• 제목/요약/키워드: Fen1

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Cellular DNA Repair of Oxidative Deoxyribose Damage by Mammalian Long-Patch Base Excision Repair

  • Sung Jung-Suk;Son Mi-Young
    • 대한의생명과학회지
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    • 제11권2호
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    • pp.103-108
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    • 2005
  • 2-Deoxyribonolactone (dL) arises as a major DNA damage induced by a variety of agents, involving free radical attack and oxidation of C1'-deoxyribose in DNA. We investigated whether dL lesions can be repaired in mammalian cells and the mechanisms underlying the role of DNA polymerase $\beta$ in processing of dL lesions. Pol $\beta$ appeared to be trapped by dL residues, resulting in stable DNA-protein cross-links. However, repair DNA synthesis at site-specific dL sites occurred effectively in cell-free extracts, but predominantly accompanied by long-patch base excision repair (BER) pathway. Reconstitution of long-patch BER demonstrated that FEN1 was capable of removing the displaced flap DNA containing a 5'-dL residue. Cellular repair of dL lesions was largely dependent on the DNA polymerase activity of Pol $\beta$. Our observations reveal repair mechanisms of dL and define how mammalian cells prevent cytotoxic effects of oxidative DNA lesions that may threaten the genetic integrity of DNA.

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저소음 Tonpilz 트랜스듀서의 설계방안 연구 (Design and evaluations of Tonpilz Transducers with self noise suppressing structures)

  • 임종인
    • 한국음향학회:학술대회논문집
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    • 한국음향학회 1996년도 제11회 수중음향학 학술발표회 논문집 11th Underwater Acoustics Symposium Proceedings
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    • pp.1-3
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    • 1996
  • 수중 트랜스듀서는 진동하는 물체위에 설치되어 다양한 외부 소음원이 유입되는 환경에 노출되어 있다. 외부 소음원으로는 선체 진동. 프로펠러 소음, 그리고 유동 유기 소음들을 들 수 있고, 트랜스듀서의 실제 작동시 이들의 레벨이 상당히 높아서 센서의 정확한 작동에 장애가 되고 있다. 본 논문에서는 외부 소음원에 무관한 고 정밀, 저 소음 특성을 지닌 음향센서를 개발하기 위하여 유한요소법 (FEN)을 사용하여 소음 전달 특성을 분석하고, air pocket과 음향 감쇠층의 다양한 조합으로 이루어진 구조를 개선한 음향센서의 설계 및 내소음성 평가를 하였다. 또한 사용한 음향 감쇠층의 최적 물성을 제시하고자 한다. 그 결과 센서 측면 하단부에 소음원이 위치할 경우 가장 큰 잡음 신호로 작용하며, 구조를 변경한 결과 기존 음향센서에 비해 55% 이상 내 소음성을 증진 시켰다. 그리고 음향 감쇠층의 최적 음향 임피던슨는 1 Mrayl 이하 혹은 4mrayl 이상으로 분석되었다.

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식물 내생균 Bacillus sp. CY22가 생성하는 iturin isoform의 분리 및 특성 (Identification and Molecular Characterization of Three Isoforms of Iturin Produced by Endophytic Bacillus sp. CY22)

  • 조수정;윤한대
    • 생명과학회지
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    • 제15권6호
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    • pp.1005-1012
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    • 2005
  • 식물 내생균 Bacillus sp. CY22는 식물병원균 Rhizoctonia solani, Fusarium oxysporum 및 Phythium ultimum에 대해 강한 항균력을 나타내었다. 일반적으로 많은 Bacillus속 균주들은 iturin, fengycin, mycosubtulin과 같은 항균 물질을 분비한다. 본 연구에서는 식물내생균 Bacillus sp. CY22의 배양액으로부터 항균물질을 분리, 정제하였으며 MALDI-TOF mass로 분자량을 확인하였다. MALDI-TOF mass spectrum분석 결과 분리된 항균물질은 Bacillus 속 균주가 생성하는 항균물질로서 잘 알려져 있는 iturin의 분자량과 거의 일치하였으며, m/z 1043.4, 1057.4, 1071.4에서 molecular ion peak를 나타내었다. 이들은 각각 m/z 14차이를 가진 iturin의 isoform으로 추정되며 이 것은 iturin을 구성하고 있는 지방산의 탄소수 차이로 생각되며 m/z 1065.4, 1079.4 peak는 sodium adduct로서 추정된다. 또한 항균물질 iturin을 생성하는데 관여하는 transacylase 유전자를 크로닝하여 ita22 유전자로 명명하고, 그 특성으로 ita22 유전자는 400 개의 아미노산을 인지하는 1,200 bp의 open reading frame (ORF)을 가지며, 아미노산의 상동성을 조사한 결과 Bacillus subtilis 168의 FenF (BAB69697)와 가장 유사하였다.

Molecular Characterization and Expression Patterns of Porcine Eukaryotic Elongation Factor 1 A

  • Wang, H.L.;Wang, H.;Zhu, Z.M.;Yang, S.L.;Fen, S.T.;Li, Kui
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제19권7호
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    • pp.953-957
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    • 2006
  • The eukaryotic elongation factor 1 A (EEF1A) participates in protein synthesis by forming the eEF1A GTP tRNA complex to deliver aminoacyl-tRNA to the A site of ribosomes. This study described cDNA sequences and partial genomic structure of porcine EEF1A1. The porcine EEF1A1 gene encoded a protein with 462 amino acids, which shared complete homology with human, chimpanzee and dog. The temporal expression pattern showed the diversity of EEF1A1 level in mRNA was relatively minor in prenatal embryo skeletal muscle, however, the expression decreased during aging after birth in skeletal muscle of the Chinese Tongcheng pig. The spatial expression patterns indicated that the gene expressed in skeletal muscle, heart, lung, liver, kidney, fat and spleen. In addition, we assigned the gene to porcine chromosome 1 using a radiation hybrid panel.

OsAREB1, an ABRE-binding protein responding to ABA and glucose, has multiple functions in Arabidopsis

  • Jin, Xiao-Fen;Xiong, Ai-Sheng;Peng, Ri-He;Liu, Jin-Ge;Gao, Feng;Chen, Jian-Min;Yao, Quan-Hong
    • BMB Reports
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    • 제43권1호
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    • pp.34-39
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    • 2010
  • Expression patterns of OsAREB1 revealed that expression of OsAREB1 gene can be induced by ABA, PEG and heat. Yeast one-hybrid assay demonstrated it can bind to ABA-responsive element (ABRE), which was found in most stress-induced genes. Transgenic Arabidopsis over-expressing OsAREB1 had different responses to ABA and glucose compared to wild-type plants, which suggest OsAREB1 might have a crucial role in these two signaling pathways. Further analysis indicate that OsAREB1 have multiple functions in Arabidopsis. First, OsAREB1 transgenic plants had higher resistance to drought and heat, and OsAREB1 up-regulated the ABA/stress related gene such as RD29A and RD29B. Second, it delayed plant flowering time by down-regulating the expression of flowering-related genes, such as FT, SOC1, LFY and AP1. Due to the dates, OsAREB1 may function as a positive regulator in drought/heat stresses response, but a negative regulator in flowering time in Arabidopsis.

Determination of Chromium(VI) and Copper(II) in Organic Solvent - Solution by Liquid Core Optical Fiber Spectrophotometry

  • Wang, JuFang;Fen, Minzhao;Wei, Wang;He, Qushe;Wu, Guanyan
    • 분석과학
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    • 제8권4호
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    • pp.457-460
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    • 1995
  • A new hollow fiber filled with the lower refractive index liquid as core constructs a liquid core optical fiber(LCOF). The LCOF have been used as colorimetric cell to determine elements Cr and Cu in the presence of 70%- 50% ethanol or 50% dioxane aqueous solution, based on colored complex of Chromium(VI) with Diphenycarbazid(DPC) and copper with Chromaurd S(CAS) respectively. The sensitivity (1/ng/ml) of calibration curve of Cr and Cu are 0.052, 0.017 over the range 0 - 25, 0 - 24(ng/ml) respectively. The Cr in the animal gum and Nation Standard of China are determined with recoveries of 94 - 102%.

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RPA-governed Endonuclease Switching during Eukaryotic Okazaki Fragment Processing.

  • Bae, Sung-Ho;Bae, Kwang-Hee;Kim, Jung-Ae;Seo, Yeon-Soo
    • 한국생물물리학회:학술대회논문집
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    • 한국생물물리학회 2001년도 학술 발표회 진행표 및 논문초록
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    • pp.22-22
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    • 2001
  • At the eukaryotic replication fork, discontinuous synthesis of lagging strand DNA gives rise to Okazaki fragments carrying ribonucleotides derived from the primer RNA at their 5' ends. Efficient removal of these ribonucleotides is vital for maintaining genome integrity. In this report we show that the endonucleases Dna2 and Fen1 act sequentially to facilitate the complete removal of the primer RNA.(omitted)

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Glutathione S-transferase P1 and DNA Polymorphisms with the Response to Chemotherapy and the Prognosis of Bone Tumor

  • Yang, Li-Min;Li, Xiu-Hua;Bao, Cui-Fen
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제13권11호
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    • pp.5883-5886
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    • 2012
  • Osteosarcoma is the most common primary bone malignancy in children and adolescents, and its clinical outcome is poor. We evaluated the response of GSTP1, ERCC1 and ERCC2 to chemotherapy among osteosarcoma patients, and the role of these genes on the prognosis of osteosarcoma. 187 patients with osteosarcoma were administered with methotrexate, cisplatin/adriamycin, actinomycin D, cyclophosphamide, or vincristine treatment. GSTP1, ERCC1 and ERCC2 polymorphism was genotyped by PCR-RFLP assay. The results showed the average survival time of 187 patients were 38.4 months. 97 patients showed response to neoadjuvant chemotherapy. The GSTP1 Val and ERCC2 A/A genotypes had significantly higher rates of response to chemotherapy, with adjusted OR (95% CI) of 2.19 (1.15-6.21) and 2.88 (1.14-13.25). Individuals with ERCC2 A/A genotype were likely to have a lower risk of death from oseosarcoma, and the adjusted HR was 0.32 (0.13-0.95). Our study indicated test of GSTP1 and ERCC2 Lys751Gln polymorphisms might be a candidate pharmacogenomic factors to be explored in the future to identify the osteosarcoma patients who might benefit from chemotherapy.

포켓 이온 주입된 MOSFET소자의 1/f 잡음 특성 (An Analysis of the 1/f Noise Characteristics of Pocket Implanted MOSFETS)

  • 이병헌;이기영
    • 대한전자공학회논문지SD
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    • 제41권3호
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    • pp.1-8
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    • 2004
  • 본 연구에서는 소오스와 드레인 근처에 포켓형상으로 이온이 주입되어 halo구조를 갖고 있는 MOSFET 소자의 1/f 잡음 특성에 대하여 고찰하였다. 채널 방향으로 전도도가 균일하지 않은 MOSFET 소자가 선형영역에서 동작할 때, 영역구분 근사기법(regional approach)을 근간으로 논의된 기존의 1/f 잡음모델을 영역별로 서로 다른 전기적 성질이 정의될 수 있는 halo MOSFET 소자에 적용하여 그 타당성을 조사하였다. 잡음모델의 검증을 위하여 기존의 모델에서와 같이 영역구분 근사를 사용하여 보다 넓은 동작범위에서 적용될 수 있도록 기존의 모델식을 개선하였다. 개선된 잡음식은 선형영역에서 기존에 보고된 잡음식에 수렴한다. 실험적으로 측정된 1/f 잡음 특성과의 비교에서 영역구분 근사기법으로 정리된 잡음식은 게이트 전압이 비교적 큰 경우에 한해서 적용될 수 있음을 보였다.