• 대한화학회지
• /
• 제46권2호
• /
• pp.151-156
• /
• 2002

Fucoidan은 갈조류에 다량 함유되어있는 다당류로서 항암작용, 항혈응고작용, 항혈전작용, 항염증작용, 항virus작용과 같은 생리활성작용력을 가지고 있어 최근 많은 연구가 수행되어지고 있다. 본 논문은 갈조류에서 fucoidan을 추출 하여 그 항암활성을 SV40 DNA replication assay, RPA-ssDNA binding assay, 그리고 MCF7 cell growth inhibition assay를 이용하여 알아보았으며 이 항암활성은 fucoidan의 황산기가 중요한 역할을 하고 있음을 알아내었다. 화학적으로 황산기의 함유량을 증가시킨 fucoidan이 황산기의 함유량을 제거시킨 fucoidan보다 항암활성이 뛰어났고, 이는 RPA의 ssDNA 결함력을 떨어 EM리기 때문이라 예측되어 진다. 본 연구는 한국산 갈조류에서 추출한 황산기를 함유한 fucoidan의 항암활성능력을 보여주었다.

• 한국연초학회지
• /
• 제21권2호
• /
• pp.152-159
• /
• 1999

A CAB cDNA clone(pKGCAB) encoding the light harvesting chlorophyll a/b binding protein of the semi-shade plant, Korean ginseng(Panax ginseng C. A. Meyer) was isolated by the one-way path random sequencing of ginseng cDNA library clones and transgenic tobacco plants(Nicotiana tabacum NC82) were produced by the transformation of this ginseng CAB gene in use of Agrobacterium tumefaciens LBA4404. The CAB gene showed type 1 structure of LHCP-II, 84% similarity in nucleotide sequence and 92% in amino acid sequence to that of Nicotiana tabacum CAB40, respectively. Seed germination and initial growth of the transgenic tobacco plants transformed with the cDNA fragment were accelerated under low light intensity compared with those of normal tobacco plant, that may result from the higher light sensitivity of the transgenic plants than that of the normal.

• 미생물학회지
• /
• 제32권2호
• /
• pp.102-108
• /
• 1994

ABF1(Autonomously replicating sequence Binding Factor 1)은 효모 genome에서 $RTCRYN_5ACG$의 염기 서열을 가지고 있는 promoter, mating-type silencer, ARS에 결합하는 DNA binding 단백질이다. E. coli 에서 ABF1 유전자를 발현하기 위하여, ABF1 유전자를 pMAL-c2 벡터에 cloning하였다.(pMAHW). pMAHW를 E. coli에 형질전환하여, ABF1 융합단백질을 발현시키고, amylose resin affinity chromatography에 의하여 분리하였다. Factor Xa protease를 이용하여 분리된 융합단백질로부터 maltose binding protein을 잘라낸 후에 gel retardation analysis 방법으로 분리된 ABF1이 ARS1에 결합하는 능력을 지니고 있음을 확인하였다. DNA 결합에 관련된 부위를 찾기 위하여, 비전형적인 zinc finger motif가 위치하는 자리에서 pMAHW의 ABF1 유전자에 His-61을 다른 아미노산으로 치환하였다. DNA binding 부위로 추정되는 ABF1 단백질의 중간지역에 Leu-353, Leu-360를 다른 아미노산으로 치환하였다. Site-specific mutagenesis 를 통해 만들어진 mutant를 gel retardation analysis와 complementation test를 통해서 비전형적인 zinc finger motif이외에 다른 DNA binding motif가 있는 것을 알 수 있었다.

• Molecules and Cells
• /
• 제27권1호
• /
• pp.47-54
• /
• 2009

A cDNA clone for a transcript preferentially expressed during an early phase of flooding was isolated from Nicotiana tabacum. Nucleotide sequencing of the cDNA clone identified an open reading frame that has high homology to the previously reported glycine-rich RNA-binding proteins. The open reading frame consists of 157 amino acids with an N-terminal RNA-recognition motif and a C-terminal glycine-rich domain, and thus the cDNA clone was designated as Nicotiana tabaccum glycine-rich RNA-binding protein-1 (NtGRP1). Expression of NtGRP1 was upregulated under flooding stress and also increased, but at much lower levels, under conditions of cold, drought, heat, high salt content, and abscisic acid treatment. RNA homopolymer-binding assay showed that NtGRP1 binds to all the RNA homopolymers tested with a higher affinity to poly r(G) and poly r(A) than to poly r(U) and poly r(C). Nucleic acid-binding assays showed that NtGRP1 binds to ssDNA, dsDNA, and mRNA. NtGRP1 suppressed expression of the fire luciferase gene in vitro, and the suppression of luciferase gene expression could be rescued by addition of oligonucleotides. Collectively, the data suggest NtGRP1 as a negative modulator of gene expression by binding to DNA or RNA in bulk that could be advantageous for plants in a stress condition like flooding.

• 한국자기공명학회논문지
• /
• 제21권3호
• /
• pp.90-95
• /
• 2017

The Z-DNA domain of human ADAR1 ($Z{\alpha}_{ADAR1}$) produces B-Z junction DNA through preferential binding to the CG-repeat segment and destabilizing the neighboring AT-rich region. However, this study could not answer the question of how many base-pairs in AT-rich region are destabilized by binding of $Z{\alpha}_{ADAR1}$. Thus, we have performed NMR experiments of $Z{\alpha}_{ADAR1}$ to the longer DNA duplex containing an 8-base-paired (8-bp) CG-repeat segment and a 12-bp AT-rich region. This study revealed that $Z{\alpha}_{ADAR1}$ preferentially binds to the CG-repeat segment rather than AT-rich region in a long DNA and then destabilizes at least 6 base-pairs in the neighboring AT-rich region for efficient B-Z transition of the CG-repeat segment.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
• /
• 제25권4호
• /
• pp.539-544
• /
• 2004

The ability of protoberberine alkaloids, berberine and berberrubine, to act as topoisomerase II poisons is linked to the anti-cancer activity. Minor alterations in structure have a significant effect on their relative activity. Berberine, which has methoxy group at the 19-position, is significantly less potent than berberrubine. Several observations support non-specific binding to HP14 by the berberine: (i) nonspecific upfield changes in $^1H$ chemical shift for protons of the berberine; (ii) the broadening of imino protons of HP14 upon binding of the berberine; (iii) very small increases in duplex melting temperature in the presence of the berberine. Our results reveal that substitution of a hydroxyl group to a methoxy group on the 19-position, thereby converting the berberrubine to the berberine is associated with a non-specific DNA binding affinity and a reduced topoisomerase II poisoning. The presence of a bulky 19-methoxy substituent decreases intercalating properties of berberine and makes it inactive as topoisomerase II poison.

• 생명과학회지
• /
• 제21권8호
• /
• pp.1067-1075
• /
• 2011

CCDC98 단백질은 BRCA1-A 복합체를 DNA 손상 부위로 이동시킴으로써 DNA손상에 의하여 유도되는 G2/M cell cycle checkpoint에 중요한 역할을 한다고 알려져 있다. 하지만 많은 연구에도 불구하고 CCDC98 단백질의 기능에 대해서 알려진 바가 거의 없다. 본 연구는 CCDC98 단백질의 기능을 밝히고자 tandem affinity purification 방법을 수행하였다. 그 결과 Wilms tumor 1-associating protein (WTAP)을 CCDC98의 결합 단백질로 분리 동정하였다. 이들 단백질의 결합을 in vivo and in vitro binding assays를 통하여 확인하였다. 또한, CCDC98 단백질이 cyclin B1의 발현을 억제함을 확인하였는데, 이는 WTAP 단백질의 발현을 조절함으로써 이루어진다는 것을 확인하였다. 이는 CCDC98 단백질이 새로운 세포주기 조절자라는 것을 증명하는 결과이다.

• 생명과학회지
• /
• 제19권2호
• /
• pp.284-288
• /
• 2009

선천성 면역은 숙주의 물리적 방어벽을 뚫고 침입하는 감염성 질병 원인균에 대항하는 첫 번째 방어로서 아주 중요한 역할을 한다. Mannose-binding lectin (MBL 또는 mannan-binding protein, MBP)은 혈청 내에 존재하는 면역성 단백질로서 감염 후 즉시 유발되는 acute phase response의 특정 단백질이다. MBL 단백질은 세균, 바이러스, 곰팡이, 기생충 등의 탄수화합물 구조에 결합하여 식균 작용을 돕거나 보체경로를 활성화 시킨다. MBL 단백질은 C-말단이 탄수화물을 인식하는 도메인이며, 연결 목 부위와 콜라겐 부위로 구성되어 있다. 혈청 내의 MBL 농도가 낮으면 높은 빈도로 면역결핍현상이 관찰된다고 알려져 있다. MBL 단백질의 기능과 유전에 대해 많은 연구가 되어져 왔으나 아직 MBL 단백질 복합체 등에 대한 연구는 많이 이루어져 있지 않다. 따라서 MBL 연구에 필수적인 MBL cDNA 제조와 재조합 단백질의 합성, 그리고 재조합 단백질을 항원으로 사용하여 polyclonal antibody를 생산한 연구 결과를 보고하는 바이다. 본 연구결과로 획득한 MBL cDNA, 재조합 단백질과 anti-MBL 항체는 앞으로의 MBL 연구에 절대적으로 필요한 도구가 될 것으로 생각된다.

• 생명과학회지
• /
• 제8권2호
• /
• pp.119-125
• /
• 1998

dsRNA결합인자인 RBF단백질을 정제하여 이의 단일 또는 이중선의 RNA 또는 DNA 와의 결합도를 측정하였다ㅓ. RBF단백질은 이들과 각각 반응시켜 그 결합도는 SDS-PAGE에 의하여 비교관찰하였다. RBF단백질은 dsRNA와은 강한 결합력을 나타낸 반면 기타의 핵산구조에 대해서는 이러한 결과를 나타내지 못하였다. 인산화 실험의 결과, RBF단백질은 poly(I) : poly(C)의 존재하에서 사람 도는 쥐 모두로 부터의 PKR 효소의 자가인산화를 유사한 방식으로 억제하였다. 이는 다른 종류의 진핵세포생물에서 단백질합성조절을 위한 PKR과 RBF가 유사한 경쟁적 관련성을 유지하면서 존재함을 시사하고 있다.

• 한국자기공명학회논문지
• /
• 제17권2호
• /
• pp.76-80
• /
• 2013

The TCP domain is a DNA-binding domain present in plant transcription factors and has a similar structural feature to the bHTH motif of eukaryotic transcription factors. The imino proton exchange study has been performed for the DNA duplex containing the consensus DNA-binding site for the AtTCP11 transcription factor. The first two base pairs in the consensus 5'-GTGGG-3' sequence are relatively very unstable but lead to greater stabilization of the neighboring two G C base pairs. These unique dynamic features of the five base pairs in the consensus DNA sequence might play crucial roles in the effective DNA binding of the AtTCP11 protein.