• 제목/요약/키워드: Fluorescent probe

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현장에서 초음파 파쇄와 형광시약을 이용한 그람 음성균의 조기 탐지 (The Early Detection of the Gram Negative Bacteria using Signification and Fluorescent Dye in the Field)

  • 하연철;최기봉;최정도
    • KSBB Journal
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    • 제21권5호
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    • pp.341-346
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    • 2006
  • 본 연구에서는 sonificator를 장착하여 세포막을 파쇄하고 현장에서 형광을 이용하여 조작이 간편하고 단시간에 DNA를 측정할 수 있는 자동화된 형광기를 개발하기 위하여 그람 음성균인 Escherchia coli를 대상으로 최적의 세포 파쇄조건을 확립하고자 하였다. Incubation time은 형광량에 크게 영향을 주지 못하는 것으로 나타났으며, 가열처리 방법은 현장에서 세포를 파괴하는 방법으로는 파쇄효과가 미약하고 적합하지 않은 것으로 나타났다. Sonificator probe 직경에 따라 세포의 파쇄 효과가 큰 차이를 보였으며 13 mm probe로 20초 동안 sonification시키는 것이 가장 효율적인 것으로 나타났다. 시료에 잠긴 Sonificator probe tip 깊이에 따라서도 세포의 파쇄 효과가 크게 나타났는데 시료에 잠긴 probe tip의 깊이가 깊을수록 큰 파쇄 효과를 발휘하였다. 선정된 최적의 파쇄 조건에서 $5{\times}10^5CFU/m{\ell}$의 Escherchia coli를 탐지 가능한 것으로 나타났다.

Fluorescent In Situ Hybridization방법으로 분석한 소양호 세균 군집 구조의 계절적 변화 (Seasonal Changes of bacterial community analysed by fluorescent in situ hybridization method in Lake Soyang)

  • 홍선희;안태석
    • 미생물학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.169-174
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    • 1998
  • 소양호에서 세균군집의 계절적, 수심별 변화를 파악하고자 총세균수와 EUB338, ALG1b, BET42a, GAM42a와 CF probe 등 fluorescent rRNA target oligonuvleotide probe와 반응하는 세균 개체수를 측정하였다. 총세균수는 $0.5{\sim}2.01{\times}10^6cells{\cdot}ml^{-1}$이였으며, 2 m와 5 m 수층에서 높게 나타났다. 총세균수에 대한 Eubacteria의 비율은 22~100%이였고, Proteobacteria ${\alpha}$-group은 Eubacteria의 2.6~66.7%, ${\beta}$-group은 4.5~53.5%, ${\gamma}$-group은 4.6~76.7%, 그리고 Cytophage-Flavobacterium group은 2.1~35.9%이였다. 또한 세균군집은 계절별, 수심별로 다양한 변화를 보여, 겨울철은 ${\beta}$-group이, 봄철과 초여름은 ${\gamma}$-group이, 여름철은 ${\alpha}$-group이 우점하였고, Cytophage-Flavobacterium group이 특정적으로 우점하는 시기는 없었다. 이러한 세균 군집 구조의 분포로 계절별, 수심별로 호수에 대한 독특한 특징을 알 수 있었다.

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자연 시료로부터 Alexandrium tamarense을 위한 종 특이적 DNA탐침의 응용 (Application of Species-specific DNA Probe to Field Samples of Alexandrium tamarense (Lebour) Balech)

  • 조은섭;김기영;박형식;김학균;문성기;이재동
    • 생명과학회지
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    • 제12권3호
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    • pp.250-255
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    • 2002
  • 독성이 있는 특이한 편모충인 Alexandrium tamarense의 구별하기 위한 종특이적인 형광 DNA탐침 AT1이 서로 다른 3가지의 고정액에서, 그리고 배양기간의 차이와 whole cell hybridization을 사용하는 광학 현미경 또는 형광 현미경에 의한 세포밀도 측정에 있어서 hiding activity를 비교하는 방법으로 여러 다른 종의 실험에 사용되어졌고, 그의 결과를 보고하는 바이다. 형광 DNA탐침 AT1은 특이적으로, A. tamarense에 결합했지만, 형태학적으로 유사한 다른 편모충에는 결합하지 않았다. 특히 형태적으로 A. tamarense에 유사한 A. catenella는 형광 DNN탐침 AT1에 결합하지 않았다. A. tamarense은 다른 세가지 고정액을 처리하였을 때, 고정액과 상관없이 강한 형광신호를 발산하였다. 추가해서 말하면, 배양기간에 관계없이 형광 DNA탐침 AT1의 biding activity는 강했다. 광학 현미경에 의해서 측정 되어지기 보다는 형광현미경에 의해서 세포밀도가 측정되었다. 형광 DNA탐침 AT1을 이용한 A. tamarense의 동정과 계산은 이 분야에서 새로운 생물독성 감시와 예측 시스템에 기여 할 것이다.

New 7-Hydroxycoumarin-Based Fluorescent Chemosensors for Zn(II) and Cd(II)

  • Swamy, K.M.K.;Kim, Min-Jung;Jeon, Hye-Ryeong;Jung, Ji-Young;Yoon, Ju-Young
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제31권12호
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    • pp.3611-3616
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    • 2010
  • Five new 4- or 8-substituted-7-hydroxycoumarin derivatives (1-5) were synthesized as fluorescent sensors for metal ions. Fluorescent changes and selectivity for metal ions were compared based on the introduction of different ligands and/or testing with different substitution positions of 7-hydroxycoumarin in aqueous solution. Especially, probes 2, 3 and 5 displayed large fluorescence enhancements with $Zn^{2+}$ and $Cd^{2+}$. Probes 2 and 3 showed moderate selectivity for $Zn^{2+}$ over $Cd^{2+}$. On the other hand, probe 4 showed large fluorescence quenching effects upon the addition of $Ag^+$ and $Hg^{2+}$.

n-Alkanols가 소의 대뇌피질로부터 분리한 Synaptosomal Plasma Membrane Vesicles의 측방확산운동 범위와 속도에 미치는 영향 (The Effect of n-Alkanols on the Lateral Diffusion of Synaptosomal Plasma Membrane Vesicles Isolated from Bovine Cerebral Cortex)

  • 정인교;강정숙;윤일
    • 대한약리학회지
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    • 제29권1호
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    • pp.157-163
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    • 1993
  • n-Alkanols의 분자적 약리작용기전 탐구에 기초자료를 제공하기 위하여 소의 신선한 대뇌피질로부터 분리한 synaptosomal plasma membrane vesicles (SPMV) 지질 이중층의 측방확산운동에 미치는 n-alkanols의 영향을 형광 probe법으로 검색하였다. n-Alkanols는 SPMV 지질 이중층의 측방확산운동 범위와 속도를 농도 의존적으로 증가시켰고 1-nonanol까지는 탄소수가 두개 증가될 때마다 그 효력은 약 10배 가량 증가되었으나 탄소수 10개인 1-decanol의 효력은 오히려 감소되는 경향을 나타내었다.

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현장에서 초음파 파쇄와 형광시약을 이용한 그람 양성균의 조기 탐지 (The Early Detection of the Gram Positive Bacteria using Sonification and Fluorescent Dye in the Field)

  • 하연철;최기봉;최정도
    • KSBB Journal
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    • 제21권5호
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    • pp.347-352
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    • 2006
  • 본 연구에서는 sonificator를 장착하여 세포막을 파쇄하고 현장에서 형광을 이용하여 조작이 간편하고 단시간에 DNA를 측정할 수 있는 자동화된 형광기를 개발하기 위하여 그람 양성균으로 간균인 Bacillus globigii와 구균인 Streptococcus epidermidis를 대상으로 최적의 세포 파쇄조건을 확립하고자 하였다. Sonificator probe 직경에 따라 세포의 파쇄 효과가 큰 차이를 보였으며 13 mm probe로 20초동안 sonification시키는 것이 가장 효율적인 것으로 나타났으며 간균인 Bacillus globigii가 구균인 Streptococcus epidermidis보다 더 파쇄가 잘 되는 것으로 나타났다. 시료에 잠긴 Sonificator probe tip 깊이에 따라서도 세포의 파쇄 효과가 크게 나타났는데 시료에 잠긴 probe tip의 깊이가 깊을수록 큰 파쇄 효과를 발휘하였다. 선정된 최적의 파쇄 조건에서 최저 탐지농도는 Bacillus globigii, Streptococcus epidermidis 모두 $5{\times}10^5CFU/m{\ell}$의 농도를 탐지 가능한 것으로 나타났다.

아르곤 압력에 따른 유도결합형 폴라즈마의 전기적 특성 (Electrical Properties of Inductively Coupled Plasma by Argon Pressurebstract)

  • 이영환;허인성;조주웅;김광수;이종찬;최용성;박대희
    • 한국전기전자재료학회:학술대회논문집
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    • 한국전기전자재료학회 2003년도 춘계학술대회 논문집 유기절연재료 방전 플라즈마연구회
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    • pp.89-91
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    • 2003
  • In this paper, using a Langmuir probe Ar gas characteristic of electrodeless fluorescent lamp which used an inductively coupled plasma were investigated. The RF output changed into 5-50W in 13.56MHz. At this time internal plasma voltage of the chamber and probe current were measured while changing in -70V - +70V with a supply voltage by Langmuir probe. If pressure of Ar gas was increased, the electric current tended to decrease. Also, an electric current was increased according to an increase of a RF output.

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Real Time PCR을 이용한 Colletotrichum acutatum과 C. gloeosporioides의 검출 (Detection of Colletotrichum acutatum and C. gloeosporioides by Real Time PCR)

  • 김승한;권오훈
    • 식물병연구
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    • 제14권3호
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    • pp.219-222
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    • 2008
  • C. gloeosporioides와 C. acutatum의 개체군 밀도분석을 위해 기존 ITS부위를 이용한 PCR방법에 사용한 caInt2와 cgint 프라이머에 형광을 표지하여 C. acutatum에 특이적인 fcaInt2와 C. gloeosporioides에 특이적인 vcgint의 두 probe를 제작하였다. 이 두개의 프라이머와 Unicof1, Unicor1 primer를 이용 real time PCR을 수행하였을 때 C. acutatum은 fcaInt2 probe에, C. gloeosporioides는 vcgint에 특이적인 형광증폭곡선을 나타냄에 따라 delta Rn 값을 비교함으로 두 종의 구분이 가능하였다.

Fluorescence Spectroscopy Studies on Micellization of Poloxamer 407 Solution

  • Lee, Ka-Young;Shin, Sang-Chul;Oh, In-Joon
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제26권8호
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    • pp.653-658
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    • 2003
  • It has been reported that at low temperature region, poloxamers existed as a monomer. Upon warming, an equilibrium between unimers and micelles was established, and finally micelle aggregates were formed at higher temperature. In this study, the fluorescence spectroscopy was used to study the micelle formation of the poloxamer 407 in aqueous solution. The excitation and emission spectra of pyrene, a fluorescence probe, were measured as a function of the concentration of poloxamer 407 and temperature. A blue shift in the emission spectrum and a red shift in the excitation spectrum were observed as pyrene transferred from an aqueous to a hydrophobic micellar environment. From the $I_1/I_3 and I_{339}/I_{333}$ results, critical micelle concentration (cmc) and critical micelle temperature (cmt) were determined. Also, from the fluorescence spectra of the probe molecules such as 8-anilino-1-naphthalene sulfonic acid and 1-pyrenecarboxaldehyde, the blue shift of the $\lambda_{max}$ was observed. These results suggest a decrease in the polarity of the microenvironment around probe because of micelle formation. The poloxamer 407 above cmc strongly complexed with hydrophobic fluorescent probes and the binding constant of complex increased with increasing the hydrophobicity of the probe.

분자생물학적 방법을 이용하여 마비성 패류 독소를 생산하는 알렉산드륨 타마렌스 시스트 탐색 (Molecular probe for identification of cysts of resting cyst of PSP-producer Alexandrium tamarense (Dinophyceae))

  • Cho, Eun-Seob
    • 생명과학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.163-167
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    • 2003
  • 알렉산드륨 적조생물 속에서 마비성 패류독소를 생산하는 종을 신속하게 동정하므로 패류양식의 독성 모니터링과 방제에 중요한 역할을 할 수 있다. 자연상태에서 영양세포가 출현하기 전 알렉산드륨 타마렌스의 휴면포자만을 신속하게 분리 동정한다는 것은 근본적인 마비성 패류독소 모니터링 및 예측에 큰 역할을 할 수 있다. cTAM-Fl DNA probe은 알렉산드륨 타마렌스의 영양세포 뿐만 아니라 primuline으로 염색하여 메타놀로 고정한 휴면포자에도 반응이 되었다. 영양세포와 휴면포자에 반응되는 DNA probe 위치는 핵내의 말단 부위에 보였다. DNA probe가 세포내로 삽입되는데 가장 적합한 온도와 시간은 50-$54^{\circ}C$, 40-60분이 좋았다.