점종으로 나타났고, 제1 우점종인 $A.$ $ambigua$는 LDF에서 가장 높은 밀도를 보였으며 HDF, NDF순으로 생물량이 낮았다(F=8.551, p=0.001). 본 연구 결과, 인공 하천생태계에서 가뭄(갈수) 효과는 수질과 부착돌말류 현존량에 유의한 변화를 야기하였으며, 특히 부착돌말류 현존량이 유의하게 증가하였다. 이는 실제 하천에서 가뭄에 의한 생태계의 변화를 이해하는데 유용한 기초자료를 제공할 것으로 사료된다.

헛개나무 분획물에 의한 HDF세포의 초기 노화관련 sm22 단백질 조절 (The Regulation of Early Senescence-related SM22 Protein in Human Dermal Fibroblasts by Hovenia dulcis Thunberg Fractions)

  • 심보람
    • 생명과학회지
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    • 제30권8호
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    • pp.680-687
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    • 2020
  • 본 연구에서는 Hovenia dulcis Thunberg (헛개나무)의 80% 메탄올 분획물의 항산화 및 세포 노화 억제활성을 규명하고자 하였다. 헛개나무 에틸아세테이트 분획물이 DPPH라이칼 소거능에서 가장 높은 활성 저해를 보였고 (RC50 = 3.6±0.8 ㎍/ml), 총 페놀(417.2±5.3 mg GAE/ml) 및 총플라보노이드(260.6±27.5 mg QE/ml) 측정에서도 가장 높은 활성을 보였다. HDF 세포에서 노화가 진행됨에 따라 sm22의 발현이 증가되었고(p<0.001), β-갈락토시다아제의 염색양이 증가(p<0.001)되는 것을 확인하였다. 반면, sm22의 증가는 세포 노화가 진행된 세포일수록 증가폭이 감소되는 것이 확인되었고, 초기노화에서 발현이 높은 것을 알 수 있었다. 헛개나무 에틸아세테이트 분획물을 처리시 HDF세포의 EGF (p<0.01), PDGF-BB (p<0.01), SHH (p<0.05)의 사이토카인이 유의적으로 증가를 보이며, 노화 시 발생된 sm22의 수치를 감소시키는 것을 보였다. 이러한 결과는 헛개나무 에틸아세테이트 분획물이 초기 세포 노화의 작용을 조절할 수 있음을 보여준다.

공간영상정보 포맷 분석 및 표준화 방향 (Analyses on Standard Formats of Spatial Imagery Information)

  • 임정호;사공호상;권용대
    • Spatial Information Research
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    • 제9권1호
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    • pp.31-50
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    • 2001
  • 이 연구는 공간영상정보의 대표적인 포맷으로 GeoTIFF, SDTS, HDF, BIIF를 크게 두부분으로 나누어 비교·분석하였다. 첫 번째는 각 포맷의 명세를 살펴보고 4가지 기준-확장성, 호환성, 범용성, 장기적인 안정성-에 기초하여 비교하였다. 두 번째는 실제적인 활용현황 및 호환성 평가로써 현재 많이 사용되는 상용 소프트웨어 5가지를 이용하여 각 포맷의 입출력 가능성과 서로간의 호환성을 조사하였다. 그 결과 4가지 포맷 중 현재로서는 GeoTIFF가 공간영상정보를 다루는데 있어 비교우위에 있음을 알 수 있었다. 그러나 앞으로 공간영상정보가 다양해지고 대용량화해짐에 따라 수많은 포맷이 개발되고 갱신될 것이므로 표준으로 하나의 포맷만을 계속 고집해서는 안 된다고 보여진다. 지속적인 연구를 통해 적절한 표준포맷을 제시함이 바람직하며, 또한 지속적인 정책지원이 따라야 할 것이다.

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잎새버섯이 생산하는 세포외 다당체의 사람 섬유아세포에서 Matrix Metalloproteinase-1 발현저해 효과 (Effect on Inhibition of Matrix Metalloproteinase-1 in Human Dermal Fibroblasts by Production of Exopolysaccharide from Mycelial Culture of Grifola frondosa)

  • 심관섭;배준태;이동환;김진화;이범천;최태부;표형배
    • 대한화장품학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.161-167
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    • 2005
  • 잎새버섯(Grifola frondosa HB0071)이 생산하는 세포외 다당체인 GF-glucan이 사람섬유아세포에서 자외선(UVA)조사 시 증가되는 MMP-1 발현에 미치는 영향을 조사하였다. 자외선으로부터 조사된 섬유아세포에 GF-glucan을 처리한 농도에 따라 MMP-1 발현이 억제되었으며, RT-PCR를 이용해 세포내 MMP-1 mRNA 발현 또한 감소하는 것으로 나타났다 즉, 최대 GF-glucan $0.5\%$를 처리했을 때 $54.4\%$의 MMP-1 발현을 억제하였다. 결과적으로, 잎새버섯 HB0071로부터 생산된 GF-glucan은 피부노화와 관련된 extracellular matrix (ECM) 조직에 손상을 주는 MMP-1의 활성을 억제하여 자외선으로부터 손상된 피부의 광노화로부터 보호해주는 것으로 밝혀졌다.